cluster # 947

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 947 cluster # 947 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_947#0 length = 2944 sequences # 2
consensusID : consensus_947#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2944
fasta sequence
                              [GCTCTCATCTCCTGCTCTGGGACACACCATTGCAGGCCAGAGCAATGAAGATTAGGTTTGTCCTTCTAGATCCGGTCTCTTCCCCCTCGCTCCTGTCACTGGATCGGGAGTTGGTCGTCGCGGGGCTGGGGTTGAGAGGAGGGGTGGGGGAGGGGGCGGGCTGGTTGTTGTAGAGATACGGGGGGTGTCACCAATAGCGCCAAGAAGGTTGAGGGGATGGAGGAGATGTGGCGGTAGCGGCCGGCGGTGATGAAGAGGTGGCGGATTTCCTCCCTGCACGCGTATCTCTGTCCTCTGAGTACAAATTTGTGGTGGCTTCCTTTGCCTTCTCCTACAGCGACCACCACCCTCCTCCTCATTTCTCCCACCTCGAGTGCGTCGCTGCTGTCACCCATCCAGAGCGATGATCCAACCCCGAGGCCTAGACTTTTGTATGGATACAATGTATTATGTCGAACCACAACCTTTGTACAGCGCTGAGGTAGGCCTGCTGTGCGGTGCTTCGCGTTGTGAATCGAGGTGTAGCTTACGCGATGGTGGCGGTCGTGAGATGACATTTTATTTTCCTCGGTGGATCTGAATTTTTGGGAGTGGATTGGAAGTTGATTATATGTTTTAACTGCTGGAAATAGGTAAGCTCTACGGACTCTTAAGCTACTATAAGTTGTTTAGATAACCATAACAAATACATGTTTCAGTACAATATATATAAACAAAATATGGTAGTCAATTATCTATTTCTGATACATTGAAGCATGTCTCTGACAATTTGGGGCATACTGCTCTCACATTCATTCTCTTGGTACGTCAACAGCTCTACTAAAAAATGCTTCCTTAGCTCGTATTCATCTTGTACATGCATTTATTTATGCAAGTGATCAAGGTTACCACTGTATGTGTAAAAAAATAATAGCATTTAAATGATAAATTCTAGTGTCATGATACTTTGCCTTTGTAATTGGTAACTGCAATTCTTCATCATTCCATTTGCACATGAAGAGGGACACAAGATAACCAGATAGTTCGCTAAGAAGATTGAATTGTTAATTAATTTTGTGTTAGGAAATAAAATAACTGGTGCTGCGCATACCGCTCCCTATCTCTTTGTCTTTTTCATACATTGGGATCCAAGAGTGGGGATGGTGATGCAGACAGTGTGGCACCAACATTAAACATGTGGGATGGAGCCGGTAATCATAAAAAGAATTATGTACTCCCTCTGGGTTGATAATACTTGTCGTTTGGACAAGGGCACGGTCTCAAAAAAACAAATTTGACCATTATTTTTTATTATAATATGTATAAAAGTGTTAACAAATATATGATTTTATTAAAGTACTTTTTAAGACTAATCTATACATGTAGTCATTATATTTAAAAGACAAATATTTTAAAAATGATTCATAATCAAAGATTCTAAAGTTTGACTTCACCCTTGTCTAAAACGACAAGTATTATCAGCCAGGAGGGAGTAGATGATTTCGTACTTCCATCTCAATATTATAAACATAGTCCATCTTAAATTCCATCTTTTTTTTCATGATTGAGTTAGTCTTTAGCACTGAATCATTAACATTGTTTTGAGCACTGAAAATAACTTATTTTGCTGCAGCCTAGTTGTTAAAGACATGTGCACCACTGATGATTTCCGTACTTCCATCTCAATATTATAAACATAAAGTCCATCTTCTTAAATTCCATCTTTTTTTTCACGATTGAGTCAGTCTTTGTTGGGAGTTTATGCAGGGTGCTTAGAATATTTGGTACTATCCTTTAGAATCATTACACAAATGCAACAGACTATTTTCTGTCTTTGCTGATGATTGCTAATGCAGCTCGAACTTATGGGAGTAAAAAAGCCCTGAGAATACTTTGCGTATGCATCTTGTTTGATCGGGCATTTTTCTTTGATGCAACTTGAGTTTATGTTTGTTGATGACTGTCGTTGATGGAGCTGCTCCTGCCAAGGTGGCCTTTTTGGCGATGGAGTAGAACTGTCTGAATTTTTTTATCACACCACAAGAACGGATTTTGTTTGTGGTACCATTTTTTGTATATATAAAACATATTTTGGTTGTATATATATAGAATAGGATGTATCTACCGTTCTTGTGGTGTTGTTCATGTGTTTGGATGTAATATGGGGAGTAAAATTGAGCTACGTGCTAGGGGATCTGTTGGGGTGGGCCTGAATGTACCATGGGCCTGAACAGATCTACGGACGTGAGAGGGAATCGGAAATTGTGGACCGATCTGGGAGGGAGCGATCTGGAAGGAATTGGACAGAAATAATCGCGTGTGCACTCGGGAGGAAATCGGACTAAAAAATCGCAATACAGGGTGTGAATTGGATTGAAAAATCATGCATTACTGGGACGACGTACGAAAAATCCCTGACAAAAACATCTTAAACTTTTATAATAGGTAAAGACTAGAAAAATACCCATGCGTTGCTACGGGAGGAAAAGACCGTGGAAGCGGGCGTCGTTCTATGGCAGAGTCGGTAATGTCAACGAAGGAGTAATCGTGGCGGAGCTGGTGGAGGTAGTGTCCAGACACCTTGGTGGTTGATGGCACATCGCCGACGAAGCTTAGTGCGGCCGACTACAGCAAGACGGCGTCAGGAGCTCTTGCCGGCATGGCAAGGAAAAGCTTGCTGGCGGCAGCAAGATGACGACGCACGGCTTGGGAGGGACAGAGCGGCATGGAATGAAACAATTCACGTCCTTGGTGGCATGTTTTGAAAGTGTTGCGAATTGAGTGGCACATCCTGAAGGTGGTGCAAATCGAATGGCATCTTCTAAAAATTCTCCTAAACCATTTGTAATATGTGATAATACAAATGCCGGCATGTTTGCAATGGAAAAAGATACAATTGCGTATGTAAATCGGGACATGTTTATATGTGTTTTTAAGTGAGACCGTCATAAATTTTAATATCGAT]

[+] EMBL AK100583             [GCTCTCATCTCCTGCTCTGGGACACACCATTGCAGGCCAGAGCAATGAAGATTAGGTTTGTCCTTCTAGATCCGGTCTCTTCCCCCTCGCTCCTGTCACTGGATCGGGAGTTGGTCGTCGCGGGGCTGGGGTTGAGAGGAGGGGTGGGGGAGGGGGCGGGCTGGTTGTTGTAGAGATACGGGGGGTGTCACCAATAGCGCCAAGAAGGTTGAGGGGATGGAGGAGATGTGGCGGTAGCGGCCGGCGGTGATGAAGAGGTGGCGGATTTCCTCCCTGCACGCGTATCTCTGTCCTCTGAGTACAAATTTGTGGTGGCTTCCTTTGCCTTCTCCTACAGCGACCACCACCCTCCTCCTCATTTCTCCCACCTCGAGTGCGTCGCTGCTGTCACCCATCCAGAGCGATGATCCAACCCCGAGGCCTAGACTTTTGTATGGATACAATGTATTATGTCGAACCACAACCTTTGTACAGCGCTGAGGTAGGCCTGCTGTGCGGTGCTTCGCGTTGTGAATCGAGGTGTAGCTTACGCGATGGTGGCGGTCGTGAGATGACATTTTATTTTCCTCGGTGGATCTGAATTTTTGGGAGTGGATTGGAAGTTGATTATATGTTTTAACTGCTGGAAATAGGTAAGCTCTACGGACTCTTAAGCTACTATAAGTTGTTTAGATAACCATAACAAATACATGTTTCAGTACAATATATATAAACAAAATATGGTAGTCAATTATCTATTTCTGATACATTGAAGCATGTCTCTGACAATTTGGGGCATACTGCTCTCACATTCATTCTCTTGGTACGTCAACAGCTCTACTAAAAAATGCTTCCTTAGCTCGTATTCATCTTGTACATGCATTTATTTATGCAAGTGATCAAGGTTACCACTGTATGTGTAAAAAAATAATAGCATTTAAATGATAAATTCTAGTGTCATGATACTTTGCCTTTGTAATTGGTAACTGCAATTCTTCATCATTCCATTTGCACATGAAGAGGGACACAAGATAACCAGATAGTTCGCTAAGAAGATTGAATTGTTAATTAATTTTGTGTTAGGAAATAAAATAACTGGTGCTGCGCATACCGCTCCCTATCTCTTTGTCTTTTTCATACATTGGGATCCAAGAGTGGGGATGGTGATGCAGACAGTGTGGCACCAACATTAAACATGTGGGATGGAGCCGGTAATCATAAAAAGAATTATGTACTCCCTCTGGGTTGATAATACTTGTCGTTTGGACAAGGGCACGGTCTCAAAAAAACAAATTTGACCATTATTTTTTATTATAATATGTATAAAAGTGTTAACAAATATATGATTTTATTAAAGTACTTTTTAAGACTAATCTATACATGTAGTCATTATATTTAAAAGACAAATATTTTAAAAATGATTCATAATCAAAGATTCTAAAGTTTGACTTCACCCTTGTCTAAAACGACAAGTATTATCAGCCAGGAGGGAGTAGATGATTTCGTACTTCCATCTCAATATTATAAACATAGTCCATCTTAAATTCCATCTTTTTTTTCATGATTGAGTTAGTCTTTAGCACTGAATCATTAACATTGTTTTGAGCACTGAAAATAACTTATTTTGCTGCAGCCTAGTTGTTAAAGACATGTGCACCACTGATGATTTCCGTACTTCCATCTCAATATTATAAACATAAAGTCCATCTTCTTAAATTCCATCTTTTTTTTCACGATTGAGTCAGTCTTTGTTGGGAGTTTATGCAGGGTGCTTAGAATATTTGGTACTATCCTTTAGAATCATTACACAAATGCAACAGACTATTTTCTGTCTTTGCTGATGATTGCTAATGCAGCTCGAACTTATGGGAGTAAAAAAGCCCTGAGAATACTTTGCGTATGCATCTTGTTTGATCGGGCATTTTTCTTTGATGCAACTTGAGTTTATGTTTGTTGATGACTGTCGTTGATGGAGCTGCTCCTGCCAAGGTGGCCTTTTTGGCGATGGAGTAGAACTGTCTGAATTTTTTTATCACACCACAAGAACGGATTTTGTTTGTGGTACCATTTTTTGTATATATAAAACATATTTTGGTTGTATATATATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AK061458             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTGGTACTATCCTTTAGAATCATTACACAAATGCAACAGACTATTTTCTGTCTTTGCTGATGATTGCTAATGCAGCTCGAACTTATGGGAGTAAAAAAGCCCTGAGAATACTTTGCGTATGCATCTTGTTTGATCGGGCATTTTTCTTTGATGCAACTTGAGTTTATGTTTGTTGATGACTGTCGTTGATGGAGCTGCTCCTGCCAAGGTGGCCTTTTTGGCGATGGAGTAGAACTGTCTGAATTTTTTTATCACACCACAAGAACGGATTTTGTTTGTGGTACCATTTTTTGTATATATAAAACATATTTTGGTTGTATATATATAGAATAGGATGTATCTACCGTTCTTGTGGTGTTGTTCATGTGTTTGGATGTAATATGGGGAGTAAAATTGAGCTACGTGCTAGGGGATCTGTTGGGGTGGGCCTGAATGTACCATGGGCCTGAACAGATCTACGGACGTGAGAGGGAATCGGAAATTGTGGACCGATCTGGGAGGGAGCGATCTGGAAGGAATTGGACAGAAATAATCGCGTGTGCACTCGGGAGGAAATCGGACTAAAAAATCGCAATACAGGGTGTGAATTGGATTGAAAAATCATGCATTACTGGGACGACGTACGAAAAATCCCTGACAAAAACATCTTAAACTTTTATAATAGGTAAAGACTAGAAAAATACCCATGCGTTGCTACGGGAGGAAAAGACCGTGGAAGCGGGCGTCGTTCTATGGCAGAGTCGGTAATGTCAACGAAGGAGTAATCGTGGCGGAGCTGGTGGAGGTAGTGTCCAGACACCTTGGTGGTTGATGGCACATCGCCGACGAAGCTTAGTGCGGCCGACTACAGCAAGACGGCGTCAGGAGCTCTTGCCGGCATGGCAAGGAAAAGCTTGCTGGCGGCAGCAAGATGACGACGCACGGCTTGGGAGGGACAGAGCGGCATGGAATGAAACAATTCACGTCCTTGGTGGCATGTTTTGAAAGTGTTGCGAATTGAGTGGCACATCCTGAAGGTGGTGCAAATCGAATGGCATCTTCTAAAAATTCTCCTAAACCATTTGTAATATGTGATAATACAAATGCCGGCATGTTTGCAATGGAAAAAGATACAATTGCGTATGTAAATCGGGACATGTTTATATGTGTTTTTAAGTGAGACCGTCATAAATTTTAATATCGAT]




>consensus_947#0
GCTCTCATCTCCTGCTCTGGGACACACCATTGCAGGCCAGAGCAATGAAGATTAGGTTTG
TCCTTCTAGATCCGGTCTCTTCCCCCTCGCTCCTGTCACTGGATCGGGAGTTGGTCGTCG
CGGGGCTGGGGTTGAGAGGAGGGGTGGGGGAGGGGGCGGGCTGGTTGTTGTAGAGATACG
GGGGGTGTCACCAATAGCGCCAAGAAGGTTGAGGGGATGGAGGAGATGTGGCGGTAGCGG
CCGGCGGTGATGAAGAGGTGGCGGATTTCCTCCCTGCACGCGTATCTCTGTCCTCTGAGT
ACAAATTTGTGGTGGCTTCCTTTGCCTTCTCCTACAGCGACCACCACCCTCCTCCTCATT
TCTCCCACCTCGAGTGCGTCGCTGCTGTCACCCATCCAGAGCGATGATCCAACCCCGAGG
CCTAGACTTTTGTATGGATACAATGTATTATGTCGAACCACAACCTTTGTACAGCGCTGA
GGTAGGCCTGCTGTGCGGTGCTTCGCGTTGTGAATCGAGGTGTAGCTTACGCGATGGTGG
CGGTCGTGAGATGACATTTTATTTTCCTCGGTGGATCTGAATTTTTGGGAGTGGATTGGA
AGTTGATTATATGTTTTAACTGCTGGAAATAGGTAAGCTCTACGGACTCTTAAGCTACTA
TAAGTTGTTTAGATAACCATAACAAATACATGTTTCAGTACAATATATATAAACAAAATA
TGGTAGTCAATTATCTATTTCTGATACATTGAAGCATGTCTCTGACAATTTGGGGCATAC
TGCTCTCACATTCATTCTCTTGGTACGTCAACAGCTCTACTAAAAAATGCTTCCTTAGCT
CGTATTCATCTTGTACATGCATTTATTTATGCAAGTGATCAAGGTTACCACTGTATGTGT
AAAAAAATAATAGCATTTAAATGATAAATTCTAGTGTCATGATACTTTGCCTTTGTAATT
GGTAACTGCAATTCTTCATCATTCCATTTGCACATGAAGAGGGACACAAGATAACCAGAT
AGTTCGCTAAGAAGATTGAATTGTTAATTAATTTTGTGTTAGGAAATAAAATAACTGGTG
CTGCGCATACCGCTCCCTATCTCTTTGTCTTTTTCATACATTGGGATCCAAGAGTGGGGA
TGGTGATGCAGACAGTGTGGCACCAACATTAAACATGTGGGATGGAGCCGGTAATCATAA
AAAGAATTATGTACTCCCTCTGGGTTGATAATACTTGTCGTTTGGACAAGGGCACGGTCT
CAAAAAAACAAATTTGACCATTATTTTTTATTATAATATGTATAAAAGTGTTAACAAATA
TATGATTTTATTAAAGTACTTTTTAAGACTAATCTATACATGTAGTCATTATATTTAAAA
GACAAATATTTTAAAAATGATTCATAATCAAAGATTCTAAAGTTTGACTTCACCCTTGTC
TAAAACGACAAGTATTATCAGCCAGGAGGGAGTAGATGATTTCGTACTTCCATCTCAATA
TTATAAACATAGTCCATCTTAAATTCCATCTTTTTTTTCATGATTGAGTTAGTCTTTAGC
ACTGAATCATTAACATTGTTTTGAGCACTGAAAATAACTTATTTTGCTGCAGCCTAGTTG
TTAAAGACATGTGCACCACTGATGATTTCCGTACTTCCATCTCAATATTATAAACATAAA
GTCCATCTTCTTAAATTCCATCTTTTTTTTCACGATTGAGTCAGTCTTTGTTGGGAGTTT
ATGCAGGGTGCTTAGAATATTTGGTACTATCCTTTAGAATCATTACACAAATGCAACAGA
CTATTTTCTGTCTTTGCTGATGATTGCTAATGCAGCTCGAACTTATGGGAGTAAAAAAGC
CCTGAGAATACTTTGCGTATGCATCTTGTTTGATCGGGCATTTTTCTTTGATGCAACTTG
AGTTTATGTTTGTTGATGACTGTCGTTGATGGAGCTGCTCCTGCCAAGGTGGCCTTTTTG
GCGATGGAGTAGAACTGTCTGAATTTTTTTATCACACCACAAGAACGGATTTTGTTTGTG
GTACCATTTTTTGTATATATAAAACATATTTTGGTTGTATATATATAGAATAGGATGTAT
CTACCGTTCTTGTGGTGTTGTTCATGTGTTTGGATGTAATATGGGGAGTAAAATTGAGCT
ACGTGCTAGGGGATCTGTTGGGGTGGGCCTGAATGTACCATGGGCCTGAACAGATCTACG
GACGTGAGAGGGAATCGGAAATTGTGGACCGATCTGGGAGGGAGCGATCTGGAAGGAATT
GGACAGAAATAATCGCGTGTGCACTCGGGAGGAAATCGGACTAAAAAATCGCAATACAGG
GTGTGAATTGGATTGAAAAATCATGCATTACTGGGACGACGTACGAAAAATCCCTGACAA
AAACATCTTAAACTTTTATAATAGGTAAAGACTAGAAAAATACCCATGCGTTGCTACGGG
AGGAAAAGACCGTGGAAGCGGGCGTCGTTCTATGGCAGAGTCGGTAATGTCAACGAAGGA
GTAATCGTGGCGGAGCTGGTGGAGGTAGTGTCCAGACACCTTGGTGGTTGATGGCACATC
GCCGACGAAGCTTAGTGCGGCCGACTACAGCAAGACGGCGTCAGGAGCTCTTGCCGGCAT
GGCAAGGAAAAGCTTGCTGGCGGCAGCAAGATGACGACGCACGGCTTGGGAGGGACAGAG
CGGCATGGAATGAAACAATTCACGTCCTTGGTGGCATGTTTTGAAAGTGTTGCGAATTGA
GTGGCACATCCTGAAGGTGGTGCAAATCGAATGGCATCTTCTAAAAATTCTCCTAAACCA
TTTGTAATATGTGATAATACAAATGCCGGCATGTTTGCAATGGAAAAAGATACAATTGCG
TATGTAAATCGGGACATGTTTATATGTGTTTTTAAGTGAGACCGTCATAAATTTTAATAT
CGAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case