These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8201#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 886 fasta sequence [GGCAACGTCAGCAATGGCGGAAGGATCAGATGCATGCAGGTGTGGCCGATTGAGGGCATTAAGAAGTTCGAGACTCTGTCGTACTTGCCGCCATTGACAGTGGAGGACCTTTTGAAGCAGATCGAGTACCTGCTCCGATCTAAGTGGGTGCCTTGCTTGGAGTTCAGCAAGGTCGGATTCGTCTACCGTGAGAATCACAGATCACCCGGATACTACGATGGCAGGTACTGGACCATGTGGAAGCTGCCCATGTTCGGCTGCACCGATGCCACCCAGGTGCTCAAGGAGCTCGAGGAGGCCAAGAAGG-CCTA-CCCCG-ATGCCTTTGTCCGTATCATCG-GC-TTCGACAACGT-CAGGCAGGTGCAGTTGATTAGCTTCATCGCCTACAAGCCCCCAGGTTGCGAGGAGTCTGGTGGCAACTAAGCTAAGATCAAGCATCGCGCTGGTGGATTGCTGCCTATAATAATAGTATGCAGCTTTGTTTTGGGCTATGTTGATGATATATCAATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTACAGTTTGGTTATGTACCATCTCAATGGCCTCTGCTCTTAACACATATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTCTCCGGCCGGTTTTATTGTAAGAGTACTACAATTATCGTTGGGTGAGGATATGTGAAAACAAAGCTCCGGCTATATACACACAAGATATGTATCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACAATAAAAAAAATGGATGGTATCACGTAATTATGTTTGTTTTTAAGTATTTGTTTGCAATGTTTGTTTCTATGTTTAACCGAATGTATTGTGAATATACGATCTGACATAATTATTTGTGTAAGTTAATTAGTAAACGAATGTATTTCTTTTTGAGAGAAAAAA] [-] EMBL CF300045 [GGCAACGTCAGCAATGGCGGAAGGATCAGATGCATGCAGGTGTGGCCGATTGAGGGCATTAAGAAGTTCGAGACTCTGTCGTACTTGCCGCCATTGACAGTGGAGGACCTTTTGAAGCAGATCGAGTACCTGCTCCGATCTAAGTGGGTGCCTTGCTTGGAGTTCAGCAAGGTCGGATTCGTCTACCGTGAGAATCACAGATCACCCGGATACTATGACGGTAGGTACTGGACCATGTGGAAGCTGCCCATGTTCGGCTGCACCGATGCCACCCAGGTGCTCAAGGAGCTCGAGGAGGCCAAGAAGGCCCTA CCCCGAATGCCTTTGTCCGTATCATCG GC TTCGACAACGT CAGGCAGGTGCAGTTGATTAGCTTCATCGCCTACAAGCCCCCAGGTTGCGAGGAGTCTGGTGGCAACTAAGCTAAGATCAAGCATCGCGCTGGTGGATTGCTGCCTATAATAATAGTATGCAGCTTTGTTTTGGGCTATGTTGATGATATATCAATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTAaaaaaa ] [+] EMBL CB680017 [ AGTTCACCTTGGTTGGATTCGTCTACCGTGAGAACCACAGGTCTCCCGGGTACTACGATGGCAGGTATTGGACCATGTGGAAGCTGCCCATGTTCGGCTGCACCGATGCCACCCAAGTGCTCAAGGAGCTCGAGGAGGCCAAGAAGG CCTA CCCCG ATGCCTTTGTCCGTATCATCGTGCGTTCGACAACGT CAGGCAGGTGCAGTTGATTAGCTTCATCGCCTACAAGCCCCCAGGTTGCGAGGAGTCTGGTGGCAACTAAGCTAAGATCAAGCATCGCGCTGGTGGATTGCTGCCTATAATAATAGTATGCAGCTTTGTTTTGGGCTATGTTGATGATATATCAATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTACAGTTTGGTTATGTACCATCTCAATGGCCTCTGCTCTTAACACATATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTCTCCGGCCGGTTTTATTGTAAGAGTACTACAATTATCGTTGGGTGAGGATATGTGAAAACAAAGCTCCGGCTATATACACACAAGATATGTATCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACAATAAAAAAAATGGATGGTATCACGTAATTATGTTTGTTTTTAAGTATTTGTTTGCAATGTTTGTTTCTATGTTTAACCGAATGTATTGTGAATATACGATCTG ] [-] EMBL CF308817 [ ACGATGGCAGGTATTGGACCATGTGGAAGCTGCCCATGTTCGGCTGCACCGATGCCACNCAGGTGCTCAAGGAGCTCGAGGAGGCCAAGAAGG CCTA CCCCG ATGCCTTTGTCCGTATCATCG GC TTCGACAACGT CAGGCAGGTGCAGTTGATTAGCTTCATCGCCTACAAGCCCCCAGGTTGCGAGGAGTCTGGTGGCAACTAAGCTAAGATCAAGCATCGCGCTGGTGGATTGCTGCCTATAATAATAGTATGCAGCTTTGTTTTGGGCTATGTTGATGATATATCAATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTACAGTTTGGTTATGTACCATCTCAATGGCCTCTGCTCTTAACACATATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTCTCCGGCCGGTTTTATTGTAAGAGTACTACAATTATCGTTGGGTGAGGATATGT AAAACAAAGCTCCGGCTATATACACACAAGATATGTATCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACAAT AAAAAAATGGATGGTATCACGTAATTATGTTTGTTTTTAAGTATTaaaaaa ] [-] EMBL CF334303 [ AGGTACTGGACCATGTGGAAACTGCCCATGTTTGGATGCACCGATGCCACCCAGGTGCTCAAGGAGCTCGAGGAGGCCAAGAAGG CCTACCCCCG ATGCCTTTGTCCGTATCATCG GC TTCGACAACGT CAGGCAGGTGCAGTTGATTAGCTTCATCGCCTACGAGCCCCCAGGTTGCGAGGAGTCTGGTGGCAACTAAGCTAAGATCAAGCATCGCGCTGGTGGATTGCTGCCTATAATAATAGTATGCAGCTTTGTTTTGGGCTATGTTGATGATATATCAATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTACAGTTTGGTTATGTACCATCTCAATGGCCTCTGCTCTTAACACATATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTCTCCGGCCGGTCTTATTGTAAGAGTACTACAATTATCGTTGGGTGAGGATATGTGAAAACAAAGCTCCGGCTATATACACACAAGATATGTATCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACAATAAAAAAAATGGATGGTATCACGTAATTATGTTTGTTTTTAAaaaaaaaa ] [-] EMBL CF297063 [ TCATCG GC TTCGACAACGTCCAGGCAGGTGCAGTTGATTAGCTTCATCGCCTACAAGCCCCCAGGTTGCGAGGAGTCTGGTGGCAACTAAGCTAAGATCAAGCATCGCGCTGGTGGATTGCTGCCTATAATAATAGTATGCAGCTTTGTTTTGGGCTATGTTGATGATATATCAATATATAATATGCTATATATTTTTATTTTACAGTTTGGTTATGTACCATCTCAATGGCCTCTGCTCTTAACACATATGTAATAATCTCTTCCCTCCCTCTCCGGCCGGTTTTATTGTAAGAGTACTACAATTATCGTTGGGTGAGGATATGTGAAAACAAAGCTCCGGCTATATACACACAAGATATGTATCTAGAGCATATCTGATAAATTCGTCGACAATAAAAAAAATGGATGGTATCACGTGATTATGTTTGTTTTTAAGTATTTGTTTGCAATGTTTGTTTCTATGTTTAACCGAATGTATTGTGAATATAGGATCTGACATAATTATTTGTGTAAGTTAATTAGTAAACGAATGTATTTCTTTTTGAGAGAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||