Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7599 cluster # 7599       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7599#0 length = 1766 sequences # 5  

consensusID : consensus_7599#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1766
fasta sequence
                              [TATATTTATCCCCGTCTCCGCGCTCGTCTCGGCTCCTTCTTTGCCCACTTCCTGCCGCCGATTTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTAACGAGGATTACATCATTAACCATCTCAGGTTCAAGGTCTTGGTCCATCAGTACCAGGCGCAGGGTGATGTTGTGATCACCAGTGAGGATGGCGTTGCCATGGTGGAGTCGGATCGCAAGAGCGGATTCCAGATTGTTGGCTTCGAGGTTGTGCCTTGCAGTGTGAGGCGTGATCCTGAGGCGATGTCCAAGCTGAAGATGTATGACAAGGTTGATTCTGTCAAGTGCCCATTGGAGCTTGAGAAATCTCAGGCTATCCGTGAGAACGAGAGGATTACATTCACCTATGACGTTGAGTATGTTAAGAGCAACATTAAGTGGCCATCAAGGTGGGATGCATACTTGAAAATGGATGGTGCCAAGGTTCACTGGTTCTCGATCATGAACTCGATGATGGTTGTCTTCTTCTTGGCTGGTATCGTGTTTGTCATATTCTTGAGGACTGTCCGTAGGGATCTGACACGGTATGAGGAGATGGACAAGGAGGCGCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCAGGATGGAAACTTGTGGTTGGTGATGTCTTCAGAGAGCCTTGCTGCTCAAAGCTGCTATGTGTTATGGTCGCTGATGGTATCCAGATCACTGGTATGGCAGTGGTTACAATTGTCTTTGCTGCTCTGGGTTTCCTCTCACCTGCTTCAAGGGGAATGCTCTTGACCGGAATGATCATCCTGTACCTCTTCCTTGGAATTATCGCTGGATATGTCGGTGTCCGTGTTTGGAGGACAATCAAAGGAACCTCAGAAGGGTGGAAATCTGTTGCTTGGCTGACCTCCTGCTTCTTCCCTGGCATTGTTTTCGTTATCCTGACTGTGCTGAACTCCATCCTGTGGGGCAAGAAGAGCACTGGAGCTTTACCTATCTCACTGTTTTTCACACTCCTGGCCCTGTGGTTCTGCATCTCAGTTCCACTCACACTTATTGGAGGTTTGCTGGGTACACGTGCTGCAAGCATAGAGTACCCTGTCCGTACCAACCAAATTCCACGAGAGATCCCTGAGCGCAAGTTCCCGTCATGGCTGCTTGTTTTGGGTGCTGGAACATTGCCCTTTGGCACCCTCTTCATTGAGCTTTTCTTCATCCTGTCTAGCATTTGGTTGGGGAGGTTCTACTACGTCTTTGGCT]

[+] EMBL CB638313             [TATATTTATCCCCGTCTCCGCGCTCGTCTCGGCTCCTTCTTTGCCCACTTCCTGCCGCCGATTTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCATCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAATATCGCCTATAACCCTGGCGAGATCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AK100711             [               CTCCGCGCTCGTCTCGGCTCCTTCTTTGCCCACTTCCTGCCGCCGATTTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTAACGAGGATTACATCATTAACCATCTCAGGTTCAAGGTCTTGGTCCATCAGTACCAGGCGCAGGGTGATGTTGTGATCACCAGTGAGGATGGCGTTGCCATGGTGGAGTCGGATCGCAAGAGCGGATTCCAGATTGTTGGCTTCGAGGTTGTGCCTTGCAGTGTGAGGCGTGATCCTGAGGCGATGTCCAAGCTGAAGATGTATGACAAGGTTGATTCTGTCAAGTGCCCATTGGAGCTTGAGAAATCTCAGGCTATCCGTGAGAACGAGAGGATTACATTCACCTATGACGTTGAGTATGTTAAGAGCAACATTAAGTGGCCATCAAGGTGGGATGCATACTTGAAAATGGATGGTGCCAAGGTTCACTGGTTCTCGATCATGAACTCGATGATGGTTGTCTTCTTCTTGGCTGGTATCGTGTTTGTCATATTCTTGAGGACTGTCCGTAGGGATCTGACACGGTATGAGGAGATGGACAAGGAGGCGCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCAGGATGGAAACTTGTGGTTGGTGATGTCTTCAGAGAGCCTTGCTGCTCAAAGCTGCTATGTGTTATGGTCGCTGATGGTATCCAGATCACTGGTATGGCAGTGGTTACAATTGTCTTTGCTGCTCTGGGTTTCCTCTCACCTGCTTCAAGGGGAATGCTCTTGACCGGAATGATCATCCTGTACCTCTTCCTTGGAATTATCGCTGGATATGTCGGTGTCCGTGTTTGGAGGACAATCAAAGGAACCTCAGAAGGGTGGAAATCTGTTGCTTGGCTGACCTCCTGCTTCTTCCCTGGCATTGTTTTCGTTATCCTGACTGTGCTGAACTCCATCCTGTGGGGCAAGAAGAGCACTGGAGCTTTACCTATCTCACTGTTTTTCACACTCCTGGCCCTGTGGTTCTGCATCTCAGTTCCACTCACACTTATTGGAGGTTTGCTGGGTACACGTGCTGCAAGCATAGAGTACCCTGTCCGTACCAACCAAATTCCACGAGAGATCCCTGAGCGCAAGTTCCCGTCATGGCTGCTTGTTTTGGGTGCTGGAACATTGCCCTTTGGCACCCTCTTCATTGAGCTTTTCTTCATCCTGTCTAGCATTTGGTTGGGGAGGTTCTACTACGTCTTTGGCT]
[+] EMBL CB646453             [                                                              TTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTAACGAGGATTACATCATTAACCATCTCAGGTTCAAGGTCTTGGTCCATCAGTACCAGGCGCAGGGTGATGTTGTGATCACCAGTGACGATGGCGTTGCCATGGTGGAGTCGGATCGCAAGAGCGGATTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB638096             [                                                                                AGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGGAATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGTGAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACACCCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCCCTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGAGAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGTCAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGAGCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCCGGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGGGTACAACCCGATGGGGAGTCACGAGGATTACATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL OSR22321B            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGGCGATGTCCAAGCTGAAGATGTATGACAAGGTTGATTCTGTCAAGTGCCCATTGGAGCTTGAGAAATCTCAGGCTATCCGTGAGAACGAGAGGATTACATTCACCTATGACGTTGAGTATGTTAAGAGCAACATTAAGTGGCCATCAAGGTGGGATGCATACTTGAAAATGGATGGTGCCAAGGTTCACTGGTTCTCGATCATGAACTCGATGATNGTTGTCTTCTTCTTGGCTGGTATCGTGTTTGTCATATTCTTGAGGACTGTCCGTAGGGATCTGACACGGTATGAGGAGATGGACAAGGAGGCGCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCAGGATGG AACTTGTGGTTGGTGATGTCTTCAGAGAGCCTTGCTGCTCAAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_7599#0 TATATTTATCCCCGTCTCCGCGCTCGTCTCGGCTCCTTCTTTGCCCACTTCCTGCCGCCG ATTTTGCATCTCGCGAGCAGAGCAGGGCGCGCGGCTGCTTCCGCCACATCCTGGGGGTGG AATGCTTGCCAAGATGCAGTCGTGCCGATGGATCTTGGCTTACTTGCTCGTCGTTCTCGT GAGCCTGCACGGTGGTGCCAATGGCTTCTACCTCCCGGGCACATTCATGCACACCTACAC CCCAAATGAGGTGATCTCAGCCAAGGTCAACTCGCTCACCTCCATTGAGACTGAGTTGCC CTTCAGCTACTACAGCTTGCCCTACTGTAAGCCCCCGGAAGGCGTCAAGAAGAGCGCCGA GAACCTCGGCGAGATCCTCATGGGTGATCAGATCGACAATTCGCCATACCGGTTCCGAGT CAACGTGAACGAGTCCGTGTACCTATGCACCACGGACCCACTCACCAAGGAGCAGGCCGA GCTGTTGAAGAAGCGGGCGCGAGATCTGTACCAGGTCAACATGATCCTTGACAATCTGCC GGTCATGCGATTCACCGAGCAGAATGGGGTGACTATCCAGTGGACCGGATTCCCGGTCGG GTACAACCCGATGGGGAGTAACGAGGATTACATCATTAACCATCTCAGGTTCAAGGTCTT GGTCCATCAGTACCAGGCGCAGGGTGATGTTGTGATCACCAGTGAGGATGGCGTTGCCAT GGTGGAGTCGGATCGCAAGAGCGGATTCCAGATTGTTGGCTTCGAGGTTGTGCCTTGCAG TGTGAGGCGTGATCCTGAGGCGATGTCCAAGCTGAAGATGTATGACAAGGTTGATTCTGT CAAGTGCCCATTGGAGCTTGAGAAATCTCAGGCTATCCGTGAGAACGAGAGGATTACATT CACCTATGACGTTGAGTATGTTAAGAGCAACATTAAGTGGCCATCAAGGTGGGATGCATA CTTGAAAATGGATGGTGCCAAGGTTCACTGGTTCTCGATCATGAACTCGATGATGGTTGT CTTCTTCTTGGCTGGTATCGTGTTTGTCATATTCTTGAGGACTGTCCGTAGGGATCTGAC ACGGTATGAGGAGATGGACAAGGAGGCGCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCAGGATG GAAACTTGTGGTTGGTGATGTCTTCAGAGAGCCTTGCTGCTCAAAGCTGCTATGTGTTAT GGTCGCTGATGGTATCCAGATCACTGGTATGGCAGTGGTTACAATTGTCTTTGCTGCTCT GGGTTTCCTCTCACCTGCTTCAAGGGGAATGCTCTTGACCGGAATGATCATCCTGTACCT CTTCCTTGGAATTATCGCTGGATATGTCGGTGTCCGTGTTTGGAGGACAATCAAAGGAAC CTCAGAAGGGTGGAAATCTGTTGCTTGGCTGACCTCCTGCTTCTTCCCTGGCATTGTTTT CGTTATCCTGACTGTGCTGAACTCCATCCTGTGGGGCAAGAAGAGCACTGGAGCTTTACC TATCTCACTGTTTTTCACACTCCTGGCCCTGTGGTTCTGCATCTCAGTTCCACTCACACT TATTGGAGGTTTGCTGGGTACACGTGCTGCAAGCATAGAGTACCCTGTCCGTACCAACCA AATTCCACGAGAGATCCCTGAGCGCAAGTTCCCGTCATGGCTGCTTGTTTTGGGTGCTGG AACATTGCCCTTTGGCACCCTCTTCATTGAGCTTTTCTTCATCCTGTCTAGCATTTGGTT GGGGAGGTTCTACTACGTCTTTGGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)