These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7662#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 446 fasta sequence [GCCTTCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATGCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGGCTGAACTAAGGGTGGTTGGNTGGTTNCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL C22424 [GCCTTCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATGCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTNTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGGCTGAACTAAGGGNGGTT ] [+] EMBL C22350 [ TCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTNTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATNCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGGCTGAACTAAGNGTGGTTGGNTGGTTNCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL C22461 [ TCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATNCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAAAAAAA ] [-] EMBL CB654211 [ CCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATGCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACCCCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTC TTTTTTTTTTGGCTTTTTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGTTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTTTAATTTTCCCAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTTTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGTTTAAAGGAAGAGTGGTTGGATGGTTgt ] [+] EMBL CF328294 [ TTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTATAACCTGTAAATATGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTCACGCCCTCTAATTTTCACAGTGGACTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||