These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8692#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 480 fasta sequence [CTGCTGATATCTCAGACAACAGTCTCCATGGGCTGCAGGCTTACAAGGTTTTCATATCCATTGCTTTGATCCTTGGGGATGGTTTATACAACTTCCTCAAGGTGCTTATCCGCACAATTGCAGGCTTTATATCAATGGTTCAGAACAATTCAAAAGGCATGCTTCCTGTTTCAGACAATGGCATGTCCATGTCCACTGCTGAAGAGGTATCCTTCGATGATGAGCGTCGCACTGAAATCTTCCTGAAAGATCAAATTCCTAAGTCAGTTGCATATGGAGGCTACGTCGTAGTTGCTGCTCTATCGATTGGCACCCTTCCTGAGATCTTCCCGCAGCTCAAGT-GGTACTAC-ATTTT-GGTTGCCTAC-ATCG-TTGC-ACC-TGT--GCCTTGG--CCTTC-TGC-AA-TG-CCTACGGGAAGTGGGTC-TCACTTGATTTGGGTC-TCTTGGCCTCCAACCTATGGCAA-GCTTTGCT-ATC--TTCGGGTTCGGAGCG] [+] EMBL OSR27921A [CTGCTGATATCTCAGACAACAGTCTCCATGGGCTGCAGGCTTACAGGGTTTTCATATCCATTGCTTTGATCCTTGGGGATGGTTTATACAACTTCCTCAAGGTGCTTATCCGCACAATTGCAGGCTTTATATCAATGGTTCAGAACAATTCAAAAGGCATGCTTCCTGTTTCAGACAATGGCATGTCCATGTCCACTGCTGAAGAGGTATCCTTCGATGATGAGCGTCGCACTGAAATCTTCCTGAAAGATCAAATTCCTAAGTCAGTTGCATATGGAGGCTACGTCGTAGTTGCTGCTCTATCGATTGGCACCCTTCCTGAGATCTTCCCGCAGCTCAAGT GGTACTAC ATTTT GGTTGCCTAC ATCG TTGC AC ] [+] EMBL AU064290 [ AGGTTTTCATATCCATTGCTTTGATCCTTGGGGATGGTTTATACAACTTCCTCAAGGTGCTTATCCGCACAATTGCAGGCTTTATATCAATGGTTCAGAACAATTCAAAAGGCATGCTTCCTGTTTCAGACAATGGCATGTCCATGTCCACTGCTGAAGAGGTATCCTTCGATGATGAGCGTCGCACTGAAATCTTCCTGAAAGATCAAATTCCTAAGTCAGTTGCATATGGAGGCTACGTCGTAGTTGCTGCTCTATCGATTGGCACCCTTCCTGAGATCTTCCCGCAGCTCAAGTGGGTACTACAATTTTGGGTTGCCTACAATCGTTTGCAACCTTGTTGGCCTTGGGCCCTTCTTGCNAATTGCCCTACGGGAAGTGGGTCTTCACTTGATTTGGGTCTTCTTGGCCTCCAACCTATGGCAAGGCTTTGCTAATCCTTTCGG ] [+] EMBL C91598 [ AGGTTTTCATATCCATTGCTTTGATCCTTGGGGATGGTTTATACAACTTCCTCAAGGTGCTTATCCGCACAATTGCAGGCTTTATATCAATGGTTCAGAACAATTCAAAAGGCATGCTTCCTGTTTCAGACAATGGCATGTCCATGTCCACTGCTGAAGAGGTATCCTTCGATGATGAGCGTCGCACTGAAATCTTCCTGAAAGATCAAATTCCTAAGTCAGTTGCATATGGAGGCTACGTCGTAGTTGCTGCTCTATCGATTGGCACCCTTCCTGAGATCTTCCCGCAGCTCAAGT GGTACTAC ATTTT GGTTGCCTAC ATCG TTGC ANC TGT GC TGG GCTTC TGC AA TG CCTAC GGAAGTGGGTC TCAC TGATT GGTC TCTTTGCCTCCAA CTATGGCAA GC TTGCT ATC TTCGTGTTCGGAGCG] [+] EMBL AU064354 [ AGGTTTTCATATCCATTGCTTTGATCCTTGGGGATGGTTTATACAACTTCCTCAAGGTGCTTATCCGCACAATTGCAGGCTTTATATCAATGGTTCAGAACAATTCAAAAGGCATGCTTCCTGTTTCAGACAATGGCATGTCCATGTCCACTGCTGAAGAGGTATCCTTCGATGATGAGCGTCGCACTGAAATCTTCCTGAAAGATCAAATTCCTAAGTCAGTTGCATATGGAGGCTACGTCGTAGTTGCTGCTCTATCGATTGGCACCCTTCCTGAGATCTTCCCGCAGCTCAAGT GGTACTAC ATTTT GGTTGCCTAC ATCG TTGC ACC TGT G CTTGG CCTTC TGC AA TG CCTACGGGAAGTGGGTC TCAC TGA TTGGG C TNTTGGCCTCC ACCTATGGCAA GCTTT CT ATC TTCGGG ] [+] EMBL AU064343 [ AGGTTTTCATATCCATTGCTTTGATCCTTGGGGATGGTTTATACAACTTCCTCAAGGTGCTTATCCGCACAATTGCAGGCTTTATATCAATGGTTCAGAACAATTCAAAAGGCATGCTTCCTGTTTCAGACAATGGCATGTCCATGTCCACTGCTGAAGAGGTATCCTTCGATGATGAGCGTCGCACTGAAATCTTCCTGAAAGATCAAATTCCTAAGTCAGTTGCATATGGAGGCTACGTCGTAGTTGCTGCTCTATCGATTGGCACCCTTCCTGAGATCTTCCCGCAGCTCAAGT GGTACTAC A TTT GGTTGCCTAC ATCG TTGC ACC TGT GC TGG CCTTC TGC AA TG CCTAC GGAA T GGTC TCACT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||