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Oryza sativa
cluster # 8179 cluster # 8179       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8179#0 length = 823 sequences # 5  
consensusID : consensus_8179#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 823
fasta sequence 
                              [AAAGGTCTCCTGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG-AG-GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT-TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG-AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGCCAAGTTAATAAGAAACACGACGATTCTCA]

[+] EMBL CB623129             [AAAGGTCTCCGGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAATATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGCCAAGTTAATAAGAAACACGACGATTCTCA]
[+] EMBL CB623167             [AAAGGTCTCATGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGCCAAGTTAATAAGAAACAGGA         ]
[+] EMBL CB623242             [AAAGGTCTAAGGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACAATCAGTCTATAAGC                             ]
[+] EMBL CB623202             [AAAGGTCTCCTGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAG AG GGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGT TGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAG AGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATATTATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGAATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATGACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCACGAAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGCTTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAG                                                         ]
[+] EMBL CB623204             [AAAGGTCT CTGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATACCAGCATGTATGCTTACTTTATTAATTAAGCAGTGGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTACTCCCTCACCTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACACTATGCAAATGATACTATCATTTTTTTGGAACATGACTTACAACAAGCCAACAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTCTGAAAAGTCTGTCTGGCTTAAAAATAAATTTTCATAAGCAGCGAATTGTTTTGTTTTGGTCACGCAAACGAATATTATGATGAGAATTCTAACATCTTTGGTAGGAAGTTTGGCTCTCTCCCACTTAAATATCTTGCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAACCAACAATTGACAAAAAAAAACTTAGTAACTGGAAACGAAAACGTTTATCTGTTGGGGGTAGACTGGTTTTAATTAACTCTGAACTATCAAATGTAACTATGTCTATGATATCTTTATTTAGATACCGAAAGGGGTTCTTCAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                       ]




>consensus_8179#0
AAAGGTCTCCTGCAAGGAGATCCTTTATCTCCAATTATTTTTAATATAGTAGCATGTATG
CTTACTTTATTAATTAAGAGGGCTAAAGATGCTGGTTCATTGAATGGGGTAGTCCCTCAC
CTAGTGGATGATGGTTTATCTATTTTACAGTATGCAGATGATACTATCATTTTTTTGGAA
CATGACTTACAACAAGCGAAGAATCTTAAATTGATTTTATCTGTGTTTGAAAAGTTGTCT
GGCTTAAAAATAAATTTTCATAAGAGTGAATTGTTTTGTTTTGGTCAGGCAAAGGAATAT
TATGATGAGTATTCTAACATCTTTGGTTGTAAGTTTGGCTCTCTCCCAGTTAAATATCTT
GCTGTACCAATGCATTTTAGAAAACTGAATAATAGAGATTGGAAAATGATTGAGCAAAGA
ATTGAGAAAAAAAAACTTAGTAGTTGGAAAGGAAAACATTTATCTGTTGGGGGTAGACTG
GTTTTGATTAACTCTGTACTTTCAAGTTTAACTATGTTTATGATATCTTTTTTTAGATAC
CGAAAGGGGTTCTTCAAAAAATTGATTATTATAGATCACAGTTCTTTTGGCAAGGGGATG
ACCATAAAAAAAAGTACAGACTTACTAGATGGGATATCATTTGTCAACCTAAGGCTCAGG
AAGGTTTAGGGGTTCATAACTTGGAAATACAAAACAAGTGTCTCTTGAGTAAGTGGTTGC
TTAAGTTGATTAACGAGGAAGGTGTATGGCAAAATCTATTGAAGAGAAAGTATCTCTACA
ATCAGTCTATAAGCCAAGTTAATAAGAAACACGACGATTCTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)