These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7686#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 2855 fasta sequence [TCCCTCCTCCCCTGAAGAAGTCGAAACCCTCCCACCGCCGGTGGGCGGTGGCGGCAAGCCGGCAACGGCGGAATCCACCCTCCTCCGGCGGCGCTGGCTGAAGACGACAGCCATGCCTACCTACCTGCCTTCCTGCCTTTCCCCTCCCTTTCTCCCCTAGCTAGGGGAATGTGCGAGAGCAGTCTAGACTCTAGAGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTTTTCTCCTCGTCCAGGTTCTCACGGCGAAATTCCGCTCCTCCTTTTTGTGCCTGCGACGAGCACTCCCGTATCGCGAATGGATTGGCTGGTTTTCTGGGTTCCTTCAGTGAAAAATCTGGCCGTGTAGGTGTCGAAGGCCAGAGATTATCGAAGTTTTTGTGTTTTGGTCTTGTGAATTTTGCGAAGGTAAACCTCATATATCTCTGATGGGATTGATGTATGTCTGGGGAATGCTTCTTATATTTGGCATGATTCTCATTATCTAATTTTTTTTTGGCATGATTCTGATTTCTGAGACCTTGAATTGACGATAACTTTCCCAGATTAATGTTGGGATTTGCAGTAGTATTACAAGACATGTTAAACATATTAAGTACTAGCATGATACTGGTAGGAATTGAAGGCTCATGGCCCTAACATGAGCATGATATATATTCACCCATTTCACCCGTATCAGTTTCAGCTTTGGAATCAGGATACTGTGGTAGTTTTGATGGTGTTCTTACATAACTTGCCTGCGCATGGAGCATGTCTCGATCCTTACTATTGTCGATTTAATTTTTCCTGTTGCAACATGAACTCAAAGCCTAGGATCTAGAACAAAATTATCATCTATTTCTGTTTTGTTATGAATATAACTGTGCCATTGTTCTTCCTATGCTCGACTCCAGAATGAAAAAGATAAGTTGCATTGACTAAAATCTCACTGAATACGGTGCCCGAAAAAACTGTTCACATGACCTCCTGATTAAAGACGAAAAATATACACCTAAAGCCAACAGTTTGCAGAAATATTTATTAATGTTTCTCTTGAATGAAAATACAATAACTCCTTAAAGTCGTCCTGGATGGATCACTGATGAAGATAATACTACCGAGGTACCTTCTCAATTTTCAAATAGAAATGAACTTTTAAACCTATTTCCCCCCAATGAACAAGAGGTTTTACTGCCTGATATTATGTCAACACCTGCTTAATGGCTAATTCTGCTCCTGTTAAGTTGAAGGTGAACTACCAGTGTAAGTGAACTGTCTGCTTAAGAATCCCAAATGGGTTTTTCCAATGCAGTGGGGTCAAGAGATGACTGATGGTAAGAGTAGATATGTTCCTGAGGTTTCTCCTGCTCATCAGAATAGCTTAATGCTGTCACATCCGCGTTGGAAAATGCTAGGGTTATCCTTTTCTTCTCTCATGGAAAATGGATGGTTCATTAGTCCAATTAAAGGCACAGTACCTGGCCTCATGATGCCACTGGACCACGGTGCGTTGATCAGAATATTACCACGGCCAATCATCACAAGTTTCTTAGTTCATGGCTAAAACGGCACTGCACAAGAACATATTGAGTTTCCAGTTCTGAGGATCAGAGGTGCTAAAAAGCCAGGTGTAACCAAGAAACACAATTATTGTTTTGAGCATTGCTTTGATGCATTTATTATGTCACTTGCACAGTTGCACGTGTGCTCATGAAATCAGACAATTATCACTCGAAATAATGAGGAAAGATCGAAGGGACGTACCTGGGTTTCCTGGGTGACCTCGTCTCTTCTTCACCACAGGCATGACAGTGTCACCTTTGCTTGATCCAGCAGCGCACGCCTCTAGCTTCGGTTGCTGCTGGAGGTTGTTCAAGGATTCTTCCTCTGATGTGTGTGACATTGTTTGGAGGCTCAGTTAGTGGTTTTAGAGGGTGCCAGTAAAGTGAGGAGGGTTGATGATTTATGCACAACAGAGTGGAGGGACTACAACTGGACAATAGGGAAATGGTGAATTCCCTTTCAGTCACCATCAAGGACTGCAACCATTAGTTTTAAATCTGAGGAACACGACGCTGATTGTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTGGGGATCTCAAAGAAAACACTTCACTGCAGACAGTAAATCTGTGCTACTGGACCTTTATTTTTCTCCTGCTGTGAGTATAAATCTGAACACCTTGTAACTATCGACACGAGGATGGAATTCATGTCATATTTCACCGCAGGTGGAACAATGGCTGTGAAGAGCAGGCAGGAGGCGGTTTTGTCGGTACAAGGAAGGTGATGGATATGACAAGGGGGAGATCCGGGAGGAGAGACAAACTCTGGCCATGTTCTTTTTCTAACCGGCATCCATGGTATCTCCCTCCTCTGCTGGCACAACTGTCAGACTTGCTCTTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGGTGGTACCTGGGGGCTTTGAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGCTGGAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCACCGATTTGGCTACTTCTAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAGAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGT-TAGTTTAAGTACATTAACA-GCTTATATACTCTTCAAG-TCATCATTTTTCCCTAAAAAAAAA] [+] EMBL AK069284 [TCCCTCCTCCCCTGAAGAAGTCGAAACCCTCCCACCGCCGGTGGGCGGTGGCGGCAAGCCGGCAACGGCGGAATCCACCCTCCTCCGGCGGCGCTGGCTGAAGACGACAGCCATGCCTACCTACCTGCCTTCCTGCCTTTCCCCTCCCTTTCTCCCCTAGCTAGGGGAATGTGCGAGAGCAGTCTAGACTCTAGAGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTTTTCTCCTCGTCCAGGTTCTCACGGCGAAATTCCGCTCCTCCTTTTTGTGCCTGCGACGAGCACTCCCGTATCGCGAATGGATTGGCTGGTTTTCTGGGTTCCTTCAGTGAAAAATCTGGCCGTGTAGGTGTCGAAGGCCAGAGATTATCGAAGTTTTTGTGTTTTGGTCTTGTGAATTTTGCGAAGGTAAACCTCATATATCTCTGATGGGATTGATGTATGTCTGGGGAATGCTTCTTATATTTGGCATGATTCTCATTATCTAATTTTTTTTTGGCATGATTCTGATTTCTGAGACCTTGAATTGACGATAACTTTCCCAGATTAATGTTGGGATTTGCAGTAGTATTACAAGACATGTTAAACATATTAAGTACTAGCATGATACTGGTAGGAATTGAAGGCTCATGGCCCTAACATGAGCATGATATATATTCACCCATTTCACCCGTATCAGTTTCAGCTTTGGAATCAGGATACTGTGGTAGTTTTGATGGTGTTCTTACATAACTTGCCTGCGCATGGAGCATGTCTCGATCCTTACTATTGTCGATTTAATTTTTCCTGTTGCAACATGAACTCAAAGCCTAGGATCTAGAACAAAATTATCATCTATTTCTGTTTTGTTATGAATATAACTGTGCCATTGTTCTTCCTATGCTCGACTCCAGAATGAAAAAGATAAGTTGCATTGACTAAAATCTCACTGAATACGGTGCCCGAAAAAACTGTTCACATGACCTCCTGATTAAAGACGAAAAATATACACCTAAAGCCAACAGTTTGCAGAAATATTTATTAATGTTTCTCTTGAATGAAAATACAATAACTCCTTAAAGTCGTCCTGGATGGATCACTGATGAAGATAATACTACCGAGGTACCTTCTCAATTTTCAAATAGAAATGAACTTTTAAACCTATTTCCCCCCAATGAACAAGAGGTTTTACTGCCTGATATTATGTCAACACCTGCTTAATGGCTAATTCTGCTCCTGTTAAGTTGAAGGTGAACTACCAGTGTAAGTGAACTGTCTGCTTAAGAATCCCAAATGGGTTTTTCCAATGCAGTGGGGTCAAGAGATGACTGATGGTAAGAGTAGATATGTTCCTGAGGTTTCTCCTGCTCATCAGAATAGCTTAATGCTGTCACATCCGCGTTGGAAAATGCTAGGGTTATCCTTTTCTTCTCTCATGGAAAATGGATGGTTCATTAGTCCAATTAAAGGCACAGTACCTGGCCTCATGATGCCACTGGACCACGGTGCGTTGATCAGAATATTACCACGGCCAATCATCACAAGTTTCTTAGTTCATGGCTAAAACGGCACTGCACAAGAACATATTGAGTTTCCAGTTCTGAGGATCAGAGGTGCTAAAAAGCCAGGTGTAACCAAGAAACACAATTATTGTTTTGAGCATTGCTTTGATGCATTTATTATGTCACTTGCACAGTTGCACGTGTGCTCATGAAATCAGACAATTATCACTCGAAATAATGAGGAAAGATCGAAGGGACGTACCTGGGTTTCCTGGGTGACCTCGTCTCTTCTTCACCACAGGCATGACAGTGTCACCTTTGCTTGATCCAGCAGCGCACGCCTCTAGCTTCGGTTGCTGCTGGAGGTTGTTCAAGGATTCTTCCTCTGATGTGTGTGACATTGTTTGGAGGCTCAGTTAGTGGTTTTAGAGGGTGCCAGTAAAGTGAGGAGGGTTGATGATTTATGCACAACAGAGTGGAGGGACTACAACTGGACAATAGGGAAATGGTGAATTCCCTTTCAGTCACCATCAAGGACTGCAACCATTAGTTTTAAATCTGAGGAACACGACGCTGATTGTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTGGGGATCTCAAAGAAAACACTTCACTGCAGACAGTAAATCTGTGCTACTGGACCTTTATTTTTCTCCTGCTGTGAGTATAAATCTGAACACCTTGTAACTATCGACACGAGGATGGAATTCATGTCATATTTCACCGCAGGTGGAACAATGGCTGTGAAGAGCAGGCAGGAGGCGGTTTTGTCGGTACAAGGAAGGTGATGGATATGACAAGGGGGAGATCCGGGAGGAGAGACAAACTCTGGCCATGTTCTTTTTCTAACCGGCATCCATGGTATCTCCCTCCTCTGCTGGCACAACTGTCAGACTTGCTCTTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGGTGGTACCTGGGGGCTTTGAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGCTGGAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCACCGATTTGGCTACTTCTAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAGAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGT TAGTTTAAGTACATTAACA GCTTATATACTCTTCAAG TCATC ] [+] EMBL CB634316 [ ATATCTCTGATGGGATTGATGTATGTCTGGGGAATGCTTCTTATATTTGGCATGATTCTCATTATCTAATTTTTTTTTGGCATGATTCTGATTTCTGAGACCTTGAATTGACGATAACTTTCCCAGATTAATGTTGGGATTTGCAGTAGTATTACAAGACATGTTAAACATATTAAGTACTAGCATGATACTGGTAGGAATTGAAGGCTCATGGCCCTAACATGAGCATGATATATATTCACCCATTTCACCCGTATCAGTTTCAGCTTTGGAATCAGGATACTGTGGTAGTTTTGATGGTGTTCTTACATAACTTGCCTGCGCATGGAGCATGTCTCGATCCTTACTATTGTCGATTTAATTTTTCCTGTTGCAACATGAACTCAAAGCCTAGGATCTAGAACAAAATTATCATCTATTTCTGTTTTGTTATGAATATAACTGTGCCATTGTTCTTCCTATGCTCGACTCCAGAATGAAAAAGATAAGTTGCATTGACTAAAATCTCACTGAATACGGTGCCCGAAAAAACTGTTCACATGACCTCCTGATTAAAGACGAAAAATATACACCTAAAGCCAACAGTTTGCAGAAATATTTATTAATGTTTCTCTTGAATGAAAATACAATAACTCCTTAAAGTCGTCCTGGATGGATCACTGATGAAGATAATACTACCGAGGTACCTTCTCAATTTTCAAATAGAAATGAACTTTTAAACCTATTTCCCCCCAATGAACAAGAGGTTTTACTGCCTGATATTATGTCAACACCTGCTTAATGGCTAATT ] [+] EMBL CF326969 [ GATCCAGCAGCGCAAGCCTCTAGCTTCGGTTGCTGCTGGAGGTTGTTCAAGGATTCTTCCTCTGATGTGTGTGACATTGTTTGGAGGCTCAGTTAGTGGTTTTAGAGGGTGCCAGTAAAGTTAGGAGGGTTGATGATTTATGCACAACAGATTGGAGGGACTACAACTGGACAATAGGGAAATGGTGAATTCCCTTTCAGTCACCATCAAGGACTGCAACCATTAGTTTTAAATCTGAGGAACACGACGCTGATTGTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTG ] [-] EMBL CB634317 [ GTTTCGTCAGCATGGAATGTTCTGTTCATTGTTCCTGATTATTTTGTCAGGATCACTGGAGTTTCCTGAGTGAAGCTCCACATGAAGAGAGATATCGAGCCTTGAGTTGCATGCCTACTGTACGCCCATTTTGTTGCAAATTATAACAGTTTCATTTAGTGTGCGCTATGAGCGACAGGTCGATATGATGACCATTTGGGGATCTCAAAGAAAACACTTCACTGCAGACAGTAAATCTGTGCTACTGGACCTTTATTTTTCTCCTGCTGTGAGTATAAATCTGAACACCTTGTAACTATCGACACGAGGATGGAATTCATGTCATATTTCACCGCAGGTGGAACAATGGCTGTGAAGAGCAGGCAGGAGGCGGTTTTGTCGGTACAAGGAAGGTGATGGATATGACAAGGGGGAGATCCGGGAGGAGAGACAAACTCTGGCCATGTTCTTTTTCTAACCGGCATCCATGGTATCTCCCTCCTCTGCTGGCACAACTGTCAGACTTGCTCTTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGGTGGTACCTGGGGGCTTTGAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGCTGGAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCACCGATTTGGCTACTTCTAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAGAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGT TAGTTTAAGTACATTAACA GCTTATATACTCTTCAAG TCATCATTTTTCCCTA ] [-] EMBL CF326970 [ GTCAGACTTGATATTGTTTTAGTGCTTGGAGCATGCTGGAACCTGGGGGCTTTCAAGGTTTCCACGGCATGTCATCCAATGCAGATACTGAGACCGGAGAGAGGATGCAAGGTATGTCAAATGAACCGTTCTCCGATTTGGGTACTTCCAGTTATCTCCGGTCTCAGCATCTGCATTGGATTTGTCCAAAGATGGGTTTTTTTGGATTTGCTCACTGACCTCTCCATGAACTTCATATGTATAGTTTAAGTACATTAACAGGCTTATATACTCTCCAAGTTCATCACTTTTCCCTAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||