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Oryza sativa
cluster # 9201 cluster # 9201       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9201#0 length = 1220 sequences # 6  

consensusID : consensus_9201#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1220
fasta sequence
                              [GTGCGCATTGCCCCACGCCTCCGCTCTCTCCCGCTCCTGCTCCCCGGACCAGACGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGTCCACCGCAGCTGCTCCTCCTGTGGCGGTAGCTTGGCCGCGTTGGCGCCTGCCCGCCTGCGCGCCATGTCGTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCCGTCTCCCCCTCCCCGTACACGACGCTCGTGGGTCGCGTGAGCTGCGAGCGCGAGATCAAGAAGAGCAAGTTCATCGCCATCGCCGCCCCCGTCCCCGACGAGCGCGCCGCCATGTCCTTCCTCAACGAGGTCAGTGATCCCCGTGCAACCCATAATTGCTGGGCGTATAAGCTGGGAGAGCAATTCCGTTACAATGATGATGGTGAACCTTCAAGCACCGCTGGAAAGCCAATATACTCTGCCATTATTTCATCTGGCATTGATATGGTCATGGTGGTGGTAATCAGATACTTTGGAGGCATAAAATTAGGAACTGGTGGGCTGGTGAGAGCTTATGGTGGGGTTGCTTCTGAATGCCTAAAAGATGCTCCTACTTGTCTTGTAAAACCAAAGGCTCGTGTGGGTATGGAGGTACCATTTGATCTCTTGGGAACAGTCTATCATCAGTTGCAACATTACCAAGCTGAAGATATCAAACAGGACTATGACACTGGGAAAGATGGTACTGTTATGGTCATGTTCAAATTGGAATATGAAAAAATTGAGAATCTTGGGAATGCAGTAAATTCAGCCTGCAGCAGGAAAATAGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT-GTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAAATCTTGCAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK063259             [GTGCGCATTGCCCCACGCCTCCGCTCTCTCCCGCTCCTGCTCCCCGGACCAGACGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGTCCACCGCAGCTGCTCCTCCTGTGGCGGTAGCTTGGCCGCGTTGGCGCCTGCCCGCCTGCGCGCCATGTCGTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCCGTCTCCCCCTCCCCGTACACGACGCTCGTGGGTCGCGTGAGCTGCGAGCGCGAGATCAAGAAGAGCAAGTTCATCGCCATCGCCGCCCCCGTCCCCGACGAGCGCGCCGCCATGTCCTTCCTCAACGAGGTCAGTGATCCCCGTGCAACCCATAATTGCTGGGCGTATAAGCTGGGAGAGCAATTCCGTTACAATGATGATGGTGAACCTTCAAGCACCGCTGGAAAGCCAATATACTCTGCCATTATTTCATCTGGCATTGATATGGTCATGGTGGTGGTAATCAGATACTTTGGAGGCATAAAATTAGGAACTGGTGGGCTGGTGAGAGCTTATGGTGGGGTTGCTTCTGAATGCCTAAAAGATGCTCCTACTTGTCTTGTAAAACCAAAGGCTCGTGTGGGTATGGAGGTACCATTTGATCTCTTGGGAACAGTCTATCATCAGTTGCAACATTACCAAGCTGAAGATATCAAACAGGACTATGACACTGGGAAAGATGGTACTGTTATGGTCATGTTCAAATTGGAATATGAAAAAATTGAGAATCTTGGGAATGCAGTAAATTCAGCCTGCAGCAGGAAAATAGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATT                                                                                ]
[+] EMBL CA757408             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCCTGCAGCAGGAAAATAGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT GTGTTATTTTGATGCGTAATTCTTTTCTTGCAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CF330189             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACCGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT GTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAAA                                                 ]
[-] EMBL CF330190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACCGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCTGGTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAAAa                                                ]
[+] EMBL CF328597             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT GTGTTATTTTGATGCGTAAAAAA                                                   ]
[-] EMBL CF328598             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCTGGTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAA                                                  ]


>consensus_9201#0 GTGCGCATTGCCCCACGCCTCCGCTCTCTCCCGCTCCTGCTCCCCGGACCAGACGCCGCC GCCACCGCCGCCGCCGTCCACCGCAGCTGCTCCTCCTGTGGCGGTAGCTTGGCCGCGTTG GCGCCTGCCCGCCTGCGCGCCATGTCGTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCCGTCTCCCCCTCC CCGTACACGACGCTCGTGGGTCGCGTGAGCTGCGAGCGCGAGATCAAGAAGAGCAAGTTC ATCGCCATCGCCGCCCCCGTCCCCGACGAGCGCGCCGCCATGTCCTTCCTCAACGAGGTC AGTGATCCCCGTGCAACCCATAATTGCTGGGCGTATAAGCTGGGAGAGCAATTCCGTTAC AATGATGATGGTGAACCTTCAAGCACCGCTGGAAAGCCAATATACTCTGCCATTATTTCA TCTGGCATTGATATGGTCATGGTGGTGGTAATCAGATACTTTGGAGGCATAAAATTAGGA ACTGGTGGGCTGGTGAGAGCTTATGGTGGGGTTGCTTCTGAATGCCTAAAAGATGCTCCT ACTTGTCTTGTAAAACCAAAGGCTCGTGTGGGTATGGAGGTACCATTTGATCTCTTGGGA ACAGTCTATCATCAGTTGCAACATTACCAAGCTGAAGATATCAAACAGGACTATGACACT GGGAAAGATGGTACTGTTATGGTCATGTTCAAATTGGAATATGAAAAAATTGAGAATCTT GGGAATGCAGTAAATTCAGCCTGCAGCAGGAAAATAGAACTACTCCTATAAGTGGAATCA TAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTT AACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAG CAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTA TTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGT TACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTT ATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGAT TCAGCTGTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAAATCTTGCAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)