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Oryza sativa
cluster # 9376 cluster # 9376       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9376#0 length = 1687 sequences # 6  

consensusID : consensus_9376#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1687
fasta sequence
                              [GCTACGGGGACAGCACTGCCGTTTCCACCCTAGTCCAGGCAGGAATTACAAGGGTTGTGGTTGGTCTTAGGCACCCCTTAAAGCACCTGAGAGGAAAGGCAATTCAATCACTACGAAATGAAGGCATTCAAGTTGACGTTGTGGGCGAGGATCTGCACAGTAAATTATTTAAGGAAGCTCTTAAGTCATGCCTCATTGTAAATGCCCCATTACTTTACCGAGCTGCCTTCCGTGTTCCGTTCTCTGTCCTGAAGTATGCTATGACTGCAGATGGAAAAATTGCAGCAAGCAGTGGGCATGCATCTTGGGTAAGTGGCAAATCATCTAGAGGCAGAGTATTTGAATTGCGTGGAAGAAGCGATGCTATAATTGTAGGTGGAAATACAGTACGCCTTGATGATCCTCGCTTAACTGCCAGGCATGTCAAGGGGCATGTTCCAGTGCGAATTGTAATGTCACAGTCTCTTAATCTTCCCGAGGAAGCAAATTTATGGAATGTACATGATGCATACACAATAGTTGCAACACAAAGAGGTGCTCGGAGAGATCTCCAAAAGAAACTTGCTTTGAAGGGTGTTGAAGTAGTGGAGTTTGACATGCTGAATCCTAGAGATGTTATGTCATATTGTTATGATCGTGGTTACCTCTCCGTATTATGGGAGTGTGGTGGGACCCTAGCAGCTTCTGCTATATCTGCAAGTGTTATTCATAAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT-CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCTTTCGTTGCCGAATTTTATTTGTTATCATCTTGTTGTACTGGTCTGGTCTGCAAATATAAAATCAGAGCAGAGATAGAGGATGCA]

[+] EMBL AK065460             [GCTACGGGGACAGCACTGCCGTTTCCACCCTAGTCCAGGCAGGAATTACAAGGGTTGTGGTTGGTCTTAGGCACCCCTTAAAGCACCTGAGAGGAAAGGCAATTCAATCACTACGAAATGAAGGCATTCAAGTTGACGTTGTGGGCGAGGATCTGCACAGTAAATTATTTAAGGAAGCTCTTAAGTCATGCCTCATTGTAAATGCCCCATTACTTTACCGAGCTGCCTTCCGTGTTCCGTTCTCTGTCCTGAAGTATGCTATGACTGCAGATGGAAAAATTGCAGCAAGCAGTGGGCATGCATCTTGGGTAAGTGGCAAATCATCTAGAGGCAGAGTATTTGAATTGCGTGGAAGAAGCGATGCTATAATTGTAGGTGGAAATACAGTACGCCTTGATGATCCTCGCTTAACTGCCAGGCATGTCAAGGGGCATGTTCCAGTGCGAATTGTAATGTCACAGTCTCTTAATCTTCCCGAGGAAGCAAATTTATGGAATGTACATGATGCATACACAATAGTTGCAACACAAAGAGGTGCTCGGAGAGATCTCCAAAAGAAACTTGCTTTGAAGGGTGTTGAAGTAGTGGAGTTTGACATGCTGAATCCTAGAGATGTTATGTCATATTGTTATGATCGTGGTTACCTCTCCGTATTATGGGAGTGTGGTGGGACCCTAGCAGCTTCTGCTATATCTGCAAGTGTTATTCATAAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCT                                                                                    ]
[+] EMBL OSR19891A            [                                                                                                                                                                                                                                                                      GACTGCAGATGGAAAAATTGCAGCAAGCAGTGGGCATGCATCTTGGGTAAGTGGCAAATCATCTAGAGGCAGAGTATTTGAATTGCGTGGAAGAAGCGATGCTATAATTGTAGGTGGAAATACAGTACGCCTTGATGATCCTCGCTTAACTGCCAGGCATGTCAAGGGGCATGTTCCAGTGCGAATTGTAATGTCACAGTCTCTTAATCTTCCCGAGGAAGCAAATTTATGGAATGTACATGATGCATACACAATAGTTGCAACACAAAGAGGTGCTCGGAGAGATCTCCAAAAGAAACTTGCTTTGAAGGGTGTTGAAGTAGTNGAGTTTGACATGCTGAATCCTAGAGATGTTATGTCATATTGTTATGATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB661103             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCTATATCTGCAAGTGTTATTCATAAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAAGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATAT                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AK058742             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGGTGTATGCATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAGGGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGGAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCTTTCGTTGCCGAATTTTATTTGTTATCATCTTGTTGTACTGGTCTGGTCTGCAAATATAAAATCAGAGCAGAGATAGAGGATGCA]
[-] EMBL CB661104             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATAGGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCATCTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATATCCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTCACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGGCACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGCTGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCAT CAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAA                                                                                                           ]
[+] EMBL AU031831             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAAAGNGAATTTCAAGAATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCATCCAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGCGCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTCTTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGAATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAGCTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTTTGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATTTGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCTTTCGTTGCCGAATTTTATTTGTTAaaaaaaa                                                     ]


>consensus_9376#0 GCTACGGGGACAGCACTGCCGTTTCCACCCTAGTCCAGGCAGGAATTACAAGGGTTGTGG TTGGTCTTAGGCACCCCTTAAAGCACCTGAGAGGAAAGGCAATTCAATCACTACGAAATG AAGGCATTCAAGTTGACGTTGTGGGCGAGGATCTGCACAGTAAATTATTTAAGGAAGCTC TTAAGTCATGCCTCATTGTAAATGCCCCATTACTTTACCGAGCTGCCTTCCGTGTTCCGT TCTCTGTCCTGAAGTATGCTATGACTGCAGATGGAAAAATTGCAGCAAGCAGTGGGCATG CATCTTGGGTAAGTGGCAAATCATCTAGAGGCAGAGTATTTGAATTGCGTGGAAGAAGCG ATGCTATAATTGTAGGTGGAAATACAGTACGCCTTGATGATCCTCGCTTAACTGCCAGGC ATGTCAAGGGGCATGTTCCAGTGCGAATTGTAATGTCACAGTCTCTTAATCTTCCCGAGG AAGCAAATTTATGGAATGTACATGATGCATACACAATAGTTGCAACACAAAGAGGTGCTC GGAGAGATCTCCAAAAGAAACTTGCTTTGAAGGGTGTTGAAGTAGTGGAGTTTGACATGC TGAATCCTAGAGATGTTATGTCATATTGTTATGATCGTGGTTACCTCTCCGTATTATGGG AGTGTGGTGGGACCCTAGCAGCTTCTGCTATATCTGCAAGTGTTATTCATAAGGTGTATG CATTCTTGGCTCCAAAAATAATTGGGGGAGTGAATGCTCCAACACCAGTCGGTGAACTAG GGATGAATCAAATGACTCAAGCGATTGATTTAATTGATGTTTCTTACGAGCAGATTGATA GGGACATGCTCATGAGTGGATTCATCCAACCTATTCCTGATCTCTCACCTGTAATACCAT CTGTGGATGAAATGCCTTCAGTTGATCCAGAAGTATCTCCATATGAAACTAATATTATAT CCTTCTACAAGACTTGGGATACCTTTGGTGCCTTCTCTAACTTTTCTCCCCATCCAATTC ACATGCCCGATGAAAATGGAGACTATTTCACATGGCCAACAGTGGAGCACTATTACCAGG CACACAAGTTTATTGGTGTTGATGATCCTCAAGCAAGAGAGATTGTCCAAGAAATAAAGC TGGCTAAGAGTCCTGAAGAAGCTGCTAGAATAGGACGCACTCGGCAAAGAGAATTTCAAG AATTGGTACGACCAGATTGGGATTCCATCAAAATTGAAGTGATGTACAGAGCTACAAAGC GCAAGTTCTCAACTTATTCCCATCTGACTGACATGCTGTTGTCAACGGCTGGCTCTGTTC TTGTTGAGGCGTCGCCCCACGATTTATTTTGGGGCGGTGGGCGCGAGGGCGAAGGTATGA ATTACTTGGGTAGATTGCTGATGCAATTGCGATCAGAGATTCTAGGAACAATTCAAACAG CTGTTGAGGTAGGGGAGCCAGCTTGATTTGCTGGAGAGGTGATCATAACAGCAGACGTTT TGATCTGGGGTATTTATATGTATCATTATGGTGATTGCCTTCAAAATTTTGTGAAACATT TGTTTCTTTATCTCTCTAAATTCCTGTAGAAATTTGAGATGCTTTCGTTGCCGAATTTTA TTTGTTATCATCTTGTTGTACTGGTCTGGTCTGCAAATATAAAATCAGAGCAGAGATAGA GGATGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)