cluster # 8024

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 8024 cluster # 8024 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8024#0 length = 2149 sequences # 5
consensusID : consensus_8024#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 2149
fasta sequence
                              [ATCATAATAATCATGATTTCTTCTCCTGCGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCAGGCCGCCCCTCCATCGCCGCGCCGCCGCTCCCCTCCTCGCCGGCGCCTCCCCTCCGCGGCATCTCCATCTCCCCCGTCGCCGCCCGCCCCATCTCCTCCCTCCGCTCCTCCTCCTCCATCAGGATCATCTCGCCGCCGCACGCCCTCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTCCCGTCCATGGACCCCCAAGAGGTGCCCGATCTGCTGCCCCCGCGCCCACCGGAGCGCGACTTCGCCGGAACGCCATACGTCCCCGTCTATGTCATGCTCCCGCTTGGAGTGGTCAATGGTAATGGCGAGGTGGTCGACGCCGACGTCTTGGTGGGCCAGCTTCGGGTACTCAAGGCTGCCGGCGTCGATGGGGTCATGGTCGATTGCTGGTGGGGGAATGTCGAGGCCCACAGGCCGCAGGAGTACAATTGGACCGGTTACAAGCGACTCTTCCATATGATCAGGGAGCTCAAGCTCAAGCTGCAGGTGGTCATGTCATTCCATGAGTGTGGAGGCAATGTTGGAGATGATGTGTCTATTCCTCTCCCACATTGGGTAACAGAGATCGGAAGAAGCAATCCAGATATCTACTTCACCGACAGGGCTGGCAGGCGTAACACGGAGTGCCTTTCATGGGGCATTGATAAAGAAAGGGTTCTTCAAGGACGGACAGGGGTCGAGGTATTTTGACTACATGAGAAGCTTCCGAGTAGAATTTGATGAATATTTTGAGGATGGTATCATTTCAGAAATTGAGATTGGGCTAGGGGCTTGTGGAGAGTTGAGGTATCCATCTTATCCAGCAAAACATGGGTGGAAATACCCTGGCATTGGAGAATTTCAGTGCTACGACAGATACTTACAGAAAAGTTTAAGAAGAGCTGCAGAAGCACGAGGACATACCATATGGGCAAGAGCGCCAGACAGTGCAGGCCATTATAATTCTGAGCCAAATCTGACTGGATTTTTCTCTGACGGAGGAGATTATGATAGCTACTATGGTCGTTTTTTCCTCAATTGGTATTCCCAGGTGTTGGTGGATCATGCTGACCGTGTATTGATGTTAGCCAGGTTGGCTTTTGAAGGTTCAGATATTGCTGTTAAGGTTTCAGGTGTACACTGGTGGTACAAAACTGCCAGTCATGCTGCTGAATTGACTGCTGGGTTTTATAACCCATGCAACCGTGATGGTTATGCCTCAATTGCTGCTGTCCTGAAAAAACATGGTGCAGCTTTGAACTTTACATGTGTTGAACTGCGCACTATGGATCAGCATGAGGTATTTCCTGAGGCCTTTGCAGATCCAGAGGGCCTTGTATGGCAGGTGCTAAATGCTGCATGGGATGCTGGCATACCAGTAGCTAGTGAGAATGCTCTGCCTTGCTACGATAGAGATGGCTTTAACAAAATTTTGGAGAATGCAAAGCCACTGAATGATCCAGATGGGAGGCATTTACTAGGATTCACGTACCTGAGGCTCACCAAAGTCCTCTTCGAGAGAGCTAATTTTTTGGAATTTGAGCGTTTCGTTAAGAGAATGCATGGTGAAGCAGTTCTCGATCTACAGGTATAAGTTGTGTTCAGGGTTCTTACATACATACATATATATACATGCCATTGTAATTGGCATAGGCCTTATGGCTTATGATGGGGGAACAGAGATGCCATTTTTGTTTCGTAGGTTGTTGTAGTATACCATCAGCAGATTTTTGAACTATAGAGGGTTTGGCTCCATGGTGTAAAGCATACCCTTGGCAAAGAGTTGTCATGCAGAAAATTGATGG--TTT-CAT-TC-GGAAT-GAGGTTGGAAG-CAGGTGTATTTCT-TTCGATG-CGGCAGA-CATA-TTTGA-TTTGTCATGAGATGAGGATT-GGGTGAGCA-GGTGGTATCC-TTCTGAAAGATTTGAGGCTGTATTGA-AGAGAAT-GTGCTGATGCATGTTTATCAT-GGAGCAAGCGACATTAATGGAGTTAGCAAAGGTTCTCGCGGTGTATGTGTTTGTATTTGTTGGTGGAATGTCACTCGAGGATCTTGGCTGTATACAATACATACATGTGCTTTTTTTTGGGTCTTTTCTACAGTGTATGAGAAATGCATGTTTCTTACTGTCAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK070300             [ATCATAATAATCATGATTTCTTCTCCTGCGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCAGGCCGCCCCTCCATCGCCGCGCCGCCGCTCCCCTCCTCGCCGGCGCCTCCCCTCCGCGGCATCTCCATCTCCCCCGTCGCCGCCCGCCCCATCTCCTCCCTCCGCTCCTCCTCCTCCATCAGGATCATCTCGCCGCCGCACGCCCTCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTCCCGTCCATGGACCCCCAAGAGGTGCCCGATCTGCTGCCCCCGCGCCCACCGGAGCGCGACTTCGCCGGAACGCCATACGTCCCCGTCTATGTCATGCTCCCGCTTGGAGTGGTCAATGGTAATGGCGAGGTGGTCGACGCCGACGTCTTGGTGGGCCAGCTTCGGGTACTCAAGGCTGCCGGCGTCGATGGGGTCATGGTCGATTGCTGGTGGGGGAATGTCGAGGCCCACAGGCCGCAGGAGTACAATTGGACCGGTTACAAGCGACTCTTCCATATGATCAGGGAGCTCAAGCTCAAGCTGCAGGTGGTCATGTCATTCCATGAGTGTGGAGGCAATGTTGGAGATGATGTGTCTATTCCTCTCCCACATTGGGTAACAGAGATCGGAAGAAGCAATCCAGATATCTACTTCACCGACAGGGCTGGCAGGCGTAACACGGAGTGCCTTTCATGGGGCATTGATAAAGAAAGGGTTCTTCAAGGACGGACAGGGGTCGAGGTATTTTGACTACATGAGAAGCTTCCGAGTAGAATTTGATGAATATTTTGAGGATGGTATCATTTCAGAAATTGAGATTGGGCTAGGGGCTTGTGGAGAGTTGAGGTATCCATCTTATCCAGCAAAACATGGGTGGAAATACCCTGGCATTGGAGAATTTCAGTGCTACGACAGATACTTACAGAAAAGTTTAAGAAGAGCTGCAGAAGCACGAGGACATACCATATGGGCAAGAGCGCCAGACAGTGCAGGCCATTATAATTCTGAGCCAAATCTGACTGGATTTTTCTCTGACGGAGGAGATTATGATAGCTACTATGGTCGTTTTTTCCTCAATTGGTATTCCCAGGTGTTGGTGGATCATGCTGACCGTGTATTGATGTTAGCCAGGTTGGCTTTTGAAGGTTCAGATATTGCTGTTAAGGTTTCAGGTGTACACTGGTGGTACAAAACTGCCAGTCATGCTGCTGAATTGACTGCTGGGTTTTATAACCCATGCAACCGTGATGGTTATGCCTCAATTGCTGCTGTCCTGAAAAAACATGGTGCAGCTTTGAACTTTACATGTGTTGAACTGCGCACTATGGATCAGCATGAGGTATTTCCTGAGGCCTTTGCAGATCCAGAGGGCCTTGTATGGCAGGTGCTAAATGCTGCATGGGATGCTGGCATACCAGTAGCTAGTGAGAATGCTCTGCCTTGCTACGATAGAGATGGCTTTAACAAAATTTTGGAGAATGCAAAGCCACTGAATGATCCAGATGGGAGGCATTTACTAGGATTCACGTACCTGAGGCTCACCAAAGTCCTCTTCGAGAGAGCTAATTTTTTGGAATTTGAGCGTTTCGTTAAGAGAATGCATGGTGAAGCAGTTCTCGATCTACAGGTATAAGTTGTGTTCAGGGTTCTTACATACATACATATATATACATGCCATTGTAATTGGCATAGGCCTTATGGCTTATGATGGGGGAACAGAGATGCCATTTTTGTTTCGTAGGTTGTTGTAGTATACCATCAGCAGATTTTTGAACTATAGAGGGTTTGGCTCCATGGTGTAAAGCATACCCTTGGCAAAGAGTTGTCATGCAGAAAATTGATGG  TTT CAT TC GGAAT GAGGTTGGAAG CAGGTGTATTTCT TTCGATG CGGCAGA CATA TTTGA TTTGTCATGAGATGAGGATT GGGTGAGCA GGTGGTATCC TTCTGAAAGATTTGAGGCTGTATTGA AGAGAAT GTGCTGATGCATGTTTATCAT GGAGCAAGCGACATTAATGGAGTTAGCAAAGGTTCTCGCGGTGTATGTGTTTGTATTTGTTGGTGGAATGTCACTCGAGGATCTTGGCTGTATACAATACATACATGTGCTTTTTTTTGGGTCTTTTCTACAGTGTATGAGAAATGCATGTT                     ]
[+] EMBL AU163556             [            ATGATTTCTTCTCCTGCGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCAGGCCGCCCCTCCATCGCCGCGCCGCCGCTCCCCTCCTCGCCGGCGCCTCCCCTCCGCGGCATCTCCATCTCCCCCGTCGCCGCCCGCCCCATCTCCTCCCTCCGCTCCTCCTCCTCCATCAGGATCATCTCGCCGCCGCACGCCCTCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTCCCGTCCATGGACCCCCAAGAGGTGCCCGATCTGCTGCCCCCGCGCCCACCGGAGCGCGACTTCGCCGGAACGCCATACGTCCCCGTCTATGTCATGCTCCCG TTGGAGTGGTCAATGGTAATGGCGANGTGGTCGACG CGACGTCTTGGTGGGGCAG TTCGGGTACT AAGGTTG CGGCGT NATGGGGT ATGGTC ATT CTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL OSS11302A            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccgATACCATATGGGCAAGAGCNCCAGACAGTGCAGGCCATTATAATTCTGAGCCAAATCTNACTGGATTNNACTCTGACGGAGGAGATTATGATAGCTACTATGGTCGTNTTTNCCTCAATTGGTATTCCCAGGTGTTGGTGGATCATGCTGACCGTGTATTGATGTTAGCCAGGTTGGCTTTTNAAGGTTCAGATATTGCTGTTAAGGTTTCAGGTGTACACTGGTGGTACAAAACTGCCAGTCATGCTGCTGAATTGACTGCTGGGTTTTATAACCCATGCAACCGTGATGGTTATGCCTCAATTGCTGCTGTCCTGNAAAAACATGGTGCAGCTTTGAACTTTACATGTGTTG ACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AU172514             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAGATCCAGAGGGCCTTGTATGGCAGGTGCTAAATGCTGCATGGGATGCTGGCATACCAGTAGCTAGTGAGAATGCTCTGCCTTGCTACGATAGAGATGGCTTTAACAAAATTTTGGAGAATGCAAAGCCACTGAATGATCCAGATGGGAGGCATTTACTAGGATTCACGTACCTGAGGCTCACCAAAGTCCTCTTCGAGAGAGCTAATTTTTTGGAATTTGAGCGTTTCGTTAAGAGAATGCATGGTGAAGCAGTTCTCGATCTACAGGTATAAGTTGTGTTCAGGGTTCTTACATACATACATATATATACATGCCATTGTAATTGGCATAGGCCTTATGGCTTATGATGGGGGAACAGAGATGCCATTTTTGTTTCGTAGGTTGTTGTAGTATACCATCAGCAGATTTTTGAACTATAGAGGGTTTGGCTCaaaaaaaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AU032604             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttgGATGGGTTTTCCATCTCNGGAATGGAGGTTGGANGCCAGGTGTATTTCTNTTCGATGCCGGCAGACCATATTTTGATTTTCTCATGAGATGAGGATTNGGGTGAGCANGGTGGTATCCTTTCTGAAAGATTTGAGGCTNTATTGANAGAGAATGGTGCTGATGCATGTTTATCATGGGAGCAAGCGACATTAATGGNGTTAGCAAAGGTTCTCGCGGTGTATGTGTTTGTATTTGTTGGTGGAATGTCACTCGAGGATCTTGGCTGTATACAATACATACATGTGCTTTTTTTTGGGTCTTTTCTACAGTGTATGAGAAATGCATGTTTCTTACTGTCAAAAAAAAAAA]




>consensus_8024#0
ATCATAATAATCATGATTTCTTCTCCTGCGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCAGGCCGCCCC
TCCATCGCCGCGCCGCCGCTCCCCTCCTCGCCGGCGCCTCCCCTCCGCGGCATCTCCATC
TCCCCCGTCGCCGCCCGCCCCATCTCCTCCCTCCGCTCCTCCTCCTCCATCAGGATCATC
TCGCCGCCGCACGCCCTCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTCCCGTCCATGGACCCCCAAGAG
GTGCCCGATCTGCTGCCCCCGCGCCCACCGGAGCGCGACTTCGCCGGAACGCCATACGTC
CCCGTCTATGTCATGCTCCCGCTTGGAGTGGTCAATGGTAATGGCGAGGTGGTCGACGCC
GACGTCTTGGTGGGCCAGCTTCGGGTACTCAAGGCTGCCGGCGTCGATGGGGTCATGGTC
GATTGCTGGTGGGGGAATGTCGAGGCCCACAGGCCGCAGGAGTACAATTGGACCGGTTAC
AAGCGACTCTTCCATATGATCAGGGAGCTCAAGCTCAAGCTGCAGGTGGTCATGTCATTC
CATGAGTGTGGAGGCAATGTTGGAGATGATGTGTCTATTCCTCTCCCACATTGGGTAACA
GAGATCGGAAGAAGCAATCCAGATATCTACTTCACCGACAGGGCTGGCAGGCGTAACACG
GAGTGCCTTTCATGGGGCATTGATAAAGAAAGGGTTCTTCAAGGACGGACAGGGGTCGAG
GTATTTTGACTACATGAGAAGCTTCCGAGTAGAATTTGATGAATATTTTGAGGATGGTAT
CATTTCAGAAATTGAGATTGGGCTAGGGGCTTGTGGAGAGTTGAGGTATCCATCTTATCC
AGCAAAACATGGGTGGAAATACCCTGGCATTGGAGAATTTCAGTGCTACGACAGATACTT
ACAGAAAAGTTTAAGAAGAGCTGCAGAAGCACGAGGACATACCATATGGGCAAGAGCGCC
AGACAGTGCAGGCCATTATAATTCTGAGCCAAATCTGACTGGATTTTTCTCTGACGGAGG
AGATTATGATAGCTACTATGGTCGTTTTTTCCTCAATTGGTATTCCCAGGTGTTGGTGGA
TCATGCTGACCGTGTATTGATGTTAGCCAGGTTGGCTTTTGAAGGTTCAGATATTGCTGT
TAAGGTTTCAGGTGTACACTGGTGGTACAAAACTGCCAGTCATGCTGCTGAATTGACTGC
TGGGTTTTATAACCCATGCAACCGTGATGGTTATGCCTCAATTGCTGCTGTCCTGAAAAA
ACATGGTGCAGCTTTGAACTTTACATGTGTTGAACTGCGCACTATGGATCAGCATGAGGT
ATTTCCTGAGGCCTTTGCAGATCCAGAGGGCCTTGTATGGCAGGTGCTAAATGCTGCATG
GGATGCTGGCATACCAGTAGCTAGTGAGAATGCTCTGCCTTGCTACGATAGAGATGGCTT
TAACAAAATTTTGGAGAATGCAAAGCCACTGAATGATCCAGATGGGAGGCATTTACTAGG
ATTCACGTACCTGAGGCTCACCAAAGTCCTCTTCGAGAGAGCTAATTTTTTGGAATTTGA
GCGTTTCGTTAAGAGAATGCATGGTGAAGCAGTTCTCGATCTACAGGTATAAGTTGTGTT
CAGGGTTCTTACATACATACATATATATACATGCCATTGTAATTGGCATAGGCCTTATGG
CTTATGATGGGGGAACAGAGATGCCATTTTTGTTTCGTAGGTTGTTGTAGTATACCATCA
GCAGATTTTTGAACTATAGAGGGTTTGGCTCCATGGTGTAAAGCATACCCTTGGCAAAGA
GTTGTCATGCAGAAAATTGATGGTTTCATTCGGAATGAGGTTGGAAGCAGGTGTATTTCT
TTCGATGCGGCAGACATATTTGATTTGTCATGAGATGAGGATTGGGTGAGCAGGTGGTAT
CCTTCTGAAAGATTTGAGGCTGTATTGAAGAGAATGTGCTGATGCATGTTTATCATGGAG
CAAGCGACATTAATGGAGTTAGCAAAGGTTCTCGCGGTGTATGTGTTTGTATTTGTTGGT
GGAATGTCACTCGAGGATCTTGGCTGTATACAATACATACATGTGCTTTTTTTTGGGTCT
TTTCTACAGTGTATGAGAAATGCATGTTTCTTACTGTCAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case