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Oryza sativa
cluster # 9701 cluster # 9701       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9701#0 length = 1403 sequences # 6  

consensusID : consensus_9701#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1403
fasta sequence
                              [GCAAATGATTACTCTTATCACTAATTCAATAAGCAAGGACCTTCCTGCTACTTTGGAGAAGTCACTGAAGAAAGAAATTTCTTCACTTGGACCTGTTATTGCACGGGCAATAACACCTATTATCGAGAAGTGTTCAGCCTCTGCAGTTGCTGATTCAATTCAGAAAGTGGTTGGTGACAGAGTGGTGAATCAGCTGGACAAGTCTGTTAGTGCAAAACTTGAAGCTACTGTTGCTAGACAAATCCAAATGCAGTTCCACACATCTGTAAAACAGACCCTTCAGGATGCTTTACGTGCTAGCCTGGAAGCTTTCCTTGTTCCAGCGTTTGAACAATCTTGCAAGACAATGTTTGAGCAAGTCGATAGCGCATTCCAGAAAGGAATGTCTGAACACACTGTTGCTATTCAGCAGCAAGTTGAGGCAACACATACCCCATTGGCGCAAACTTTAAAGGATACCATCTCTTCTGCGTCTTCGATCACCCAGAATCTTACAGCAGAGTTGCTTGATGGCCATCGCAAACTATTGGCGCTGCTTGCATCGGGCAATGCAAAAGCACATAGTACAAACGTTTTGCAGCCCAACAATGTCCCTGTGACTGGTCCACCGGAGGTTGAGGCTCCATTAGATCCAATGAAGGAGTTGGGCAGACTGATATCTGAACGCAAATTTGACGAGGCATTTACAATGGCTCTTCAAAGAAGTGACTTGTCGATAGTGTCTTGGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCTTAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGCTAGCAGTTGACATTGCTACTGATACGCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGTGATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTCGAGCAAGTCTACAATGCATTGCTCCACCTACGCTCGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAATTAATTCTGTTCTGCTTAGCTACAAGTGATTCTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAGATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGGCATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTTGCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATTTCAATATCCAGTTTAGTGTCTACTAGTTCGCCCTCTTGAGCCAGTAATGCTCAATCAGGCACACAACTGTAGCCCCTGCAGCTTAAGATGGTAATTTGTAGCGGCCGCTTTACAGTGAGTGACAATTTCCACTCAAAATTTTGTAGTTCAAAAAGATAAATGT]

[+] EMBL AK061221             [GCAAATGATTACTCTTATCACTAATTCAATAAGCAAGGACCTTCCTGCTACTTTGGAGAAGTCACTGAAGAAAGAAATTTCTTCACTTGGACCTGTTATTGCACGGGCAATAACACCTATTATCGAGAAGTGTTCAGCCTCTGCAGTTGCTGATTCAATTCAGAAAGTGGTTGGTGACAGAGTGGTGAATCAGCTGGACAAGTCTGTTAGTGCAAAACTTGAAGCTACTGTTGCTAGACAAATCCAAATGCAGTTCCACACATCTGTAAAACAGACCCTTCAGGATGCTTTACGTGCTAGCCTGGAAGCTTTCCTTGTTCCAGCGTTTGAACAATCTTGCAAGACAATGTTTGAGCAAGTCGATAGCGCATTCCAGAAAGGAATGTCTGAACACACTGTTGCTATTCAGCAGCAAGTTGAGGCAACACATACCCCATTGGCGCAAACTTTAAAGGATACCATCTCTTCTGCGTCTTCGATCACCCAGAATCTTACAGCAGAGTTGCTTGATGGCCATCGCAAACTATTGGCGCTGCTTGCATCGGGCAATGCAAAAGCACATAGTACAAACGTTTTGCAGCCCAACAATGTCCCTGTGACTGGTCCACCGGAGGTTGAGGCTCCATTAGATCCAATGAAGGAGTTGGGCAGACTGATATCTGAACGCAAATTTGACGAGGCATTTACAATGGCTCTTCAAAGAAGTGACGTGTCGATAGTGTCTTGGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCTTAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGCTAGCAGTTGACATTGCTACTGATACGCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGTGATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTCGAGCAAGTCTACAATGCATTGCTCCACCTACGCTCGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAATTAATTCTGTTCTGCTTAGCTACAAGTGATTCTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAGATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGGCATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTTGCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATTTCAATATCCAG                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CB627066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATC TACAGCAGAGTTGCTTGATGGCCATCGCAAACTATTGGCGCTGCTTGCATCGGGCAATGCAAAAGCACATAGTACAAACGTTTTGCAGCCCAACAATGTCCCTGTGACTGGTCCACCGGAGGTTGAGGCTCCATTAGATCCAATGAAGGAGTTGGGCAGACTGATATCTGAACGCAAATTTGACGAGGCATTTACAATGGCTCTTCAAAGAAGTGACTTGTCGATAGTGTCTTGGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCTTAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGCTAGCAGTTGACATTGCTACTGATACGCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGTGATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTCGAGCAAGTCTACAATGCATTGCTCCACCTACGCTCGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAATTAATTCTGTTCTGCTTAGCTACAAGTGATTTTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAGATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGGCATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTTGCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATTTCAATATCCAGT                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BI305346             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATTGGCGCTGCTTGCATCGGGCAATGCAAAAGCACATAGTACAAACGTTTTGCAGCCCAACAATGTCCCTGTGACTGGTCCACCGGAGGTTGAGGCTCCATTAGATCCAATGAAGGAGTTGGGCAGACTGATATCTGAACGCAAATTTGACGAGGCATTTACAATGGCTCTTCAAAGAAGTGACTTGTCGATAGTGTCTTGGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCTTAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGCTAGCAGTTGACATTGCTACTGATACGCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGTGATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTCGAGCAAGTCTACAATGCATTGCTCCACCTACGCTCGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAATTAATTCTGTTCTGCTTAGCTACAAGTGATTCTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAGATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGGCATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTTGCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATT                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CB634728             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGAAGGAGTTGGGCAGACTGATATCTGAACGCAAATTTGACGAGGCATTTACAATGGCTCTTCAAAGAAGTGACTTGTCGATAGTGTCTTGGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCTTAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGCTAGCAGTTGACATTGCTACTGATACGCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGTGATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTCGAGCAAGTCTACAATGCATTGCTCCACCTACGCTCGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAATTAATTCTGTTCTGCTTAGCTACAAGTGATTCTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAGATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGGCATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTTGCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATTTCAATATCCAGTTTAGTGTCTACTAGTTCGCCCTCTTGAGCCAGTAATGCTCAATCAGGCACACAACTGTAGCCCCTGCAGCTTAAGATGGTAATTTGTAGCGGCCGCTTTACAGTGAGTGACAATTTCCACTCAAAATTTTGTAGTTCAAAAAGATAAATGT]
[-] EMBL CB632429             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGAAGGAGTTGGGCAGACTGATATCTGAACGCAAATTTGACGAGGCATTTACAATGGCTCTTCAAAGAAGTGACTTGTCGATAGTGTCTTGGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCTTAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGCTAGCAGTTGACATTGCTACTGATACGCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGTGATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTCGAGCAAGTCTACAATGCATTGCTCCACCTACGCTCGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAATTAATTCTGTTCTGCTTAGCTACAAGTGATTCTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAGATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGGCATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTTGCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATTTCAATATCCAGTTTAGTGTCTACTAGTTCGCCCTCTTGAGCCAGTAATGCTCAATCAGGCACACAACTGTAGCCCCTGCAGCTTAAGATGGTAATTTGTAGCGGCCGCTTTACAGTGAGTGACAATTTCCACTCAAAATTTTGTAGTT               ]
[-] EMBL CB634727             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCTTAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGGTAGCAGTTGACATTGCTACTGATACGCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGTGATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTGGAGCAAGTGTACAATGCATTGGTCCACCTACGCTGGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAATTAATTCTGTTCTGGTTAGCTACAAGTGATTGTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAGATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGGCATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTTGCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATTTCAATATCCAGTTTAGTGTTTACTAGTTCGCCCTCTTGAGCCAGTAATGCTCAATCAGGCACACAAGGGTAGCCCCTGCAGCTTAAGATGGTAATTTGTAGGGGCCGCTTTACAGTGAGTGACAATTTCCACTCAAAAAGGGGTAGTTCAAAAAGATAAATG ]


>consensus_9701#0 GCAAATGATTACTCTTATCACTAATTCAATAAGCAAGGACCTTCCTGCTACTTTGGAGAA GTCACTGAAGAAAGAAATTTCTTCACTTGGACCTGTTATTGCACGGGCAATAACACCTAT TATCGAGAAGTGTTCAGCCTCTGCAGTTGCTGATTCAATTCAGAAAGTGGTTGGTGACAG AGTGGTGAATCAGCTGGACAAGTCTGTTAGTGCAAAACTTGAAGCTACTGTTGCTAGACA AATCCAAATGCAGTTCCACACATCTGTAAAACAGACCCTTCAGGATGCTTTACGTGCTAG CCTGGAAGCTTTCCTTGTTCCAGCGTTTGAACAATCTTGCAAGACAATGTTTGAGCAAGT CGATAGCGCATTCCAGAAAGGAATGTCTGAACACACTGTTGCTATTCAGCAGCAAGTTGA GGCAACACATACCCCATTGGCGCAAACTTTAAAGGATACCATCTCTTCTGCGTCTTCGAT CACCCAGAATCTTACAGCAGAGTTGCTTGATGGCCATCGCAAACTATTGGCGCTGCTTGC ATCGGGCAATGCAAAAGCACATAGTACAAACGTTTTGCAGCCCAACAATGTCCCTGTGAC TGGTCCACCGGAGGTTGAGGCTCCATTAGATCCAATGAAGGAGTTGGGCAGACTGATATC TGAACGCAAATTTGACGAGGCATTTACAATGGCTCTTCAAAGAAGTGACTTGTCGATAGT GTCTTGGTTGTGCTCTCAGGTTGATTTGCGCGCATTGTGCTCAATGGTCCCCGTCCCCCT TAACCAGGGGGTCCTCCTAGCCCTATTGCAGCAGCTAGCAGTTGACATTGCTACTGATAC GCCGCGGAAGATTCAGTGGATGACAGATGTCGCTATGGCGATAAATCCAACCGATCCGGT GATCGCCATGCACGTGAAGCCTATTTTCGAGCAAGTCTACAATGCATTGCTCCACCTACG CTCGCTCCCCACCACCAGCCCATCAGACAGCACCAGCATCCGCTTATTCATGCATGTAAT TAATTCTGTTCTGCTTAGCTACAAGTGATTCTAGGCATCTATTGAGGTTCTGGAACTGAG ATGCATGGTCTACTACCGTTGTATAGAGAAATTTTGGTAAGCGAAGGAAACCCAATAGGG CATTCCATTGCCTATGAGGCTGTGACCGAGAACACTAGCAGGAGGGTGGAAGTGCCCCTT GCTGTAAACTAGGCTTGTAACAGTCTTAATTTGGAGTATTTCAATATCCAGTTTAGTGTC TACTAGTTCGCCCTCTTGAGCCAGTAATGCTCAATCAGGCACACAACTGTAGCCCCTGCA GCTTAAGATGGTAATTTGTAGCGGCCGCTTTACAGTGAGTGACAATTTCCACTCAAAATT TTGTAGTTCAAAAAGATAAATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)