cluster # 8173

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 8173 cluster # 8173 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8173#0 length = 2450 sequences # 5
consensusID : consensus_8173#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 2450
fasta sequence
                              [CAGTTTATCACACTTGTTGGGTCATGAATTTCTGAAGCTGACCATGGCCATTTCTGGTGCACTCTTTCTCCCTGGTATCTTTCAAAGCTTGAGTATACTAGCTGTTCTTGGGGTTCTTGTTACTAAGAGTGGAGCTGCTGATTTTCAAGAACAACCAGCTTGCGTTCCTTTCTCCTGTGGACATCTTGAAGGTATCAGGTACCCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGAAAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTTGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGTTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGTTCAAAACATCGAGCCTTCTTGT-GGATACTTGGCTGTGATTCCTGT-GGATGATCGTACAAAGAATGTACCAGACTATGCAAGCTATGCAGATGTTGTGAAATTCATGAGGAATGGTTTTCCTGTTTCGTTTCCTCGAGTTGAATCCCCAAGTCATTCTCCAGTCATCAAAGCCTGTGCGAGAGATACATTCCAAAACTTTAAGGAGCAAATGTATAGTAGGAACATTCAAAACTGGACTTCTGCCATTATTGGGACCGAGCTACAATTTTTAGGATGTGTAATTAATTATTACTCTAGTGCCACGCAAGTTTGGGTTACTCTCGTTCTGGTATTTGCCGTAGAGATTGTTAAGTGCATTATAGTACTATGCAGGTTCATCTTGGCGCCGTTGACTGTTTTGACCTTCCTCGGTTACAAATACCGGAAAACAAGGATATCTATCGACGCAGTAGAGAAGTTTCTCCGAATGCAGCAAGCTCATGGTCCAAAGAGGTATGCGTACACAGAAATCACTGCAATCACAGGCCATTTCAGGGAGAAGCTAGGCCAGGGGGGCTATGGTTCTGTGTACAAAGGTTTCCTTCCTGGCGATGGTCATGTTGCTATCAAGATGCTGAGCAACTCCATGTGCAATGGAGAAGAATTCATCAGCGAGGTTTCCACCATTAGCAGGATACACCATGTGAATGTGGTGCGCCTTGTTGGATTTTGCTCGGAGGAACTTAGGAGGGCTCTTGTATATGAGTACATGCCCTGTGGATCTCTAGACAAGTACATTTTCTCACCCGAGAAGAGTCTATCTTGGGACAAGCTCAATGAGATTGCTCTAGGAATTGCTAGAGGGATCGACTACTTGCATCATGGTTGTGATATGCAGATCATGCACTTTGACATCAAGCCACACAACATCCTTCTGGATAGCAACTTCACTCCAAAAGTCGCCGACTTTGGGCTGGCCAAGCTATACCCAAGGGACGACAGCTTGGTGCCGGTGAGTGCTGCACGGGGAACGATAGGGTACATCGCTCCTGAGATGATATCTCGAAGCTTTGGCACCATTTCATGCAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGGATGTTATTGCTGGACATTGCTGGTGGTAGGAGGAACA-GGGAGCAGCATACATCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGCCTAACTCAACAAGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATGTTGGTATCCACTGGGTAGAAAGGAAGTTGTGCATTGTTGGGTTCTGGTGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGAGCGAGGTTGTGGAGATGCTCGAATCTGATGATCCTGATAACCTGCAGGTACCTCCGAGACCTTTCTTTGGTGTGGATGATCACATCTCTGAGATGGATGATTGCTGCAATTCTTCATCAAAGTCAAGTGCAATCTCAGAGGATGACTGAAGCAAACTAGGATAGCGACTTGACATTCCTGCCCACGTATATATTCAGTTCGTGCCCTGCTTTTTGCCTCATCTTTTTGCGGGTTATTTGTTTCGCTTTTTTTCATCTATCCCTGTATATATCTTGCTATAATTTTCTCCTGCTCTATTAATATATACAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCCTTTAAAAAAAATATATATTCAGTTCGTGCTTATACAACAGGGGATGTTTCTTGACTCTTGTAGAGGTATGAGGTTAATATGAAGATTAGTAGGACTAAGAAGAATTCCTCGTTGATATTTTCAGGTTGCTAGATTGTTCATCAGTACACGACCCTGATTGTACTGCATAAAAAGGAAGTAATAATATAGGAGTTTTGATTGATGGACTTTGACCTGACCAGAAATTTGGTGTAGTTTGAGGACATCTT]

[+] EMBL AK111565             [CAGTTTATCACACTTGTTGGGTCATGAATTTCTGAAGCTGACCATGGCCATTTCTGGTGCACTCTTTCTCCCTGGTATCTTTCAAAGCTTGAGTATACTAGCTGTTCTTGGGGTTCTTGTTACTAAGAGTGGAGCTGCTGATTTTCAAGAACAACCAGCTTGCGTTCCTTTCTCCTGTGGACATCTTGAAGGTATCAGGTACCCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGAAAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTTGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGTTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGTTCAAAACATCGAGCCTTCTTGT GGATACTTGGCTGTGATTCCTGT GGATGATCGTACAAAGAATGTACCAGACTATGCAAGCTATGCAGATGTTGTGAAATTCATGAGGAATGGTTTTCCTGTTTCGTTTCCTCGAGTTGAATCCCCAAGTCATTCTCCAGTCATCAAAGCCTGTGCGAGAGATACATTCCAAAACTTTAAGGAGCAAATGTATAGTAGGAACATTCAAAACTGGACTTCTGCCATTATTGGGACCGAGCTACAATTTTTAGGATGTGTAATTAATTATTACTCTAGTGCCACGCAAGTTTGGGTTACTCTCGTTCTGGTATTTGCCGTAGAGATTGTTAAGTGCATTATAGTACTATGCAGGTTCATCTTGGCGCCGTTGACTGTTTTGACCTTCCTCGGTTACAAATACCGGAAAACAAGGATATCTATCGACGCAGTAGAGAAGTTTCTCCGAATGCAGCAAGCTCATGGTCCAAAGAGGTATGCGTACACAGAAATCACTGCAATCACAGGCCATTTCAGGGAGAAGCTAGGCCAGGGGGGCTATGGTTCTGTGTACAAAGGTTTCCTTCCTGGCGATGGTCATGTTGCTATCAAGATGCTGAGCAACTCCATGTGCAATGGAGAAGAATTCATCAGCGAGGTTTCCACCATTAGCAGGATACACCATGTGAATGTGGTGCGCCTTGTTGGATTTTGCTCGGAGGAACTTAGGAGGGCTCTTGTATATGAGTACATGCCCTGTGGATCTCTAGACAAGTACATTTTCTCACCCGAGAAGAGTCTATCTTGGGACAAGCTCAATGAGATTGCTCTAGGAATTGCTAGAGGGATCGACTACTTGCATCATGGTTGTGATATGCAGATCATGCACTTTGACATCAAGCCACACAACATCCTTCTGGATAGCAACTTCACTCCAAAAGTCGCCGACTTTGGGCTGGCCAAGCTATACCCAAGGGACGACAGCTTGGTGCCGGTGAGTGCTGCACGGGGAACGATAGGGTACATCGCTCCTGAGATGATATCTCGAAGCTTTGGCACCATTTCATGCAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGGATGTTATTGCTGGACATTGCTGGTGGTAGGAGGAACA GGGAGCAGCATACATCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGCCTAACTCAACAAGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATATTGGTATCCACTGGGTAGAAAGGAAGTTGTGCATTGTTGGGTTCTGGTGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGAGCGAGGTTGTGGAGATGCTCGAATCTGATGATCCTGATAACCTGCAGGTACCTCCGAGACCTTTCTTTGGTGTGGATGATCACATCTCTGAGATGGATGATTGCTGCAATTCTTCATCAAAGTCAAGTGCAATCTCAGAGGATGACTGAAGCAAACTAGGATAGCGACTTGACATTCCTGCCCACGTATATATTCAGTTCGTGCCCTGCTTTTTGCCTCATCTTTTTGCGGGTTATTTGTTTCGCTTTTTTTCATCTATCCCTGTATATATCTTGCTATAATTTTCTCCTGCTCTATTAATATATACAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCCTTTAAAAAAAATATATATTCAGTTC                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB635030             [                                   AGCTG CCTTGGCCATTTCTGGTGCACTCTTTCTCCCTGGTATCTTTCAAACCTTGAGTATACTAGCTGTTCTTGGGGCCCTTGTTACTAAGAGTGGAGCTGCTGATTTTCAAGAACAACCAGCTTGCGTTCCTTTCTCCTGTGGACATCTTGAAGGTATCAGGTACCCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGACAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTTGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGTTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGTTCAAAACATCGAGCCTTCTTGT GGATACTTGGCTGTGATTCCTGT GGATGATCGTACAAAGAATGTACCAGACTATGCAAGCTATGCAGATGTTGTGAAATTCATGAGGAATGGTTTTCCTGTTTCGTTTCCTCGAGTTGAATCCCCAAGTCATTCTCCAGTCATCAAAGCCTGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL C28887               [                                                                                                                                                                                                          CCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGAAAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTNGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGGTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGGTCAAAACATCGAGCCTTCTTGTGGGATACTTGGCTGTAATTCCCGTGGGATGATCCNACAAAGAATGTACCNGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CA764419             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTAGGCCAGGGGGGCTATGGTTCTGTGTACAAAGGTTTCCTTCCTGGCGATGGTCATGTTGCTATCAAGATGCTGAGCAACTCCATGTGCAATGGAGAAGAATTCATCAGCGAGGTTTCCACCATTAGCAGGATACACCATGTGAATGTGGTGCGCCTTGTTGGATTTTGCTCGGAGGAACTTAGGAGGGCTCTTGTATATGAGTACATGCCCTGTGGATCTCTAGACAAGTACATTTTCTCACCCGAGAAGAGTCTATCTTGGGACAAGCTCAATGAGATTGCTCTAGGAATTGCTAGAGGGATCGACTACTTGCATCATGGTTGTGATATGCAGATCATGCACTTTGACATCAAGCCACACAACATCCTTCTGGATAGCAACTTCACTCCAAAAGTCGCCGACTTTGGGCTGGCCAAGCTATACCCAAGGGACGACAGCTTGGTGCCGGTGAGTGCTGCACGGGGAACGATAGGGTACATCGCTCCTGAGATGATATCTCGAAGCTTTGGCACCATTTCATGCAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGGATGNTATTGCTGGACATTGCTGGTGGTAGGAGGAACAGGGGAGCAGCATACATCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGNCTAACTCAACAGGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATGNTGGTATCCACTGGGTANAAAGGAAGTTGGGCATTGGTGGGTTCTGGNGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGANCGAGGTTGGGGANATGCTCGAATCTGATGATCCTGANACCCTGCAGG ACCTCCGAGACCTTTNTTTGG GGGGATGATCCCATTTCTGA AAGGANGATTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CB635031             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGCCTAACTCAACAAGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATGTTGGTATCCACTGGGTAGAAAGGAAGTTGTGCATTGTTGGGTTCTGGTGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGAGCGAGGTTGTGGAGATGCTCGAATCTGATGATCCTGATAACCTGCAGGTACCTCCGAGACCTTTCTTTGGTGTGGATGATCACATCTCTGAGATGGATGATTGCTGCAATTCTTCATCAAAGTCAAGTGCAATCTCAGAGGATGACTGAAGCAAACTAGGATAGCGACTTGACATTCCTGCCCACGTATATATTCAGTTCGTGCCCTGCTTTTTGCCTCTCCTTTTTGCGGGTTATTTGTTTCGCTTTTTTTCATCTAACCCTGTATATATCTCGCTATAATTTTCTCCTGCTCTATTAATATATACAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCCTTTAAAAAAA  ATATATTCAGTTCGTGCTTATACAACAGGGGATGTTTCTTGACTCTTGTAGAGGTATGAGGTTAATATGAAGATTAGTAGGACTAAGAAGAATTCCTCGTTGATATTTTCAGGTTGCTAGATTGTTCATCAGTACACGACCCTGATTGTACTGCATAAAAAGGAAGTAATAATATAGGAGTTTTGATTGATGGACTTTGACCTGACCAGAAATTTGGTGTAGTTTGAGGACATCTT]




>consensus_8173#0
CAGTTTATCACACTTGTTGGGTCATGAATTTCTGAAGCTGACCATGGCCATTTCTGGTGC
ACTCTTTCTCCCTGGTATCTTTCAAAGCTTGAGTATACTAGCTGTTCTTGGGGTTCTTGT
TACTAAGAGTGGAGCTGCTGATTTTCAAGAACAACCAGCTTGCGTTCCTTTCTCCTGTGG
ACATCTTGAAGGTATCAGGTACCCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGA
TGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAA
ATATTTTGTGAAAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTT
AGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGG
CACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGAT
AAACAATGGCATGTACATGCCTGTTGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGTTTATGT
CTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGTTCAAAACATCGAGCCTTCTTGTGGATACTTGGC
TGTGATTCCTGTGGATGATCGTACAAAGAATGTACCAGACTATGCAAGCTATGCAGATGT
TGTGAAATTCATGAGGAATGGTTTTCCTGTTTCGTTTCCTCGAGTTGAATCCCCAAGTCA
TTCTCCAGTCATCAAAGCCTGTGCGAGAGATACATTCCAAAACTTTAAGGAGCAAATGTA
TAGTAGGAACATTCAAAACTGGACTTCTGCCATTATTGGGACCGAGCTACAATTTTTAGG
ATGTGTAATTAATTATTACTCTAGTGCCACGCAAGTTTGGGTTACTCTCGTTCTGGTATT
TGCCGTAGAGATTGTTAAGTGCATTATAGTACTATGCAGGTTCATCTTGGCGCCGTTGAC
TGTTTTGACCTTCCTCGGTTACAAATACCGGAAAACAAGGATATCTATCGACGCAGTAGA
GAAGTTTCTCCGAATGCAGCAAGCTCATGGTCCAAAGAGGTATGCGTACACAGAAATCAC
TGCAATCACAGGCCATTTCAGGGAGAAGCTAGGCCAGGGGGGCTATGGTTCTGTGTACAA
AGGTTTCCTTCCTGGCGATGGTCATGTTGCTATCAAGATGCTGAGCAACTCCATGTGCAA
TGGAGAAGAATTCATCAGCGAGGTTTCCACCATTAGCAGGATACACCATGTGAATGTGGT
GCGCCTTGTTGGATTTTGCTCGGAGGAACTTAGGAGGGCTCTTGTATATGAGTACATGCC
CTGTGGATCTCTAGACAAGTACATTTTCTCACCCGAGAAGAGTCTATCTTGGGACAAGCT
CAATGAGATTGCTCTAGGAATTGCTAGAGGGATCGACTACTTGCATCATGGTTGTGATAT
GCAGATCATGCACTTTGACATCAAGCCACACAACATCCTTCTGGATAGCAACTTCACTCC
AAAAGTCGCCGACTTTGGGCTGGCCAAGCTATACCCAAGGGACGACAGCTTGGTGCCGGT
GAGTGCTGCACGGGGAACGATAGGGTACATCGCTCCTGAGATGATATCTCGAAGCTTTGG
CACCATTTCATGCAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGGATGTTATTGCTGGACATTGCTGG
TGGTAGGAGGAACAGGGAGCAGCATACATCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTT
GGTGTATGATTGCCTAACTCAACAAGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATGTTGGTATCCA
CTGGGTAGAAAGGAAGTTGTGCATTGTTGGGTTCTGGTGCATTCAGATGAAACCAGCTGA
ACGGCCTTCGATGAGCGAGGTTGTGGAGATGCTCGAATCTGATGATCCTGATAACCTGCA
GGTACCTCCGAGACCTTTCTTTGGTGTGGATGATCACATCTCTGAGATGGATGATTGCTG
CAATTCTTCATCAAAGTCAAGTGCAATCTCAGAGGATGACTGAAGCAAACTAGGATAGCG
ACTTGACATTCCTGCCCACGTATATATTCAGTTCGTGCCCTGCTTTTTGCCTCATCTTTT
TGCGGGTTATTTGTTTCGCTTTTTTTCATCTATCCCTGTATATATCTTGCTATAATTTTC
TCCTGCTCTATTAATATATACAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCCTTTAAAAAAAATATATAT
TCAGTTCGTGCTTATACAACAGGGGATGTTTCTTGACTCTTGTAGAGGTATGAGGTTAAT
ATGAAGATTAGTAGGACTAAGAAGAATTCCTCGTTGATATTTTCAGGTTGCTAGATTGTT
CATCAGTACACGACCCTGATTGTACTGCATAAAAAGGAAGTAATAATATAGGAGTTTTGA
TTGATGGACTTTGACCTGACCAGAAATTTGGTGTAGTTTGAGGACATCTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case