These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9376#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1687 fasta sequence [GCTACGGGGACAGCACTGCCGTTTCCACCCTAGTCCAGGCAGGAATTACAAGGGTTGTGGTTGGTCTTAGGCACCCCTTAAAGCACCTGAGAGGAAAGGCAATTCAATCACTACGAAATGAAGGCATTCAAGTTGACGTTGTGGGCGAGGATCTGCACAGTAAATTATTTAAGGAAGCTCTTAAGTCATGCCTCATTGTAAATGCCCCATTACTTTACCGAGCTGCCTTCCGTGTTCCGTTCTCTGTCCTGAAGTATGCTATGACTGCAGATGGAAAAATTGCAGCAAGCAGTGGGCATGCATCTTGGGTAAGTGGCAAATCATCTAGAGGCAGAGTATTTGAATTGCGTGGAAGAAGCGATGCTATAATTGTAGGTGGAAATACAGTACGCCTTGATGATCCTCGCTTAACTGCCAGGCATGTCAAGGGGCATGTTCCAGTGCGAATTGTAATGTCACAGTCTCTTAATCTTCCCGAGGAAGCAAATTTATGGAATGTACATGATGCATACACAATAGTTGCAACACAAAGAGGTGCTCGGAGAGATCTCCAAAAGAAACTTGCTTTGAAGGGTGTTGAAGTAGTGGAGTTTGACATGCTGAATCCTAGAGATGTTATGTCATATTGTTATGATCGTGGTTACCTCTCCGTATTATGGGAGTGTGGTGGGACCCTAGCAGCTTCTGCTATATCTGCAAGTGTTATTCATAAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT-CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCTTTCGTTGCCGAATTTTATTTGTTATCATCTTGTTGTACTGGTCTGGTCTGCAAATATAAAATCAGAGCAGAGATAGAGGATGCA] [+] EMBL AK065460 [GCTACGGGGACAGCACTGCCGTTTCCACCCTAGTCCAGGCAGGAATTACAAGGGTTGTGGTTGGTCTTAGGCACCCCTTAAAGCACCTGAGAGGAAAGGCAATTCAATCACTACGAAATGAAGGCATTCAAGTTGACGTTGTGGGCGAGGATCTGCACAGTAAATTATTTAAGGAAGCTCTTAAGTCATGCCTCATTGTAAATGCCCCATTACTTTACCGAGCTGCCTTCCGTGTTCCGTTCTCTGTCCTGAAGTATGCTATGACTGCAGATGGAAAAATTGCAGCAAGCAGTGGGCATGCATCTTGGGTAAGTGGCAAATCATCTAGAGGCAGAGTATTTGAATTGCGTGGAAGAAGCGATGCTATAATTGTAGGTGGAAATACAGTACGCCTTGATGATCCTCGCTTAACTGCCAGGCATGTCAAGGGGCATGTTCCAGTGCGAATTGTAATGTCACAGTCTCTTAATCTTCCCGAGGAAGCAAATTTATGGAATGTACATGATGCATACACAATAGTTGCAACACAAAGAGGTGCTCGGAGAGATCTCCAAAAGAAACTTGCTTTGAAGGGTGTTGAAGTAGTGGAGTTTGACATGCTGAATCCTAGAGATGTTATGTCATATTGTTATGATCGTGGTTACCTCTCCGTATTATGGGAGTGTGGTGGGACCCTAGCAGCTTCTGCTATATCTGCAAGTGTTATTCATAAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCT ] [+] EMBL OSR19891A [ GACTGCAGATGGAAAAATTGCAGCAAGCAGTGGGCATGCATCTTGGGTAAGTGGCAAATCATCTAGAGGCAGAGTATTTGAATTGCGTGGAAGAAGCGATGCTATAATTGTAGGTGGAAATACAGTACGCCTTGATGATCCTCGCTTAACTGCCAGGCATGTCAAGGGGCATGTTCCAGTGCGAATTGTAATGTCACAGTCTCTTAATCTTCCCGAGGAAGCAAATTTATGGAATGTACATGATGCATACACAATAGTTGCAACACAAAGAGGTGCTCGGAGAGATCTCCAAAAGAAACTTGCTTTGAAGGGTGTTGAAGTAGTNGAGTTTGACATGCTGAATCCTAGAGATGTTATGTCATATTGTTATGATCG ] [+] EMBL CB661103 [ GCTATATCTGCAAGTGTTATTCATAAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAAGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATAT ] [+] EMBL AK058742 [ AAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGGAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCTTTCGTTGCCGAATTTTATTTGTTATCATCTTGTTGTACTGGTCTGGTCTGCAAATATAAAATCAGAGCAGAGATAGAGGATGCA] [-] EMBL CB661104 [ CAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAA ] [+] EMBL AU031831 [ GCAAAGNGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCATCCAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCTTTCGTTGCCGAATTTTATTTGTTAaaaaaaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||