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Oryza sativa
cluster # 7945 cluster # 7945       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7945#0 length = 1547 sequences # 5  
consensusID : consensus_7945#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1547
fasta sequence 
                              [CGCGATCAGGTTGAGGAAGAGGGACTTGGTGCCGTCGTGGATGAGGATGCGCGGGATCTGGAGCACGCCGTCGTGGAACCTGATGTCCCAGAAGCGGTCCGTGTTCCGCCGCCGGCACCGGATGCCGGCCTCCCGGAGCTCCGACACGCAGTGGACGAACTGCTGCCGCCGCTTGTCCGCCACGCGCCGGAGCCCCGACCACTTCTTGAGCCACAGCCGCGCGGGGGGCGGCGGGGTGGGCTGCAGCCCCGCGCGGAGGAGGCTGCGCCGGAACACGTCGAGGCAATGGAGCATCGGGCCGGACAGCGGGTCGAACTCGAACGCCGCCGCCGCCGGTGAGGCGCCGATGGAGGACTCCAGCTTGGACCGGTCCTTGCGGAGCAGCGGCTCGTCGGTCGGCATGAGCGGGTCGAAGAAGCGCACAGCGAGGCCGGCGACGGCGCCGGTCTGCTCCGGGTTGCCGAGCTGGAGGCCGAGCAGGAGGTCGAGCACGAACAGGGGTATCTGGTTCTCGAGCAGGATCATGTCGTTGCGGATGGCGTGCATCGCGCCGCGCATGGCGAAGATGGGGTCGTGCCGCGAGTACCCCAGGTCGTCGCCGAACCCCTTCCCGCCGTCCTGCGCGCCGCGGAAGAGCTCCAGCACGAAGGTCCCGTCCAGCACCAGGCACTCGACGAGCTCGTTCCCCTGCATCCCGGCGACGCGGCCGTCGTAGCAGGCGCGCGCCCGCTCCTCCATCGGCCGCAGCGCGTCGAGGTAGGCGGTGACGTCGTGCCCCGTGCGCTTCAGGACGTGGTGCAGCGCGCGCCACTTGTGCCGCTCCATCTCCCGCAGCCGCCGCCGGCCGCGGTGGAGCGGGCCGATGGACACCACCTGCGGCATGTACGCGCGCTCGTCGCCGTCGCGGAGCGACTTGGGCACGCGGTACACGGACAGCCGCGCCCACGGGCACGCTGCCTCCTCGGCGCGCGCCTGCGCCAGCTTCCCGCGGATGGCCACCACCCATTCCGGGTCCTGCGGCTTCGGGCTGTGCGCCGGCGACTGCACCTGGACCTTCACCTCCCGCTCCCGCTCCTGGCGCGGCGGCAGCGCGTCGCCTCCCGCTCCGGCGGCCTCGCCGTTGGTGAGCAGCGGCAGGTTGCGGTTCAGCGCCTGCCACAGCGGCAGCGCGCCGGGCGGCGGCGCGGACTTGTTGAGGTTGGCATCGACGGTCTCCTTGAGCTTGACCGTGATCAGGTACCAGCTCAGGACGTCCTTGTTGAAGACGGCGACCATCGAGATGGAGGCTGGCAGTGGCAGGTGCAGCGGCTTCGCCGGCGGCGTGGGGCTCGCCGCAGTAGCGTCTCGTGGTTGCCAAGATCAGTGGCCCCGGGACAGAGAGAGCAAGCCAACTCGAGAGGGAGGCGAGGCAAGCAATGTACCTATGAATATCTTAGAACGATAATTTTATCAGCTGATGATGATTGATAGTGGAATTTTTGGGATTGCTTGCTTGTTGTAAAATATTGTGTGGTCTTTGACAAAATTAAATAAAGTTTCCTCTTGCG]

[+] EMBL AK121493             [CGCGATCAGGTTGAGGAAGAGGGACTTGGTGCCGTCGTGGATGAGGATGCGCGGGATCTGGAGCACGCCGTCGTGGAACCTGATGTCCCAGAAGCGGTCCGTGTTCCGCCGCCGGCACCGGATGCCGGCCTCCCGGAGCTCCGACACGCAGTGGACGAACTGCTGCCGCCGCTTGTCCGCCACGCGCCGGAGCCCCGACCACTTCTTGAGCCACAGCCGCGCGGGGGGCGGCGGGGTGGGCTGCAGCCCCGCGCGGAGGAGGCTGCGCCGGAACACGTCGAGGCAATGGAGCATCGGGCCGGACAGCGGGTCGAACTCGAACGCCGCCGCCGCCGGTGAGGCGCCGATGGAGGACTCCAGCTTGGACCGGTCCTTGCGGAGCAGCGGCTCGTCGGTCGGCATGAGCGGGTCGAAGAAGCGCACAGCGAGGCCGGCGACGGCGCCGGTCTGCTCCGGGTTGCCGAGCTGGAGGCCGAGCAGGAGGTCGAGCACGAACAGGGGTATCTGGTTCTCGAGCAGGATCATGTCGTTGCGGATGGCGTGCATCGCGCCGCGCATGGCGAAGATGGGGTCGTGCCGCGAGTACCCCAGGTCGTCGCCGAACCCCTTCCCGCCGTCCTGCGCGCCGCGGAAGAGCTCCAGCACGAAGGTCCCGTCCAGCACCAGGCACTCGACGAGCTCGTTCCCCTGCATCCCGGCGACGCGGCCGTCGTAGCAGGCGCGCGCCCGCTCCTCCATCGGCCGCAGCGCGTCGAGGTAGGCGGTGACGTCGTGCCCCGTGCGCTTCAGGACGTGGTGCAGCGCGCGCCACTTGTGCCGCTCCATCTCCCGCAGCCGCCGCCGGCCGCGGTGGAGCGGGCCGATGGACACCACCTGCGGCATGTACGCGCGCTCGTCGCCGTCGCGGAGCGACTTGGGCACGCGGTACACGGACAGCCGCGCCCACGGGCACGCTGCCTCCTCGGCGCGCGCCTGCGCCAGCTTCCCGCGGATGGCCACCACCCATTCCGGGTCCTGCGGCTTCGGGCTGTGCGCCGGCGACTGCACCTGGACCTTCACCTCCCGCTCCCGCTCCTGGCGCGGCGGCAGCGCGTCGCCTCCCGCTCCGGCGGCCTCGCCGTTGGTGAGCAGCGGCAGGTTGCGGTTCAGCGCCTGCCACAGCGGCAGCGCGCCGGGCGGCGGCGCGGACTTGTTGAGGTTGGCATCGACGGTCTCCTTGAGCTTGACCGTGATCAGGTACCAGCTCAGGACGTCCTTGTTGAAGACGGCGACCATCGAGATGGAGGCTGGCAGTGGCAGGTGCAGCGGCTTCGCCGGCGGCGTGGGGCTCGCCGCAGTAGCGTCTCGTGGTTGCCAAGATCAGTGGCCCCGGGACAGAGAGAGCAAGCCAACTCGAGAGGGAGGCGAGGCAAGCAATGTACCTATGAATATCTTAGAACGATAATTTTATCAGCTGATGATGATTGATAGTGGAATTTTTGGGATTGCTTGCTTGTTGTAAAATATTGTGTGGTCTTTGACAAAATTAAATAAAGTTTCCTCTTGCG]
[+] EMBL AK063370             [CGCGATCAGGTTGAGGAAGAGGGACTTGGTGCCGTCGTGGATGAGGATGCGCGGGATCTGGAGCACGCCGTCGTGGAACCTGATGTCCCAGAAGCGGTCCGTGTTCCGCCGCCGGCACCGGATGCCGGCCTCCCGGAGCTCCGACACGCAGTGGACGAACTGCTGCCGCCGCTTGTCCGCCACGCGCCGGAGCCCCGACCACTTCTTGAGCCACAGCCGCGCGGGGGGCGGCGGGGTGGGCTGCAGCCCCGCGCGGAGGAGGCTGCGCCGGAACACGTCGAGGCAATGGAGCATCGGGCCGGACAGCGGGTCGAACTCGAACGCCGCCGCCGCCGGTGAGGCGCCGATGGAGGACTCCAGCTTGGACCGGTCCTTGCGGAGCAGCGGCTCGTCGGTCGGCATGAGCGGGTCGAAGAAGCGCACAGCGAGGCCGGCGACGGCGCCGGTCTGCTCCGGGTTGCCGAGCTGGAGGCCGAGCAGGAGGTCGAGCACGAACAGGGGTATCTGGTTCTCGAGCAGGATCATGTCGTTGCGGATGGCGTGCATCGCGCCGCGCATGGCGAAGATGGGGTCGTGCCGCGAGTACCCCAGGTCGTCGCCGAACCCCTTCCCGCCGTCCTGCGCGCCGCGGAAGAGCTCCAGCACGAAGGTCCCGTCCAGCACCAGGCACTCGACGAGCTCGTTCCCCTGCATCCCGGCGACGCGGCCGTCGTAGCAGGCGCGCGCCCGCTCCTCCATCGGCCGCAGCGCGTCGAGGTAGGCGGTGACGTCGTGCCCCGTGCGCTTCAGGACGTGGTGCAGCGCGCGCCACTTGTGCCGCTCCATCTCCCGCAGCCGCCGCCGGCCGCGGTGGAGCGGGCCGATGGACACCACCTGCGGCATGTACGCGCGCTCGTCGCCGTCGCGGAGCGACTTGGGCACGCGGTACACGGACAGCCGCGCCCACGGGCACGCTGCCTCCTCGGCGCGCGCCTGCGCCAGCTTCCCGCGGATGGCCACCACCCATTCCGGGTCCTGCGGCTTCGGGCTGTGCGCCGGCGACTGCACCTGGACCTTCACCTCCCGCTCCCGCTCCTGGCGCGGCGGCAGCGCGTCGCCTCCCGCTCCGGCGGCCTCGCCGTTGGTGAGCAGCGGCAGGTTGCGGTTCAGCGCCTGCCACAGCGGCAGCGCGCCGGGCGGCGGCGCGGACTTGTTGAGGTTGGCATCGACGGTCTCCTTGAGCTTGACCGTGATCAGGTACCAGCTCAGGACGTCCTTGTTGAAGACGGCGACCATCGAGATGGAGGCTGGCAGTGGCAGGTGCAGCGGCTTCGCCGGCGGCGTGGGGCTCGCCGCAGTAGCGTCTCGTGGTTGCCAAGATCAGTGGCCCCGGGACAGAGAGAGCAAGCCAACTCGAGAGGGAGGCGAGGCAAGCAATGTACCTATGAATATCTTAGAACGATAATTTTATCAGCTGATGATGATTGATAGTGGAATTTTTGGGATTGCTTGCTTGTTGTAAAATATTGTGTGGTCTTTGACAAAATTAAATAAAGTTTCC       ]
[-] EMBL AK063930             [ GCGATCAGGTTGAGGAAGAGGGACTTGGTGCCGTCGTGGATGAGGATGCGCGGGATCTGGAGCACGCCGTCGTGGAACCTGATGTCCCAGAAGCGGTCCGTGTTCCGCCGCCGGCACCGGATGCCGGCCTCCCGGAGCTCCGACACGCAGTGGACGAACTGCTGCCGCCGCTTGTCCGCCACGCGCCGGAGCCCCGACCACTTCTTGAGCCACAGCCGCGCGGGGGGCGGCGGGGTGGGCTGCAGCCCCGCGCGGAGGAGGCTGCGCCGGAACACGTCGAGGCAATGGAGCATCGGGCCGGACAGCGGGTCGAACTCGAACGCCGCCGCCGCCGGTGAGGCGCCGATGGAGGACTCCAGCTTGGACCGGTCCTTGCGGAGCAGCGGCTCGTCGGTCGGCATGAGCGGGTCGAAGAAGCGCACAGCGAGGCCGGCGACGGCGCCGGTCTGCTCCGGGTTGCCGAGCTGGAGGCCGAGCAGGAGGTCGAGCACGAACAGGGGTATCTGGTTCTCGAGCAGGATCATGTCGTTGCGGATGGCGTGCATCGCGCCGCGCATGGCGAAGATGGGGTCGTGCCGCGAGTACCCCAGGTCGTCGCCGAACCCCTTCCCGCCGTCCTGCGCGCCGCGGAAGAGCTCCAGCACGAAGGTCCCGTCCAGCACCAGGCACTCGACGAGCTCGTTCCCCTGCATCCCGGCGACGCGGCCGTCGTAGCAGGCGCGCGCCCGCTCCTCCATCGGCCGCAGCGCGTCGAGGTAGGCGGTGACGTCGTGCCCCGTGCGCTTCAGGACGTGGTGCAGCGCGCGCCACTTGTGCCGCTCCATCTCCCGCAGCCGCCGCCGGCCGCGGTGGAGCGGGCCGATGGACACCACCTGCGGCATGTACGCGCGCTCGTCGCCGTCGCGGAGCGACTTGGGCACGCGGTACACGGACAGCCGCGCCCACGGGCACGCTGCCTCCTCGGCGCGCGCCTGCGCCAGCTTCCCGCGGATGGCCACCACCCATTCCGGGTCCTGCGGCTTCGGGCTGTGCGCCGGCGACTGCACCTGGACCTTCACCTCCCGCTCCCGCTCCTGGCGCGGCGGCAGCGCGTCGCCTCCCGCTCCGGCGGCCTCGCCGTTGGTGAGCAGCGGCAGGTTGCGGTTCAGCGCCTGCCACAGCGGCAGCGCGCCGGGCGGCGGCGCGGACTTGTTGAGGTTGGCATCGACGGTCTCCTTGAGCTTGACCGTGATCAGGTACCAGCTCAGGACGTCCTTGTTGAAGACGGCGACCATCGAGATGGAGGCTGGCAGTGGCAGGTGCAGCGGCTTCGCCGGCGGCGTGGGGCTCGCCGCAGTAGCGTCTCGTGGTTGCCAAGATCAGTGGCCCCGGGACAGAGAGAGCAAGCCAACTCGAGAGGGAGGCGAGGC                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CF325696             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCTGGCGCGGCGGCAGCGCGTCGCCTCCCGCTCCGGCGGCCTCGCCGTTGGTGAGCAGCGGCAGGTTGCGGTTCAGCGCCTGCCACAGCGGCAGCGCGCCGGGCGGCGGCGCGGACTTGTTGAGGTTGGCATCGACGGTCTCCTTGAGCTTGACCGTGATCAGGTACCAGCTCAGGACGTCCTTGTTGAAGACGGCGACCATCGAGATGGAGGCTGGCAGTGGCAGGTGCAGCGGCTTCGCCGGCGGCGTGGGGCTCGCCGCAGTAGCGTCTCGTGGTTGCCAAGATCAGTGGCCCCGGGACAGAGAGAGCAAGCCAACTCGAGAGGGAGGCGAGGCAAGCAATGTACCTATGAATATCTTAGAACGATAATTTTATCAGCTGATGATGATTGATAGTGGAATTTTTGGGATTGCTTGCTTGTTGTAAAATATTGTGTGGTCTTTGACAAAATTAAATAAAGTTT         ]
[-] EMBL CF326246             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAGCGCGTCGCCTCCCGCTCCGGCGGCCTCGCCGTTGGTGAGCAGCGGCAGGTTGCGGTTCAGCGCCTGCCACAGCGGCAGCGCGCCGGGCGGCGGCGCGGACTTGTTGAGGTTGGCATCGACGGTCTCCTTGAGCTTGACCGTGATCAGGTACCAGCTCAGGACGTCCTTGTTGAAGACGGCGACCATCGAGATGGAGGCTGGCAGTGGCAGGTGCAGCGGCTTCGCCGGCGGCGTGGGGCTCGCCGCAGTAGCGTCTCGTGGTTGCCAAGATCAGTGGCCCCGGGACAGAGAGAGCAAGCCAACTCGAGAGGGAGGCGAGGCAAGCAATGTACCTATGAATATCTTAGAACGATAATTTTATCAGCTGATGATGATTGATAGTGGAATTTTTGGGATTGCTTGCTTGTTGTAAAATATTGTGTGGTCTTTGACAAAATTAAATAAAGTTT         ]




>consensus_7945#0
CGCGATCAGGTTGAGGAAGAGGGACTTGGTGCCGTCGTGGATGAGGATGCGCGGGATCTG
GAGCACGCCGTCGTGGAACCTGATGTCCCAGAAGCGGTCCGTGTTCCGCCGCCGGCACCG
GATGCCGGCCTCCCGGAGCTCCGACACGCAGTGGACGAACTGCTGCCGCCGCTTGTCCGC
CACGCGCCGGAGCCCCGACCACTTCTTGAGCCACAGCCGCGCGGGGGGCGGCGGGGTGGG
CTGCAGCCCCGCGCGGAGGAGGCTGCGCCGGAACACGTCGAGGCAATGGAGCATCGGGCC
GGACAGCGGGTCGAACTCGAACGCCGCCGCCGCCGGTGAGGCGCCGATGGAGGACTCCAG
CTTGGACCGGTCCTTGCGGAGCAGCGGCTCGTCGGTCGGCATGAGCGGGTCGAAGAAGCG
CACAGCGAGGCCGGCGACGGCGCCGGTCTGCTCCGGGTTGCCGAGCTGGAGGCCGAGCAG
GAGGTCGAGCACGAACAGGGGTATCTGGTTCTCGAGCAGGATCATGTCGTTGCGGATGGC
GTGCATCGCGCCGCGCATGGCGAAGATGGGGTCGTGCCGCGAGTACCCCAGGTCGTCGCC
GAACCCCTTCCCGCCGTCCTGCGCGCCGCGGAAGAGCTCCAGCACGAAGGTCCCGTCCAG
CACCAGGCACTCGACGAGCTCGTTCCCCTGCATCCCGGCGACGCGGCCGTCGTAGCAGGC
GCGCGCCCGCTCCTCCATCGGCCGCAGCGCGTCGAGGTAGGCGGTGACGTCGTGCCCCGT
GCGCTTCAGGACGTGGTGCAGCGCGCGCCACTTGTGCCGCTCCATCTCCCGCAGCCGCCG
CCGGCCGCGGTGGAGCGGGCCGATGGACACCACCTGCGGCATGTACGCGCGCTCGTCGCC
GTCGCGGAGCGACTTGGGCACGCGGTACACGGACAGCCGCGCCCACGGGCACGCTGCCTC
CTCGGCGCGCGCCTGCGCCAGCTTCCCGCGGATGGCCACCACCCATTCCGGGTCCTGCGG
CTTCGGGCTGTGCGCCGGCGACTGCACCTGGACCTTCACCTCCCGCTCCCGCTCCTGGCG
CGGCGGCAGCGCGTCGCCTCCCGCTCCGGCGGCCTCGCCGTTGGTGAGCAGCGGCAGGTT
GCGGTTCAGCGCCTGCCACAGCGGCAGCGCGCCGGGCGGCGGCGCGGACTTGTTGAGGTT
GGCATCGACGGTCTCCTTGAGCTTGACCGTGATCAGGTACCAGCTCAGGACGTCCTTGTT
GAAGACGGCGACCATCGAGATGGAGGCTGGCAGTGGCAGGTGCAGCGGCTTCGCCGGCGG
CGTGGGGCTCGCCGCAGTAGCGTCTCGTGGTTGCCAAGATCAGTGGCCCCGGGACAGAGA
GAGCAAGCCAACTCGAGAGGGAGGCGAGGCAAGCAATGTACCTATGAATATCTTAGAACG
ATAATTTTATCAGCTGATGATGATTGATAGTGGAATTTTTGGGATTGCTTGCTTGTTGTA
AAATATTGTGTGGTCTTTGACAAAATTAAATAAAGTTTCCTCTTGCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)