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Oryza sativa
cluster # 7415 cluster # 7415       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7415#0 length = 905 sequences # 4  
consensusID : consensus_7415#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 905
fasta sequence 
                              [TTTCTCTTTCATTGTTTTCTCCGTCAAGAGAGAGGGAGAGAGACATCTTGCCGCGGCGAGAGAGAGGGGGCTCGCCGGCGGGAGGGAGCGGGCTCGCCGGCGGGAGGGATCCGGCTTGCCGGCGTGCGGGAGAGAGTTTGTTTTTGTAAGATGGCTCCTATGCATAAATCAAGGCTTGGCAAAGCTCCTATTGTTATTGACTCCGATGACTCTGATGATGATGATCAAGAGCATGATAGTACAAAATTTGATGATTTCATTCTTGGAATGCAGAGGAAATTGATTGTTCAAGATGTGATGAAGGAACTGATGTCCAAATCTTATGTTTTGCCAAAGCCTCATGTGAAGAAACAAAAGGCTCATGCTAATGCAGAATCGTCTTTCACAAGATTCTCTATCAGATATTTTTCAGATGTTATTTCCAAGTTATCTGACTATCACAAGTCCATCATCCACAAATATGAGTTTGATTTTTTGTTATTGTTTGAGAGCAACTCTGTTCCTGTCAAATTTGCATATTGGATTGTTAAACATGTCGATGTTAGGACTTCTGAAATAATTCTAAATGACAAAATTATCCCAGTAACAGTTGAATCAGTGCACGCTGTTCTCGGTGTTCCTTTAGGTGGAATAGAATTCAGCAAAGATTATGAAGCTGGCAGGCAATATGTCATGTATATGTTTGGTCAGGATGCTATTCCTTCGGTTAAATTTTTTGAAGATCTACTAATTCAGAAGAAAGACTTGTCTGAAGATCAAATAATCACCTCTTTCCTTACTGTTGCCTTGGCTTGCTTTTTATGCCCCAACTCATCTTTGATCCCAAGTGTCAAGTATTTGACTATCTTCGAGGATGCTAACCTGTTGAAAAGCTATGATTGGTCAAAATTTGTGTATGAATGGCT]

[+] EMBL CB630070             [TTTCTCTTTCATTGTTTTCTCCGTCAAGAGAGAGGGAGAGAGACATCTTGCCGCGGCGAGAGAGAGGGGGCTCGCCGGCGGGAGGGAGCGGGCTCGCCGGCGGGAGGGATCCGGCTTGCCGGCGTGCGGGAGAGAGTTTGTTTTTGTAAGATGGCTCCTATGCATAAATCAAGGCTTGGCAAAGCTCCTATTGTTATTGACTCCGATGACTCTGATGATGATGATCAAGAGCATGATAGTACAAAATTTGATGATTTCATTCTTGGAATGCAGAGGAAATTGATTGTTCAAGATGTGATGAAGGAACTGATGTCCAAATCTTATGTTTTGCCAAAGCCTCATGTGAAGAAACAAAAGGCTCATGCTAATGCAGAATCGTCTTTCACAAGATTCTCTATCAGATATTTTTCAGATGTTATTTCCAAGTTATCTGACTATCACAAGTCCATCATCCACAAATATGAGTTTGATTTTTTGTTATTGTTTGAGAGCAACTCTGTTCCTGTCAAATTTGCATATTGGATTGTTAAACATGTCGATGTTAGGACTTCTGAAATAATTCTAAATGACAAAATTATCCCAGTAACAGTTGAATCAGTGCACGCTGTTCTCGGTGTTCCTTTAGGTGGAATAGAATTCAGCAAAGATTATGAAGCTGGCAGGCAATATGTCATGTATATGTTTGGTCAGGATGCTATTCCTTCGGTTAAATTTTTTGAAGATCTACTAATTCA                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB629914             [TTTCTCTTTCATTGTTTTCTCCGTCAAGAGAGAGGGAGAGAGACATCTTGCCGCGGCGAGAGAGAGGGGGCTCGCCGGCCGGAGGGAGCGGGCTCGCCGGCGGGAGGGATCCGGCTTGCCGGCGTGCGGGAGAGAGTTTGTTTTTGTAAGATGGCTCCTATGCATAAATCAAGGCTTGGCAAAGCTCCTATTGTTATTGACTCCGATGACTCTGATGATGATGATCAAGAGCATGATAGTACAAAATTTGATGATTTCATTCTTGGAATGCAGAGGAAATTGATTGTTCAAGATGTGATGAAGGAACTGATGTCCAAATCTTATGTTTTGCCAAAGCCTCATGTGAAGAAACAAAAGGCTCATGCTAATGCAGAATCGTCTTTCACAAGATTCTCTATCAGATATTTTTCAGATGTTATTTCCAAGTTATCTGACTATCACAAGTCCATCATCCACAAATATGAGTTTGATTTTTTGTTATTGTTTGAGAGCAACTCTGTTCCTGTCAAATTTGCATATTGGATTGTTAAACATGTCGATGTTAGGACTTCTGAAATAATTCTAAATGACAAAATTATCCCAGTAACAGTTGAATCAGTGCACGCTGTTCTCGGTGTTCCTTTAGGTGGAATAGAATTCAGCAAAGATTATGAAGCTGGCAGGCAATATGTCATGTATATGTTTGGTCAGGATGCTATTCCTTCGGTTAAATTTTT                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CA765989             [                                                                             GCGGGAGGGAGCGGGCTCGCCGGCGGGAGGGATCCGGCTTGCCGGCGTGCGGGAGAGAGTTTGTTTTTGTAAGATGGCTCCTATGCATAAATCAAGGCTTGGCAAAGCTCCTATTGTTATTGACTCCGATGACTCTGATGATGATGATCAAGAGCATGATAGTACAAAATTTGATGATTTCATTCTTGGAATGCAGAGGAAATTGATTGTTCAAGATGTGATGAAGGAACTGATGTCCAAATCTTATGTTTTGCCAAAGCCTCATGTGAAGAAACAAAAGGCTCATGCTAATGCAGAATCGTCTTTCACAAGATTCTCTATCAGATATTTTTCAGATGTTATTTCCAAGTTATCTGACTATCACAAGTCCATCATCCACAAATATGAGTTTGATTTTTTGTTATTGTTTGAGAGCAACTCTGTTCCTGTCAAATTTGCATATTGGATTGTTAAACATGTCGATGTTAGGACTTCTGAAATAATTCTAAATGACAAAATTATCCCAGTAACAGTTGAATCAGTGCACGCTGTTCTCGGTGTTCCTTTAGGTGGAATAGAATTCAGCAAAGATTATGAAGCTGGCAGGCAATATGTCATGTATATGTTTGGTCAGGATGCTATTCCTTCGGTTAAATTTTTTGAAG                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB635263             [                                                                                      AGCGGCCTCGCCGGCGGGAGGGATCCGGCTTGCCGGCGTGCGGGAGAGAGTTTGTTTTTGTAAGATGGCTCCTATGCATAAATCAAGGCTTGGCAAAGCTCCTATTGTTATTGACTCCGATGACTCTGATGATGATGATCAAGAGCATGATAGTACAAAATTTGGTGATTTCATTCTTGGAATGCAGAGGAAATTGATTGTTCAAGATGTGATGAAGGAACTGATGTCCAAATCTTATGTTTTGCCAAAGCCTCATGTGAAGAAACAAAAGGCTCATGCTAATGCAGAATCGTCTTTCACAAGATTCTCTATCAGATATTTTTCAGATGTTATTTCCAAGTTATCTGACTATCACAAGTCCATCATCCACAAATATGAGTTTGATTTTTTGTTATTGTTTGAGAGCAACTCTGTTCCTGTCAAATTTGCATATTGGATTGTTAAACATGTCGATGTTAGGACTTCTGAAATAATTCTAAATGACAAAATTATCCCAGTAACAGTTGAATCAGTGCACGCTGTTCTCGGTGTTCCTTTAGGTGGAATAGAATTCAGCAAAGATTATGAAGCTGGCAGGCAATATGTCATGTATATGTTTGGTCAGGATGCTATTCCTTCGGTTAAATTTTTTGAAGATCTACTAATTCAGAAGAAAGACTTGTCTGAAGATCAAATAATCACCTCTTTCCTTACTGTTGCCTTGGCTTGCTTTTTATGCCCCAACTCATCTTTGATCCCAAGTGTCAAGTATTTGACTATCTTCGAGGATGCTAACCTGTTGAAAAGCTATGATTGGTCAAAATTTGTGTATGAATGGCT]




>consensus_7415#0
TTTCTCTTTCATTGTTTTCTCCGTCAAGAGAGAGGGAGAGAGACATCTTGCCGCGGCGAG
AGAGAGGGGGCTCGCCGGCGGGAGGGAGCGGGCTCGCCGGCGGGAGGGATCCGGCTTGCC
GGCGTGCGGGAGAGAGTTTGTTTTTGTAAGATGGCTCCTATGCATAAATCAAGGCTTGGC
AAAGCTCCTATTGTTATTGACTCCGATGACTCTGATGATGATGATCAAGAGCATGATAGT
ACAAAATTTGATGATTTCATTCTTGGAATGCAGAGGAAATTGATTGTTCAAGATGTGATG
AAGGAACTGATGTCCAAATCTTATGTTTTGCCAAAGCCTCATGTGAAGAAACAAAAGGCT
CATGCTAATGCAGAATCGTCTTTCACAAGATTCTCTATCAGATATTTTTCAGATGTTATT
TCCAAGTTATCTGACTATCACAAGTCCATCATCCACAAATATGAGTTTGATTTTTTGTTA
TTGTTTGAGAGCAACTCTGTTCCTGTCAAATTTGCATATTGGATTGTTAAACATGTCGAT
GTTAGGACTTCTGAAATAATTCTAAATGACAAAATTATCCCAGTAACAGTTGAATCAGTG
CACGCTGTTCTCGGTGTTCCTTTAGGTGGAATAGAATTCAGCAAAGATTATGAAGCTGGC
AGGCAATATGTCATGTATATGTTTGGTCAGGATGCTATTCCTTCGGTTAAATTTTTTGAA
GATCTACTAATTCAGAAGAAAGACTTGTCTGAAGATCAAATAATCACCTCTTTCCTTACT
GTTGCCTTGGCTTGCTTTTTATGCCCCAACTCATCTTTGATCCCAAGTGTCAAGTATTTG
ACTATCTTCGAGGATGCTAACCTGTTGAAAAGCTATGATTGGTCAAAATTTGTGTATGAA
TGGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)