cluster # 9540

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Oryza sativa
cluster # 9540 cluster # 9540 Sequences # 6 consensus # 1
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consensus_9540#0 length = 2680 sequences # 6
consensusID : consensus_9540#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
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Sequences nbr = 6
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fasta sequence
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[+] EMBL OSC107341            [                                         AGAAGAAGAACACGTCGGGTTCTCTGTTCTTTGGGGGACTCCTACAGATGTAATTGGTTCTGTAAGTTGGGGACCTAATCAGGGTTAAGAAATGTCTGACCAGGAGAGAGATGATATTCCTATGCTACTAAGAAATGTTGAGCTACCAACGTTTCCTCCTAGAAGTACATCAATGTGCATACCAGTTAGGGATGATGAATACGAAGAAGACACATTTGTACCCCATACTGGTCCTCTGTTTGTTCAGCCACCAACACAAACTGCAGCAGCGGGCATTCCATTTACAAATACACCAGATATGCCTNCTCGACCTNCACAAGGAAAACAAGTCAACAAGNCACATGCGATAATGCCAGAGGAATTTGNGGGAAc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CA998743             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAGAAGGAGGGTTAGACGCGCAGAAATGTTTTCCCGGGCAGCTACCCAAGGGGTGAATGAAGAGGAGCTTTTAAGTAATTTACCAGAAGATATTCAAAGGGACATACGCCGTCATTTCTTTAGATTTCTTAACAAGGTCCGATTATTCACATTGATGGATTGGCCTATCTTGGACGCTATATGTGACAAACTAAGACAAAACTTGTATATTAGCGGAAGTGACATCCTTTATCAAGGTGGTCCAGTTGAAAAAATGGTCTTCATAG TGAGGGG AAAGCTAG AAAGCAT CAGTGCAGATGGAAGCAAAGCT CCGTTACATGAAGGTGATGTATGTGGAGAGGAGCTCCTGACATGGTACTTGGAACACTCTT CAGCTAACAGAGATGGTGGGAGAATGAGATT CCATGGTATGCGTTTGGTTGCTATTCGTA CTGTAAG ATGTTTAACAAATGTTG AAGCTT TTGTACTAAGGGCAAGCGATCTCGAAGAAGTAACTTCACAATTTTCACGATTCTTGCGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AU092108             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCATAGTTGAGGGGAAAANCTAGAAAAGCATCCAGTGCAGATGGAAGCAAAGCTCCCGTTACATGAAGGTGATGTATGTGGAGAGGAGCTCCTGACATGGTACTTGGAACACTCTT CAGCTAACAGAGATGGTGGGAGAATGAGATT CCATGGTATGCGTTTGGTTGCTATTCGTA CTGTAAG ATGTTTAACAAATGTTG AAGCTT TTGTACTAAGGGCAAGCGATCTCGAAGAAGTAACTTCACAATTTTCACGATTCTTGCGCAATCCACGAGTGCAGGGTGCA ATCAGGTATGAGTCACCCTA CTGGAGAACCA TTGCTGCAACGCGTATTCAAGTCGCATGGAGGTATCGGAATAGGCGATTGAAGCGAGCTGGGGATGTCGAAGTTGAACGATCAACCTTATAATTCTGCATTGGAACGTGGCGCGCGTGAATGTGATGCTCGNCAGCATGGGCGGGTATGATTTGGATCGA CAAGGTGCTAACGTTTGGTCACATTTTTATGCGCTAGAGCCCTGACAT CCTTGTGGCTATCTTACTTGGCAGAATGTATTCTATGTGAGCTACATAATTTTTTTTTTGCCCCACAATTAGATCTGGTAGCTAGAGTACCAAACTGGAGGAACTACATCTCATGTATATAATGACGGCTAGTTTTTCACTAATAACTGTTTCATTCTTGGCCTGAAAAAA]
[-] EMBL CB639177             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GATGGAAGCAAAGCT CCGTTACATGAAGGTGATGTATGTGGAGAGGAGCTCCTGACATGGTACTTGGAACACTCTT CAGCTAACAGAGATGGTGGGAGAATGAGATT CCATGGTATGCGTTTGGTTGCTATTCGTA CTGTAAG ATGTTTAACAAATGTTG AAGCTT TTGTACTAAGGGCAAGCGATCTCGAAGAAGTAACTTCACAATTTTCACGATTCTTGCGCAATCCACGAGTGCAGGGTGCA ATCAGGTATGAGTCACCCTA CTGGAGAACCA TTGCTGCAACGCGTATTCAAGTCGCATGGAGGTATCGGAATAGGCGATTGAAGCGAGCT GGGATGTCGAAGTTGAACGATCAATCTTATAATTCTGCATTGGAACGTGGCGCGCGTGAATGTGATGCTCGTCAGCATGGGCGGGTATGATTTGGATCGA CAAGGTGCTAACGTTTGGTCACATTTTTATGCGGTAGAGCCCTGACAT CCTTGTGGCTATTTTACTTGGCAGAATGTATTCTATGTGAGCTACATAATTTTTTTTTTGCCCCCCAATTAGATTTGGTAGCTAGAGTACCAAACTGGAGGAACTACATTTCATGTATATAATGACGGCTAGTTTTTCACTAATAACT TTTCAT                ]
[+] EMBL BI806585             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGACCACTCTTGCA CTACCAAAGAT GTGGGAGAATGAGATTCCCATGGTATGCCTTT GTTGCTATTCGTACCTGTAAGAATGTTTAACCAATGTTGAAAGCTTGTTGTACTAA GGCAAGCGATCTCGAAGAAGTAACTTCAC ATTTTCACGATTCTTGCGCAATCCACGAGTCCAGGGT CANATCAGGTATGAGTCACCCTATCTGGAGAACCACTTGCTGCAACGCGTATTCAAGTCGCATGGAGGTATCGGAATAGGCGATTGAAGCGAGCT GGGATGTCGAAGTTGAACGATCAATCTTATAATTCTGCATTGGAACGTGGCGCGCGTGAATGTGATGCTCGTCAGCATGGGCGGGTATGATTTGGATCGACCAAGGTGCTAACGTTTGGTCACATTTTTATGCGCTAGAGCCCTGACATCCCCCCTGGCTATCTTACTTGGCAGAATGTATTCTATGTGAGCTACATAATTTTTTTTTTGCCCCACAATTAGATCTGGTAGCTAGAGTACC AACTGGAGGAACTACATCTCATGTATATAATGACGGCTAGTTTTTCACTAATAACTGTTTCCTTCTTGCCCTGAAAAA ]




>consensus_9540#0
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GAGCTACGAACGTTTCCTCCTAGAAGTACATCAATGTGCATACCAGTTAGGGATGATGAA
TACGAAGAAGACACATTTGTACCCCATACTGGTCCTCTGTTTGTTCAGCCACCAACACAA
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AATAGGCGATTGAAGCGAGCTGGGATGTCGAAGTTGAACGATCAATCTTATAATTCTGCA
TTGGAACGTGGCGCGCGTGAATGTGATGCTCGTCAGCATGGGCGGGTATGATTTGGATCG
ACAAGGTGCTAACGTTTGGTCACATTTTTATGCGCTAGAGCCCTGACATCCTTGTGGCTA
TCTTACTTGGCAGAATGTATTCTATGTGAGCTACATAATTTTTTTTTTGCCCCACAATTA
GATCTGGTAGCTAGAGTACCAAACTGGAGGAACTACATCTCATGTATATAATGACGGCTA
GTTTTTCACTAATAACTGTTTCATTCTTGGCCTGAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case