These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8758#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 2662 fasta sequence [TTAACCACCGGACACCACAGCGAGCAGAGCGCCGCTGTTCTCTTCCGCTTCTCTCCCTGAGCTCGGCCTCGTGTCACTGACGTCGTGTATGAGAGGAAGGTGGTGAGCTCAGCAGCTCAGGCTCAGCTCGCAGTAGGGAGCAGACGCCGGCCGCATCGCCCCCCTTCGCGTTTCGCTGCTCCGAGGTGAAACGGCAATGCATGATTGGTGCTGTGTCAGCCTCAGTCCTTGATTATTTCCACAGAGAAAACGCATAATGCGCCTTGTTTCTAGGAAGACCTATCAGGTTAAGAATTCGGGAGAAATATTTGGAAATTCTCAGGCATGATATGTCCCAAAATTTCTTTGGCATGCGTTCTTCTGCTCCTATGGTTTACCTCAACGGGAGATGCAGCATACATGAAGTACCTGGATCCAAAGCAACCCACCAACACTAGAATCAAGGACCTTATCAGTAGGATGACTCTTGCAGAAAAAATTGGCCAAATGACACAGATTGAACGTGGGGTTGCATCTGCAGATGTCATGAAAAACTACTTCATAGGTAGTGTATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTCCCTGCTCCCCAGGCTACTCCTGCAGTTTGGGTGAACATGGTAAATGAATTCCAGAAAGGCGCCTTGTCAACACGTCTAGGAATACCTATGATCTACGGCATTGATGCAGTTCATGGTAATAACAATGTCTACAATGCCACCCTATTTCCTCACAACATTGGGCTTGGAGCTACAAGGGATCCTGACCTCGTAAGGAGGATCGGCGAAGCAACTGCTCTTGAAGTACGGGCAACAGGCATTCCGTACACCTTTGCTCCATGTATTGCAGTTTGTCGAGATCCACGATGGGGCCGATGTTATGAGAGCTACAGTGAAGACCACAGGGTAGTCCAGCAGATGACAGACATTATACTTGGTCTACAAGGAGATATCCCAATAAATCATACCAAGGGAGTTCCTTATATTGCTGGGAAGGATAAAGTTGCTGCTTGTGCTAAGCACTTTGTTGGTGATGGTGGAACTCATAATGGAATCAATGAGAACAACACGATCACTGATGAACATGGGCTTCTAGGCATTCACATGCCCCCATATTATGACTCTATTATAAAGGGTGTTGCTACTGTTATGGTTTCCTATTCAAGCTTGAATGGTGTCAAAATGCATGCCAATCATGATCTGGTTACTGGCTACCTGAAATCCAAATTGCATTTTAGAGGATTTGTGATATCAGATTGGCTAGGAATAGACAGGATAACGTCACCACCTGATGCAAATTATACTTACTCTGTGCAAGCTGGAATAAATGCTGGTATTGATATGGTCATGGTGCCATTCAATTACACCCAATACATTGATGATGTGACACCTCTTGTTAAGAAGGGTATTATCAATATGAGCAGAATTGATGATGCTGTCAGGCGTATCCTTCGAGTCAAATTTATAATGGGCCTATTCGAGAACCCTTTAGCTGATCTTAGCTTCGCAGATCAGCTTGGAAAGAAGGAGCACAGAGATTTGGCTAGAGAAGCCGTCAGGAAATCACTTGTTCTATTAAAAAACGGCAACTCTCCCAATCAACAATTCCTGCCTCTACCAAAGAAAGCTAGAAGTATCCTTGTAGCTGGAAGCCATGCTAGCAATTTGGGCTACCAATGTGGCGGGTGGTCAATTGAATGGATCGGAGGTAGTGGAGATATTACTGTAGGTACAACAATTCTTGAGGCCATAAAGTCCACTGTCGCTGATTCAACACATGTTGTCTACTCTGAGAACCCTGATGAAAGCTTCATGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGTCAGTGGGTGATAAGCAGATTTGTTCTTTCACGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAATAGAGCATTTTTATCTAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGGCCTACAGCACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATTGATGGGTTTGA] [+] EMBL AK066300 [TTAACCACCGGACACCACAGCGAGCAGAGCGCCGCTGTTCTCTTCCGCTTCTCTCCCTGAGCTCGGCCTCGTGTCACTGACGTCGTGTATGAGAGGAAGGTGGTGAGCTCAGCAGCTCAGGCTCAGCTCGCAGTAGGGAGCAGACGCCGGCCGCATCGCCCCCCTTCGCGTTTCGCTGCTCCGAGGTGAAACGGCAATGCATGATTGGTGCTGTGTCAGCCTCAGTCCTTGATTATTTCCACAGAGAAAACGCATAATGCGCCTTGTTTCTAGGAAGACCTATCAGGTTAAGAATTCGGGAGAAATATTTGGAAATTCTCAGGCATGATATGTCCCAAAATTTCTTTGGCATGCGTTCTTCTGCTCCTATGGTTTACCTCAACGGGAGATGCAGCATACATGAAGTACCTGGATCCAAAGCAACCCACCAACACTAGAATCAAGGACCTTATCAGTAGGATGACTCTTGCAGAAAAAATTGGCCAAATGACACAGATTGAACGTGGGGTTGCATCTGCAGATGTCATGAAAAACTACTTCATAGGTAGTGTATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTCCCTGCTCCCCAGGCTACTCCTGCAGTTTGGGTGAACATGGTAAATGAATTCCAGAAAGGCGCCTTGTCAACACGTCTAGGAATACCTATGATCTACGGCATTGATGCAGTTCATGGTAATAACAATGTCTACAATGCCACCCTATTTCCTCACAACATTGGGCTTGGAGCTACAAGGGATCCTGACCTCGTAAGGAGGATCGGCGAAGCAACTGCTCTTGAAGTACGGGCAACAGGCATTCCGTACACCTTTGCTCCATGTATTGCAGTTTGTCGAGATCCACGATGGGGCCGATGTTATGAGAGCTACAGTGAAGACCACAGGGTAGTCCAGCAGATGACAGACATTATACTTGGTCTACAAGGAGATATCCCAATAAATCATACCAAGGGAGTTCCTTATATTGCTGGGAAGGATAAAGTTGCTGCTTGTGCTAAGCACTTTGTTGGTGATGGTGGAACTCATAATGGAATCAATGAGAACAACACGATCACTGATGAACATGGGCTTCTAGGCATTCACATGCCCCCATATTATGACTCTATTATAAAGGGTGTTGCTACTGTTATGGTTTCCTATTCAAGCTTGAATGGTGTCAAAATGCATGCCAATCATGATCTGGTTACTGGCTACCTGAAATCCAAATTGCATTTTAGAGGATTTGTGATATCAGATTGGCTAGGAATAGACAGGATAACGTCACCACCTGATGCAAATTATACTTACTCTGTGCAAGCTGGAATAAATGCTGGTATTGATATGGTCATGGTGCCATTCAATTACACCCAATACATTGATGATGTGACACCTCTTGTTAAGAAGGGTATTATCAATATGAGCAGAATTGATGATGCTGTCAGGCGTATCCTTCGAGTCAAATTTATAATGGGCCTATTCGAGAACCCTTTAGCTGATCTTAGCTTCGCAGATCAGCTTGGAAAGAAGGAGCACAGAGATTTGGCTAGAGAAGCCGTCAGGAAATCACTTGTTCTATTAAAAAACGGCAACTCTCCCAATCAACAATTCCTGCCTCTACCAAAGAAAGCTAGAAGTATCCTTGTAGCTGGAAGCCATGCTAGCAATTTGGGCTACCAATGTGGCGGGTGGTCAATTGAATGGATCGGAGGTAGTGGAGATATTACTGTAGGTACAACAATTCTTGAGGCCATAAAGTCCACTGTCGCTGATTCAACACATGTTGTCTACTCTGAGAACCCTGATGAAAGCTTCATGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTTCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCGCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGTCAGTGGGTGATAAGCAGATTTGTTCTTTCACGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAATAGAGCATTTTTATCTAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGGCCTACAGCACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATT ] [+] EMBL CA764163 [ aggggGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACGGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCCTTTGGTTTTGGTTTGACGATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGGTATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCAT ] [+] EMBL CB097006 [ ACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACACACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACGATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGGTATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCAT ] [-] EMBL CF306152 [ GAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGTCAGTGGGTGATAAGCAGATTTGTTCTATAAAGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAATAGAGCATTTTAAAATAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGGCCTACAGCACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATTGATGGGTTTGA] [-] EMBL CF306173 [ CACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATTGATGGGTTTGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||