These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8633#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1609 fasta sequence [ACCAAATGCTAAGGATGGTAAATGGTTAACCAGCGGAGCACTTTTTCCTGTTGGTAAGCACTGGTGGTCATGGTGCTATTTGGAAACTTGCATGTGATAGAGGTATATTCCAATGGCTTTACCAAAATGGCAGAAAAGGCGCAACTGTACGTCAAGTCAGCAATGTTGTGGCTGCAACTGATTTAACACTGATGGCATTGGCAGGAATAGGCCTGCGTCACGATAAGAAATTAGGTTTTGCGTCTTGTGAACGAAGACCAGGTGCTACTGAAGGGGTAAATGTACTAATCGAAAAAGAAAACCAGGATGGACAATGGGCATATGGTATCACTTGCATTGAATACACTGAGTTTGAAAAATATGGCATCCCAGAACCAACAGTAACAAATGGCAGTTTGCAGGCTAACTATCCAGCAAATACAAATATACTATATGTTGATCTGCAAGCAGCAGAGGAAGTTGGTTCGCGCAAAAATGCTAGCTGTTTACCCGGAATGGTGCTAAATTTGAAAAAAGCTGTGTCATACTTGGATCATCTGGGCTTTGAGTGTAGTGCTGCTGGAGGCAGGTTACAATGCACGATGCAAAACATAGCGGATAATTTTATGAACACATATAACTACAGGTGCAGTAAAGGAATAGAAAGTGAGCTAGACACATTCATTGTGTACAACGAAAGGAAAAAAGTCACTTCGTCAGCTAAAAGGAAGCTGAAATCAGAAGATAAGTCATTGCACCAGGTCAAAGACAACTGTGAATACTTGCGTTCTGGACCACCTTTTTCTATATTTCTTCATCCTGCTTTAGGTCCATTTTGGGATATCACAAGGCAGAAGTTTGTAGGTGGCTCGGTCTCTCAAGGTTCAGAATTGCAAATAGAGGTGGCAGAATTTCTATGGCAAGATGTTGAGCTCGATGGAAGCCTAATCGTTTTAGCTGACAATATTATGGGTTCAACCAACAAGAATAATACTGGAGAACAAATAATGCACTATGGTGCCAGGTGTGGGAGATGCAAACTGCGAAGTGTTAAAATTGTGAATAAAGGGATCAACTGGAGTTCTGCCAATAATGTCTACTGGAAGCATGATGTCGAGAGATCAGAATCTGTGAAGAT-CATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACGGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAAGGGCATTATCAACACT-AATTCTTGATTCATTGATTTCCAGCTAGCTTAATCATATCGAGGGCACACGTGACTAATGAATTTTGTTGACTAAAGTCCATCCTGTAGTTGCTGTTGTAAA-GGTTTTAGGTCTAAATAGATTGATGTACAGTGCACTT-GAATATTAAGGCATGCTGTCAGCCTATTCTCTTACTCATTCAATAAGTGATGTACGGACAGAGATATTTATAAAGGTTGAGGAGAATTCTCATTCTCTGAAATTCCCCCAAAAA] 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CATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACGGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAAGGGCATTATCAACACTAAATTCTTGATTCATTGATTTCCAGCTAGCTTAATCATATCGAGGGCACACGTGACTAATGAATTTTGTTGACTAAAGTCCATCCTGTAGTTGCTGTTGTAAA GGTTTTAGGTCTAAATAGATTGATGTACAGTGCACTT GAATATTAAGGCATGCTGTCAGCCTATTCTCTTACTCATTCAATAAGTGATGTACGGACAGAGATATTTATAAAGGTTGAGGAGAATTCTCATTCTCTGA ] [+] EMBL AU094036 [ TACTGGAAGCATGATGTCGAGAGATCAGAATCTGTGAAGATCCATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACAGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAAGGGCATTATCAACACTAAATTCTTGATTCATTGATTTCCAGCTAGCTTAATCATATCGAGGGCACACGTGACTAATGAATTTTGTTGACTAAAGTCCATCCTGTAGTTGCTGTTGTAAA GGTTTTAGGTCTAAATAGATTGATGTACAGTGCACTT GAATATTAAGGCATGCTGTCAGCCTATTCTCTTACTCATTCAATAAGTGATGTACGGACAGAGATATTTATAAATGTTGAGGAGAATTCTCATTCTCCGAAATTCCCCCAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||