cluster # 7690

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7690 cluster # 7690 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7690#0 length = 1717 sequences # 5
consensusID : consensus_7690#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1717
fasta sequence
                              [CCCTCGTCGACCCACTCCCGTCTCCGATCCGCCGCCGCCGCCGACGACGACGACACCGGCAGCCATGTCCAACCCCGAATCGAACCCACCACCACCATCCGCCACATCCTGCCCGCCTCCCGGCTCCGCCGCGCACGCGGGCCACGCCCCGCTCTGCCGCTCCTGCGGCGCGCCCACGACGACGCCCGTGCCTCCCCCCTGGTCGGCGTCCTCCGACTCCCCGCCGCCTGCGTACCGCCCCATCCGCATGCCGGCCATCAACGCGCCCACCAACACCGCCGCCATCGTCCTCTCCCCGGTGCCCCAGCCGCTCCCCGTGCCGCCCGCCTCCCCGCCGTTCGCCTTCCAGGTCCCCGCCAAGCGCATCACCTCCCCCGACGACATCGCCCGCTTCCACGCCTCCGTCCACGGCCGCCACTTCCTCGGCTTCGTCGCCGCGCTCTCCGCCTCCGTCCACGGCCGCAAGCTCTCCGACCCGCTCCCGTCCCCGCCATCCCCGGTCGTTTCCGCGCTCCTCGAGCTCATCTCCGCGCTCTCCGCCTTCGTCGCGTCCACCCCACCGCTCCCACACAACTCCCGCTACGGCAACCCCGCCTTCCGCCTGTGGCACGAGAAGCTCTCCGACTCGGCCAACCAGCTGATCGCTCCGATCATGGCCACCGCCGGGTCGCCCGACCTCGCCGGCGCCGAGGCCGAGCTTGCGCCGTACCTTCTCGACTCCTTCGGCAACGCCACCCGCATCGACTACGGCACGGGGCATGAGACCAACTTCGCGGCGTTCCTCTACTGCCTAGCACGGCTTGGGCTCATCACCGAGGCTGATTACCCCGCGGTTGTGCTACGGGTCTTCGCTGCATACCTGGACCTAATGCGCACGCTTCAGGACACCTACTTGCTGGAGCCCGCTGGCTCGCATGGCGTGTGGGGGCTCGACGATTACCACTTCCTCCCATTCATATTTGGCGCGGCGCAGTTGATTGATCACAAGTACATGAAGCCCAAGTCGATCCACAACCCGGATATCCTGGATAACTTCTCAAAGGAGTATATGTACCTCGCATGCGTTGCCTATGTGAAGAAGGTGAAGAAGGGGCCGTTCGCAGAGCACTCGCCAATGTTGGATGATATCAGTGGCGTACCACATTGGAAGAAGGTGAACAGCGGGCTGCTCAAGATGTACAAGGCTGAGGTGCTTGAGAAAGTGCCGATTATGCAGCATTTCCTCTTTGGTTCACTCATCAAATGGGAGGACTGAAGCAATATCCAAAACCCCTCTGCTTCGAGGCAAATGTCCAGAACACACACACACACCATCATGTTCTGCAAGTACTCCGCCTGGATGCAAAAGACTGATGTACAGCGATGCTGCTCAATGTCTGTACCTATAGAAGCTCACTTTCCTTCTAGCGTTATGGGCTCCGGCTTAGGGGATGTGCTCGGTTTCTGCATGATGGATAGCATAGCGTTTCATCATTCGTTGTGCTGTAGCGTAGTAGTTCCTCATCACACCCGCTGTGGAGCTTAAATTCTGGACCTTGTCTGTTCCTGTTCAGCTCACATTGCTTTGGGGATTCCCCTCTGGACAGGCTGGTAGTGGTAATATTAATAACTCCATGTACTCAGGCTTTTTGATGTGGATGACTGGGAAGTGAAACAGTTTCTGTTGTTGGTGAAGGTACACTGTTTGGTGCTATTTCATGAATAAACATCCTCCTGC]

[+] EMBL AK072030             [CCCTCGTCGACCCACTCCCGTCTCCGATCCGCCGCCGCCGCCGACGACGACGACACCGGCAGCCATGTCCAACCCCGAATCGAACCCACCACCACCATCCGCCACATCCTGCCCGCCTCCCGGCTCCGCCGCGCACGCGGGCCACGCCCCGCTCTGCCGCTCCTGCGGCGCGCCCACGACGACGCCCGTGCCTCCCCCCTGGTCGGCGTCCTCCGACTCCCCGCCGCCTGCGTACCGCCCCATCCGCATGCCGGCCATCAACGCGCCCACCAACACCGCCGCCATCGTCCTCTCCCCGGTGCCCCAGCCGCTCCCCGTGCCGCCCGCCTCCCCGCCGTTCGCCTTCCAGGTCCCCGCCAAGCGCATCACCTCCCCCGACGACATCGCCCGCTTCCACGCCTCCGTCCACGGCCGCCACTTCCTCGGCTTCGTCGCCGCGCTCTCCGCCTCCGTCCACGGCCGCAAGCTCTCCGACCCGCTCCCGTCCCCGCCATCCCCGGTCGTTTCCGCGCTCCTCGAGCTCATCTCCGCGCTCTCCGCCTTCGTCGCGTCCACCCCACAGCTCCCACACAACTCCCGCTACGGCAACGCCGCCTTCCGCCTGTGGCACGAGAAGCTCTCCGACTCGGCCAACCAGCTGATCGCTCCGATCATGGCCACCGCCGGGTCGCCCGACCTCGCCGGCGCCGAGGCCGAGCTTGCGCCGTACCTTCTCGACTCCTTCGGCAACGCCACCCGCATCGACTACGGCACGGGGCATGAGACCAACTTCGCGGCGTTCCTCTACTGCCTAGCACGGCTTGGGCTCATCACCGAGGCTGATTACCCCGCGGTTGTGCTACGGGTCTTCGCTGCATACCTGGACCTAATGCGCACGCTTCAGGACACCTACTTGCTGGAGCCCGCTGGCTCGCATGGCGTGTGGGGGCTCGACGATTACCACTTCCTCCCATTCATATTTGGCGCGGCGCAGTTGATTGATCACAAGTACATGAAGCCCAAGTCGATCCACAACCCGGATATCCTGGATAACTTCTCAAAGGAGTATATGTACCTCGCATGCGTTGCCTATGTGAAGAAGGTGAAGAAGGGGCCGTTCGCAGAGCACTCGCCAATGTTGGATGATATCAGTGGCGTACCACATTGGAAGAAGGTGAACAGCGGGCTGCTCAAGATGTACAAGGCTGAGGTGCTTGAGAAAGTGCCGATTATGCAGCATTTCCTCTTTGGTTCACTCATCAAATGGGAGGACTGAAGCAATATCCAAAACCCCTCTGCTTCGAGGCAAATGTCCAGAACACACACACACACCATCATGTTCTGCAAGTACTCCGCCTGGATGCAAAAGACTGATGTACAGCGATGCTGCTCAATGTCTGTACCTATAGAAGCTCACTTTCCTTCTAGCGTTATGGGCTCCGGCTTAGGGGATGTGCTCGGTTTCTGCATGATGGATAGCATAGCGTTTCATCATTCGTTGTGCTGTAGCGTAGTAGTTCCTCATCACACCCGCTGTGGAGCTTAAATTCTGGACCTTGTCTGTTCCTGTTCAGCTCACATTGCTTTGGAGATTCCCCTCTGGACAGGCTGGTAGTGGTAATATTAATAACTCCATGTACTCAGGCTTTTTGATGTGGATGACTGGGAAGTGAAACAGTTTCTGTTGTTGGTGAAGGTACACTGTTTGGTGCTATTTCATGAATAAACATCCTCCTGC]
[+] EMBL AK100405             [CCCTCGTCGACCCACTCCCGTCTCCGATCCGCCGCCGCCGCCGACGACGACGACACCGGCAGCCATGTCCAACCCCGAATCGGACCCACCACCACCATCCGCCACATCCTGCCCGCCTCCCGGCTCCGCCGCGCACGCGGGCCACGCCCCGCTCTGCCGCTCCTGCGGCGCGCCCACGACGACGCCCGTGCCTCCCCCCTGGTCGGCGTCCTCCGACTCCCCGCCGCCTGCGTACCGCCCCATCCGCATGCCGGCCATCAACGCGCCCACCAACACCGCCGCCATCGTCCTCTCCCCGGTGCCCCAGCCGCTCCCCGTGCCGCCCGCCTCCCCGCCGTTCGCCTTCCAGGTCCCCGCCAAGCGCATCACCTCCCCCGACGACATCGCCCGCTTCCACGCCTCCGTCCACGGCCGCCACTTCCTCGGCTTCGTCGCCGCGCTCTCCGCCTCCGTCCACGGCCGCAAGCTCTCCGACCCGCTCCCGTCCCCGCCATCCCCGGTCGTTTCCGCGCTCCTCGAGCTCATCTCCGCGCTCTCCGCCTTCGTCGCGTCCACCCCACCGCTCCCACACAACTCCCGCTACGGCAACCCCGCCTTCCGCCTGTGGCACGAGAAGCTCTCCGACTCGGCCAACCAGCTGATCGCTCCGATCATGGCCACCGCCGGGTCGCCCGACCTCGCCGGCGCCGAGGCCGAGCTTGCGCCGTACCTTCTCGACTCCTTCGGCAACGCCACCCGCATCGACTACGGCACGGGGCATGAGACCAACTTCGCGGCGTTCCTCTACTGCCTAGCACGGCTTGGGCTCATCACCGAGGCTGATTACCCCGCGGTTGTGCTACGGGTCTTCGCTGCATACCTGGACCTAATGCGCACGCTTCAGGACACCTACTTGCTGGAGCCCGCTGGCTCGCATGGCGTGTGGGGGCTCGACGATTACCACTTCCTCCCATTCATATTTGGCGCGGCGCAGTTGATTGATCACAAGTACATGAAGCCCAAGTCGATCCACAACCCGGATATCCTGGATAACTTCTCAAAGGAGTATATGTACCTCGCATGCGTTGCCTATGTGAAGAAGGTGAAGAAGGGGCCGTTCGCAGAGCACTCGCCAATGTTGGATGATATCAGTGGCGTACCACATTGGAAGAAGGTGAACAGCGGGCTGCTCAAGATGTACAAGGCTGAGGTGCTTGAGAAAGTGCCGATTATGCAGCATTTCCTCTTTGGTTCACTCATCAAATGGGAGGACTGAAGCAATATCCAAAACCCCTCTGCTTCGAGGCAAATGTCCAGAACACACACACACACCATCATGTTCTGCAAGTACTCCGCCTGGATGCAAAAGACTGATGTACAGCGATGCTGCTCAATGTCTGTACCTATAGAAGCTCACTTTCCTTCTAGCGTTATGGGCTCCGGCTTAGGGGATGTGCTCGGTTTCTGCATGATGGATAGCATAGCGTTTCATCATTCGTTGTGCTGTAGCGTAGTAGTTCCTCATCACACCCGCTGTGGAGCTTAAATTCTGGACCTTGTCTGTTCCTGTTCAGCTCACATTGCTTTGGGGATTCCCCTCTGGACAGGCTGGTAGTGGTAATATTAATAACTCCATGTACTCAGGCTTTTTGATGTGGATGACTGGGAAGTGAAACAGTTTCTGTTGTTGGTGAAGGTACACTGTTTGGTGCTATTTCATGAATAAACATCCTC    ]
[+] EMBL CB656929             [                                                                                                                                                                                         CCGTGCCTCCCACCTGGTCGGCGTCCTCCGACTCCCCGCCGCCTGCGTACCGCCCCATCCGCATGCCGGCCATCAACGCGCCCACCAACACCGCCGCCATCGTCCTCTCCCCGGTGCCCCAGCCGCTCCCCGTGCCGCCCGCCTCCCCGCCGTTCGCCTTCCAGGTCCCCGCCAAGCGCATCACCTCCCCCGACGACATCGCCCGCTTCCACGCCTCCGTCCACGGCCGCCACTTCCTCGGCTTCGTCGCCGCGCTCTCCGCCTCCGTCCACGGCCGCAAGCTCTCCGACCCGCTCCCGTCCCCGCCATCCCCGGTCGTTTCCGCGCTCCTCGAGCTCATCTCCGCGCTCTCCGCCTTCGTCGCGTCCACCCCACCGCTCCCACACAACTCCCGCTACGGCAACCCCGCCTTCCGCCTGTGGCACGAGAAGCTCTCCGACTCGGCCAACCAGCTGATCGCTCCGATCATGGCCACCGCCGGGTCGCCCGACCTCGCCGGCGCCGAGGCCGAGCTTGCGCCGTACCTTCTCGACTCCTTCGGCAACGCCACCCGCATCGACTACGGCACGGGGCATGAGACCAACTTCGCGGCGTTCCTCTACTGCCTAGCACGGCTTGGGCTCATCACCGAGGCTGATTACCCCGCGGTTGTGCTACGGGTCTTCGCTGCATACCTGGACCTAATGCGCACGCTTCAGGACACCTACTTGCTGGAGCCCGCTGGCTCGCATGGCGTGTGGGGGCTCGACGATTACCACTTCCTCCCATTCATATTTGGCGCGGCGCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CA767423             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GACGATTACCACTTCCTCCCATTCATATTTGGCGCGGCGCAGTTGATTGATCACAAGTACATGAAGCCCAAGTCGATCCACAACCCGGATATCCTGGATAACTTCTCAAAGGAGTATATGTACCTCGCATGCGTTGCCTATGTGAAGAAGGTGAAGAAGGGGCCGTTCGCAGAGCACTCGCCAATGTTGGATGATATCAGTGGCGTACCACATTGGAAGAAGGTGAACAGCGGGCTGCTCAAGATGTACAAGGCTGAGGTGCTTGAGAAAGTGCCGATTATGCAGCATTTCCTCTTTGGTTCACTCATCAAATGGGAGGACTGAAGCAATATCCAAAACCCCTCTGCTTCGAGGCAAATGTCCAGA  ACACACACACACCATCATGTTCTGCAAGTACTCCGCCTGGATGCAAAAGACTGATGTACAGCGATGCTGCTCAATGTCTGTACCTATAGAAGCTCACTTTCCTTCTAGCGTTATGGGCTCCGGCTTAGGGGATGTGCTCGGTTTCTGCATGATGGATAGCATAGCGTTTCATCATTCGTTGTGCTGTAGCGTAGTAGTTCCTCATCACACCCGCTGTGGAGCTTAAATTCTGGACCTTGTCTGNTCCTGGTCAGCTCACATTGCTTTGGGGATTCCCCTCTGGACAGGCTGGTAGTGGTAATATTAATAACTCCATGTACTCAGGCTTTTTGATGNGGATGACTGGGAAGTGAAACAGGTTCTGNTGGTGGTGAAAGNACACTGGTTGGNGCTATTTCATG                 ]
[-] EMBL CB656930             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACTTCCTCCCATTCATATTTGGCGCGGCGCAGTTGATTGATCACAAGTACATGAAGCCCAAGTCGATCCACAACCCGGATATCCTGGATAACTTCTCAAAGGAGTATATGTACCTCGCATGCGTTGCCTATGTGAAGAAGGTGAAGAAGGGGCCGTTCGCAGAGCACTCGCCAATGTTGGATGATATCAGTGGCGTACCACATTGGAAGAAGGTGAACAGCGGGCTGCTCAAGATGTACAAGGCTGAGGTGCTTGAGAAAGTGCCGATTATGCAGCATTTCCTCTTTGGTTCACTCATCAAATGGGAGGACTGAAGCAATATCCAAAACCCCTCTGCTTCGAGGCAAATGTCCAGAACACACACACACACCATCATGTTCTGCAAGTACTCCGCCTGGATGCAAAAGACTGATGTACAGCGATGCTGCTCAATGTCTGTACCTATAGAAGCTCACTTTCCTTCTAGCGTTATGGGCTCCGGCTTAGGGGATGTGCTCGGTTTCTGCATGATGGATAGCATAGCGTTTCATCATTCGTTGTGCTGTAGCGTAGTAGTTCCTCATCACACCCGCTGTGGAGCTTAAATTCTGGACCTTGTCTGTTCCTGTTCAGCTCACATTGCTTTGGGGATTCCCCTCTGGACAGGCTGGTAGTGGTAATATTAATAACTCCATGTACTCAGGCTTTTTGATGAGGATGACTGGGAAGTGAAACAGTTTCTGTTGTTG                                                ]




>consensus_7690#0
CCCTCGTCGACCCACTCCCGTCTCCGATCCGCCGCCGCCGCCGACGACGACGACACCGGC
AGCCATGTCCAACCCCGAATCGAACCCACCACCACCATCCGCCACATCCTGCCCGCCTCC
CGGCTCCGCCGCGCACGCGGGCCACGCCCCGCTCTGCCGCTCCTGCGGCGCGCCCACGAC
GACGCCCGTGCCTCCCCCCTGGTCGGCGTCCTCCGACTCCCCGCCGCCTGCGTACCGCCC
CATCCGCATGCCGGCCATCAACGCGCCCACCAACACCGCCGCCATCGTCCTCTCCCCGGT
GCCCCAGCCGCTCCCCGTGCCGCCCGCCTCCCCGCCGTTCGCCTTCCAGGTCCCCGCCAA
GCGCATCACCTCCCCCGACGACATCGCCCGCTTCCACGCCTCCGTCCACGGCCGCCACTT
CCTCGGCTTCGTCGCCGCGCTCTCCGCCTCCGTCCACGGCCGCAAGCTCTCCGACCCGCT
CCCGTCCCCGCCATCCCCGGTCGTTTCCGCGCTCCTCGAGCTCATCTCCGCGCTCTCCGC
CTTCGTCGCGTCCACCCCACCGCTCCCACACAACTCCCGCTACGGCAACCCCGCCTTCCG
CCTGTGGCACGAGAAGCTCTCCGACTCGGCCAACCAGCTGATCGCTCCGATCATGGCCAC
CGCCGGGTCGCCCGACCTCGCCGGCGCCGAGGCCGAGCTTGCGCCGTACCTTCTCGACTC
CTTCGGCAACGCCACCCGCATCGACTACGGCACGGGGCATGAGACCAACTTCGCGGCGTT
CCTCTACTGCCTAGCACGGCTTGGGCTCATCACCGAGGCTGATTACCCCGCGGTTGTGCT
ACGGGTCTTCGCTGCATACCTGGACCTAATGCGCACGCTTCAGGACACCTACTTGCTGGA
GCCCGCTGGCTCGCATGGCGTGTGGGGGCTCGACGATTACCACTTCCTCCCATTCATATT
TGGCGCGGCGCAGTTGATTGATCACAAGTACATGAAGCCCAAGTCGATCCACAACCCGGA
TATCCTGGATAACTTCTCAAAGGAGTATATGTACCTCGCATGCGTTGCCTATGTGAAGAA
GGTGAAGAAGGGGCCGTTCGCAGAGCACTCGCCAATGTTGGATGATATCAGTGGCGTACC
ACATTGGAAGAAGGTGAACAGCGGGCTGCTCAAGATGTACAAGGCTGAGGTGCTTGAGAA
AGTGCCGATTATGCAGCATTTCCTCTTTGGTTCACTCATCAAATGGGAGGACTGAAGCAA
TATCCAAAACCCCTCTGCTTCGAGGCAAATGTCCAGAACACACACACACACCATCATGTT
CTGCAAGTACTCCGCCTGGATGCAAAAGACTGATGTACAGCGATGCTGCTCAATGTCTGT
ACCTATAGAAGCTCACTTTCCTTCTAGCGTTATGGGCTCCGGCTTAGGGGATGTGCTCGG
TTTCTGCATGATGGATAGCATAGCGTTTCATCATTCGTTGTGCTGTAGCGTAGTAGTTCC
TCATCACACCCGCTGTGGAGCTTAAATTCTGGACCTTGTCTGTTCCTGTTCAGCTCACAT
TGCTTTGGGGATTCCCCTCTGGACAGGCTGGTAGTGGTAATATTAATAACTCCATGTACT
CAGGCTTTTTGATGTGGATGACTGGGAAGTGAAACAGTTTCTGTTGTTGGTGAAGGTACA
CTGTTTGGTGCTATTTCATGAATAAACATCCTCCTGC
clustalw multiple alignements is not computed in this case