These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7158#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1025 fasta sequence [GCTCTCCCCGAGCGGCGCGCGCGACTCCACCACGAATCCGTCCTCCCTGATCGAACCACCACCGATCCGCCTACCTCGCCGCTCCGATCGCTCGCACCGCACGCAATGCCGCCCCGGCGCCGAGCGCACCGCCGGTCGCCGTGAGCCGCGACGGGGGAGATCTCGCGCAGCCGCACCTCCAGCCACGCGCCCCCACGAGGCCGAGGCCGCGCGCCGCGGCCGCACCCGACCCGCCGCCCTGGAGCCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGGCCTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCACTTGTTTCTCTTCTAGAGGAAGCTGAAAAAGTAATTCCTGTGGAATTACGTGAGCAAACTCCTGTCAGGGTTGGGGCTACTGCAGGCCTGAGAGCATTAGGGACTGAAAAGTCTGAAGAAATTTTGCAAGCGGTAAGGGATCTTCTTCAAGACAAGAGCTCTTTCAGATCCCAACCAGAATGGGTTACCGTTCTAGATGGATCTCANGAAGGTGCATTCCAGT] [+] EMBL CB667680 [GCTCTCCCCGAGCGGCGCGCGCGACTCCACCACGAATCCGTCCTCCCTGATCGAACCACCACCGATCCGCCTACCTCGCCGCTCCGATCGCTCGCACCGCACGCAATGCCGCCCCGGCGCCGAGCGCACCGCCGGTCGCCGTGAGCCGCGACGGGGGAGATCTCGCGCAGCCGCACCTCCAGCCACGCGCCCCCACGAGGCCGAGGCCGCGCGCCGCGGCCGCACCCGACCCGCCGCCCTGGAGCCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAAT ] [+] EMBL CB651936 [ ACCGCACCCTATGCCGCCCCGGCGCCGAGCGCACCGCCGGTCGCCGTGAGCCGCGACGGGGGAGATCTCGCGCAGCCGCACCTCCAGCCACGCGCCCCCACGAGGCCGAGGCCGCGCGCCGCGGCCGCACCCGACCCGCCGCCCTGGAGCCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGGCCTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCACTTGTTTCTCTTCTAGAGGAAGCTGAAAAAGTAATTCCTGTGGAATTACGTGAGCAAACTCCTGTCAGGGTTG ] [+] EMBL CB659453 [ CCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGGCCTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCACTTGTTTCTCTTCTAGAGGAAGCTGAAAAAGTAATTCCTGTGGAATTACGTGAGCAAACTCCTGTCAGGGTTGGGGCTACTGCAGGCCTGAGAGCATTAGGGACTGAAAAGTCTGAAGAAATTTTGCAAGCGGTAAGGGATCTTCTTCAAGACAAGAGCTCTTTCAGATCCCAACCAGAATGGGTTACCGTTCTAGATGGATCTCANGAAGGTGCATTCCAGT] [+] EMBL CB651965 [ CCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGG CTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCAC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||