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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8192#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1042 fasta sequence
[TTGNGCTTCTCTCTCTTTCTCTAGACTCTACTACTGGCAGACAAAAATGGGATGTTTTTAGCTTTGTTTTACTGAAAAATATTATACTGATTAAGTTGGTGTCAAGTGCACGCACACTGACGAGGAATAATATATATTTGCTTCTTGCTTAGGTGCTTGAATGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACCTAGTTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCT-AAAGTGTGT-AATAACTTTAACAAGTATGCTAAT-AAGCTAGCTCGTGA-CCAAGGATAACCTTAAACAAC-GGGATAAGCTTTTGA-CCCT-AAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTA-CCTAACCCTGAAAATTAGGTCT-AATAGTTGAAAACTCTCCCCTGATCACGGCATCTAGCTATAGCTCTTGATGCAATTTTTTTTTGACTTTGGAAAGCTATCAAGTGTTTATCCTACAACAAATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTCCAAT-TAAATGAAG-CACACCC-CTACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGTCAGGTCACAACATGCTTTAGGACAACATAAGCAACACCTGTCCTAACTAATTAATTTCTGACTACTGGTGATCATGGATGTGCCATGTGTTTACTACTACTCTCTTTACAGTTTAGTTGCACTATATGTGTCAATATTTGTGTTAGAACAAGACTAATAGCTATAATATGTAGTACAC]
[-] EMBL AU175006 [TTGNGCTTCTCTCTCTTTCTCTAGACTCTACTACTGGCAGACAAAAATGGGATGTTTTTAGCTTTGTTTTACTGAAAAATATTATACTGATTAAGTTGGTGTCAAGTGCACGCACACTGACGAGGAATAATATATATTTGCTTCTTGCTTAGGTGCTTGAATGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACCTAGGTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCTAAAAGTGTGTAAATAACTTTAACAAGTATGCTAATAAAGCTAGCTCGTGACCCAAGGATAACCTTAAACAACGGGGATAAGCTTTTGACCCCTAAAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTACCCTAACCCTGAAAATTAGGTCTAAATAGTTGAAAACTCTCC ]
[+] EMBL CB628871 [ tGCTTCTCTCTCTTTCTCTAGACTCTACTACTGGCAGACAAAAATGGGATGTTTTTAGCTTTGTTTTACTGAAAAATATTATACTGATTAAGTTGGTGTCAAGTGCACGCACACTGACGAGGAATAATATATATTTGCTTCTTGCTTAGTTGCTTGAATGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACCTAGTTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCT AAAGTGTGT AATAACTTTAACAAGTATGCTAAT AAGCTAGCTCGTGA CCAAGGATAACCTTAAACAAC GGGATAAGCTTTTGA CCCT AAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTA CCTAACCCTGAAAATTAGGTCT AATAGTTGAAAACTCTCCCCTGATCACGGCATCTAGCTATAGCTCTTGATGCAATTTTTTTTTGACTTTGGAAAGCTATCAAGTGTTTATCCTACAACAAATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTC ]
[-] EMBL CB634859 [ TGCTGCAGGTTTCCTGCTTCTCTAGCTTGACNTAGTTGTCACTCGTGACTAAAGACGTGTCT AAAGTGTGT AATAACTTTAACAAGTATGCTAAT AAGCTAGCTCGTGA CCAAGGATAACCTTAAACAAC GGGATAAGCTTTTGA CCCT AAGTGGATTAATCTCTTACTAGCTAGCAATCTCACTCTACTA CCTAACCCTGAAAATTAGGTCT AATAGTTGAAAACTCTCCCCTGATCACGGCATCTAGCTATAGCTCTTGATGCAATTTTTTTTTGACTTTGGAAAGCTATCAAGTGTTTATCCTACAACAAATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTCCAAT TAAATGAAG CACACCC CTACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGTCAGGTCACAACATGCTTTAGGACAACATAAGCAACACCTGTCCTAACTAATTAATTTCTGACTACTGGTGATCATGGATGTGCC ]
[-] EMBL CB668672 [ AGCTATCAAGTGTTTATCTTACAACAAATAGCACGTACTTGCACGCCACTTGTCAGATAATTTGGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCCCGTAAGGTCGATGTGCCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGTTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAATTACTCAAGAAACGTACATGTCCAATCTAAATGAAGTCACACCCAATACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGT ]
[+] EMBL CB636343 [ ATAGCATGTACTTGCACGCCACTTGTCAGCTAATTTCGGAGATGGACAAGGAATATACTACCCAAGAAACATAGAGAAATTGAGAGAGAAAAAATGAGATAGAGAAATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGATGTAATGGTTTGGTCCAACGTCAGCAGCATGACCGTTGGATAGTCCACGTAAGGTCGATGTGGCCAAAGGGGAAGCTAGCTAGCTAACTAACAAAGCAGCATCTAATAAGCTTTAGCTGAAGCTTAGTTTAGACCACCCGTGTGCTAATAGTCAGTGAGTGCAGTGGAGTAATATGCAACTACTCAAGAAACGTACATGTCCAAT TAAATGAAG CACACCC CTACAACTTACTAATTGCTCCAATTTGTCAGGTCATAACATGCTTTAGGACAACATAAGCAACACCTGTCCTAACTAATTAATTTCTGACTACTGGTGATCATGGATGTGCCATGTGTTTACTACTACTCTCTTTACAGTTTAGTTGCACTATATGTGTCAATATTTGTGTTAGAACAAGACTAATAGCTATAATATGTAGTACAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||