These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9728#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 814 fasta sequence [TTTTTTTTTTTTTTTAGTCGAGAAACACAATATT-C-GTTTCTAGATACCCCAGGTAATGCTATTGGATGCCCGAAGTACATGGCCATGGAGAGTGAAACATGTCTAATTGTTCACCTGGCGCTGCCCTCCTCGAAGTGCAAGTACTAGAACACAACATACAAGGGAAGAGAGGTTGAGGCATGCTACTCCTCCTCCTCGACCTTCTTTGCTTTCTTGCCACCCTTCTTCTTGCCGGTACCGTCGCCAGCGGCTATGGTCCTCTGTGCAGTGAGGACAACCTCCAAGCGAGTCCAGTGTTCCTTATTCCAGATGAAGCCCTTCAGGAATTTGGCATCGCCCAGCTCGTCATCGGACTTGGTCTTGTATCTCTTGTGGATTGCCTTCATCGCATCCTTAATTGTGACACCTTTAAAACTGCTTGCGGAGACAGTTGCATCCCCAAGCTCAAACCACAGGTCAATCCTC-TTGACTGGGGGGTTGGTCAGGAATTCGTCTAAAACTGCGGGGTCCTCGACATGATCAGCCGACGGTGAGGTATTGACTTTCCAACCAGTCTGCTGTGTGGCCATTGGTAGCTCGATTTTGGTCTCTGAAGCCTCAAGGTCCTGGATTTTGGAGACGCCTGGGGCAGCAGCAGAGCTCTGTCTCCTTTTGGAGAGCTCCTTCTTCTCGGTTACCTCTTTCTTGTCGACGGGAGAGTCCAGACCCTGGACGGCGGAATCGACCTTCTTCAGTGGCTCTGTCATGATGATGAATTGGTTCTGTGTGAGCTTGATCTGTTACCGATCAAGACTCTTGAAGCGTTGGAATTGGG] [+] EMBL CA999593 [TTTTTTTTTTTTTTTAGTCGAGAAACACAATATT C GTTTCTAGATACCCCAGGTAATGCTATTGGATGCCCGAAGTACATGGCCATGGAGAGTGAAACATGTCTAATTGTTCACCTGGCGCTGCCCTCCTCGAAGTGCAAGTACTAGAACACAACATACAAGGGAAGAGAGGTTGAGGCATGCTACTCCTCCTCCTCGACCTTCTTTGCTTTCTTGCCACCCTTCTTCTTGCCGGTACCGTCGCCAGCGGCTATGGTCCTCTGTGCAGTGAGGACAACCTCCAAGCGAGTCCAGTGTTCCTTATTCCAGATGAAGCCCTTCAGGAATTTGGCATCGCCCAGCTCGTCATCGGACTTGGTCTTGTATCTCTTGTGGATTGCCTTCATCGCATCCTTAATTGTGACACCTTTAAAACTGCTTGCGGAGACAGTTGCATCCCCAAGCTCAAACCACAGGTCAATCCTCTTTGACTGGGGGGTTGGTCAGGAATTCGTCTAAAACTGCGGGGTCCTCGACATGATCAGCCGACGGTGAGGTATTGACTTTCCAACCAGTCTGCTGTGTGGCCATTGGTAGCTCGATTTTGGTCTCTGAAGCCTCAAGGTCCTGGATTTTGGAGACGCCTGGGGCAGCAGCAGAGCTCTGTCTCCTTTTGGAGAGCTCCTTCTTCTCGGTT ] [+] EMBL CA999236 [ AGTCGAGAAACACAATATT CNGTTTCTAGATACCCCAGGTAATGCTATTGGATGCCCGAAGTACATGGCCATGGAGAGTGAAACATGTCTAATTGTTCACCTGGCGCTGCCCTCCTCGAAGTGCAAGTACTAGAACACAA ] [+] EMBL CA999140 [ AGAAACACAATATTCC GTTTCTAGATACCCCAGGTAATGCTATTGGATGCCCGAAGTACATGGCCATGGAGAGTGAAACATGTCTAATTGTTCACCTGGCGCTGCCCTCCTCGAAGTGCAAGTACTAGAACACAACATACAAGGGAAGAGAGGTTGAGGCATGCTACTCCTCCTCCTCGACCTTCTTTGCTTTCTTGCCACCCTTCTTCTTGCCGGTACCGTCGCCAGCGGCTATGGTCCTCTGTGCAGTGAGGACAACCTCCAAGCGAGTCCAGTGTTCCTTATTCCAGATGAAGCCCTTCAGGAATTTGGCATCGCCCAGCTCGTCATCGGACTTGGTCTTGTATCTCTTGTGGATTGCCTTCATCGCATCCTTAATTGTGACACCTTTAAAACTGCTTGCGGAGACAGTTGCATCCCCAAGCTCAAACCACAGGTCAATCCTC TTGACTGGGGGGTTGGTCA ] [+] EMBL CA999012 [ GAAACACAATATT C GTTTCTAGATACCCCAGGTAATGCTATTGGATGCCCGAAGTACATGGCCATGGAGAGTGAAACATGTCTAATTGTTCACCTGGCGCTGCCCTCCTCGAAGTGCAAGTACTAGAACACAACATACAAGGGAAGAGAGGTTGAGGCATGCTACTCCTCCTCCTCGACCTTCTTTGCTTTCTTGCCACCCTTCTTCTTGCCGGTACCGTCGCCAGCGGCTATGGTCCTCTGTGCAGTGAGGACAACCTCCAAGCGAGTCCAGTGTTCCTTATTCCAGATGAAGCCCTTCAGGAATTTGGCATCGCCCAGCTCGTCATCGGACTTGGTCTTGTATCTCTTGTGGATTGCCTTCATCGCATCCTTAATTGTGACACCTTTAAAACTGCTTGCGGAGACAGTTGCATCCCCAAGCTCAAACCACAGGTCAATCCTC TTGACTGGGGGGTTGGTCAGGAATTCGTCTAAAACTGCGGGGTCCTCGACATGATCAGCCGACGGTGAGGTATTGACTTTCCAACCAGTCTGCTGTGTGGCCATTGGTAGCTCGATTTTGGTCTCTGAAGCCTCAAGGTCCTGGATTTTGGAGACGCCTGGGGCAGCAGCAGAGCTCTGTCTCCTTTTGGAGAGCTCCTTCTTCTCGGTT ] [+] EMBL CB000152 [ AACACAATACT T TTTTCTAGATACCCCAGGTAATGCTATTGGATGCCCGAAGTACATGGCCATGGAGAGTGAAACATGTCTAATTGTTCACCTGGCGCTGCCCTCCTCGAAGTGCAAGTACTAGAACACAACATACAAGGGAAGAGAGGTTGAGGCATGCTACTCCTCCTCCTCGACCTTCTTTGCTTTCTTGCCACCCTTCTTCTTGCCGGTACCGTCGCCAGCGGCTATGGTCCTCTGTGCAGTGAGGACAACCTCCAAGCGAGTCCAGTGTTCCTTATTCCAGATGAAGCCCTTCAGGAATTTGGCATCGCCCAGCTCGTCATCGGACTTGGTCTTGTATCTCTTGTGGATTGCCTTCATCGCATCCTTAATTGTGACACCTTTAAAACTGCTTGCGGAGACAGTTGCATCCCCAAGCTCAAACCACAGGTCAATCCTC TTGACTGGGGGGTTGGTCAGGAATTCGTCTAAAACTGCGGGGTCCTCGACATGATCAGCCGACGGTGAGGTATTGACTTTCCAACCAGTCTGCTGTGTGGCCATTGGTAGCTCGATTTTGGTCTCTGAAGCCTCAACGTCCTGGATTTTGGAGACGCCTGGGGCAGCAGCAGAGCTCTGTCTCCTTTTGGAGAGCTCCTTCTTCTCGGTTACCTCTTTCTTGTCGACGGGAGAGTCCAGACCCTGGACGGCGGAATCGACCTTCTTCAGTGGCTCTGTCATGATGATGAATTGGTTCTGTGTGAGCTTGATCTGTTACCGATCAAGACTCTTGAAGCGTTGGAATTGGG] [+] EMBL CA998335 [ ACACAATATT C GTTTCTAGATACCCCAGGTAATGCTATTGGATGCCCGAAGTACATGGCCATGGAGAGTGAAACATGTCTAATTGTTCACCTGGCGCTGCCCTCCTCGAAGTGCAAGTACTAGAACACAACATACAAGGGAAGAGAGGTTGAGGCATGCTACTCCTCCTCCTCGACCTTCTTTGCTTTCTTGCCACCCTTCTTCTTGCCGGTACCGTCGCCAGCGGCTATGGTCCTCTGTGCAGTGAGGACAACCTCCAAGCGAGTCCAGTGTTCCTTATTCCAGATGAAGCCCTTCAGGAATTTGGCATCGCCCAGCTCGTCATCGGACTTGGTCTTGTATCTCTTGTGGATTGCCTTCATCGCATCCTTAATTGTGACACCTTTAAAACTGCTTGCGGAGACAGTTGCATCCCCAAGCTCAAACCACAGGTCAATCCTC TTGACTGGGGGGTTGGTCAGGAATTCGTCTAAAACTGCGGGGTCCTCGACATGATCAGCCGACGGTGAGGTATTGACTTTCCAACCAGTCTGCTGTGTGGCCATTGGTAGCTCGATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||