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Oryza sativa
cluster # 9245 cluster # 9245       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9245#0 length = 667 sequences # 6  

consensusID : consensus_9245#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 667
fasta sequence
                              [CAGCACTTAAGGCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACTGCAAAATGAGAAAAATAGTCGTTATCTTTT]

[+] EMBL CF339335             [CAGCACTTAAGTCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACTGCAAAATGAGAAAAATAGTCGTTATCTTTT]
[+] EMBL CF339100             [CAGCACTTAA GCTT TTACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAA                                       ]
[+] EMBL CF340005             [           GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACT                              ]
[+] EMBL CF339812             [           GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTA                                                                                                   ]
[+] EMBL CF338251             [           GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAA                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CF339662             [           GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_9245#0 CAGCACTTAAGGCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCAC TCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACC CCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTT AAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAG GCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCT TTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTA ATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATT AACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAAT CCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCA ATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTC ATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACTGCAAAATGAGAAAAATAGTCGTT ATCTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)