Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7293 cluster # 7293       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7293#0 length = 677 sequences # 4  

consensusID : consensus_7293#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 677
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGAAATGCTAACATTTTGAATGCTATTGAATTAACACAAGTTGACAGATAGCACACCAATTCTTAAATGAGAAGCAAATTTTGAAACTTCAGCAAAGACACCAATTCTTAAAAAAGAACATCCTCGAGCAACTATTGCGCAACATTCCAAAACTTCAACAGAAACTCCAATTCTTAGGAAATCACATCTTCCAATAACAATTACACAAAACCATATGGAAGATTGCCTCTAGTTGGTCCCCTTCCCCTTGGGTACTGAGTAGGACCTGGAGTTGTCTCCATTGTCCTTCCTTTCACAGACCTATCCGTTCCTTGACCTTGCAAATTATGATCAGAGGATTTCTTTATTTTACTCCCACCGTTATCTTGTCGAGTTCTCTTCCCAACATTCTTGCTTGTATTCTTGACTGAATTCATGGATTTTGTTTCAATAGTTTCCAGTTCCTCGGGTACATCCTTGGTAGCCTTGGCTAGAATTTCCACTTTGTCAGGCTCATCTTGCTTTCCTAGATTAAGCATGCTTGATGATTCTAGCACAGAATGATCAACATGATCATTCTTTGTTGTCACCACAAAACTATCTTGATTTCCCTTCAAATGCTCCATTGATTCTTTTGTATCCCCCGATGAGTTACTAGGGCCCATGGTATTTTTG]

[+] EMBL CA759612             [TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGAAATGCTAACATTTTGAATGCTATTGAATTAACACAAGTTGACAGATAGCACACCAATTCTTAAATGAGAAGCAAATTTTGAAACTTCAGCAAAGACACCAATTCTTAAAAAAGAACATCCTCGAGCAACTATTGCGCAACATTCCAAAACTTCAACAGAAACTCCAATTCTTAGGAAATCACATCTTCCAATAACAATTACACAAAACCATATGGAAGATTGCCTCTAGTTGGTCCCCTTCCCCTTGGGTACTGAGTAGGACCTGGAGTTGTCTCCATTGTCCTTCCTTTCACAGACCTATCCGTTCCTTGACCTTGCAAATTATGATCAGAGGATTTCTTTATTTTACTCCCACCGTTATCTTGTCGAGTTCTCTTCCCAACATTCTTGCTTGTATTCTTGACTGAATTCATGGATTTTGTTTCAATAGTTTCCAGTTCCTCGGGTACATCCTTGGTAGCCTTGGCTAGAATTTCCACTTTGTCAGGCTCATCTTGCTTTCCTAGATTAAGCATGCTTGATGATTCTAGCACAGAATGATCAACATGATCATTCTTTGTTGTCACCACAAAACTATCTTGATTTCCCTTCAAATGCTCCATTGATTCTTTTGTATCCCCCGATGAGTTACTAGGGCCCATGGTATTTTTG]
[+] EMBL CA759613             [TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGAAATGCTAACATTTTGAATGCTATTGAATTAACACAAGTTGACAGATAGCACACCAATTCTTAAATGAGAAGCAAATTTTGAAACTTCAGCAAAGACACCAATTCTTAAAAAAGAACATCCTCGAGCAACTATTGCGCAACATTCCAAAACTTCAACAGAAACTCCAATTCTTAGGAAATCACATCTTCCAATAACAATTACACAAAACCATATGGAAGATTGCCTCTAGTTGGTCCCCTTCCCCTTGGGTACTGAGTAGGACCTGGAGTTGTCTCCATTGTCCTTCCTTTCACAGACCTATCCGTTCCTTGACCTTGCAAATTATGATCAGAGGATTTCTTTATTTTACTCCCACCGTTATCTTGTCGAGTTCTCTTCCCAACATTCTTGCTTGTATTCTTGACTGAATTCATGGATTTTGTTTCAATAGTTTCCAGTTCCTCGGGTACATCCTTGGTAGCCTTGGCTAGAATTTCCACTTTGTCAGGCTCATCTTGCTTTCCTAGATTAAGCATGCTTGATGATTCTAGCACAGAATGATCAACATGATCATTCTTTGTTGTCACCACAAAACTATCTTGATTTCCCTTCAAATGCTCCATTGATTCTTTTGTATCCCCCGATGAGTTACTAGGGCCCATGGTATTTTTG]
[+] EMBL CA759614             [TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGAAATGCTAACATTTTGAATGCTATTGAATTAACACAAGTTGACAGATAGCACACCAATTCTTAAATGAGAAGCAAATTTTGAAACTTCAGCAAAGACACCAATTCTTAAAAAAGAACATCCTCGAGCAACTATTGCGCAACATTCCAAAACTTCAACAGAAACTCCAATTCTTAGGAAATCACATCTTCCAATAACAATTACACAAAACCATATGGAAGATTGCCTCTAGTTGGTCCCCTTCCCCTTGGGTACTGAGTAGGACCTGGAGTTGTCTCCATTGTCCTTCCTTTCACAGACCTATCCGTTCCTTGACCTTGCAAATTATGATCAGAGGATTTCTTTATTTTACTCCCACCGTTATCTTGTCGAGTTCTCTTCCCAACATTCTTGCTTGTATTCTTGACTGAATTCATGGATTTTGTTTCAATAGTTTCCAGTTCCTCGGGTACATCCTTGGTAGCCTTGGCTAGAATTTCCACTTTGTCAGGCTCATCTTGCTTTCCTAGATTAAGCATGCTTGATGATTCTAGCACAGAATGATCAACATGATCATTCTTTGTTGTCACCACAAAACTATCTTGATTTCCCTTCAAATGCTCCATTGATTCTTTTGTATCCCCCGATGAGTTACTAGGGCCCATGGTATTTTTG]
[+] EMBL CA759611             [TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGAAATGCTAACATTTTGAATGCTATTGAATTAACACAAGTTGACAGATAGCACACCAATTCTTAAATGAGAAGCAAATTTTGAAACTTCAGCAAAGACACCAATTCTTAAAAAAGAACATCCTCGAGCAACTATTGCGCAACATTCCAAAACTTCAACAGAAACTCCAATTCTTAGGAAATCACATCTTCCAATAACAATTACACAAAACCATATGGAAGATTGCCTCTAGTTGGTCCCCTTCCCCTTGGGTACTGAGTAGGACCTGGAGTTGTCTCCATTGTCCTTCCTTTCACAGACCTATCCGTTCCTTGACCTTGCAAATTATGATCAGAGGATTTCTTTATTTTACTCCCACCGTTATCTTGTCGAGTTCTCTTCCCAACATTCTTGCTTGTATTCTTGACTGAATTCATGGATTTTGTTTCAATAGTTTCCAGTTCCTCGGGTACATCCTTGGTAGCCTTGGCTAGAATTTCCACTTTGTCAGGCTCATCTTGCTTTCCTAGATTAAGCATGCTTGATGATTCTAGCACAGAATGATCAACATGATCATTCTTTGTTGTCACCACAAAACTATCTTGATTTCCCTTCAAATGCTCCATTGATTCTTTTGTATCCCCCGATGAGTTACTAGGGCCCATGGTATTTTTG]


>consensus_7293#0 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGAAATGCTAACATTTTGAATGCTATTGAATTAACAC AAGTTGACAGATAGCACACCAATTCTTAAATGAGAAGCAAATTTTGAAACTTCAGCAAAG ACACCAATTCTTAAAAAAGAACATCCTCGAGCAACTATTGCGCAACATTCCAAAACTTCA ACAGAAACTCCAATTCTTAGGAAATCACATCTTCCAATAACAATTACACAAAACCATATG GAAGATTGCCTCTAGTTGGTCCCCTTCCCCTTGGGTACTGAGTAGGACCTGGAGTTGTCT CCATTGTCCTTCCTTTCACAGACCTATCCGTTCCTTGACCTTGCAAATTATGATCAGAGG ATTTCTTTATTTTACTCCCACCGTTATCTTGTCGAGTTCTCTTCCCAACATTCTTGCTTG TATTCTTGACTGAATTCATGGATTTTGTTTCAATAGTTTCCAGTTCCTCGGGTACATCCT TGGTAGCCTTGGCTAGAATTTCCACTTTGTCAGGCTCATCTTGCTTTCCTAGATTAAGCA TGCTTGATGATTCTAGCACAGAATGATCAACATGATCATTCTTTGTTGTCACCACAAAAC TATCTTGATTTCCCTTCAAATGCTCCATTGATTCTTTTGTATCCCCCGATGAGTTACTAG GGCCCATGGTATTTTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)