These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7527#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1466 fasta sequence [GAGATCATATTTAGCTATATCTCTAGCTAGCTGCGTCTCGTCTTCTCCAAGCTATTGTTACTTAGCTAGCTTTAGCTAGGAGAGTAAAAGATCGAGTGATCATTAGTGAGTTTGATTAGTTGATTTTGTTGGGGTTGAGATCGAAGAGATCGATGGCCGGGCTGAGGGAGATGGAGTCGACGCTGCCGCCGGGGTTCAGATTCTGCCCCAGCGACGAGGAGCTCATCTGCTTCTACCTCCGCAACAAGGTCGCCAACCACCGCGTCGCCTCCGGCACCCTCGTCGACGTCGACCTTCACGCCCGCGAGCCATGGGAGCTTCCCGAGGTGGCTAAGCTCACTGCAGAGGAGTGGTACTTCTTCAGCTTCAGAGACCGGAAATATGCGACAGGGTCACGGACGAACCGTGCGACCAAGACAGGTTACTGGAAGGCCACGGNGAAGGACCGGATTGTCCATGAGGGTACAACACGAGCGGTGGTCGGGATGAGGAAGACGCTGGTTTTTTACCTCGGCCGTGCCCCTAATGGGCAAAAGACGACATGGGTCATGCATGAGTTCCGCCTTGAAACACCTAACTCCCAACCTAAGGAGGATTGGGTGCTATGTAGGGTGTTTGACAAGAAGAAGCCATCGACAATAGAAGCCGAGGGTGGCGGAAGCAGTGGCAGCGACCTTTTCATTCCCGGTGCCACCGATGGCTCTACTGACCCCTCCTCGCCGACGACGATGGCACCTCTCCTTGGCTCATCGCCCGATCCGACAGTGGTGGACAGGTTCGACCACCGGTCAGCGGCGGTGCCACCATTAATGGTACTCATGCAAGGTGGTGGGGACCAAATGATCAGTGGTAGCGGTGTCCACTGCAGCAACAACGACAACTCCGGTAGTAGCAGCGCACTGCTTAACCTGACGATGCTGCAATACAGCTTCCTAGAACATCGGCCAACTGGTGACGACATGGCGGTGGGGGCCCACTTTGGAACATGCCAGGGTGGCAACAACGATGCCACGATGGCACTTGGGATGGGGTTTGAGGAGCATGGCATGGGAGAGATCATAGAGATGGAACCAGCATGGCGCCAAGGTGGTAGCAACTGCGTGTACAGGGACGAGCTCTACTTCTAGCAGAAGTAGTACAATGGATTAATATTAATGATTTGCATGTGTTAGAGTTCAGTTAAATTCAGAAAATATGTAGAGCTTAGAAGAGGTTTGCTAGTTTGTGATTAGAGTGTGATTATTAATTAAGGTGGAGTT-AATTAAGGGGTCGATTAGTTCGAGTGGTCGTGATATGAAAATATTTGTGTAATTACTCAGTTTGTAGGTGAGCCATATATCAAACAACTTTAGGGAAAGGGGATGATCAAGAATTCAGAACCAGGATGAATTTGATATTCTTGTACTTTAAAAAATGTAATGAT-GGGAATAATATTTAAATCTGATTGAGCCAAGCTCTTCAAAAAA] [+] EMBL CF279719 [GAGATCATATTTAGCTATATCTCTAGCTAGCTGCGTCTCGTCTTCTCCAAGCTATTGTTACTTAGCTAGCTTTAGCTAGGAGAGTAAAAGATCGAGTGATCATTAGTGAGTTTGATTAGTTGATTTTGTTGGGGTTGAGATCGAAGAGATCGATGGCCGGGCTGAGGGAGATGGAGTCGACGCTGCCGCCGGGGTTCAGATTCTGCCCCAGCGACGAGGAGCTCATCTGCTTCTACCTCCGCAACAAGGTCGCCAACCACCGCGTCGCCTCCGGCACCCTCGTCGACGTCGACCTTCACGCCCGCGAGCCATGGGAGCTTCCCGAGGTGGCTAAGCTCACTGCAGAGGAGTGGTACTTCTTCAGCTTCAGAGACCGGAAATATGCGACAGGGTCACGGACGAACCGTGCGACCAAGACAGGTTACTGGAAGGCCACGGNGAAGGACCGGATTGTCCATGAGGGTACAACACGAGCGGTGGTCGGGATGAGGAAGACGCTGGTTTTTTACCTCGGCCGTGCCCCTAATGGGCAAAAGACGACATGGGTCATGCATGAGTTCCGCCTTGAAACACCTAA ] [+] EMBL AK119558 [ TCATATTTAGCTATATCTCTAGCTAGCTGCGTCTCGTCTTCTCCAAGCTATTGTTACTTAGCTAGCTTTAGCTAGGAGAGTAAAAGATCGAGTGATCATTAGTGAGTTTGATTAGTTGATTTTGTTGGGGTTGAGATCGAAGAGATCGATGGCCGGGCTGAGGGAGATGGAGTCGACGCTGCCGCCGGGGTTCAGATTCTGCCCCAGCGACGAGGAGCTCATCTGCTTCTACCTCCGCAACAAGGTCGCCAACCACCGCGTCGCCTCCGGCACCCTCGTCGACGTCGACCTTCACGCCCGCGAGCCATGGGAGCTTCCCGAGGTGGCTAAGCTCACCGCAGAGGAGTGGTACTTCTTCAGCTTCAGAGACCGGAAATATGCGACAGGGTCACGGACGAACCGTGCGACCAAGACAGGTTACTGGAAGGCCACGGGGAAGGACCGGATTGTCCATGAGGGTACAACACGAGCGGTGGTCGGGATGAGGAAGACGCTGGTTTTTTACCTCGGCCGTGCCCCTAATGGGCAAAAGACGACATGGGTCATGCATGAGTTCCGCCTTGAAACACCTAACTCCCAACCTAAGGAGGATTGGGTGCTATGTAGGGTGTTTGACAAGAAGAAGCCATCGACAATAGAAGCCGAGGGTGGCGGAAGCAGTGGCAGCGACCTTTTCATTCCCGGTGCCACCGATGGCTCTACTGACCCCTCCTCGCCGACGACGATGGCACCTCTCCTTGGCTCATCGCCCGATCCGACAGTGGTGGACAGGTTCGACCACCGGTCAGCGGCGGTGCCACCATTAATGGTACTCATGCAAGGTGGTGGGGACCAAATGATCAGTGGTAGCGGTGTCCACTGCAGCAACAACGACAACTCCGGTAGTAGCAGCGCACTGCTTAACCTGACGATGCTGCAATACAGCTTCCTAGAACATCGGCCAACTGGTGACGACATGGCGGTGGGGGCCCACTTTGGAACATGCCAGGGTGGCAACAACGATGCCACGATGGCACTTGGGATGGGGTTTGAGGAGCATGGCATGGGAGAGATCATAGAGATGGAACCAGCATGGCGCCAAGGTGGTAGCAACTGCGTGTACAGGGACGAGCTCTACTTCTAGCAGAAGTAGTACAATGGATTAATATTAATGATTTGCATGTGTTAGAGTTCAGTTAAATTCAGAAAATATGTAGAGCTTAGAAGAGGTTTGCTAGTTTGTGATTAGAGTGTGATTATTAATTAAGGTGGAGTT AATTAAGGGGTCGATTAGTTCGAGTGGTCGTGATATGAAAATATTTGTGTAATTACTCAGTTTGTAGGTGAGCCATATATCAAACAACTTTAGGGAAAGGGGATGATCAAGAATTCAGAACCAGGATGAATTTGATATTCTTGTACTTTAAAAAATGTAATGAT GGGAATAATATTTAAATC ] [+] EMBL CA765299 [ TGCGTGTACAGGGACGAGCTCTACTTCTAGCAGAAGTAGTACAATGGATTAATATTAATGATTTGCATGTGTTAGAGTTCAGTTAAATTCAGAAAATATGTAGAGCTTAGAAGAGGTTTGCTAGTTTGTGATTAGAGTGTGATTATTAATTAAGGTGGAGTTGAATTAAGGGGTCGATTAGTTCGAGTGGTCGTGATATGCAAATATTTGTGTAATTACTCAGTTTGTAGGTGAGCCATATATCAAACAACTTTAGGGAAAGGGGATGATCAAGAATTCAGAACCAGGATGAATTTGATATTCTTGTACTTT AAGATTGTAATGAT GGGAATAATATTTAAATCTGAT ] [-] EMBL CF279720 [ GTACAATGGATTAATATTAATGATTTGCATGTGTTAGAGTTCAGTTAAATTCAGAAAATATGTAGAGCTTAGAAGAGGTTTGCTAGTTTGTGATTAGAGTGTGATTATTAATTAAGGTGGAGTT AATTAAGGGGTCGATTAGTTCGAGTGGTCGTGATATGAAAATATTTGTGTAATTACTCAGTTTGTAGGTGAGCCATATATCAAACAACTTTAGGGAAAGGGGATGATCAAGAATTCAGAACCAGGATGAATTTGATATTCTTGTACTTTAAAAAATGTAATGATGGGGAATAATATTTAAATCTGATTGAGCCAAGCTCTTCAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||