These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9245#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 667 fasta sequence [CAGCACTTAAGGCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACTGCAAAATGAGAAAAATAGTCGTTATCTTTT] [+] EMBL CF339335 [CAGCACTTAAGTCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACTGCAAAATGAGAAAAATAGTCGTTATCTTTT] [+] EMBL CF339100 [CAGCACTTAA GCTT TTACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAA ] [+] EMBL CF340005 [ GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTATTGCGCCTTACCTCGTGTTTTGTCTTTTTTTCATTACCAATGTGTGCATGTGAGGAACAATATGGCACT ] [+] EMBL CF339812 [ GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAATCCCCATTCTGCCCCCGCGGTTACGCTTTCTTATCTATTCTTTCAATCAGCACTTCACCCAATTCATCCTTAATTCTAATAACTGGCTA ] [+] EMBL CF338251 [ GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAAACATGACATACGTTCAAAGATTAACCCCGTTTGAAGGTTAGCTTGTTAGTTACATTTAGTAACACATATCTGGCTACTTAA ] [+] EMBL CF339662 [ GCTTAATACTGGCCTGGCAATTCTTTCGCCTGGTGCATTTGAAGTTCACTCTGACGGAATAGATGTGGATAACGAATTGTTTCACTATCCTATTAAAAAAGCATATACCCCATATAATATACACACTTACAAGACAGAGGAAGTTGTAAACCAGATGAATATAAAAGTTAAAAACATGACCTTAGATGAAATAAACAATACTTACTGTAATAACGATTATTACAATCAGGCAATAAGAGAGGAACCGATAGACCTTCTGGACAGATCGTTTTCCTCCAGTTCATGGCCTTTTTAGTGAATAAATCATCACTAATTCTATAAGTGTCTGGTCTTGTTGATAATATAGTTAATATGTAACCCTTTAGATTCACGATCTGAAGGGTTGAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||