cluster # 8744

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Oryza sativa
cluster # 8744 cluster # 8744 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8744#0 length = 471 sequences # 5

consensusID : consensus_8744#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 471
fasta sequence

                              [TAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTTAATTA]

[+] EMBL CF339685             [TAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTTAATTA]
[+] EMBL CF340350             [TAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAAT                                                            ]
[+] EMBL CF340326             [TAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAA                                                                     ]
[+] EMBL CF340098             [TAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAA                                                                                                                        ]
[+] EMBL CF338317             [TAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGCTGAACTGTGA                                                                                                                                        ]




>consensus_8744#0
TAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATA
ATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAG
AGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAA
GTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATG
GGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGA
AGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAAT
CTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTT
TGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTTAATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case