These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7615#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 840 fasta sequence [TAGCCTATACGGCTCCTCTATGATCAGAAAAAAGGAAAGTACTGTTTCATTTCGTTATTATCTTCTTGGGCGTACTTAGAATTATCTAAGATAAAATCGATTTCAACGTCCTAAATTAGACCAAAGGAATTCTGTCTGCTAGAATAATAAAAAACGCTTCGGAATTCATCTCATCCTTTATAATATAATGGTACTTTTTCTTTGTTCAGCAATAACTTAATCTTGGAATAAAACACTCGTTATAAC-AATTAATAAACGAAAAGAGTTGGGTATTAGTTCATGAAGAATTCTGTATGAATATGGATAAACGACGGAAAGAATAAATAAAGATCTTTTTTTTTGTATTGCATTCCATATCTTTTGTCCTA-TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA-TTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAAC-TTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTATTGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATAGGAAATGAGATTTTTTTCTTTTACTACAAATT-ATAAGCAGTTTTGTTTCACTCATATAGCTATCTAGTTTAACT] [+] EMBL CB630693 [TAGCCTATACGGCTCCTCTATGATCAGAAAAAAGGAAAGTACTGTTTCATTTCGTTATTATCTTCTTGGGCGTACTTAGAATTATCTAAGATAAAATCGATTTCAACGTCCTAAATTAGACCAAAGGAATTCTGTCTGCTAGAATAATAAAAAACGCTTCGGAATTCATCTCATCCTTTATAATATAATGGTACTTTTTCTTTGTTCAGCAATAACTTAATCTTGGAATAAAACACTCGTTATAAC AATTAATAAACGAAAAGAGTTGGGTATTAGTTCATGAAGAATTCTGTATGAATATGGATAAACGACGGAAAGAATAAATAAAGATCTTTTTTTTTGTATTGCATTCCATATCTTTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA TTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAACTTTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTATTGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATAGGAAATGAGATTTTTTTCTTTTACTACAAATT ATAAGCAGTTTTGTTTCACTCATATAGCTATCTAGTTTAACT] [+] EMBL BI801659 [ TGGAATAAAACACTCGTTATAACAAATTAATAAACGAAAAGAGTTGGGTATTAGTTCATGAAGAATTCTGTATGAATATGGATAAACGACGGAAAGAATAAATAAAGATCTTTTTTTTTGTATTGCATTCCATATCTTTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAA ] [-] EMBL BI800833 [ TTTTGTA TGCATTCCATATC TTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA TTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAAC TTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTA TGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATAGGAAATGAGATTTTTTCTTTTTACTACAAATTAATAAGCAG TTTGTTTCACTC ] [-] EMBL BI803588 [ TTTTTTA TGCATTCCATATC TTTGTCCTAGTTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGAATAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGAAGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAAGTTTCAAGTCCTTATTATGATTCCTTTTATGAGGAAAAATATCTAATGCTTTAGATTCCCTCATTACTAATCCTTTATGTACTTTAGTGTTTCTAATCCCTCACTAAC TTTGATGGATTCCCTTATGATTACAACTTTCTGTATCGGGAATCCCTTATTATTGCCCGCTTCAAGATATGATGACTAATCAAAAAATCTCAACCTTGGGGTAAAGAATTTACACCGCTTATGTTTACTTCCATTTTTTCTTGTACATA ] [-] EMBL AU078639 [ TATNGCATNCCATATCTTTTGTCCTA TTCTTCTTTCCCCGAGGGGTATTTAAAAAGAAAAAAGGNCTAAAGGGTTAATTCGTTCTTGATAGCCATTTCCTTAACAAGTGAATGGGAACATACTCTGGATCGGAATCCGNNGAAAGTACTACTTGCTCATTTCCACCAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||