These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7186#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1116 fasta sequence [CACGAGGCTCGGATTGACTCTCCTCTCTCGCTGGTGATGGGTCCTGACTCGCTCTCGGTTCTTTGTGTTAAGAGGGGGGGTTTTGCTCTGGTGTTTTCTTTCTCTTTGCTTTGATGAGTGATTTACTAGGCTGATTTTACTTTCCTGGATGGATAATCCAGTTCATTCAATTTGTTAAGATTTTTTTTCTTCTTTTTGGTGATTTTGGTTTTTGCAGAATTTGATTGGGGGTTTCTACCCAAATAACAGCTTGTTTATACCTTTTATGTATGGCTCTGCTCGAAGAGAACTTGGGGATGGTTTCTTGATTGGAAACACGAATTCGAGCTTTATTGCAAGAAAATAGATGTTCTTTTCAGTTAATGATTTATGGTACGAAATATATTTCCCCGACAGTTTGACTGTAAAACCCATCATGGAAAACATCATAACAAGTAGCAATCAAGCCATAATAGCTGTGAAAGATGTATGTTCTGTGTGAATTTAATGCAGTGTCCGTTGAATTCTAGCTTAAGAGGTTATAGCTTGAGCTTGGACTGCTGATATATGCATAATTTAGCATTTCTGTCACAGAATTCGCACTAGGATGAAACTGTCACTGCATCAAAGGTCCCGAGGGGAACGCAGTAAAGTTCCTTGAGATAAAGAAATTTACGTGGGTTGGCAATGGAATTCGTATTTGTTTCATTATTGTTTTGGAGTATAGCTTTCAGAGCTCCATAGTGGAGCACTTTGCACACAAGTGCTTCTGGTGTATAAATATAATAACTGGGAAAGTAGGCCTTTGTTGGATTGAATCTTGTGATGTTTGGGATATAATATCCACACTTCCCATATTGGCCAGTGCTTATTTGTGCCTGGTATGTACTTATTGTATCTGTAGAAGAATGGGTTATGTGTCTATGAGGAGTATTTGCTTGTGTTACATACAATCCATTGCTTCATCTAGGACCGTTTGAACAGTTCAAACGAACACATTGTGGTTAAGGCCCAAGTAGTACATGTAACTTTTCTAGTTTTGCATGCCTTAGATGCAGGGAATAACGCTTGCAACTCCATATCTTATTAATTTATTAACTGAAAAACTGGTCAAGNTACATTGTAGATTGTTCTGAA] [+] EMBL CF303183 [CACGAGGCTCGGATTGACTCTCCTCTCTCGCTGGTGATGGGTCCTGACTCGCTCTCGGTTCTTTGTGTTAAGAGGGGGGGTTTTGCTCTGGTGTTTTCTTTCTCTTTGCTTTGATGAGTGATTTACTAGGCTGATTTTACTTTCCTGGATGGATAATCCAGTTCATTCAATTTGTTAAGATTTTTTTTCTTCTTTTTGGTGATTTTGGTTTTTGCAGAATTTGATTGGGGGTTTCTACCCAAATAACAGCTTGTTTATACCTTTTATGTATGGCTCTGCTCGAAGAGAACTTGGGGATGGTTTCTTGATTGGAAACACGAATTCGAGCTTTATTGCAAGAAAATAGATGTTCTTTTCAGTTAATGATTTATGGTACGAAATATATTTCCCCGACAGTTTGACTGTAAAACCCATCATGGAAAACATCATAACAAGTAGCAATCAAGCCATAATAGCTGTGAAAGATGTATGTTCTGTGTGAA TTAATGCAGTGTCC ] [+] EMBL CB633014 [ CTCTTTGCTTTGATGAGTGATTTACTAGGCTGATTTTACTTTCCTGGATGGATAATCCAGTTCATTCAATTTGTTAAGATTTTTTTTCTTCTTTTTGGTGATTTTGGTTTTTGCAGAATTTGATTGGGGGTTTCTACCCAAATAACAGCTTGTTTATACCTTTTATGTATGGCTCTGCTCGAAGAGAACTTGGGGATGGTTTCTTGATTGGAAACACGAATTCGAGCTTTATTGCAAGAAAATAGATGTTCTTTTCAGTTAATGATTTATGGTACGAAATATATTTCCCCGACAGTTTGACTGTAAAACCCATCATGGAAAACATCATAACAAGTAGCAATCAAGCCATAATAGCTGTGAAAGATGTATGTTCTGTGTGAATTTAATGCAGTGTCCGTTGAATTCTAGCTTAAGAGGTTATAGCTTGAGCTTGGACTGCTGATATATGCATAATTTAGCATTTCTGTCACAGAATTCGCACTAGGATGAAACTGTCACTGCATCAAAGGTCCCGAGGGGAACGCAGTAAAGTTCCTTGAGATAAAGAAATTTACGTGGGTTGGCAATGGAATTCGTATTTGTTTCATTATTGTTTTGGAGTATAGCTTTCAGAGCTCCATAGTGGAGCACTTTGCACACAAGTGCTTCTGGTGTATAAATATAATAACTGGGAAAGTAGGCCTTTGTTGGATTGAATCTTGTGATGTTTGGGATATAATATCCACACTTCCCATATTGGCCAGTGCTTATTTGTGCCTGGTATGTACTTATTGTATCTGTAGAAGAATGGGCTATGTGTCTATGAAGAGTATTTGCTTGTGTTACATACAATCCAT ] [+] EMBL CB629008 [ gAGAGAACTTGGGGATGGTTTCTTGATTGGAAACACGAATTCGAGCTTTATTGCAAGAAAATAGATGTTCTTTTCAGTTAATGATTTATGGTACGAAATATATTTCCCCGACAGTTTGACTGTAAAACCCATCATGGAAAACATCATAACAAGTAGCAATCAAGCCATAATAGCTGTGAAAGATGTATGTTCTGTGTGAATTTAATGCAGTGTCCGTTGAATTCTAGCTTAAGAGGTTATAGCTTGAGCTTGGACTGCTGATATATGCATAATTTAGCATTTCTGTCACAGAATTCGCACTAGGATGAAACTGTCACTGCATCAAAGGTCCCGAGGGGAACGCAGTAAAGTTCCTTGAGATAAAGAAATTTACGTGGGTTGGCAATGGAATTCGTATTTGTTTCATTATTGTTTTGGAGTATAGCTTTCAGAGCTCCATAGTGGAGCACTTTGCACACAAGTGCTTCTGGTGTATAAATATAATAACTGGGAAAGTAGGCCTTTGTTGGATTGAATCTTGTGATGTTTGGGATATAATATCCACACTTCCCATATTGGCCAGTGCTTATTTGTGCCTGGTATGTACTTATTGTATCTGTAGAAGAATGGGTTATGTGTCTATGAGGAGTATTTGCTTGTGTTACATACAATCCATTGCTTCATCTAGGACCGTTTGAACAGTTCAAACGAACACATTGTGGTTAAGGCCCAAGTAGTACATGTAACTTTTCTAGTTTTGCATGCCTTAGATGCAGGGAATAACGCTTGCAACTCCATATCTTATTAATTTATTAACTGAAAAACTGGTCAAGNTACATTGTAGATTGTTCTGAA] [+] EMBL CB629049 [ gAGAGAACTTGGGGATGGTTTCTTGATTGGAAACACGAATTCGAGCTTTATTGCAAGAAAATAGATGTTCTTTTCAGTTAATGATTTATGGTACGAAATATATTTCCCCGACAGTTTGACTGTAAAACCCATCATGGAAAACATCATAACAAGTAGCAATCAAGCCATAATAGCTGTGAAAGATGTATGTTCTGTGTGAATTTAATGCAGTGTCCGTTGAATTCTAGCTTAAGAGGTTATAGCTTGAGCTTGGACTGCTGATATATGCATAATTTAGCATTTCTGTCACAGAATTCGCACTAGGATGAAACTGTCACTGCATCAAAGGTCCCGAGGGGAACGCAGTAAAGTTCCTTGAGATAAAGAAATTTACGTGGGTTGGCAATGGAATTCGTATTTGTTTCATTATTGTTTTGGAGTATAGCTTTCAGAGCTCCATAGTGGAGCACTTTGCACACAAGTGCTTCTGGTGTATAAATATAATAACTGGGAAAGTAGGCCTTTGTTGGATTGAATCTTGTGATGTTTGGGATATAATATCCACACTTCCCATATTGGCCAGTGCTTATTTGTGCCTGGTATGTACTTATTGTATCTGTAGAAGAATGGGTTATGTGTCTATGAGGAGTATTTGCTTGTGTTACATACAATCCATTGCTTCATCTAGGACCGTTTGAACAGTTCAAACGAACACATTGTGGTTAAGGCCCAAGTAGTACATGTAAC TTTCTAGTTTTGCATGCCTTAGATGCAGGGAATAACGCTTGCAACTCCATATCTTATTAATTTATTAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||