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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9342#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1252 fasta sequence
[CGGCGACGAGGGGCGTGCGGGTGGCGAGGGACAAAAGCGGCGGAGGGAAGCTGGAGGAGCGGACGGCCGTTGCAGTTGCAGTGAAGGTGGTGGTGGTGGATCCGCAGCGCCTGCGCATGGCGGCCTTCGAGCCCCATCGGCTTCAGCTCTTGTACTTCATTGCCATTACAGTGCTCGCTTCGGTGTTCCAACCTTGCACGTCCATTGAGCTCCACCGTGAGCTCTCTGGCTGGTCGAATGGCATTGCTACATGGTATGGCGATCCTAATGGTGCAGGAAGTGAAGGCGGTGCATGTGGGTACCAGTATGCTGTTGACCAGCCACCGTTCTCATCCAGGATTGCTGCTGGTAGCCCCTACATCTATGACTCTGGCAAGGGAT-G-TGGTTCGTGCT-ACCGGGTGGTGTGTGCTGGTAATGAAGCTTGCTCTGGTATCCCTGTAACCGTTGTCATCACTGACCAGGGGCCTGGTGGCCCATGCTTGGAAGAGCTAGTCGATGGTCAATGCATGAATGAAGCAGCTCACTTTGACATGAGCGGGACAGCATTCGGTGCCATGGCGAGGCCTGGCCAGGCTGATCAACTCCGTGGTGCTGGCCTCCTCCAAATT-CAGTACACCCGTGTGGAGTGTG-AATGGACTGG-AGTAGGGCTAACCTTTGTCGTGGACTCTGGCT-CCAACCCGAACTACCTGG-CCCTGCTGGTGGAGTACGATGACAACGACAGTGACCTTGCGGCTGTCGACATCATGCCGATTGGTGCTGGTGCTTCGGGGTCATGGATTCCGATGCAGCAGTCATGGGGCGCAGTGTGGAGGCTCAACTCCGGCTCCGCCCTGCAGGGCCCGTTCTCCGTCCGCCTGACGTTCAGCTCCGGCCAGATGTTTGTTGCCAGCAACGCCATACCGGCAGGGTGGAACCCCGGCATGGCGTACCAGCCCGGCGGAGTGGCGATGAGGGTTAGGGGAAGAAATGGTGGTCGCCGGGGCTACGAGGCCGTCGGGATGCTGGGTGGCTTGTGTCACCTTCTACTGCTGCTGTTGTTAATGTTGTTCGAGTTGTGACTTGTGATGCACTAAAAACATGTGCTGAAACTTTGGTGCTTTCTGTAGGACTAGCCATGGTTGGATTAGCCTGGCCGTGCTCTCTTGTAGCTCAGATGATGTATTGCCCGCAGCCTTGGAGACATTATCAATTTGTCATGTGCTGGATTAATGGAATAAGTAGTATTCCACTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AY046928 [CGGCGACGAGGGGCGTGCGGGTGGCGAGGGACAAAAGCGGCGGAGGGAAGCTGGAGGAGCGGACGGCCGTTGCAGTTGCAGTGAAGGTGGTGGTGGTGGATCCGCAGCGCCTGCGCATGGCGGCCTTCGAGCCCCATCGGCTTCAGCTCTTGTACTTCATTGCCATTACAGTGCTCGCTTCGGTGTTCCAACCTTGCACGTCCATTGAGCTCCACCGTGAGCTCTCTGGCTGGTCGAATGGCATTGCTACATGGTATGGCGATCCTAATGGTGCAGGAAGTGAAGGCGGTGCATGTGGGTACCAGTATGCTGTTGACCAGCCACCGTTCTCATCCAGGATTGCTGCTGGTAGCCCCTACATCTATGACTCTGGCAAGGGAT G TGGTTCGTGCT ACCGGGTGGTGTGTGCTGGTAATGAAGCTTGCTCTGGTATCCCTGTAACCGTTGTCATCACTGACCAGGGGCCTGGTGGCCCATGCTTGGAAGAGCTAGTCGATGGTCAATGCATGAATGAAGCAGCTCACTTTGACATGAGCGGGACAGCATTCGGTGCCATGGCGAGGCCTGGCCAGGCTGATCAACTCCGTGGTGCTGGCCTCCTCCAAATT CAGTACACCCGTGTGGAGTGTG AATGGACTGG AGTAGGGCTAACCTTTGTCGTGGACTCTGGCT CCAACCCGAACTACCTGG CCCTGCTGGTGGAGTACGATGACAACGACAGTGACCTTGCGGCTGTCGACATCATGCCGATTGGTGCTGGTGCTTCGGGGTCATGGATTCCGATGCAGCAGTCATGGGGCGCAGTGTGGAGGCTCAACTCCGGCTCCGCCCTGCAGGGCCCGTTCTCCGTCCGCCTGACGTTCAGCTCCGGCCAGATGTTTGTTGCCAGCAACGCCATACCGGCAGGGTGGAACCCCGGCATGGCGTACCAGCCCGGCGGAGTGGCGATGAGGGTTAGGGGAAGAAATGGTGGTCGCCGGGGCTACGAGGCCGTCGGGATGCTGGGTGGCTTGTGTCACCTTCTACTGCTGCTGTTGTTAATGTTGTTCGAGTTGTGACTTGTGATGCACTAAAAACATGTGCTGAAACTTTGGTGCTTTCTGTAGGACTAGCCATGGTTGGATTAGCCTGGCCGTGCTCTCTTGTAGCTCAGATGATGTATTGCCCGCAGCCTTGGAGACATTATCAATTTGTCATGTGCTGGATTAATGGAATAAGTAGTATTCCACTGTTAAAA ]
[+] EMBL AU064549 [ GGCGTGCGGGTGGCGAGGGACAAAAGCGGCGGAGGGAAGCTGGAGGAGCGGACGGCCGTTGCAGTTGCAGTGAAGGTGGTGGTGGTGGATCCGCAGCGCCTGCGCATGGCGGCCTTCGAGCCCCATCGGCTTCAGCTCTTGTACTTCATTGCCATTACAGTGCTCGCTTCGGTGTTCCAACCTTGCACGTCCATTGAGCTCCACCGTGAGCTCTCTGGCTGGTCGAATGGCATTGCTACATGGTATGGCGATCCTAATGGTGCAGGAAGTGAAGGCGGTGCATGTGGGTACCAGTATGCTGTTGACCAGCCACCGTTCTCATCCAGGATTGCTGCTTGTAG CCCTACATCTATGACTTTTGCAAGGGAT GTTGGTTCGTGCTAACCCGGTGGTGTTTTCTtg ]
[+] EMBL AU162026 [ GGCGTGCGGGTGGCGAGGGACAAAAGCGGCGGAGGGAAGCTGGAGGAGCGGACGGCCGTTGCAGTTGCAGTGAAGGTGGTGGTGGTGGATCCGCAGCGCCTGCGCATGGCGGCCTTCGAGCCCCATCGGCTTCAGCTCTTGTACTTCATTGCCATTACAGTGCTCGCTTCGGTGTTCCAACCTTGCACGTCCATTGAGCTCCACCGTGAGCTCTCTGGCTGGTCGAATGGCATTGCTACATGGTATGGCGATCCTAATGGTGCAGGAAGTGAAAGCGGTGCATGTGGGTACCAGTATGCTGTTGACCAGCCACCGTTCTCATCCAGGATTNCTGCTGGTAACCCCTANATCTATTACTCTGGCAAAGGATNT TGGTTCGTGCTAACCG ]
[+] EMBL AU029651 [ tTGGTGCTGGCCTCNTCTAAATTCCAGTACACCCTTGTGGANTGTGAAATGGACTGGAATTAGGGCTAA CTTTGTCGTGGACTCTGGCTCCCAACCCGAA TACCTGG CCCTGCTGGTGGAGTACGATGACAACGACAGTGA CTTGCGGCTGTCGACATCATGCCGATTGGTGCTGGTGCTTCGGGGTCATGGATTCCGATGCAGCAGTCATGGGGCGCAGTGTGGAGGCTCAACTCC GCTCCG CCTGCAGGGCCCGTTCTCCGTCCGCCTGACGTTCAGCTCCGGCCAGATGTTTGTTGCCAGCAACGCCATACCGGCAGGGTGGAACCCCGGCATGGCGTACCAGCCCGGCGGAGTGGCGATGAGGGTTAGGGGAAGAAATGGTGGTCGCCGGGGCTACGAGGCCGTCGGGATGCTGGGTGGCTTGTGTCACCTTCTACTGCTGCTGTTGTTAATGTTGTTCGAGTTGTGACTTGTGATGCACTAAAAACATGTGCTGAAACTTTGGTGCTTTCTGTAGGACTAGCCATGGTTGGATTAGCCTGGCCGTGCTCTCTTGTAGCTCAGATGATGTATTGCCCGCAGCCTTGGAGACATTATCAATTTGTCATGTGCTGGATTAATGGAATAAGTAGTATTCCACTGTTAAAAAAA ]
[-] EMBL CA759688 [ TGCTGGCCTCCTCCAAATT CAGTACACCCGTGTGGAGTGTG AATGGACTGG AGTAGGGCTAACCTTTGTCGTGGACTCTGGCT CCAACCCGAACTACCTGG CCCTGCTGGTGGAGTACGATGACAACGACAGTGACCTTGCGGCTGTCGACATCATGCCGATTGGTGCTGGTGCTTCGGGGTCATGGATTCCGATGCAGCAGTCATGGGGCGCAGTGTGGAGGCTCAACTCCGGCTCCGCCCTGCAGGGCCCGTTCTCCGTCCGCCTGACGTTCAGCTCCGGCCAGATGTTTGTTGCCAGCAACGCCATACCGGCAGGGTGGAACCCCGGCATGGCGTACCAGCCCGGCGGAGTGGCGATGAGGGTTAGGGGAAGAAATGGTGGTCGCCGGGGCTACGAGGCCGTCGGGATGCTGGGTGGCTTGTGTCACCTTCTACTGCTGCTGTTGTTAATGTTGTTCGAGTTGTGACTTGTGATGCACTAAAAACATGTGCTGAAACTTTGGTGCTTTCTGTAGGACTAGCCATGGTTGGATTAGCCTGGCCGTGCTCTCTTGTAGCTCAGATGATGTATTGCCCGCAGCCTTGGAGACATTATCAATTTGTCATGTGCTGGATTAATGGAATAAGTAGTATTCCACTGTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU166149 [ CGTGTGGAGTGTG AATGGACTGG AGTAGGGCTAACCTTTGTCGTGGACTCTGGCT CCAACCCGAA TACCTGGCCCCTGCTGGTGGAGTACGATGACAACGACAGTGA CTTGCGGCTGTCGACATCATGCCGATTGGTGCTGGTGCTTCGGGGTCATGGATTCCGATGCAGCAGTCATGGGGCGCAGTGTGGAGGCTCAACTTCCGCTCCGCCCTGCAGGGCCCGTTCTCCGTCCGCCTGACGTTCAGCTCCGGCCAGATGTTTGTTGCCAGCAACGCCATACCGGCAGGGTGGAACCCCGGCATGGCGTACCAGCCCGGCGGAGTGGCGATGAGGGTTAGGGGAAGAAATGGTGGTCGCCGGGGCTACGAGGCCGTCGGGATGCTGGGTGGCTTGTGTCACCTTCTACTGCTGCTGTTGTTAATGTTGTTCGAGTTGTGACTTGTGATGCACTAAAAACATGTGCTGAAACTTTGGTGCTTTCTGTAGGACTAGCCATGGTTGGATTAGCCTGGCCGTGCTCTCTTGTAGCTCAGATGATGTATTGCCCGCAGCCTTGGAGACATTATCAATTTGTCATGTGCTGGATTAATGGAATAAGTAGTATTCCACTGTTAAAAAAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||