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Oryza sativa
cluster # 9612 cluster # 9612       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9612#0 length = 1267 sequences # 6  
consensusID : consensus_9612#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1267
fasta sequence 
                              [ACGAGGCCGAATCGAAACCCCACCATCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGACACCTGACGCCATGGACCCCGGCGGCCTGCGCCCAGCGCCCCAGTCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGCTGCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGTCCGCGGCGGACGAGCCCCGCGACGCGCGCGTGGTGCGGGAGCTCCTGCGCTCCATGGGGCTGAGCGAGGGGGAGTACGAGCCGCGGGTGGTGCACCAGTTCCTCGACCTGGCCTACCGCTACGTCGGCGACGTGCTCGGGGACGCCCAGGTCTACGCCGACCACGCGGGGAAGCCCCAGCTTGACGCCGACGACGTCCGCCTCGCCATCCAGTCCAAGGTCAACTTCTCCTTCTCCCAGCCGCCGCCCCGCGAGGTTCTCCTTGAGGTGGCACGGAACCGGAACAAAATCCCGCTACCCAAGTCGATTGCTCCACCTGGCTCAATTCCTCTGCCACCAGAGCAGGACACGCTGTTGAGCCAAAATTACCAGCTCCTAGCTCCGTTGAAGCCACCGCCTCAGTTTGAAGAAACAGAAGATGACAATGCAGGAGCCAACCCTACTCCAACCTCAAACCCGAGCAACCCTAGTCCAAACAATCTGCAGGAGCAGCAGCAGCTTCCGCAGCATGGTCAGAGGGTTTCTTTCCAGCTCAACGCCGTTGCTGCCGCCAAACGCCGAGGGACCATGGATCAGTTGAACATGGGCTAACTGTTGGTCGTTGGCTGGTTTCTCGCTTCCATCTTGCAAATCTGGTACATTGTCGTGTTGCATTGCCCAACAA-ATTCTTGTTGGGATGGTGCTGTTACTCTTAGTTTGTTTGTTGTGAGATGAGAAGTTAATAAGCTTTAGCTTGTGCAGATAAGAACAATGCTTTAAGAAAGGGAAATGATTTTGCAAGAAGTGTGCATGCTGTTCTTCTTCGCTGGTTAATTCCTTACCGTCAGCAGAGTTTAGTTGTTGAAGTTCTTTTTACAGCTTCTCAAGATTAGAGATGTGGTTTCTTCGTCTTGCACATCTATTGGTTTTTTTTTGGGAGTAGCTATATAAAGACGCTATATTTTTTTCACCAAAAGATAGTCAGCATGTATTTACATTATAAGTCTCTAAATTACATATATAATTAGTATGTAATATTAGTATGTAATTATAGTGTAAGTATGATGTAATTATATTCTAACTAACCTGTATACTAATTACTGATACTCAAATTTGTTTATATGAATTCCTAAAAAAAAA]

[+] EMBL BP185041             [ACGAGGCCGAATCGAAACCCCACCATCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGACACCTGACGCCATGGACCCCGGCGGCCTGCGCCCAGCGCCCCAGTCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGCTGCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGTCCGCGGCGGACGAGCCCCGCGACGCGCGCGTGGTGCGGGAGCTCCTGCGCTCCATGGGGCTGAGCGAGGGGGAGTACGAGCCGCGGGTGGTGCACCAGTTCCTCGACCTGGCCTACCGCTACGTCGGCGACGTGCTCGGGGACGCCCAGGTCTACGCCGACCACGCGGGGAAGCCCCAGCTTGACGCCGACGACGTCCGCCTCGCCATCCAGTCCAAGGTCAACTTCTCCTTCTCCCAGCCGCCGCCCCGCGAGGTTCTCCTTGAGGTGGCACGGAACCGGAACAAAATCCCGCTACCCAAGTCGATTGCTCCACCTGGCTCAATTCCTCTGCCACCAGAGCAGGACACGCTGTTGAGCCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CA765503             [                                                                                                                                                                                                                        GGGGGAGTACGGGCCGCGGGTGGTGCACCAGTTCCTCGACCTGGCCTACCGCTACGTCGGCGACGTGCTCGGGGACGCCCAGGTCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CF314142             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCCACCTGGCTCAATTCCTCTGCCACCAGAGCAGGACACGCTGTTGAGCCAAAATTACCAGCTCCTAGCTCCGTTGAAGCCACCGCCTCAGTTTGAAGAAACAGAAGATGACAATGCAGGAGCCAACCCTACTCCAACCTCAAACCCGAGCAACCCTAGTCCAAACAATCTGCAGGAGCAGCAGCAGCTTCCGCAGCATGGTCAGAGGGTTTCTTTCCAGCTCAACGCCGTTGCTGCCGCCAAACGCCGAGGGACCATGGATCAGTTGAACATGGGCTAACTGTTGGTCGTTGGCTGGTTTCTCGCTTCCATCTTGCAAATCTGGTACATTGTCGTGTTGCATTGCCCAACAA ATTCTTGTTGGGATGGTGCTGTTACTCTTAGTTTGTTTGTTGTGAGATGAGAAGTTAATAAGCTTTAGCTTGTGCAGATAAGAACAATGCTTTAAGAAAGGGAAATGATTTTGCAAGAAGTGTGCATGCTGTTCTTCTTCGCTGGTTAATTCCTTACCGTCAGCAGAGTTTAGTTGTTGAAGTTCTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CF314141             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTGAACATGGGCTAACTGTTGGTCGTTGGCTGGTTTCTCGCTTCCATCTTGCAAATCTGGTACATTGTCGTGTTGCATTGCCCAACAACATTCTTGTTGGGATGGTGCTGTTACTCTTAGTTTGTTTGTTGTGAGATGAGAAGTTAATAAGCTTTAGCTTGTGCAGATAAGAACAATGCTTTAAGAAAGGGAAATGATTTTGCAAGAAGTGTGCATGCTGTTCTTCTTCGCTGGTTAATTCCTTACCGTCAGCAGAGTTTAGTTGTTGAAGTTCTTTTTACAGCTTCTCAAGATTAGAGATGTGGTTTCTTCGTCTTGCACATCTATTGGTTTTTTTTTGGGAGTAGCTATATAAAGACGCTATATTTTTTTCACCAAAAGATAGTCAGCATGTATTTACATTATAAGTCTCTAAATTACATATATAATTAGTATGTAATATTAGTATGTAATTATAGTGTAAGTATGATGTAATTATATTCTAACTAACCTGTATACTAATTACTGATACTCAAATTTGTTTATATGAATTCCTAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU166471             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAACAA ATTCTTGTTGGGATGGTGCTGTTACTCTTAGTTTGTTTGTTGTGAGATGAGAAGTTAATAAGCTTTAGCTTGTGCAGATAAGAACAATGCTTTAAGAAAGGGAAATGATTTTGCAAGAAGTGTGCATGCTGTTCTTCTTCGCTGGTTAATTCCTTACCGTCAGCAGAGTTTAGTTGTTGAAGTTCTTTTTACAGCTTCTCAAGATTAGAGATGTGGTTTCTTCGTCTTGCACATCTATTGGTTTTTTTTTGGGAGTAGCTATATAAAGACGCTATATTTTTTTCACCAAAAGATAGTCAGCATGTATTTACATTATAAGTCTCTAAATTACATATATAATTAGTATGTAATATTAGTATGTAATTATAGTGTAAGTATGATGTAATTATATTCTAACTAACCTGTATACTAATTACTGATACTCAAATTTGTTTAaaaa                ]
[+] EMBL BI810069             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCTTCGCTGGTTAATTCCTTACCGTCAGCAGAGTTTAGTTGTTGAAGTTCTTTTTACAGCTTCTCAAGATTAGAGATGTGGTTTCTTCGTCTTGCACATCTATTGGTTTTTTTTTGGGAGTAGCTATATAAAGACGCTATATTTTTTTCACC AAAGATAGTCAGCATGTATTTACATTATAAGTCTCTAAATTACATATATAATTAGTATGTAATATTAGTATGTAATTATAGTGTAAGTATGATGTAATTATATTCTAACTAACCTGTATACTAATTACTGATACTCAAATTTGTTTATATGAAaaa           ]




>consensus_9612#0
ACGAGGCCGAATCGAAACCCCACCATCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGACACCTGA
CGCCATGGACCCCGGCGGCCTGCGCCCAGCGCCCCAGTCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGC
CGCGGCTGCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGTCCGCGGCGGACGAGCCCCGCGACGCGCGCGT
GGTGCGGGAGCTCCTGCGCTCCATGGGGCTGAGCGAGGGGGAGTACGAGCCGCGGGTGGT
GCACCAGTTCCTCGACCTGGCCTACCGCTACGTCGGCGACGTGCTCGGGGACGCCCAGGT
CTACGCCGACCACGCGGGGAAGCCCCAGCTTGACGCCGACGACGTCCGCCTCGCCATCCA
GTCCAAGGTCAACTTCTCCTTCTCCCAGCCGCCGCCCCGCGAGGTTCTCCTTGAGGTGGC
ACGGAACCGGAACAAAATCCCGCTACCCAAGTCGATTGCTCCACCTGGCTCAATTCCTCT
GCCACCAGAGCAGGACACGCTGTTGAGCCAAAATTACCAGCTCCTAGCTCCGTTGAAGCC
ACCGCCTCAGTTTGAAGAAACAGAAGATGACAATGCAGGAGCCAACCCTACTCCAACCTC
AAACCCGAGCAACCCTAGTCCAAACAATCTGCAGGAGCAGCAGCAGCTTCCGCAGCATGG
TCAGAGGGTTTCTTTCCAGCTCAACGCCGTTGCTGCCGCCAAACGCCGAGGGACCATGGA
TCAGTTGAACATGGGCTAACTGTTGGTCGTTGGCTGGTTTCTCGCTTCCATCTTGCAAAT
CTGGTACATTGTCGTGTTGCATTGCCCAACAAATTCTTGTTGGGATGGTGCTGTTACTCT
TAGTTTGTTTGTTGTGAGATGAGAAGTTAATAAGCTTTAGCTTGTGCAGATAAGAACAAT
GCTTTAAGAAAGGGAAATGATTTTGCAAGAAGTGTGCATGCTGTTCTTCTTCGCTGGTTA
ATTCCTTACCGTCAGCAGAGTTTAGTTGTTGAAGTTCTTTTTACAGCTTCTCAAGATTAG
AGATGTGGTTTCTTCGTCTTGCACATCTATTGGTTTTTTTTTGGGAGTAGCTATATAAAG
ACGCTATATTTTTTTCACCAAAAGATAGTCAGCATGTATTTACATTATAAGTCTCTAAAT
TACATATATAATTAGTATGTAATATTAGTATGTAATTATAGTGTAAGTATGATGTAATTA
TATTCTAACTAACCTGTATACTAATTACTGATACTCAAATTTGTTTATATGAATTCCTAA
AAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)