These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7429#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2499 fasta sequence [CTTCTTCCCAGCCGCCATGGCTCCTCCTCCTCCTTCCTCCTCCGTTGCTCTTCGACGATTCAACCCAGCCGCCATGGAGAGCGGAGGGAGGTAGCTGACTAGCTGGGGCTGGGGATTTCCGGCGAACGGAGGTGAGGTTGGTGCCGCTCCGGCCGCTACTTCCGCGACCCAAAGAATCGGCAAGTCCATAGATACCGGACCTCCGCGAATGCCCCGCGGCCATAGACGCCGCCGCCGCTGCGCATGCGCCACCACCACCTCGCCGTCGCCGCCGCGAGGTCCCACGCCTCCCTCCTCAAGTCCGGCTTCGCCGCCCCCACGCCCTGGAACCAGCTCCTCACCGCCTACTCCCGCTCCTCCCCCGATGGCCTCGCCGCCGCGCGCCGGGTGTTCGACGAGGTGCCCCGCCGCGACGAGGTCTCCTGGAACGCGCTCCTCGCCGCACACGCCGCGTCCGGCGCGCACCCGGAAGCATGGCGCCTCCTCCGGGCCATGCACGCGCAGGGGCTCGCTTCCAACACGTTCGCCCTCGGCTCGGCCCTCCGCTCCGCCGCCGTAGCGCGGCGTCCTGCCATCGGCGCCCAACTGCAGTCGCTCGCTTTGAAATCCGGCCTTGCCAACAATGTGTTCGCGGCAAGTGCATTACTTGATGTGTATGCTAAATGTGGCCGCGTGAGGGATGCCCGACAGGTGTTTGATGGAATGCCAGAGCGGAACACTGTTTCTTGGAATGCACTCATTGCCGGGTATACTGAATCTGGGGACATGGCATCTGCACTGGAGCTGTTTCTTGAGATGGAAAGAGAAGGTTTGGCTCCAGATGAAGCAACATTTGCGTCGCTGCTCACAGCAGTTGAGGGCCCAAGCTGTTTCTTGATGCACCAGTTGCATGGGAAGATTGTGAAGTATGGATCTGCGTTAGGGCTGACAGTGTTGAATGCAGCAATCACTGCATATTCACAATGTGGGTCCCTGAAAGACTCTAGAAGGATCTTTGATGGAATTGGGGACATTAGGGATTTGATCTCATGGAATGCGATGCTTGGAGCTTACACTCACAATGGAATGGACGACGAGGCGATGAAATTCTTTGTTAGGATGATGCAAGAGAGTGGAGTTCATCCTGACATGTATAGTTTCACAAGTATCATAAGTTCATGTTCAGAGCATGGGCATGATGATCATCAAGGGAGAGTAATTCATGGGTTGGTGATCAAGAGTGCTCTGGAAGGAGTCACGCCTGTTTGTAATGCTCTGATTGCCATGTACACTAGGTACAATGAGAATTGCATGATGGAAGATGCATACAAGTGTTTTAACTCTTTGGTGCTTAAGGACACAGTGTCCTGGAATTCTATGCTGACTGGATATTCACAGCACGGTTTGAGTGCCGATGCCTTGAAGTTCTTCAGATGTATGTGTTCGGAAAATGTTAGAACCGATGAGTATGCATTTTCTGCGGCTCTGCGGTCCTCTTCTGAACTTGCTGTGCTTCAGTTAGGTAAACAAATACATGGTTTAGTCATCCATTCTGGTTTTGCTTCCAATGATTTTGTTTCCAGCTCGCTAATCTTCATGTACTCTAAGAGTGGCATTATTGACGATGCACGGAAATCTTTTGAGGAGGCAGATAAGAGTAGTTCAGTGCCTTGGAATGCTATGATATTTGGTTATGCACAACATGGACAAGCTGAAAACGTAGACATACTTTTCAATGAGATGCTGCAACGTAAGGCTCCTTTGGATCACATAACGTTTGTTGGCCTAATTACTTCCTGCAGTCATGCTGGTCTTGTAGATGAAGGGTCAGAGATTCTCAATACAATGGAAACTAAGTATGGAGTTCCTCTTCGAATGGAGCACTATGCATGTGGTGTTGATCTGTATGGGAGGGCTGGACAGCTTGATAAAGCAAAAAAGCTAATTGATTCTATGCCATTTGAACCAGATGCCATGGTATGGATGACCCTATTGGGTGCTTGCAGAATCCATGGGAATGTGGAACTAGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTTGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCCTTAAGTAAACATATATCACAAATATTATTTTTCTGACCATTTATTTGGTTAGAATTTTGTG-ATTTCTTTTAAGGTAGCATATTTAAATAGTACTATCAAGAGCT] [+] EMBL CB620241 [CTTCTTCCCAGCCGCCATGGCTCCTCCTCCTCCTTCCTCCTCCGTTGCTCTTCGACGATTCAACCCAGCCGCCATGGAGAGCGGAGGGAGGTAGCTGACTAGCTGGGGCTGGGGATTTCCGGCGAACGGAGGTGAGGTTGGTGCCGCTCCGGCCGCTACTTCCGCGACCCAAAGAATCGGCAAGTCCATAGATACCGGACCTCCGCGAATGCCCCGCGGCCATAGACGCCGCCGCCGCTGCGCATGCGCCACCACCACCTCGCCGTCGCCGCCGCGAGGTCCCACGCCTCCCTCCTCAAGTCCGGCTTCGCCGCCCCCACGCCCTGGAACCAGCTCCTCACCGCCTACTCCCGCTCCTCCCCCGATGGCCTCGCCGCCGCGCGCCGGGTGTTCGACGAGGTGCCCCGCCGCGACGAGGTCTCCTGGAACGCGCTCCTCGCCGCACACGCCGCGTCCGGCGCGCACCCGGAAGCATGGCGCCTCCTCCGGGCCATGCACGCGCAGGGGCTCGCTTCCAACACGTTCGCCCTCGGCTCGGCCCTCCGCTCCGCCGCCGTAGCGCGGCGTCCTGCCATCGGCGCCCAACTGCAGTCGCTCGCTTTGAAATCCGGCCTTGCCAACAATGTGTTCGCGGCAAGTGCATTACTTGATGTGTATGCTAAATGTGGCCGCGTGAGGGATGCCCGACAGGTGTTTGATGGAATGCCAGAGCGGAACACTGTTTCTTGGAATGCACTCATTGCCGGGTATACTGAATCTGGGGACATGGCATCTGC ] [+] EMBL AK101199 [ TCCTCCGTTGCTCTTCGACGATTCAACCCAGCCGCCATGGAGAGCGGAGGGAGGTAGCTGACTAGCTGGGGCTGGGGATTTCCGGCGAACGGAGGTGAGGTTGGTGCCGCTCCGGCCGCTACTTCCGCGACCCAAAGAATCGGCAAGTCCATAGATACCGGACCTCCGCGAATGCCCCGCGGCCATAGACGCCGCCGCCGCTGCGCATGCGCCACCACCACCTCGCCGTCGCCGCCGCGAGGTCCCACGCCTCCCTCCTCAAGTCCGGCGTCGCCGCCCCCACGCCCTGGAACCAGCTCCTCACCGCCTACTCCCGCTCCTCCCCCGATGGCCTCGCCGCCGCGCGCCGGGTGTTCGACGAGGTGCCCCGCCGCGACGAGGTCTCCTGGAACGCGCTCCTCGCCGCGCAAGCCGCGTCCGGCGCGCACCCGGAAGCATGGCGCCTCCTCCGGGCCATGCACGCGCAGGGGCTCGCTTCCAACACGTTCGCCCTCGGCTCGGCCCTCCGCTCCGCCGCCGTAGCGCGGCGTCCTGCCATCGGCGCCCAACTGCAGTCGCTCGCTTTGAAATCCGGCCTTGCCAACAATGTGTTCGCGGCAAGTGCATTACTTGATGTGTATGCTAAATGTGGCCGCGTGAGGGATGCCCGACAGGTGTTTGATGGAATGCCAGAGCGGAACACTGTTTCTTGGAATGCACTCATTGCCGGGTATACTGAATCTGGGGACATGGCATCTGCACTGGAGCTGTTTCTTGAGATGGAAAGAGAAGGTTTGGCTCCAGATGAAGCAACATTTGCGTCGCTGCTCACAGCAGTTGAGGGCCCAAGCTGTTTCTTGATGCACCAGTTGCATGGGAAGATTGTGAAGTATGGATCTGCGTTAGGGCTGACAGTGTTGAATGCAGCAATCACTGCATATTCACAATGTGGGTCCCTGAAAGACTCTAGAAGGATCTTTGATGGAATTGGGGACATTAGGGATTTGATCTCATGGAATGCGATGCTTGGAGCTTACACTCACAATGGAATGGACGACGAGGCGATGAAATTCTTTGTTAGGATGATGCAAGAGAGTGGAGTTCATCCTGACATGTATAGTTTCACAAGTATCATAAGTTCATGTTCAGAGCATGGGCATGATGATCATCAAGGGAGAGTAATTCATGGGTTGGTGATCAAGAGTGCTCTGGAAGGAGTCACGCCTGTTTGTAATGCTCTGATTGCCATGTACACTAGGTACAATGAGAATTGCATGATGGAAGATGCATACAAGTGTTTTAACTCTTTGGTGCTTAAGGACACAGTGTCCTGGAATTCTATGCTGACTGGATATTCACAGCACGGTTTGAGTGCCGATGCCTTGAAGTTCTTCAGATGTATGTGTTCGGAAAATGTTAGAACCGATGAGTATGCATTTTCTGCGGCTCTGCGGTCCTCTTCTGAACTTGCTGTGCTTCAGTTAGGTAAACAAATACATGGTTTAGTCATCCATTCTGGTTTTGCTTCCAATGATTTTGTTTCCAGCTCGCTAATCTTCATGTACTCTAAGAGTGGCATTATTGACGATGCACGGAAATCTTTTGAGGAGGCAGATAAGAGTAGTTCAGTGCCTTGGAATGCTATGATATTTGGTTATGCACAACATGGACAAGCTGAAAACGTAGACATACTTTTCAATGAGATGCTGCAACGTAAGGCTCCTTTGGATCACATAACGTTTGTTGGCCTAATTACTTCCTGCAGTCATGCTGGTCTTGTAGATGAAGGGTCAGAGATTCTCAATACAATGGAAACTAAGTATGGAGTTCCTCTTCGAATGGAGCACTATGCATGTGGTGTTGATCTGTATGGGAGGGCTGGACAGCTTGATAAAGCAAAAAAGCTAATTGATTCTATGCCATTTGAACCAGATGCCATGGTATGGATGACCCTATTGGGTGCTTGCAGAATCCATGGGAATGTGGAACTAGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTGGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCCTTAAGTAAACATATATCACAAATATTAT ] [-] EMBL CB620242 [ CAATGAGATGCTGCAACGTAAGGCTCCTTTGGATCACATAACGTTTGTTGGCCTAATTACTTCCTGCAGTCATGCTGGTCTTGTAGATGAAGGGTCAGAGATTCTCAATACAATGGAAACTAAGTATGGAGTTCCTCTTCGAATGGAGCACTATGCATGTGGTGTTGATCTGTATGGGAGGGCTGGACAGCTTGATAAAGCAAAAAAGCTAATTGATTCTATGCCATTTGAACCAGATGCCATGGTATGGATGACCCTATTGGGTGCTTGCAGAATCCATGGGAATGTGGAACTAGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTTGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCGGTAAGTAAACATATATCACAAATATTATTTTTCTGACCATTTATTTGGTTAGAATTTTGTG ATTTCTTTTAAGGTAGCATATTTAAA ] [+] EMBL CA765212 [ TGGGTGCTTGCAGAATTCATGGGAATGTGGAACTNGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTTGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCCTTAAGTAAACATATATCACAAATATTATTTTTCTGACCATTTATTTGGTTAGAATTTTGTGTATTTCTTTGCACCTAGCATATTTAAATAGTACTATCAAGAGCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||