These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7666#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1731 fasta sequence [TCCTACTCAGCCTACCAATCCCATCTTTCTCTCCCACTATGCCGGATTCATCTTCATATTCAGATGATTCCGATGAACTAGCCCCATCAAACATTATGGAGCAATATGTTGCTGAGCGGGGGGGTTCTAGACTCCTTTGCTAGGAGGCTCACTATAAAGATCAAGGCTAGTCTCTCAGTTGGGGTATCTTGGAGACGGAGTGGTCCAAGGAAGTGCATTTAGAGGGATCATGCTGCTGCTCATCAGCGTCTTGTGGAGGACTACTTCGCTGCAGAACCACTCTACACTAAGAGTATGTTTCGTACAAGATTCCGTATGAATAGACGCCTCTTCCTACGCATTGTGAATGCCCTTGGTCAGTGTTCTCCCTATTTCACTTATAGGGTAGATTGTACTGGTCGAATAGGGCTTTCACCACTGCAAAAGTGTACAGCAGCCATGCGCATGCTGGCATATGGCACTCCTGCAGATGCCCTTGATGAGTACTTGAAGATTGGGAAGTGTACTTCATTAGAGTGCTTGGATAGGTTTACACGGGGGGTGATTGAGGTGTTCGGTGGGGAGTACTTGCGACGCCCCACATCCTCGGATGTTGAGCGTCTACTTCAGGTCAACGAGTCTCGTGGTTTTTCTGGAATGTTAGGAAGTATAGATTGCATGCACTGGCGTTGGGAGAAGTGTCCTTTAGCATGGAGGGGGCAATTCACCCGTGGTGATTATGGAGTACCAACAATAGTCCTAGAAGCTGTTGCTTCCCAGGACTTGCATATTTGGCATGCTTTCTTTGGAGTTGCTGGGTCAAACAATGACCTTAATGTGCTGAACCAGTCCCCATTGTTTTTTGATGCATTGAAAGGAGAAGCCCCGCAAGTTCAGTTTTCAGTCAATGGGAATGAGTATGGAACAGGTTATTACCTTGCTGATGGTATATATCCAGAATGGGCTGCCTTCATGAAGACCATACCTCTTCCCCAAACTGAGAAGCATAAGTTGTTTGCCAAGCACCAAGAAGGGGCAAGGAAAGATGTGGAGCGTGCTTTTGGGGTGTTGCAGTCCCGATTTACCATTGTCCGTCGGCCTGCACGATTGTGGAGGCGGAAGAGTGTTGGGAGGATCATGCTAGCTTGTGTGATTCTCCACAACATGATAGTCGAAGATGAGAGAGAGGAAGCTACCATTCATATTGACTTGAATGAGAATCCAGGGGCATCGTTTGCGCTGCCTCCTGAAGTGAATATAGGTGGTAATCTGTGTTTTGCTGATGTGATGCGCAAAAAAGCTACTGTCCGTTCTCGTCCACAACACACCCAACTTAAAAATGATTTGGTCGAGCACATTTGGCATAAGTTTGGAGATAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTACGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGTTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCAGTACTTTTGGTTAATGTTTTCAGAAAGACTCATGTAATGTTTTAAGCGCCGGTGTCATGGTGCTCAAATCTCATCATATCATGCGTGCAATGTTGCTTGAAAATTATTTGCTATCTGATCATTGAGATGAATATTGTTGCCTGAAAAA] [+] EMBL CF328089 [TCCTACTCAGCCTACCAATCCCATCTTTCTCTCCCACTATGCCGGATTCATCTTCATATTCAGATGATTCCGATGAACTAGCCCCATCAAACATTATGGAGCAATATGTTGCTGAGCGGGGGGGTTCTAGACTCCTTTGCTAGGAGGCTCACTATAAAGATCAAGGCTAGTCTCTCAGTTGGGGTATCTTGGAGACGGAGTGGTCCAAGGAAGTGCATTTAGAGGGATCATGCTGCTGCTCATCAGCGTCTTGTGGAGGACTACTTCGCTGCAGAACCACTCTACACTAAGAGTATGTTTCGTACAAGATTCCGTATGAATAGACGCCTCTTCCTACGCATTGTGAATGCCCTTGGTCAGTGTTCTCCCTATTTCACTTATAGGGTAGATTGTACTGGTCGAATAGGGCTTTCACCACTGCAAAAGTGTACAGCAGCCATGCGCATGCTGGCATATGGCACTCCTGCAGATGCCCTTGATGAGTACTTGAAGATTGGGAAGTGTACTTCATTAGAGT ] [+] EMBL AK106574 [ ACGGAGTGGTCCAAGGAAGTGCATTTAGAGGGATCATGCTGCTGCTCATCAGCGTCTTGTGGAGGACTACTTCGCTGCAGAACCACTCTACACTAAGAGTATGTTTCGTACAAGATTCCGTATGAATAGACGCCTCTTCCTACGCATTGTGAATGCCCTTGGTCAGTGTTCTCCCTATTTCACTTATAGGGTAGATTGTACTGGTCGAATAGGGCTTTCACCACTGCAAAAGTGTACAGCAGCCATGCGCATGCTGGCATATGGCACTCCTGCAGATGCCCTTGATGAGTACTTGAAGATTGGGAAGTGTACTTCATTAGAGTGCTTGGATAGGTTTACACGGGGGGTGATTGAGGTGTTCGGTGGGGAGTACTTGCGACGCCCCACATCCTCGGATGTTGAGCGTCTACTTCAGGTCAACGAGTCTCGTGGTTTTTCTGGAATGTTAGGAAGTATAGATTGCATGCACTGGCGTTGGGAGAAGTGTCCTTTAGCATGGAGGGGGCAATTCACCCGTGGTGATTATGGAGTACCAACAATAGTCCTAGAAGCTGTTGCTTCCCAGGACTTGCATATTTGGCATGCTTTCTTTGGAGTTGCTGGGTCAAACAATGACCTTAATGTGCTGAACCAGTCCCCATTGTTTTTTGATGCATTGAAAGGAGAAGCCCCGCAAGTTCAGTTTTCAGTCAATGGGAATGAGTATGGAACAGGTTATTACCTTGCTGATGGTATATATCCAGAATGGGCTGCCTTCATGAAGACCATACCTCTTCCCCAAACTGAGAAGCATAAGTTGTTTGCCAAGCACCAAGAAGGGGCAAGGAAAGATGTGGAGCGTGCTTTTGGGGTGTTGCAGTCCCGATTTACCATTGTCCGTCGGCCTGCACGATTGTGGAGGCGGAAGAGTGTTGGGAGGATCATGCTAGCTTGTGTGATTCTCCACAACATGATAGTCGAAGATGAGAGAGAGGAAGCTACCATTCATATTGACTTGAATGAGAATCCAGGGGCATCGTTTGCGCTGCCTCCTGAAGTGAATATAGGTGGTAATCTGTGTTTTGCTGATGTGATGCGCAAAAAAGCTACTGTCCGTTCTCGTCCACAACACACCCAACTTAAAAATGATTTGGTCGAGCACATTTGGCATAAGTTTGGAGATAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTATGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGTTGTTCAGCTCAGTAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCAGTACTTTTGGTTAATGTTTTCAGAAAGACTCATGTAATGTTTTAAGCGCCGGTGTCATGGTGCTCAAATCTCATCATATCATGCGTGCA ] [+] EMBL CF328371 [ ATAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTACGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGCTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGC ] [-] EMBL CF328372 [ TAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTACGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGCTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCA ] [-] EMBL CF328090 [ CCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGTTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCAGTACTTTTGGTTAATGTTTTCAGAAAGACTCATGTAATGTTTTAAGCGCCGGTGTCATGGTGCTCAAATCTCATCATATCATGCGTGCAATGTTGCTTGAAAATTATTTGCTATCTGATCATTGAGATGAATATTGTTGCCTGAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||