These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8412#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1455 fasta sequence [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCACTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAGGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATTGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGT-CAGTATCCACATTTTACTATATATAGGCGGCATGTTATTGAAGGTGGTTTGTTTCGTGGGGCATGTTATTGAAAGCAAACAAGTATTCTAGGTCGAGTGTAACATGCAAATAT] [+] EMBL AK069790 [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCACTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAGGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATTGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGT CAGTATCCACATTTTACTATATATAGGCGG ] [+] EMBL AK103986 [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCACTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAGGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTG GTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATTGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATAT ] [+] EMBL CB620318 [TTGGAAGCACACTTGATCCAGATCGACCCAGGAATGATAAGGCAACTATCCTTAGTGATGCAATTCAAATGCTGAAAGATTTGACGTCCCAGGTGAACAAGCTTAAAGCTGAATATACTTCACTCTCAGAAGAAGCACGTGAGTTGACTCAGGAAAAGAATGAGCTCAGAGATGAGAAAGTTTCACTGAAGTTTGAGGTTGATAATCTGAATACCCAGTATCAGCAACGAATGCGTGTGCTGTACCCTTGGACTGGAATGGAGCCTTCTGTTGTCATTGGGCCACCCCTGCCATATCCTTTTTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCTATACCTTCAGGTGCTGTTCCTATGCACCCACAGCTCCAGGCATACCCTTACTTCCGAAATCAAACTTCTGGAACCGTCTCCAATCCATGCACACCTTACATGGCATACACTCAACCCATCCATCCTCCTACTGATCAACTATCTAACCAATTCAGTGCTCCAGTTCAGCATTCAAGTAGTAATCGATCTCACTCTATGGCCCAAGACTCTAGAAGCAAGTCCTCTGCCCTGCAGCAAGTAAGTTGTAGAGGGAAACATGATGACTTTGATGACGTTGCAACTGATCTGGAACTAAAAACTCCTGGTTCCTCAGCCCCTCTACAATCAGAGATTGCCAACAAGGATTCCTCTTCTGACTTGAAAAAAAAGCAGCAGTTCATACAGGAAACTAAAGGTAGTTCTCTTACAGAAAGCAGTAGTAGTTCAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCC ] [-] EMBL CB620319 [ CAAGCAGATGCTCGTCCAGTGGTCCTCCAGATGTCTCTAACAGTATTGAAGGTGGATCAGTTGCTGATGATCAACGATCGACAGTACAGACATAGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATAGACAAATTAGGAGGCCTATAGGCAAAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCAAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCAACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACAAGTTGTACATCATACACTATATTACCATTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGT CAGTATCCACATTTTACTATATACAGGCGGCATGTTATTGAAGGTGGTTTGTTTCGTGGGGCATGTTATTGAAAGCAAACAAGTATTCTAGGTCGAGTGTAACATGCAAATAT] [+] EMBL BI813143 [ AGACTAATATATGACGTATAGCTATCTTTTCCGACATTCCTAGGCCTGCATGTGTGGTGTAATCTGCTGGCACATCAACCTTTGCTGCTTAGCTGTGCCCACTTGATATCGGAATAGAC AATTAGGAGGCCTATAGGC AAGTAGAACTGGTTAGTCGAAGCCCAAGCCATATTCCATGGCTATGATTATGAATGGTCGGTAGTTACCCACACTCTTCTATGGCAGTTTGAAATGCTTTCGGCGACTAGGTATGCTTGCGACTAACTTCTGCGGTTTGTCATCTAAGATATGCGTCAAGTGCCCACCAGATCTGTTGAGATAGTTCTATCCTGGAGTAGCATTTTCTACGAATATATGGTAAATTAACTAGTGATTAACCATAGAATTTATCATGGTTCAATAGTTACCTGGTAGATCAGCTACCAGTTGTACATCATACACTATATTACC TTAATTGGAATATGTTCTTAAGTATATTATTTGACATGATTGTCCAGTAaaaaaaaaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||