|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8442#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 3255 fasta sequence
[CGTCGCCACCCTCTCGTCTCCCCCTCCCGCCTCCGCCTCGCCGCCGCCTCGAGATGCTCGCGACCCCCGGCGCGCTCCACCACCTCCTCCTCCTCCCGCCGCCGCCGCACACGCAACTCGCCTTCCACCATGCCGTCGGGGGCGTCCCCGCGGCGCTGCTCCCGCTCCCCCGCCCCCGCCGCGTAGCAGCGAGCGCCTCCACCTCGCGTCGCGGTGGCGCGCGAAGGAGAGCGGCGGGGGCTAGGGTTAGGGCTTCCGTGGGCGAGGAGGCGCCCCCCGTGGTGACCGAGGAGGCGAGCACCTCCGGCGGCCCGACCAAGTTCTCCACGAAGATTCCCGTCGGCGACCGCCACATACTGGTGGAGACAGGCCACATAGGGAGGCAAGCAAGCGCTTCTGTAATGGTCACGGATGGCGAAACAATTGTTTACTCCTCCGTCTGTCTTGCTGATACACCAAACGATCCTTCTGATTTTTTCCCAATGTCAGTTCACTATCAAGAACGCCTTTCAGCTGCTGGAAGAACTAGTGGTGGTTTCTTTAAACGAGAAGGAAGGGCAAAAGACCATGAGGTTTTAGTATGCAGATTGATAGATAGGCCCCTACGCCCTACTATGCCCAAGGGCTTCTACTACGAAACTCAGATTCTATCCTGGGTTTTCAGTTATGATGGTATTCATTCCCCCGATAGCTTGGCTATCACAGCTGCTGGTGTAGCCATGGCACTCTCTGAAGTTCCAAATAAACAAACAATTGCTGGAGTGAGAGTTGGTATGATCAATGATCAGTTTGTTGTTAACCCAACCACTGAACAAATGGATGACTCAGAGTTGGACTTGGTGATGGCTGGGACCGATAGTGCCATACTGATGATAGAGGGCTATTGTGATTTTCTAACTGAGGAGAAGCTACTTCAAGCTGTGGAAACTGGGCAGGGGGCAATTCGAGAAATCTGCAAAGCAATTGATGGTCTTGTCCAGAAATGTGGAAAGAAGAAAATGTTCGATGCTATCGACTTACCACCCCCTGAACTCTACAGGCATGTTGAAGATATTTCTGGAGATGAGTTGGTGAAGGCGCTGCAAATAAAAGAGAAGATCCTCAGAAGAAAAGCTCTTTCAGCATTGGAGGAGAAAGTAATAACAATACTTTCTGAACAAGGATATGTTGCTAAAGATGAGTCATCTGGAGTCAGTGAAAATTTAGCTGATGTAATTGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGTTATAGTGGATGGTGAAGTGGATGAAGGTGAAGTTCATATCAAGCAAGTATCAAGGAAACCCCCACGTCAGTTATTCTCAGAAGTTGACGTCAAGCTAGTCTTCAAGGAAGTTTCATCCAAATTTTTACGGAGACGGATTGTAGAGGGTGGAAAGCGAAGTGATGGAAGGAGTCCTTGTGAGCTTCGTCCCATTAATTCTCAATGTGGATTACTTCCTCGAGCACATGGTAGTGCACTATTCACAAGGGGAGAAACCCAGGCACTGGCTGTGGTCACTTTAGGTGACTATCAGATGGCACAGCGAATTGATAACCTTGTTGATACTGAGGAATCGAAAAGTTTCTATCTTCAGTACACATTTCCTCCATCATCTGTTGGTGAAGTTGGTCGAATTGGAGCACCTAATAGGAGGGAGATAGGACATGGAATGCTTGCAGAAAGAGCCCTGGAACCAATTTTACCTCCTGAAGAGGATTTTCCTTACACTATTCGAGTTTAGAGTACTATCACCGAAAGTAATGGCTCCTCCAGCATGGCTTCTGTCTGTGGAGGTTGTTTAGCACTTCAAGACGCTGGTGTTCCAATAAAGTTCCCTGTTGCTGGAATAGCAATGGGCTTGGTTCTTGATACACTGGAATTTGGTGGAGATGGCAAGCCACTTATTCTCTCTGATATTACGGGTGCTGAAGATGCCTCTGGTGATATGGATTTTAAGGTTGCTGGTAATGAAAATGGTATATCTGCTTTCCAAATGGACATCAAGGTAGTGGGGATAACTCTGCCTATAATGGAACACGCCCTTCTTCAAGCTAGAGATGGTAGAAAACATATTTTAAATGAAATGTCAAAATGTTCACCTCCACCAGCAAAAGTACTCTCTCCATACGCTCCCTTAATCCATGTCATGAAGGTCAAGCCAAACAAGGTGAATTTAATAATTGGTTCTGGTGGAAAGACGATAAAAAGCATAATTGAGGAGACTGGCGTTGATTCTATTGACACTGGAGATGATGGCACAGTAAAAATTACCGCTAGGGACTTATCAAGCTTAGAGAAGTCAAAAGCTATAATTGCTAACCTTACCATGGTTCCAAAAGTTGGAGAAATTTACAGGAACTGCGAGATCAAAACAATTGCACCATATGGAGCTTTTGTTGAAATTGCACCAGGGCGTGAGGGTTTATGCCATATCAGTGAGTTAAGTTCGAGTTGGTTGGCCAAGGCTGAGGATGCTTTCAAAGTCGGCGATCGCATTGATGTCAAGCTAATTGAGATAAATGACAAGGGTCAACTTCGCCTAAGTTCTCGAGCCTTACTGCCTGATGCAAATCAAGAATCTAGCAGCAAGCAACAAGCAGGTGGTTCAACTAGGGAGAAGG-CACCACAGAAGGATAATCTTGTTAAGATGACAACAAGAAGACCCAGACGTAAGAAGCAAGCAGAGGCATCTACAGCTGAAAACAATGCAACTGCTTCACCGAAGGATTTGGCTTCACAAGGCAGCGAAATGGGAACGGAATAGGGTGGACAGAAGCAGTGTTCACTTTATCAAATGATTGCTTGTGAAGCTTTGCCAACTTAAAACGTATCACCACAAAATGCAGTGAACATATGACAGGAACTCCATTGCAAGGGTCAAGACATTTACCCAGCCGTAAGTGAAGGATTAATTGGCTGATGTTTTGAGTGTTCATGCTTGATGATATGTTGAATTTTGACGCTGCCGTAGAAGCGAAATTCATTTTGAGTTTAGTTGCTGCTTCATACTGCACTGTTTGGCTGTGTTTCAAGTCTTTCAGATGTACGAAGCTGCATTCTGCTGATTAGTTTCGCAGATTTTTTGTCAGAAGAGTAATCACGAAGAAGCCAAGAAAGTACATACGCAATTTCCTCCATTAGTTTAGCAGTTTAACACAAGTCAGCATCTTAGTGAACTATTGTAACTCAAACATGAACCCCCGTTGTGGGTCTTTTGTTGGAACTTCCCTGTTTTCCACTTAAAAAAAAAAAGGAAA]
[+] EMBL AK065622 [CGTCGCCACCCTCTCGTCTCCCCCTCCCGCCTCCGCCTCGCCGCCGCCTCGAGATGCTCGCGACCCCCGGCGCGCTCCACCACCTCCTCCTCCTCCCGCCGCCGCCGCACACGCAACTCGCCTTCCACCATGCCGTCGGGGGCGTCCCCGCGGCGCTGCTCCCGCTCCCCCGCCCCCGCCGCGTAGCAGCGAGCGCCTCCACCTCGCGTCGCGGTGGCGCGCGAAGGAGAGCGGCGGGGGCTAGGGTTAGGGCTTCCGTGGGCGAGGAGGCGCCCCCCGTGGTGACCGAGGAGGCGAGCACCTCCGGCGGCCCGACCAAGTTCTCCACGAAGATTCCCGTCGGCGACCGCCACATACTGGTGGAGACAGGCCACATAGGGAGGCAAGCAAGCGCTTCTGTAATGGTCACGGATGGCGAAACAATTGTTTACTCCTCCGTCTGTCTTGCTGATACACCAAACGATCCTTCTGATTTTTTCCCAATGTCAGTTCACTATCAAGAACGCCTTTCAGCTGCTGGAAGAACTAGTGGTGGTTTCTTTAAACGAGAAGGAAGGGCAAAAGACCATGAGGTTTTAGTATGCAGATTGATAGATAGGCCCCTACGCCCTACTATGCCCAAGGGCTTCTACTACGAAACTCAGATTCTATCCTGGGTTTTCAGTTATGATGGTATTCATTCCCCCGATAGCTTGGCTATCACAGCTGCTGGTGTAGCCATGGCACTCTCTGAAGTTCCAAATAAACAAACAATTGCTGGAGTGAGAGTTGGTATGATCAATGATCAGTTTGTTGTTAACCCAACCACTGAACAAATGGATGACTCAGAGTTGGACTTGGTGATGGCTGGGACCGATAGTGCCATACTGATGATAGAGGGCTATTGTGATTTTCTAACTGAGGAGAAGCTACTTCAAGCTGTGGAAACTGGGCAGGGGGCAATTCGAGAAATCTGCAAAGCAATTGATGGTCTTGTCCAGAAATGTGGAAAGAAGAAAATGTTCGATGCTATCGACTTACCACCCCCTGAACTCTACAGGCATGTTGAAGATATTTCTGGAGATGAGTTGGTGAAGGCGCTGCAAATAAAAGAGAAGATCCTCAGAAGAAAAGCTCTTTCAGCATTGGAGGAGAAAGTAATAACAATACTTTCTGAACAAGGATATGTTGCTAAAGATGAGTCATCTGGAGTCAGTGAAAATTTAGCTGATGTAATTGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGTTATAGTGGATGGTGAAGTGGATGAAGGTGAAGTTCATATCAAGCAAGTATCAAGGAAACCCCCACGTCAGTTATTCTCAGAAGTTGACGTCAAGCTAGTCTTCAAGGAAGTTTCATCCAAATTTTTACGGAGACGGATTGTAGAGGGTGGAAAGCGAAGTGATGGAAGGAGTCCTTGTGAGCTTCGTCCCATTAATTCTCAATGTGGATTACTTCCTCGAGCACATGGTAGTGCACTATTCACAAGGGGAGAAACCCAGGCACTGGCTGTGGTCACTTTAGGTGACTATCAGATGGCACAGCGAATTGATAACCTTGTTGATACTGAGGAATCGAAAAGTTTCTATCTTCAGTACACATTTCCTCCATCATCTGTTGGTGAAGTTGGTCGAATTGGAGCACCTAATAGGAGGGAGATAGGACATGGAATGCTTGCAGAAAGAGCCCTGGAACCAATTTTACCTCCTGAAGAGGATTTTCCTTACACTATTCGAGTTTAGAGTACTATCACCGAAAGTAATGGCTCCTCCAGCATGGCTTCTGTCTGTGGAGGTTGTTTAGCACTTCAAGACGCTGGTGTTCCAATAAAGTTCCCTGTTGCTGGAATAGCAATGGGCTTGGTTCTTGATACACTGGAATTTGGTGGAGATGGCAAGCCACTTATTCTCTCTGATATTACGGGTGCTGAAGATGCCTCTGGTGATATGGATTTTAAGGTTGCTGGTAATGAAAATGGTATATCTGCTTTCCAAATGGACATCAAGGTAGTGGGGATAACTCTGCCTATAATGGAACACGCCCTTCTTCAAGCTAGAGATGGTAGAAAACATATTTTAAATGAAATGTCAAAATGTTCACCTCCACCAGCAAAAGTACTCTCTCCATACGCTCCCTTAATCCATGTCATGAAGGTCAAGCCAAACAAGGTGAATTTAATAATTGGTTCTGGTGGAAAGACGATAAAAAGCATAATTGAGGAGACTGGCGTTGATTCTATTGACACTGGAGATGATGGCACAGTAAAAATTACCGCTAGGGACTTATCAAGCTTAGAGAAGTCAAAAGCTATAATTGCTAACCTTACCATGGTTCCAAAAGTTGGAGAAATTTACAGGAACTGCGAGATCAAAACAATTGCACCATATGGAGCTTTTGTTGAAATTGCACCAGGGCGTGAGGGTTTATGCCATATCAGTGAGTTAAGTTCGAGTTGGTTGGCCAAGGCTGAGGATGCTTTCAAAGTCGGCGATCGCATTGATGTCAAGCTAATTGAGATAAATGACAAGGGTCAACTTCGCCTAAGTTCTCGAGCCTTACTGCCTGATGCAAATCAAGAATCTAGCAGCAAGCAACAAGCAGGTGGTTCAACTAGGGAGAAGG CACCACAGAAGGATAATCTTGTTAAGATGACAACAAGAAGACCCAGACGTAAGAAGCAAGCAGAGGCATCTACAGCTGAAAACAATGCAACTGCTTCACCGAAGGATTTGGCTTCACAAGGCAGCGAAATGGGAACGGAATAGGGTGGACAGAAGCAGTGTTCACTTTATCAAATGATTGCTTGTGAAGCTTTGCCAACTTAAAACGTATCACCACAAAATGCAGTGAACATATGACAGGAACTCCATTGCAAGGGTCAAGACATTTACCCAGCCGTAAGTGAAGGATTAATTGGCTGATGTTTTGAGTGTTCATGCTTGATGATATGTTGAATTTTGACGCTGCCGTAGAAGCGAAATTCATTTTGAGTTTAGTTGCTGCTTCATACTGCACTGTTTGGCTGTGTTTCAAGTCTTTCAGATGTACGAAGCTGCATTCTGCTGATTAGTTTCGCAGATTTTTTG ]
[+] EMBL CB675486 [ AAAATGGTATATCTGCTTTCCAAATGGACATCAAGGTAGTGGGGATAACTCTGCCTATAATGGAACACGCCCTTCTTCAAGCTAGAGATGGTAGAAAACATATTTTAAATGAAATGTCAAAATGTTCACCTCCACCAGCAAAAGTACTCTCTCCATACGCTCCCTTAATCCATGTCATGAAGGTCAAGCCAAACAAGGTGAATTTAATAATTGGTTCTGGTGGAAAGACGATAAAAAGCATAATTGAGGAGACTGGCGTTGATGCTATTGACACTGGAGATGATGGCACAGTAAAAATTACCGCTAGGGACTTATCAAGCTTAGAGAAGTCAAAAGCTATAATTGCTAACCTTACCATGGTTCCAAAAGTTGGAGAAATTTACAGGAACTGCGAGATCAAAACAATTGCACCATATGGAGCTTTTGTTGAAATTGCACCAGGGCGTGAGGGTTTATGCCATATCAGTGAGTTAAGTTCGAGTTGGTTGGCCAAGGCTGAGGATGCTTTCAAAGTCGGCGATCGCATTGATGTCAAGCTAATTGAGATAAATGACAAGGGTCAACTTCGCCTAAGTTCTCGAGCCTTACTGCCTGATGCAAATCAAGAATCTAGCAGCAAGCAACAAGCAGGTGGTTCAACTAGGGAGAAGG CACCACAGAAGGATAATCTTGTTAAGATGACAACAAGAAGACCCAGACGTAAGAAGCAAGCAGAGGCATCTACAGCTGAAAACAATGCAACTGCTTCACCGAAGGATTTGGCTTCACAAGGCA ]
[-] EMBL CB675487 [ TGAGTTAAGTTCGAGTTGGTTGGCCAAGGCTGAGGATGCTTTCAAAGTCGGCGATCGCATTGATGTCAAGCTAATTGAGATAAATGACAAGGGTCAACTTCGCCTAAGTTCTCGAGCCTTACTGCCTGATGCAAATCAAGAATCTAGCAGCAAGCAACAAGCAGGTGGTTCAACTAGGGAGAAGG CACCACAGAAGGATAATCTTGTTAAGATGACAACAAGAAGACCCAGACGTAAGAAGCAAGCAGAGGCATCTACAGCTGAAAACAATGCAACTGCTTCACCGAAGGATTTGGCTTCACAAGGCAGCGAAATGGGAACGGAATAGGGTGGACAGAAGCAGTGTTCACTTTATCAAATGATTGCTTGTGAAGCTTTGCCAACTTAAAACGTATCACCACAAAATGCAGTGAACATATGACAGGAACTCCATTGCAAGGGTCAAGACATTTACCCAGCCGTAAGTGAAGGATTAATTGGCTGATGTTTTGAGTGTTCATGCTTGATGATATGTTGAATTTTGACGCTGCCGTAGAAGCGAAATTCATTTTGAGTTTAGTTGCTGCTTCATACTGCACTGTTTGGCTGTGTTTCAAGTCTTTCAGATGTACGAAGCTGCATTCTGCTGATTAGTTTCGCAGATTTTTTGTCAGAAGAGTAATCACGAAGAAGCCAAGAAAGTACATACGCAATTTCCTCCATTAGTTTAGCAGTTTAACACAAGTCAGCATCTTAGTGAACTATTGTAACTCAAACATGAACCCCCGTTGTGGGTCTTTTGTTGGAACTTCCCTGTTTTCCACTT ]
[-] EMBL CB678860 [ AAGCTAATTGAGATAAATGACAAGGGTCAACTTCGCCTAAGTTCTCGAGCCTTACTGCCTGATGCAAATCAAGAATCTAGCAGCAAGCAACAAGCAGGTGGTTCAACTAGGGAGAAGG CACCACAGAAGGATAATCTTGTTAAGATGACAACAAGAAGACCCAGACGTAAGAAGCAAGCAGAGGCATCTCCAGCTGAAAACAATGCAACTGCTTCACCGAAGGATTTGGCTTCACAAGGCAGCGAAATGGGAACGGAATAGGGTGGACAGAAGCAGTGTTCACTTTATCAAATGATTGCTTGTGAAGCTTTGCCAACTTAAAACGTATCACCACAAAATGCAGTGAACATATGACAGGAACTCCATTGCAAGGGTCAAGACATTTACCCAGCCGTAAGTGAAGGATTAATTGGCTGATGTTTTGAGTGTTCATGCTTGATGATATGTTGAATTTTGACGCTGCCGTAGAAGCGAAATTCATTTTGAGTTTAGTTGCTGCTTCATACTGCACTGTTTGGCTGTGTTTCAAGTCTTTCAGATGTAGGAAGCTGCATTTTGCTGATTAGTTTCGCAGATTTTTTGTCAGAAGAGTAATCACGAAGAAGCCAAGAAAGTACATACGCAATTTCCTCCATTAGTTTAGCAGTTTAACACAAGTCAGCATCTTAGTGAATTATTGTAACTCAAACATGAACCCCCGTTGTGGGTGTTTTGTTGGAACTTCCCTGTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGA ]
[-] EMBL CA760919 [ AGCAACCAACAAGCAGNTGGTTCAACTA GGAGAAGGCCCCCACAGAAGGATAATCTTGTTAAGATG CAACAAGAAGACCCAGACGTAAGAAGCAACCAGAGGCATCTACAGCTGAAAACAATGCAACTGCTTCACCGAAGGATTTGGCTTCACAAGGCAGCGAAATGGGAACGGAATAGGGTGGACAGAAGCAGTGTTCACTTTATCAAATGATTGCTTGTGAAGCTTTGCCAACTTAAAACGTATCACCACAAAATGCAGTGAACATATGACAGGAGCTCCATTGCAAGGGTCAAGACATTTACCCAGCCGTAAGTGAAGGATTAATTGGCTGATGTTTTGAGTGTTCATGCTTGATGATATGTTGAATTTTGACGCTGCCGTAGAAGCGAAATTCATTTTGAGTTTAGTTGCTGCTTCATACTGCACTGTTTGGCTGTGTTTCAAGTCTTTCAGATGTACGAAGCTGCATTTTGCTGATTAGTTTCGCAGATTTTTTGTCAGAAGAGTAATCCCGAAGAAGCCAAGAAAGTACATACGCAATTTCCTCCATTAGTTTAGCAGTTTAACCCAAGTCAGCATTTTAGTGAACTATTGTAACTCAAACATGAACCCCCGTTGTGGGTCTTTTGTTGGAACTTCCCTGTTTTCCCCTTCAAAAAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||