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Oryza sativa
cluster # 7158 cluster # 7158       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7158#0 length = 1025 sequences # 4  

consensusID : consensus_7158#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1025
fasta sequence
                              [GCTCTCCCCGAGCGGCGCGCGCGACTCCACCACGAATCCGTCCTCCCTGATCGAACCACCACCGATCCGCCTACCTCGCCGCTCCGATCGCTCGCACCGCACGCAATGCCGCCCCGGCGCCGAGCGCACCGCCGGTCGCCGTGAGCCGCGACGGGGGAGATCTCGCGCAGCCGCACCTCCAGCCACGCGCCCCCACGAGGCCGAGGCCGCGCGCCGCGGCCGCACCCGACCCGCCGCCCTGGAGCCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGGCCTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCACTTGTTTCTCTTCTAGAGGAAGCTGAAAAAGTAATTCCTGTGGAATTACGTGAGCAAACTCCTGTCAGGGTTGGGGCTACTGCAGGCCTGAGAGCATTAGGGACTGAAAAGTCTGAAGAAATTTTGCAAGCGGTAAGGGATCTTCTTCAAGACAAGAGCTCTTTCAGATCCCAACCAGAATGGGTTACCGTTCTAGATGGATCTCANGAAGGTGCATTCCAGT]

[+] EMBL CB667680             [GCTCTCCCCGAGCGGCGCGCGCGACTCCACCACGAATCCGTCCTCCCTGATCGAACCACCACCGATCCGCCTACCTCGCCGCTCCGATCGCTCGCACCGCACGCAATGCCGCCCCGGCGCCGAGCGCACCGCCGGTCGCCGTGAGCCGCGACGGGGGAGATCTCGCGCAGCCGCACCTCCAGCCACGCGCCCCCACGAGGCCGAGGCCGCGCGCCGCGGCCGCACCCGACCCGCCGCCCTGGAGCCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CB651936             [                                                                                               ACCGCACCCTATGCCGCCCCGGCGCCGAGCGCACCGCCGGTCGCCGTGAGCCGCGACGGGGGAGATCTCGCGCAGCCGCACCTCCAGCCACGCGCCCCCACGAGGCCGAGGCCGCGCGCCGCGGCCGCACCCGACCCGCCGCCCTGGAGCCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGGCCTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCACTTGTTTCTCTTCTAGAGGAAGCTGAAAAAGTAATTCCTGTGGAATTACGTGAGCAAACTCCTGTCAGGGTTG                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CB659453             [                                                                                                                                                                                                                                                    CCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGGCCTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCACTTGTTTCTCTTCTAGAGGAAGCTGAAAAAGTAATTCCTGTGGAATTACGTGAGCAAACTCCTGTCAGGGTTGGGGCTACTGCAGGCCTGAGAGCATTAGGGACTGAAAAGTCTGAAGAAATTTTGCAAGCGGTAAGGGATCTTCTTCAAGACAAGAGCTCTTTCAGATCCCAACCAGAATGGGTTACCGTTCTAGATGGATCTCANGAAGGTGCATTCCAGT]
[+] EMBL CB651965             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCGCTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTCCGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGTGCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTCCGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCCCCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGGGAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTATTGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGG CTCAGTGCCTATGCCATGGACCCACAAGAAGCTGCTAAGTCAC                                                                                                                                                                                                                              ]


>consensus_7158#0 GCTCTCCCCGAGCGGCGCGCGCGACTCCACCACGAATCCGTCCTCCCTGATCGAACCACC ACCGATCCGCCTACCTCGCCGCTCCGATCGCTCGCACCGCACGCAATGCCGCCCCGGCGC CGAGCGCACCGCCGGTCGCCGTGAGCCGCGACGGGGGAGATCTCGCGCAGCCGCACCTCC AGCCACGCGCCCCCACGAGGCCGAGGCCGCGCGCCGCGGCCGCACCCGACCCGCCGCCCT GGAGCCGCCGCAGCAGGAGGCGGTGAAGCCGTCCCCGACCAACGGCCGCATCCGCTACCG CTCGCCCTCGGCGGCCGACCTACTCCCGGCCGATGACCTCGCCGCCGCCGCCGGCCCCTC CGCCGCGGATGCCGCGAGGATGCGCCGCTTCTCGGCCGCCGCCGGGGCGCGGCAGCAGCA GCAGCAGGGGGAGGCCGTGTCCGACCGCGTCCTCCGCTTCCGCGGGGTCCTCGTCGTGGT GCTCGCGCCGGTGCTCCTCATCTCGCTCGTGCTCCTTCTCATGCCTCGCGCGCCCGCCTC CGCTACCGTCGAGGGCTCTGCCGGTGAGCTCGTCGCCGCTGCCGGACGGAGGTGGGGCCC CCGGGCCGTCAGCGGACTTGGGGACGGATCCACCAGGTACGCTGTGATATTTGATGCCGG GAGCTCCGGGAGCCGCGTGCACGTGTACTGCTTCGATGGGAACCTGGATCTGCTGCCTAT TGGAAAGGAAATCGAGCTGTTCAAGCAGAAAAAACCAGGCCTCAGTGCCTATGCCATGGA CCCACAAGAAGCTGCTAAGTCACTTGTTTCTCTTCTAGAGGAAGCTGAAAAAGTAATTCC TGTGGAATTACGTGAGCAAACTCCTGTCAGGGTTGGGGCTACTGCAGGCCTGAGAGCATT AGGGACTGAAAAGTCTGAAGAAATTTTGCAAGCGGTAAGGGATCTTCTTCAAGACAAGAG CTCTTTCAGATCCCAACCAGAATGGGTTACCGTTCTAGATGGATCTCANGAAGGTGCATT CCAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)