These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9201#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1220 fasta sequence [GTGCGCATTGCCCCACGCCTCCGCTCTCTCCCGCTCCTGCTCCCCGGACCAGACGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGTCCACCGCAGCTGCTCCTCCTGTGGCGGTAGCTTGGCCGCGTTGGCGCCTGCCCGCCTGCGCGCCATGTCGTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCCGTCTCCCCCTCCCCGTACACGACGCTCGTGGGTCGCGTGAGCTGCGAGCGCGAGATCAAGAAGAGCAAGTTCATCGCCATCGCCGCCCCCGTCCCCGACGAGCGCGCCGCCATGTCCTTCCTCAACGAGGTCAGTGATCCCCGTGCAACCCATAATTGCTGGGCGTATAAGCTGGGAGAGCAATTCCGTTACAATGATGATGGTGAACCTTCAAGCACCGCTGGAAAGCCAATATACTCTGCCATTATTTCATCTGGCATTGATATGGTCATGGTGGTGGTAATCAGATACTTTGGAGGCATAAAATTAGGAACTGGTGGGCTGGTGAGAGCTTATGGTGGGGTTGCTTCTGAATGCCTAAAAGATGCTCCTACTTGTCTTGTAAAACCAAAGGCTCGTGTGGGTATGGAGGTACCATTTGATCTCTTGGGAACAGTCTATCATCAGTTGCAACATTACCAAGCTGAAGATATCAAACAGGACTATGACACTGGGAAAGATGGTACTGTTATGGTCATGTTCAAATTGGAATATGAAAAAATTGAGAATCTTGGGAATGCAGTAAATTCAGCCTGCAGCAGGAAAATAGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT-GTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAAATCTTGCAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK063259 [GTGCGCATTGCCCCACGCCTCCGCTCTCTCCCGCTCCTGCTCCCCGGACCAGACGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGTCCACCGCAGCTGCTCCTCCTGTGGCGGTAGCTTGGCCGCGTTGGCGCCTGCCCGCCTGCGCGCCATGTCGTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCCGTCTCCCCCTCCCCGTACACGACGCTCGTGGGTCGCGTGAGCTGCGAGCGCGAGATCAAGAAGAGCAAGTTCATCGCCATCGCCGCCCCCGTCCCCGACGAGCGCGCCGCCATGTCCTTCCTCAACGAGGTCAGTGATCCCCGTGCAACCCATAATTGCTGGGCGTATAAGCTGGGAGAGCAATTCCGTTACAATGATGATGGTGAACCTTCAAGCACCGCTGGAAAGCCAATATACTCTGCCATTATTTCATCTGGCATTGATATGGTCATGGTGGTGGTAATCAGATACTTTGGAGGCATAAAATTAGGAACTGGTGGGCTGGTGAGAGCTTATGGTGGGGTTGCTTCTGAATGCCTAAAAGATGCTCCTACTTGTCTTGTAAAACCAAAGGCTCGTGTGGGTATGGAGGTACCATTTGATCTCTTGGGAACAGTCTATCATCAGTTGCAACATTACCAAGCTGAAGATATCAAACAGGACTATGACACTGGGAAAGATGGTACTGTTATGGTCATGTTCAAATTGGAATATGAAAAAATTGAGAATCTTGGGAATGCAGTAAATTCAGCCTGCAGCAGGAAAATAGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATT ] [+] EMBL CA757408 [ GCCTGCAGCAGGAAAATAGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT GTGTTATTTTGATGCGTAATTCTTTTCTTGCAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CF330189 [ AGAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACCGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT GTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAAA ] [-] EMBL CF330190 [ GAACTACTCCTATAAGTGGAATCATAGGGTTAAGTGTGACCATGCAGATTCAATGTTCAGGTTGTGCCTACCGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCTGGTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAAAa ] [+] EMBL CF328597 [ TTCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCT GTGTTATTTTGATGCGTAAAAAA ] [-] EMBL CF328598 [ TCAGGTTGTGCCTACTGCAGCCTCTGTTAACCAGTGCACTACTACTACCCCTGAAATATTCAGCCTTTGACTCGACGATAGTTCTTAGCAGCAACTTCAGATTGGAGTTCCCCAATGTAAACGGCAGAATCATGTTCTACTGAGATTATTGATCCTCCAAACATACATATATATTAGTTTCTCATCCTGTCTACCATCTATTGTAAGTTACCAATAATAACGTCTTAGTATTATACTCTTGTAGCATTGATATGTTGAAAGAGATGTTATGATAACTTCTCCATGATCTTTATGACCAAATTGACATTAATTTGGCTGATCTTTTGATTCAGCTGGTGTTATTTTGATGCGTAAAAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||