These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8822#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 2293 fasta sequence [TTGAGTTTGGAGGGAGAGAGAGTAGAGGAAGGAAACCTCCCTCCGGATCCAGGAAATCCTCATCCATCCTCATGACTTCCGACGAGCTCGCCGGTGAGGGTGAGGTCGACGGCGCGGAGCTGATCCTGTCGCTGCCGGAGGACGTGCTCGGGCTCATCTCCGCCCACCTCCGCCCGCGCGACCTCCTCGCCCTCTCCGCCGCCTCCCGCAGCCTCCGCAACGCCGTCTCCACCGCCGACAAGGCGTGGCTCGCCCAGTGCCGCCGCCTCCTCCCCACCGCCTCCCACCTCCTCGCCTGGCGCACCGCCCTCGCCCACTCCTCCCTCGCCGTCTGCCGCTTCCTCCACTCCGCCGCCCCGCTCCTCGGCCTCTGGGCCCACCAGAACCCCGAGCTCGGCAACCTCGTCCTCGCCCTCCCTGGCTTCCTCTCCCTCGTCGCCGTCCGCTCCATCCCCCAGGAGCTCTCCCCGCGCCTCCTCTGGGCCCCCGTCTTCGAGCTCCTCGCCGACCACCGCGGCCACCCCGCCTTCCTCTTCCTCCACGGCGCCGCCCACGACTCCCTCTTCCCCGGCCTCCTCTCCTCCTCCCTCCACCCCCTCGCCAACACCCTCTTCCTCGAGGCCCACACCTCCACCTCCACCTCCCACTTCTCCCGCCTCGCCTTCGCCGACCGCCGCCGCCTCCTCAACGCCCTCGTCGCCGCCTCCCGCCTCACCCTCCCCCCCGATGTCGCCACTGCCCCGCTCTTCGCGCGCTCCGACGCCGACCTCCCGCTGCTCGCCGCGCGCCGGGAGGCCATGCTGCGCCTGCACAGCCAGTCTGGCGGGGGCATGGTGCGCAGGGCCGAGATCGAGGCGCTGCTGATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCGACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTGTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTGCCATTGGACGAGTTCCTGCG-AGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTGAGCCTCCGTGGCGCGCGGATGAGGCTGTCTATCTACCGGAATTGGCCAAGCATGCATGACAACCGGTTTGTGCTCTACAAGCTGACGACGCAGGCGCCCATGCCTGGCCGGGAGTATGCCGGTTTGTGGGGAGGCACATTCGGGTGGCCGCCAGGGCGGCCGGAGGATGAGCGCAAACCTGGCAAGGCTCTCTTCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCCTCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGTCGCGTGCTGTGGAGATCAATAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATTTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAAGGAGAGGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCGCCGATACCCAACTTCGCCTACCTCACAAAGTCTTACTCCAATGTCTTT-GCTGTGGCACCT-GGCAGCA-CGAGC-TTCCCAG-CTTCTCCAAGG--TAAAAGATGGCTT--GGGAACCGTTATGATGGTATCACCTGATACAGAGGCAACAGCGACAGATCTTTGCGGGATCATGTTCTACTGTGCTTCCTTGCCATACGTCTTGTACTGAAGATCTGAATCCCACATTTTTCACCCTGAACCTGAAGGTTGGCCATCACCGTACGTTGATCTGAGTTGATGTACCGCTGCTGCTGCTGTTAATGGAAGCAGCATGGCAGCAGTGTTAATATGGTATATATTGGTACCCTGAAGGAAATGCAGCCAACTCCATCTGTATTTCCCTTGTTACTGAACTGGCATCTTCATGCCTGCAGTAAACTAAAATGTCAAAATTTAGCAAATGAGCTACAGTCGCAGATCCAGCCTCCTGATGATAACATCATGAGGTGTTAAACTGACATGAGTTGAAAGTTACATTAATGTCAAATTGTAAAATTTTGGAGGCATACNGATACAGCTAGGTGACCAGCGCAAATTGTAAGCTGGCACAGTAATTATTTTGGCATGATGTCGCTGGGTGAATCGTTGCAGTATTGAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK069415 [TTGAGTTTGGAGGGAGAGAGAGTAGAGGAAGGAAACCTCCCTCCGGATCCAGGAAATCCTCATCCATCCTCATGACTTCCGACGAGCTCGCCGGTGAGGGTGAGGTCGACGGCGCGGAGCTGATCCTGTCGCTGCCGGAGGACGTGCTCGGGCTCATCTCCGCCCACCTCCGCCCGCGCGACCTCCTCGCCCTCTCCGCCGCCTCCCGCAGCCTCCGCAACGCCGTCTCCACCGCCGACAAGGCGTGGCTCGCCCAGTGCCGCCGCCTCCTCCCCACCGCCTCCCACCTCCTCGCCTGGCGCACCGCCCTCGCCCACTCCTCCCTCGCCGTCTGCCGCTTCCTCCACTCCGCCGCCCCGCTCCTCGGCCTCTGGGCCCACCAGAACCCCGAGCTCGGCAACCTCGTCCTCGCCCTCCCTGGCTTCCTCTCCCTCGTCGCCGTCCGCTCCATCCCCCAGGAGCTCTCCCCGCGCCTCCTCTGGGCCCCCGTCTTCGAGCTCCTCGCCGACCACCGCGGCCACCCCGCCTTCCTCTTCCTCCACGGCGCCGCCCACGACTCCCTCTTCCCCGGCCTCCTCTCCTCCTCCCTCCACCCCCTCGCCAACACCCTCTTCCTCGAGGCCCACACCTCCACCTCCACCTCCCACTTCTCCCGCCTCGCCTTCGCCGACCGCCGCCGCCTCCTCAACGCCCTCGTCGCCGCCTCCCGCCTCACCCTCCCCCCCGATGTCGCCACTGCCCCGCTCTTCGCGCGCTCCGACGCCGACCTCCCGCTGCTCGCCGCGCGCCGGGAGGCCATGCTGCGCCTGCACAGCCAGTCTGGCGGGGGCATGGTGCGCAGGGCCGAGATCGAGGCGCTGCTGATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCGACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTGTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTGCCATTGGACGAGTTCCTGCG 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AGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTGAGCCTCCGTGGCGCGCGGATGAGGCTGTCTATCTACCGGAATTGGCCAAGCATGCATGACAACCGGTTTGTGCTCTACAAGCTGACGACGCAGGCGCCCATGCCTGGCCGGGAGTATGCCGGTTTGTGGGGAGGCTCATTCGGGTGGCCGCCAGGGCGGCCGGAGGATGAGCGCAAACCTGGCAAGGCTCTCTTCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCATCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGCCGCGTGCTGTGGAGATCAATAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATTTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAAGGAGAGGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCGCCGATACCCAACTTCGCCTACCTCACAAAGTCTTACTCCAATGTCTTT GCTGTGGCACCT GGCAGCA CGAGC TTCCCAG CTTCTCCAAGG TAAAAGATGGCTT GGGAACCGTTATGATGGTATCACCTGATACAGAGGCAACAGCGACAGATCTTTGCGGGATCATGTTCTACTGTGCTTCCTTGCCATACGTCTTGTACTGAAGATCTGAATCCCACATTTTTCACCCTGAACCTGAAGGTTGGCCATCACCGTACGTTGATCTGAGTTGATGTACCGCTGCTGCTGCTGTTAATGGAAGCAGCATGGCAGCAGTGTTAATATGGTATATATTGGTACCCTGAAGGAAATGCAGCCAACTCCATCTGTATTTCCCTTGTTACTGAACTGGCATCTTCATGCCTGCAGTAAACTAAAATGTC ] [+] EMBL C97048 [ CGCCGCG GCCGGGA GNCATGCTGCGNCTGCACAGCCAGTCTGGCGGGGGCATGGTGCGCAGGGCCGAGATCGAGGCGCTGCTGATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCNACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTNTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTTCCATTGGACGAGTTNCTGCGAAGCCGGAGAGAGCGTCGGCCTTAGCCTCCGTGGCGCGCGGATTAAGNTGTCTATCTACCGGAATTTGNCAAGAATGAATNACAACCG ] [+] EMBL CB654394 [ GATCGGGGCCAGGAAGACGGCGGCGCTGCCGGCCGACACCGCCGGCGACAAGATGCGGCTGCGGAGGACCTTCTCGGTGGTCGCCGGTTTTGTCAGGAACAGCCTGCGGCAGATGGTGACACGGTCGGCGTCCGCCAATTCCAGGGCTGAGTACGCCCACCCCAAGCATCTGCCATTGGACGAGTTCCTGCG 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GCNCNCTNCTTCCTACTCCTCTCCTATGAGGAGGACAGCGAAGGGAAGCTTCAGCTGATTGCAACCAAGGTGTTGGAGGGTACACACTATGTCGTGCATCCGAATGGGTCCTCTATGTTTATCGTGCGGGTCGGTGAGCCATCCACTGAGACTTTTCCGTGGCAAACCGATGAGGAGTCGCGTGCTGTGGAGATCAAGAGAAGCTTTGCTGGTGAGGGCATTGCCACCGGGTATGGGTTCAGGTATCCTGGCTCAAAGCCCGGATCGCTCTTTGTCCTCCTGGATGGCCGGCTTGCATGTGTTTGGAGAGAGAACAAAGCTGTTCTCACCTTGCAAAGGCTGGACCTGGAGGATATGATAAGGAGAAGGGAGCGTGTGCCTTCATTGCCCCCGATACCCCACTTCGCCTACCTCCCAAAGTCTTACTCCAATGTCTTTGGCTGTTGGACCTGGGCAGCACCGAGCTTTCCCAGCCTTCTCCCAGGGTTAAAAGATGGCTTGGGGGAACCc ] [+] EMBL C97049 [ GTTGATCTGAGTTGATGTACCGCTGCTGCTGCTGTTAATGGAAGCAGCATGGCAGCAGTGTTAATATGGTATATATTGGTACCCTGAAGGAAATGCAGCCAACTCCATCTGTATTTCCCTTGTTACTGAACTGGCATCTTCATGCCTGCAGTAAACTAAAATGTCAAAATTTAGCAAATGAGCTACAGTCGCAGATCCAGCCTCCTGATGATAACATCATGAGGTGTTAAACTGACATGAGTTGAAAGTTACATTAATGTCAAATTGTAAAATTTTGGAGGCATACNGATACAGCTAGGTGACCAGCGCAAATTGTAAGCTGGCACAGTAATTATTTTGGCATGATGTCGCTGGGTGAATCGTTGCAGTATTGAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||