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Oryza sativa
cluster # 8113 cluster # 8113       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8113#0 length = 1457 sequences # 5  
consensusID : consensus_8113#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1457
fasta sequence 
                              [TTTTGGTACTCCAGAAAAGCAAATCTTGATCGAACCTATATTTGCTCAATGGATACAATCGGCTCATGGTAAGACGACATATGGGTTCGATATACTCTTATCTTCAACGAGCGGTCCCGCTTTCAATGCGGGTCGAACCCTATGGTTACCCGGATGGTTGAATGCTGTTAACGAGAATAGTAATTCGCTTTTCTTAACAATAGGACCTGGAGATTTCTTGGTTCATCATGCTATTGCTTTAGGTTTGCATACAACTACATTGATTTTAGTAAAGGGTGCTTTAGATGCACGCGGTTCCAAATTAATGCCGGATAAAAAAGATTTTGGATATAGTTTTCCTTGCGACGGCCCTGGTCGCGGCGGTACTTGTGATATTTCTGCTTGGGACGCGTTTTATTTGGCAGTTTTCTGGATGTTAAATACCATTGGATGGGTTACTTTTTATTGGCATTGGAAACACATCACATTATGGCAGGGCAACGTTTCACAATTTAATGAATCCTCCACTTATTTGATGGGATGGTTAAGAGATTACCTATGGTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGATATAATCCTTTTGGGATGAATAGTTTATCGGTATGGGCGTGGATGTTCTTATTTGGACATCTTGTTTGGGCGACTGGATTTATGTTCTTAATTTCCTGGCGTGGATATTGGCAGGAATTAATTGAGACTTTAGCATGGGCTCATGAACGGACACCTTTGGCTAATTTAATTCGCTGGAGAGATAAGCCCGTGGCTCTTTCCA-TTGTGCAAGCAAGATTGGTGGGATTAGCTCACTTTTCCGTGGGTTATATATTCACTTATGCCG-CTTTCTTGATTGCCTCAA-CAT-CAGGCAAGTTTGGTTAATTTAGTTAATTTTGTTGTA-CTGTATCAGCACCTAGTT-CATTACTCTTGATGGAGGGGGAGGATCCGCCTTCTTAGATTTCTTTTTCTATTTATTTTTCCATCTAGGATTAGAACCGTATACTTGGTAGATAGTAGGAACGGCACATTATGGCAAAAAAAAGTTTGATTCAGAGAGAGAGGAAGCGGCAGAAATTAGAA-CAGAAATATCATTTGATTCGTCGATCTTCAAAAAAAAAGATAAGAAGCAAAGTTTACCCTTTGAGTTTGAGTGAAAAAACGAAAATGCGAGAAAAATTGCAATCCCTGCCACGTAATAGTGCACCGACACGCCTTCATCGACGTTGTTTTTTGACCGGAAGACCTAGAGCTAACTATCGAGACTTTGGGCTATCCGGACACATACTTCGAGAAATGGTTTATGCATGTTTGTTACCGGGTGCAACAAGATCCAGTTGGTAAGGATAAAATACCCTTTCGTATTTGTATGGATTTCTGGAATTGATGATCGTAGAAGAGCCCTCTTTACCATTCTGTATAAATGGACTATTCTATTTGTATAGATATGGTAGAGGGGCGTCTATGGAAG]

[+] EMBL AK059927             [TTTTGGTACTCCAGAAAAGCAAATCTTGATCGAACCTATATTTGCTCAATGGATACAATCGGCTCATGGTAAGACGACATATGGGTTCGATATACTCTTATCTTCAACGAGCGGTCCCGCTTTCAATGCGGGTCGAACCCTATGGTTACCCGGATGGTTGAATGCTGTTAACGAGAATAGTAATTCGCTTTTCTTAACAATAGGACCTGGAGATTTCTTGGTTCATCATGCTATTGCTTTAGGTTTGCATACAACTACATTGATTTTAGTAAAGGGTGCTTTAGATGCACGCGGTTCCAAATTAATGCCGGATAAAAAAGATTTTGGATATAGTTTTCCTTGCGACGGCCCTGGTCGCGGCGGTACTTGTGATATTTCTGCTTGGGACGCGTTTTATTTGGCAGTTTTCTGGATGTTAAATACCATTGGATGGGTTACTTTTTATTGGCATTGGAAACACATCACATTATGGCAGGGCAACGTTTCACAATTTAATGAATCCTCCACTTATTTGATGGGATGGTTAAGAGATTACCTATGGTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGATATAATCCTTTTGGGATGAATAGTTTATCGGTATGGGCGTGGATGTTCTTATTTGGACATCTTGTTTGGGCGACTGGATTTATGTTCTTAATTTCCTGGCGTGGATATTGGCAGGAATTAATTGAGACTTTAGCATGGGCTCATGAACGGACACCTTTGGCTAATTTAATTCGCTGGAGAGATAAGCCCGTGGCTCTTTCCA TTGTGCAAGCAAGATTGGTGGGATTAGCTCACTTTTCCGTGGGTTATATATTCACTTATGCCG CTTTCTTGATTGCCTCAA CAT CAGGCAAGTTTGGTTAATTTAGTTAATTTTGTTGTA CTGTATCAGCACCTAGTT CATTACTCTTGATGGAGGGGGAGGATCCGCCTTCTTAGATTTCTTTTTCTATTTATTTTTCTATCTAGGATTAGAACCGTATACTTGGTAGATAGTAGGAACGGCACATTATGGCAAAAAAAAGTTTGATTCAGAGAGAGAGGAAGCGGCAGAAATTAGAA CAGAAATATCATTTGATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CA763791             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TACTTTTTATTGGCATTGGAAACACATCACATTATGGCGGGGCAACGTTTCACAATTTAATGAATCCTCCACTTATTTGATGGGATGGTTAAGAGATTACCTATGGTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGATATAATCCTTTTGGGATGAATAGTTTATCGGTATGGGCGTGGATGCTCTTATTTGGACATCTTGTTTGGGCGACTGGATTTATGTTCTTAATTTCCTGGCGTGGATATTGGCAGGAATTAATTGAGACTTTAGCATGGGCTCATGAACGGACACCTTTGGCTAATTTAATTCGCTGGAGAGATAAGCCCGTGGCTCTCTCCA TTGTGCAAGCAAGATTGGTGGGATTAGCTCACTTTTCCGTGGGTTATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI796900             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgccCAGGAATTAATTGAGACTTTAGCATGGGCTCATGACCGGACCCCTTTGGCTAATTTAATTCGCTGGAGAGATAAGCCCGTGGCTCTTTCCACTTGTCCAAGCAAGATTGGTGGGATTAGCTCACTTTTCCGTGGGTTATATATTCACTTATGCCGCCTTTCTTGATTGCCTCAACCATCCAGGCAAGTTTGGTTAATTTAGTTAATTTTGTTGTACCTGTATCAGCACCTAGTTCCATTACTCTTGATGGAGGGGGAGGATCCGCCTTCTTAGATTTCTTTTTCTATTTATTTTTCCATCTAGGATTAGAACCGTATACTTGGTAGATAGTAGGAACGGCACATTAT GCAAAAAAAAGTTTGATTCAGAGAGAGAGGAACCGCCAGAAATTAGAACCAGAAATATCATTTGATTCGTCGATCTTCAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI809292             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCCCGTGGCTCTTTCCA TTGTGCAAGCAAGATTGGTGGGATTAGCTCACTTTTCCGTGGGTTATATATTCACTTATGCCG CTTTCTTGATTGCCTCAA CAT CAGGCAAGTTTGGTTAATTTAGTTAATTTTGTTGTA CTGTATCAGCACCTAGTT CATTACTCTTGATGGAGGGGGAGGATCCGCCTTCTTAGATTTCTTTTTCTATTTATTTTTCCATCTAGGATTAGAACCGTATACTTGGTAGATAGTAGGAACGGCACATTATGGCAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AK119250             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTAATTTTGTTGTA CTGTATCAGCACCTAGTT CATTACTCTTGATGGAGGGGGAGGATCCGCCTTCTTAGATTTCTTTTTCTATTTATTTTTCCATCTAGGATTAGAACCGTATACTTGGTAGATAGTAGGAACGGCACATTATGGCAAAAAAAAGTTTGATTCAGAGAGAGAGGAAGCGGCAGAAATTAGAA CAGAAATATCATTTGATTCGTCGATCTTTAAAAAAAAAGATAAGAAGCAAAGTTTACCCTTTGAGTTTGAGTGAAAAAACGAAAATGCGAGAAAAATTGCAATCCCTGCCACGTAATAGTGCACCGACACGCCTTCATCGACGTTGTTTTTTGACCGGAAGACCTAGAGCTAACTATCGAGACTTTGGGCTATCCGGACACATACTTCGAGAAATGGTTTATGCATGTTTGTTACCGGGTGCAACAAGATCCAGTTGGTAAGGATAAAATACCCTTTCGTATTTGTATGGATTTCTGGAATTGATGATCGTAGAAGAGCCCTCTTTACCATTCTGTATAAATGGACTATTCTATTTGTATAGATATGGTAGAGGGGCGTCTATGGAAG]




>consensus_8113#0
TTTTGGTACTCCAGAAAAGCAAATCTTGATCGAACCTATATTTGCTCAATGGATACAATC
GGCTCATGGTAAGACGACATATGGGTTCGATATACTCTTATCTTCAACGAGCGGTCCCGC
TTTCAATGCGGGTCGAACCCTATGGTTACCCGGATGGTTGAATGCTGTTAACGAGAATAG
TAATTCGCTTTTCTTAACAATAGGACCTGGAGATTTCTTGGTTCATCATGCTATTGCTTT
AGGTTTGCATACAACTACATTGATTTTAGTAAAGGGTGCTTTAGATGCACGCGGTTCCAA
ATTAATGCCGGATAAAAAAGATTTTGGATATAGTTTTCCTTGCGACGGCCCTGGTCGCGG
CGGTACTTGTGATATTTCTGCTTGGGACGCGTTTTATTTGGCAGTTTTCTGGATGTTAAA
TACCATTGGATGGGTTACTTTTTATTGGCATTGGAAACACATCACATTATGGCAGGGCAA
CGTTTCACAATTTAATGAATCCTCCACTTATTTGATGGGATGGTTAAGAGATTACCTATG
GTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGATATAATCCTTTTGGGATGAATAGTTTATCGGT
ATGGGCGTGGATGTTCTTATTTGGACATCTTGTTTGGGCGACTGGATTTATGTTCTTAAT
TTCCTGGCGTGGATATTGGCAGGAATTAATTGAGACTTTAGCATGGGCTCATGAACGGAC
ACCTTTGGCTAATTTAATTCGCTGGAGAGATAAGCCCGTGGCTCTTTCCATTGTGCAAGC
AAGATTGGTGGGATTAGCTCACTTTTCCGTGGGTTATATATTCACTTATGCCGCTTTCTT
GATTGCCTCAACATCAGGCAAGTTTGGTTAATTTAGTTAATTTTGTTGTACTGTATCAGC
ACCTAGTTCATTACTCTTGATGGAGGGGGAGGATCCGCCTTCTTAGATTTCTTTTTCTAT
TTATTTTTCCATCTAGGATTAGAACCGTATACTTGGTAGATAGTAGGAACGGCACATTAT
GGCAAAAAAAAGTTTGATTCAGAGAGAGAGGAAGCGGCAGAAATTAGAACAGAAATATCA
TTTGATTCGTCGATCTTCAAAAAAAAAGATAAGAAGCAAAGTTTACCCTTTGAGTTTGAG
TGAAAAAACGAAAATGCGAGAAAAATTGCAATCCCTGCCACGTAATAGTGCACCGACACG
CCTTCATCGACGTTGTTTTTTGACCGGAAGACCTAGAGCTAACTATCGAGACTTTGGGCT
ATCCGGACACATACTTCGAGAAATGGTTTATGCATGTTTGTTACCGGGTGCAACAAGATC
CAGTTGGTAAGGATAAAATACCCTTTCGTATTTGTATGGATTTCTGGAATTGATGATCGT
AGAAGAGCCCTCTTTACCATTCTGTATAAATGGACTATTCTATTTGTATAGATATGGTAG
AGGGGCGTCTATGGAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)