cluster # 870

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Oryza sativa
cluster # 870 cluster # 870 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_870#0 length = 656 sequences # 2

consensusID : consensus_870#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 656
fasta sequence

                              [GAAGNTGCTTGAGCTTGNATCCCGGTTATGGGTTAGCTGGACTTGCTATTGCAGCCAGCACAGATGCTGATGAGGTCGTTATTTCTGATGGAAATCCACAAGTAGTTGGATATATTCAGCAGAATATATCCATCAATACAGAAACTTTTGGTCAAACAAAAGTTAAATCTATGGTACTTCACTGGGATGCTGGGCAGGCTTCAGAAATTATTAGTTCCTTCGATATTATTGTTGCAAGTGACTGCACATTTTTCAAGCAATTCCATCAGAGCCTTGCACGGGTTGTCAAATCCTTGTTGAAGCATTCAGAAACCTCACAGGCCATTTTCCTGAGCCCAAAGAGAGGCGATTCACTCAGCAAATTCCTAGAAGTAATTAAAAAGAATGGTTTGTCTTGTGAGTTGATAGAGAAGTATGATCCCACTGTATGGAATATGCACAAAAAATATGTATCGGATGATAACAG-ATCCTGGCCCAACTACAATGAAGAGCACTGCTACCCTCTATTGGTTAGAATTAATAGTCACAGCAAATAGTTACCTCCAGACATTTCGTTTGATCTATGATGGGTTCATTTGTGATGTAAAAGCTTTAGCTAGTCTATGTTGTAATTTATACATTACAATAGAAGTGGGTTATCGGTTGATATTAAAAAA]

[+] EMBL AU082460             [GAAGNTGCTTGAGCTTGNATCCCGGTTATGGGTTAGCTGGACTTGCTATTGCAGCCAGCACAGATGCTGATGAGGTCGTTATTTCTGATGGAAATCCACAAGTAGTTGGATATATTCAGCAGAATATATCCATCAATACAGAAACTTTTGGTCAAACAAAAGTTAAATCTATGGTACTTCACTGGGATGCTGGGCAGGCTTCAGAAATTATTAGTTCCTTCGATATTATTGTTGCAAGTGACTGCACATTTTTCAAGCAATTCCATCAGAGCCTTGCACGGGTTGTCAAATCCTTGTTGAAGCATTCAGAAACCTCACAGGCCATTTTCCTGAGCCCAAAGAGAGGCGATTCACTCAGCAAATTCCTAGAAGTAATTAAAAAGAATGGTTTGTCTTGTGAGTTGATAGAGAAGTATGATCCCACTGTATGGAATATGCACAAAAAATATGTATCGGATGATAACAG ATCCTGGCCCAACTACAATGAAGAGCACTGCTACCCTCTATTGGTTAGAATTAATAGTCACAGCAAATAGTTACCTCCAGACATTTCGTTTGATCTATGATGGGTTCATTTGTGATGTAAAAGCTTTAGCTAGTCTATGTTGTAATTTATACATTACAATAGAAGTGGGTTATCGGTTGATATTAAAAAA]
[+] EMBL C74645               [                                                                                                                                                                                        GGATGCTGGGCAGGCTTCAGAAATTATTAGTTCCTTCGATATTATTGTTGCAAGTGACTGCACATTTTTCAAGCAATTCCATCAGAGCCTTGCACGGGTTGTC AATCCTTGTTGAAGCATTCAGAAACCTCACAGGCCATTTTCCTGAG CCAAAGAGAGGCGATTCACTCAGCAAATTCCTAGAAGTAATTAAAAAGAATGGTTTGTCTTGTGAGTTGATAGAGAAGTATGATCCCACTGTATGGGATATGCAC AAAAATATGTATCGGNTGAT ACAGNAT CTGGCCa                                                                                                                                                                                    ]




>consensus_870#0
GAAGNTGCTTGAGCTTGNATCCCGGTTATGGGTTAGCTGGACTTGCTATTGCAGCCAGCA
CAGATGCTGATGAGGTCGTTATTTCTGATGGAAATCCACAAGTAGTTGGATATATTCAGC
AGAATATATCCATCAATACAGAAACTTTTGGTCAAACAAAAGTTAAATCTATGGTACTTC
ACTGGGATGCTGGGCAGGCTTCAGAAATTATTAGTTCCTTCGATATTATTGTTGCAAGTG
ACTGCACATTTTTCAAGCAATTCCATCAGAGCCTTGCACGGGTTGTCAAATCCTTGTTGA
AGCATTCAGAAACCTCACAGGCCATTTTCCTGAGCCCAAAGAGAGGCGATTCACTCAGCA
AATTCCTAGAAGTAATTAAAAAGAATGGTTTGTCTTGTGAGTTGATAGAGAAGTATGATC
CCACTGTATGGAATATGCACAAAAAATATGTATCGGATGATAACAGATCCTGGCCCAACT
ACAATGAAGAGCACTGCTACCCTCTATTGGTTAGAATTAATAGTCACAGCAAATAGTTAC
CTCCAGACATTTCGTTTGATCTATGATGGGTTCATTTGTGATGTAAAAGCTTTAGCTAGT
CTATGTTGTAATTTATACATTACAATAGAAGTGGGTTATCGGTTGATATTAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case