These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8173#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 2450 fasta sequence [CAGTTTATCACACTTGTTGGGTCATGAATTTCTGAAGCTGACCATGGCCATTTCTGGTGCACTCTTTCTCCCTGGTATCTTTCAAAGCTTGAGTATACTAGCTGTTCTTGGGGTTCTTGTTACTAAGAGTGGAGCTGCTGATTTTCAAGAACAACCAGCTTGCGTTCCTTTCTCCTGTGGACATCTTGAAGGTATCAGGTACCCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGAAAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTTGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGTTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGTTCAAAACATCGAGCCTTCTTGT-GGATACTTGGCTGTGATTCCTGT-GGATGATCGTACAAAGAATGTACCAGACTATGCAAGCTATGCAGATGTTGTGAAATTCATGAGGAATGGTTTTCCTGTTTCGTTTCCTCGAGTTGAATCCCCAAGTCATTCTCCAGTCATCAAAGCCTGTGCGAGAGATACATTCCAAAACTTTAAGGAGCAAATGTATAGTAGGAACATTCAAAACTGGACTTCTGCCATTATTGGGACCGAGCTACAATTTTTAGGATGTGTAATTAATTATTACTCTAGTGCCACGCAAGTTTGGGTTACTCTCGTTCTGGTATTTGCCGTAGAGATTGTTAAGTGCATTATAGTACTATGCAGGTTCATCTTGGCGCCGTTGACTGTTTTGACCTTCCTCGGTTACAAATACCGGAAAACAAGGATATCTATCGACGCAGTAGAGAAGTTTCTCCGAATGCAGCAAGCTCATGGTCCAAAGAGGTATGCGTACACAGAAATCACTGCAATCACAGGCCATTTCAGGGAGAAGCTAGGCCAGGGGGGCTATGGTTCTGTGTACAAAGGTTTCCTTCCTGGCGATGGTCATGTTGCTATCAAGATGCTGAGCAACTCCATGTGCAATGGAGAAGAATTCATCAGCGAGGTTTCCACCATTAGCAGGATACACCATGTGAATGTGGTGCGCCTTGTTGGATTTTGCTCGGAGGAACTTAGGAGGGCTCTTGTATATGAGTACATGCCCTGTGGATCTCTAGACAAGTACATTTTCTCACCCGAGAAGAGTCTATCTTGGGACAAGCTCAATGAGATTGCTCTAGGAATTGCTAGAGGGATCGACTACTTGCATCATGGTTGTGATATGCAGATCATGCACTTTGACATCAAGCCACACAACATCCTTCTGGATAGCAACTTCACTCCAAAAGTCGCCGACTTTGGGCTGGCCAAGCTATACCCAAGGGACGACAGCTTGGTGCCGGTGAGTGCTGCACGGGGAACGATAGGGTACATCGCTCCTGAGATGATATCTCGAAGCTTTGGCACCATTTCATGCAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGGATGTTATTGCTGGACATTGCTGGTGGTAGGAGGAACA-GGGAGCAGCATACATCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGCCTAACTCAACAAGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATGTTGGTATCCACTGGGTAGAAAGGAAGTTGTGCATTGTTGGGTTCTGGTGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGAGCGAGGTTGTGGAGATGCTCGAATCTGATGATCCTGATAACCTGCAGGTACCTCCGAGACCTTTCTTTGGTGTGGATGATCACATCTCTGAGATGGATGATTGCTGCAATTCTTCATCAAAGTCAAGTGCAATCTCAGAGGATGACTGAAGCAAACTAGGATAGCGACTTGACATTCCTGCCCACGTATATATTCAGTTCGTGCCCTGCTTTTTGCCTCATCTTTTTGCGGGTTATTTGTTTCGCTTTTTTTCATCTATCCCTGTATATATCTTGCTATAATTTTCTCCTGCTCTATTAATATATACAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCCTTTAAAAAAAATATATATTCAGTTCGTGCTTATACAACAGGGGATGTTTCTTGACTCTTGTAGAGGTATGAGGTTAATATGAAGATTAGTAGGACTAAGAAGAATTCCTCGTTGATATTTTCAGGTTGCTAGATTGTTCATCAGTACACGACCCTGATTGTACTGCATAAAAAGGAAGTAATAATATAGGAGTTTTGATTGATGGACTTTGACCTGACCAGAAATTTGGTGTAGTTTGAGGACATCTT] [+] EMBL AK111565 [CAGTTTATCACACTTGTTGGGTCATGAATTTCTGAAGCTGACCATGGCCATTTCTGGTGCACTCTTTCTCCCTGGTATCTTTCAAAGCTTGAGTATACTAGCTGTTCTTGGGGTTCTTGTTACTAAGAGTGGAGCTGCTGATTTTCAAGAACAACCAGCTTGCGTTCCTTTCTCCTGTGGACATCTTGAAGGTATCAGGTACCCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGAAAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTTGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGTTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGTTCAAAACATCGAGCCTTCTTGT GGATACTTGGCTGTGATTCCTGT GGATGATCGTACAAAGAATGTACCAGACTATGCAAGCTATGCAGATGTTGTGAAATTCATGAGGAATGGTTTTCCTGTTTCGTTTCCTCGAGTTGAATCCCCAAGTCATTCTCCAGTCATCAAAGCCTGTGCGAGAGATACATTCCAAAACTTTAAGGAGCAAATGTATAGTAGGAACATTCAAAACTGGACTTCTGCCATTATTGGGACCGAGCTACAATTTTTAGGATGTGTAATTAATTATTACTCTAGTGCCACGCAAGTTTGGGTTACTCTCGTTCTGGTATTTGCCGTAGAGATTGTTAAGTGCATTATAGTACTATGCAGGTTCATCTTGGCGCCGTTGACTGTTTTGACCTTCCTCGGTTACAAATACCGGAAAACAAGGATATCTATCGACGCAGTAGAGAAGTTTCTCCGAATGCAGCAAGCTCATGGTCCAAAGAGGTATGCGTACACAGAAATCACTGCAATCACAGGCCATTTCAGGGAGAAGCTAGGCCAGGGGGGCTATGGTTCTGTGTACAAAGGTTTCCTTCCTGGCGATGGTCATGTTGCTATCAAGATGCTGAGCAACTCCATGTGCAATGGAGAAGAATTCATCAGCGAGGTTTCCACCATTAGCAGGATACACCATGTGAATGTGGTGCGCCTTGTTGGATTTTGCTCGGAGGAACTTAGGAGGGCTCTTGTATATGAGTACATGCCCTGTGGATCTCTAGACAAGTACATTTTCTCACCCGAGAAGAGTCTATCTTGGGACAAGCTCAATGAGATTGCTCTAGGAATTGCTAGAGGGATCGACTACTTGCATCATGGTTGTGATATGCAGATCATGCACTTTGACATCAAGCCACACAACATCCTTCTGGATAGCAACTTCACTCCAAAAGTCGCCGACTTTGGGCTGGCCAAGCTATACCCAAGGGACGACAGCTTGGTGCCGGTGAGTGCTGCACGGGGAACGATAGGGTACATCGCTCCTGAGATGATATCTCGAAGCTTTGGCACCATTTCATGCAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGGATGTTATTGCTGGACATTGCTGGTGGTAGGAGGAACA GGGAGCAGCATACATCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGCCTAACTCAACAAGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATATTGGTATCCACTGGGTAGAAAGGAAGTTGTGCATTGTTGGGTTCTGGTGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGAGCGAGGTTGTGGAGATGCTCGAATCTGATGATCCTGATAACCTGCAGGTACCTCCGAGACCTTTCTTTGGTGTGGATGATCACATCTCTGAGATGGATGATTGCTGCAATTCTTCATCAAAGTCAAGTGCAATCTCAGAGGATGACTGAAGCAAACTAGGATAGCGACTTGACATTCCTGCCCACGTATATATTCAGTTCGTGCCCTGCTTTTTGCCTCATCTTTTTGCGGGTTATTTGTTTCGCTTTTTTTCATCTATCCCTGTATATATCTTGCTATAATTTTCTCCTGCTCTATTAATATATACAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCCTTTAAAAAAAATATATATTCAGTTC ] [+] EMBL CB635030 [ AGCTG CCTTGGCCATTTCTGGTGCACTCTTTCTCCCTGGTATCTTTCAAACCTTGAGTATACTAGCTGTTCTTGGGGCCCTTGTTACTAAGAGTGGAGCTGCTGATTTTCAAGAACAACCAGCTTGCGTTCCTTTCTCCTGTGGACATCTTGAAGGTATCAGGTACCCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGACAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTTGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGTTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGTTCAAAACATCGAGCCTTCTTGT GGATACTTGGCTGTGATTCCTGT GGATGATCGTACAAAGAATGTACCAGACTATGCAAGCTATGCAGATGTTGTGAAATTCATGAGGAATGGTTTTCCTGTTTCGTTTCCTCGAGTTGAATCCCCAAGTCATTCTCCAGTCATCAAAGCCTGTGC ] [+] EMBL C28887 [ CCTTTCCGTTTACAAGGTGATCCACTTGGCTGTGGTGATGAAGCTTATGAGCTAGTCTGTAGAGATGGCAGAGCTATAATTCACATCAACACAGGAAAATATTTTGTGAAAGACATCTCCTATAACGAGTCTAGATTTTGGGTTGTTGATGCTAATTTAGACAACAGCAGTTGCCCTCTTCCACTGTGGAATAATCTTCCCTACTTCAATGACATGGGCACTAAGCTGTACACTTCTGCAGTTCGGTGGGCTACATTTCTAAATTGCTCACGGGCGATAAACAATGGCATGTACATGCCTGTNGCTTGCTTGAGTGGGAATACTTCTTTTGGTTATGTCTTGACTACATCGAGCTCTTACTATGGTCAAAACATCGAGCCTTCTTGTGGGATACTTGGCTGTAATTCCCGTGGGATGATCCNACAAAGAATGTACCNGAC ] [+] EMBL CA764419 [ CTAGGCCAGGGGGGCTATGGTTCTGTGTACAAAGGTTTCCTTCCTGGCGATGGTCATGTTGCTATCAAGATGCTGAGCAACTCCATGTGCAATGGAGAAGAATTCATCAGCGAGGTTTCCACCATTAGCAGGATACACCATGTGAATGTGGTGCGCCTTGTTGGATTTTGCTCGGAGGAACTTAGGAGGGCTCTTGTATATGAGTACATGCCCTGTGGATCTCTAGACAAGTACATTTTCTCACCCGAGAAGAGTCTATCTTGGGACAAGCTCAATGAGATTGCTCTAGGAATTGCTAGAGGGATCGACTACTTGCATCATGGTTGTGATATGCAGATCATGCACTTTGACATCAAGCCACACAACATCCTTCTGGATAGCAACTTCACTCCAAAAGTCGCCGACTTTGGGCTGGCCAAGCTATACCCAAGGGACGACAGCTTGGTGCCGGTGAGTGCTGCACGGGGAACGATAGGGTACATCGCTCCTGAGATGATATCTCGAAGCTTTGGCACCATTTCATGCAAGGCTGATGTTTACAGCTTTGGGATGNTATTGCTGGACATTGCTGGTGGTAGGAGGAACAGGGGAGCAGCATACATCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGNCTAACTCAACAGGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATGNTGGTATCCACTGGGTANAAAGGAAGTTGGGCATTGGTGGGTTCTGGNGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGANCGAGGTTGGGGANATGCTCGAATCTGATGATCCTGANACCCTGCAGG ACCTCCGAGACCTTTNTTTGG GGGGATGATCCCATTTCTGA AAGGANGATTGC ] [-] EMBL CB635031 [ TCCAACTCAGCCCATCTTTATTACCCAGCTTTGGTGTATGATTGCCTAACTCAACAAGAAGTGAGCGAGATTTCAGAGGATGTTGGTATCCACTGGGTAGAAAGGAAGTTGTGCATTGTTGGGTTCTGGTGCATTCAGATGAAACCAGCTGAACGGCCTTCGATGAGCGAGGTTGTGGAGATGCTCGAATCTGATGATCCTGATAACCTGCAGGTACCTCCGAGACCTTTCTTTGGTGTGGATGATCACATCTCTGAGATGGATGATTGCTGCAATTCTTCATCAAAGTCAAGTGCAATCTCAGAGGATGACTGAAGCAAACTAGGATAGCGACTTGACATTCCTGCCCACGTATATATTCAGTTCGTGCCCTGCTTTTTGCCTCTCCTTTTTGCGGGTTATTTGTTTCGCTTTTTTTCATCTAACCCTGTATATATCTCGCTATAATTTTCTCCTGCTCTATTAATATATACAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCCTTTAAAAAAA ATATATTCAGTTCGTGCTTATACAACAGGGGATGTTTCTTGACTCTTGTAGAGGTATGAGGTTAATATGAAGATTAGTAGGACTAAGAAGAATTCCTCGTTGATATTTTCAGGTTGCTAGATTGTTCATCAGTACACGACCCTGATTGTACTGCATAAAAAGGAAGTAATAATATAGGAGTTTTGATTGATGGACTTTGACCTGACCAGAAATTTGGTGTAGTTTGAGGACATCTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||