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Oryza sativa
cluster # 94 cluster # 94       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_94#0 length = 1453 sequences # 2  
consensusID : consensus_94#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1453
fasta sequence 
                              [AGAGAGGGGGGTGATCAAGTGGAGCATGGGATAACTACTGGGTGATGCATTAGTTCAGCTAAGTTGAGCGGGGCACGTTTGGAATGACTTGGCACATGCTTGCTTGCTAACTTATGTAATTCGTGGGTATCCTCATAGTTAAGCTATGTTTCACTTGAGGTATGCCTGCAGGTAAGGTAATTTCTGCTAGCTTTCTTGTAAAGATGGGAAGGTATGTAGCTAGGGCTGAGTTTGGGAACTCCAAGCCTCTTTTAGTAAATAGTAGAGAGATATTTATTTAATTCCTGAAAAATTGTGTGAAGTGAGAGTTACTAGTAGTGCCTGCAGGTGATATATGGCATAAGTAACCCAACAGGTGACAAGTAACCCCCGTTATTCTTGTAATGTATTATGCTCTTCCAATGCAATTTGTTGCTTCATCTTGGGCCCCCTGTGTACTCATCCTTGGTAGAAAAACAGAGCTTACAAACTTGGGAGTTCAAAATAGCCAAAAAAAAACTTAGCTAGCTAGGTGAAAGTAATGCTTAATTAATATTTTTTGTGTATTGTCCTCTTGCAAAGTTGATGTGCACAGGCAACTGCATCAGATCTATAACATACCCTACCATATTACAGTGAAACGGAGGAGATCTCAGGGAATGGCTGAAGTTGCATTGGACCAATCTTGGTCCGACAAGCCTCCAAGACAAACTTGGATTCAATTTCGTTCTGGCAGATCGGTATGAATGCCATCCTCGCAAGCATTGCGCAAGTTGATAGTGGTGATATTCTTGAAAAGAAAAAATCGATAGTGGTAATGAGAAAAGCACAGGAGGAGGACAAGAGGACAAGTGAGGCGGCAAGCTAAGAAGACGGTGGCTTGGCGTGCTTGGCGTAATCTAACTTGATTACCAGGCAGAGGCAGACAAACA---CTGGATTCTAGCTCGATGGAAGATGTTCCTGCCACATGTGCATGCATTCATGCTGGCTTAAGGAAATTATTCAGGGAGACATGATGCCCAAGCAAGAAGATCGAGGGCAGGGCTGCTCCAGATGAGATCATCAGCCGCAGCTACACCTCTACCTCTGCTTCTTGTTTTCCTCTACCTGTAGGCTGTAGCAACAACAAGTTTTCCTCTACCCCTCTGCTTCTTGTTTAGCAACAACAATAGTACTACTGCTCTGCTTCCTGTGTGTCATCTGCATCAATGATCTGTGATGATCTATTGGATGTATCTCAGTATCTGTGCTTATAGCTTTCCACCATCGAATCGAACATGCACGACTCATTTTTTGGTATTTCTCAGTCAAATTTCTTTAAATTTGATCAAATTTATAAAAGAAAAACATAGCAATATTTTCAGTACAAAACAAACATACTATGAGAATGTATTATATTTATTTGATGTTAGATTTAATAAAATTAATATGATATTGTAGATGTATTAGTCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK108701             [AGAGAGGGGGGTGATCAAGTGGAGCATGGGATAACTACTGGGTGATGCATTAGTTCAGCTAAGTTGAGCGGGGCACGTTTGGAATGACTTGGCACATGCTTGCTTGCTAACTTATGTAATTCGTGGGTATCCTCATAGTTAAGCTATGTTTCACTTGAGGTATGCCTGCAGGTAAGGTAATTTCTGCTAGCTTTCTTGTAAAGATGGGAAGGTATGTAGCTAGGGCTGAGTTTGGGAACTCCAAGCCTCTTTTAGTAAATAGTAGAGAGATATTTATTTAATTCCTGAAAAATTGTGTGAAGTGAGAGTTACTAGTAGTGCCTGCAGGTGATATATGGCATAAGTAACCCAACAGGTGACAAGTAACCCCCGTTATTCTTGTAATGTATTATGCTCTTCCAATGCAATTTGTTGCTTCATCTTGGGCCCCCTGTGTACTCATCCTTGGTAGAAAAACAGAGCTTACAAACTTGGGAGTTCAAAATAGCCAAAAAAAAACTTAGCTAGCTAGGTGAAAGTAATGCTTAATTAATATTTTTTGTGTATTGTCCTCTTGCAAAGTTGATGTGCACAGGCAACTGCATCAGATCTATAACATACCCTACCATATTACAGTGAAACGGAGGAGATCTCAGGGAATGGCTGAAGTTGCATTGGACCAATCTTGGTCCGACAAGCCTCCAAGACAAACTTGGATTCAATTTCGTTCTGGCAGATCGGTATGAATGCCATCCTCGCAAGCATTGCGCAAGTTGATAGTGGTGATATTCTTGAAAAGAAAAAATCGATAGTGGTAATGAGAAAAGCACAGGAGGAGGACAAGAGGACAAGTGAGGCGGCAAGCTAAGAAGACGGTGGCTTGGCGTGCTTGGCGTAATCTAACTTGATTACCAGGCAGAGGCAGACAAACA   CTGGATTCTAGCTCGATGGAAGATGTTCCTGCCACATGTGCATGCATTCATGCTGGCTTAAGGAAATTATTCAGGGAGACATGATGCCCAAGCAAGAAGATCGAGGGCAGGGCTGCTCCAGATGAGATCATCAGCCGCAGCTACACCTCTACCTCTGCTTCTTGTTTTCCTCTACCTGTAGGCTGTAGCAACAACAAGTTTTCCTCTACCCCTCTGCTTCTTGTTTAGCAACAACAATAGTACTACTGCTCTGCTTCCTGTGTGTCATCTGCATCAATGATCTGTGATGATCTATTGGATGTATCTCAGTATCTGTGCTTATAGCTTTCCACCATCGAATCGAACATGCACG                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CA761185             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   nAAGGGGACAAGTGAGGCGGCAAGCTAAGAACACGGTGGCTTGGCGTGCTTGGCGTAATCTAACTTGATTACCAGGCAGAGGCAGACAAACACAGCTGGATTCTAGCTCGATGGAAGATGTTCCTGCCACATGTGCATGCATTCATGCTGGCTTAAGGAAATTATTCAGGGAGACATGATGCCCAAGCAAGAAGATCGAGGGCAGGGCTGCTCCAGATGAGATCATCAGCCGCAGCTACACCTCTACCTCTGCTTCTTGTTTTCCTCTACCTGTAGGCTGTAG   CAACAAGTTTTCCTCTACCCCTCTGCTTCTTGTTTAGCAACAACAATAGTACTACTGCTCTGCTTCCTGTGTGTCATCTGCATCAATGATCTGTGATGATCTATTGGATGTATCTCAGTATCTGTGCTTATAGCTTTCCACCATCGAATCGAACATGCACGACTCATTTTTTGGTATTTCTCAGTCAAATTTCTTTAAATTTGATCAAATTTATAAAAGAAAAACATAGCAATATTTTCAGTACAAAACAAACATACTATGAGAATGTATTATATTTATTTGATGTTAGATTTAATAAAATTAATATGATATTGTAGATGTATTAGTCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_94#0
AGAGAGGGGGGTGATCAAGTGGAGCATGGGATAACTACTGGGTGATGCATTAGTTCAGCT
AAGTTGAGCGGGGCACGTTTGGAATGACTTGGCACATGCTTGCTTGCTAACTTATGTAAT
TCGTGGGTATCCTCATAGTTAAGCTATGTTTCACTTGAGGTATGCCTGCAGGTAAGGTAA
TTTCTGCTAGCTTTCTTGTAAAGATGGGAAGGTATGTAGCTAGGGCTGAGTTTGGGAACT
CCAAGCCTCTTTTAGTAAATAGTAGAGAGATATTTATTTAATTCCTGAAAAATTGTGTGA
AGTGAGAGTTACTAGTAGTGCCTGCAGGTGATATATGGCATAAGTAACCCAACAGGTGAC
AAGTAACCCCCGTTATTCTTGTAATGTATTATGCTCTTCCAATGCAATTTGTTGCTTCAT
CTTGGGCCCCCTGTGTACTCATCCTTGGTAGAAAAACAGAGCTTACAAACTTGGGAGTTC
AAAATAGCCAAAAAAAAACTTAGCTAGCTAGGTGAAAGTAATGCTTAATTAATATTTTTT
GTGTATTGTCCTCTTGCAAAGTTGATGTGCACAGGCAACTGCATCAGATCTATAACATAC
CCTACCATATTACAGTGAAACGGAGGAGATCTCAGGGAATGGCTGAAGTTGCATTGGACC
AATCTTGGTCCGACAAGCCTCCAAGACAAACTTGGATTCAATTTCGTTCTGGCAGATCGG
TATGAATGCCATCCTCGCAAGCATTGCGCAAGTTGATAGTGGTGATATTCTTGAAAAGAA
AAAATCGATAGTGGTAATGAGAAAAGCACAGGAGGAGGACAAGAGGACAAGTGAGGCGGC
AAGCTAAGAAGACGGTGGCTTGGCGTGCTTGGCGTAATCTAACTTGATTACCAGGCAGAG
GCAGACAAACACTGGATTCTAGCTCGATGGAAGATGTTCCTGCCACATGTGCATGCATTC
ATGCTGGCTTAAGGAAATTATTCAGGGAGACATGATGCCCAAGCAAGAAGATCGAGGGCA
GGGCTGCTCCAGATGAGATCATCAGCCGCAGCTACACCTCTACCTCTGCTTCTTGTTTTC
CTCTACCTGTAGGCTGTAGCAACAACAAGTTTTCCTCTACCCCTCTGCTTCTTGTTTAGC
AACAACAATAGTACTACTGCTCTGCTTCCTGTGTGTCATCTGCATCAATGATCTGTGATG
ATCTATTGGATGTATCTCAGTATCTGTGCTTATAGCTTTCCACCATCGAATCGAACATGC
ACGACTCATTTTTTGGTATTTCTCAGTCAAATTTCTTTAAATTTGATCAAATTTATAAAA
GAAAAACATAGCAATATTTTCAGTACAAAACAAACATACTATGAGAATGTATTATATTTA
TTTGATGTTAGATTTAATAAAATTAATATGATATTGTAGATGTATTAGTCCTAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)