These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9764#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1636 fasta sequence [AGTCCACTCCTCGCCTTCGTTTCTCCTCCCCCATTTCGTCCCTACCTGCTCCTCACCAGATCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCATGTGGAGGGGCGGAGCGACCGCCGCCTCCGCCGCGAGGGCTCTCCGCTCGCGCCTGATCCCCGACACGTCCCACCACCCGGCCACGGCTCTAGCTCCCATCGCATCGCCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTGCCCCCACCATCGCCGCCGCTGTGCCCGCCGTCGCGGAGGCTACGGCGGCCGCGGCCGCTGTTTCGAGGCAAGCTGGATCCGTCTCCGACGCGCTGAGGCACTACGGGAGGTGCTACTTCGAGCTCTCCAAAGCCCGCCTAAGTGCCCTTGTTGTGGCAACATCTGGGGCTGGTTATGTGCTCGGAAGTGGCAACATGGTAGACATAGCTGGACTTTGTTGCACCTGCGCTGGTACCATGATGGTTGCAGCATCTGCAAATACTCTCAACCAGGTGTTTGAGATAAAGAATGACGCTAAAATGAAAAGAACCATGCGACGGCCCCTACCATCAGGGCGCATTAGTCCTGCACATGCTGCCATGTGGGCTACTAGTGTTGGAGTTGCTGGAACAGCTTTGTTGGCTTGGAAGGCTAATGGCTTGGCGGCTGGGCTCGCAGCTTCTAATCTTATTCTGTATGCATTTGTATACACACCATTGAAGCAAATACACCCTGTAAATACATGGGTTGGAGCAGTTGTTGGTGCCATACCACCACTTCTAGGGTGGGCAGCAGCTTCGTCTGAACTGTCACTGAATGCTATGATTCTCCCTGCTGCATTGTACTATTGGCAAATACCACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA-CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGCACATACTTTCAGAAATAATCTGCATATTTTCAAACTTTGTTTGCT] [+] EMBL AK061861 [AGTCCACTCCTCGCCTTCGTTTCTCCTCCCCCATTTCGTCCCTACCTGCTCCTCACCAGATCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCATGTGGAGGGGCGGAGCGACCGCCGCCTCCGCCGCGAGGGCTCTCCGCTCGCGCCTGATCCCCGACACGTCCCACCACCCGGCCACGGCTCTAGCTCCCATCGCATCGCCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTGCCCCCACCATCGCCGCCGCTGTGCCCGCCGTCGCGGAGGCTACGGCGGCCGCGGCCGCTGTTTCGAGGCAAGCTGGATCCGTCTCCGACGCGCTGAGGCACTACGGGAGGTGCTACTTCGAGCTCTCCAAAGCCCGCCTAAGTGCCCTTGTTGTGGCAACATCTGGGGCTGGTTATGTGCTCGGAAGTGGCAACATGGTAGACATAGCTGGACTTTGTTGCACCTGCGCTGGTACCATGATGGTTGCAGCATCTGCAAATACTCTCAACCAGGTGTTTGAGATAAAGAATGACGCTAAAATGAAAAGAACCATGCGACGGCCCCTACCATCAGGGCGCATTAGTCCTGCACATGCTGCCATGTGGGCTACTAGTGTTGGAGTTGCTGGAACAGCTTTGTTGGCTTGGAAGGCTAATGGCTTGGCGGCTGGGCTCGCAGCTTCTAATCTTATTCTGTATGCATTTGTATACACACCATTGAAGCAAATACACCCTGTAAATACATGGGTTGGAGCAGTTGTTGGTGCCATACCACCACTTCTAGGGTGGGCAGCAGCTTCGTCTGAACTGTCACTGAATGCTATGATTCTCCCTGCTGCATTGTACTATTGGCAAATACCACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGCAC ] [+] EMBL AK099005 [ CCTACCTGCTCCTCACCAGATCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCATGTGGAGGGGCGGCGCGACCGCCGCCTCCGCCGCGAGGGCTCTCCGCTCGCGCCTGATCCCCGACACGTCCCACCACCCGGCCACGGCTCTAGCTCCCATCGCATCGCCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTGCCCCCACCATCGCCGCCGCTGTGCCCGCCGTCGCGGAGGCTACGGCGGCCGCGGCCGCTGTTTCGAGGCAAGCTGGATCCGTCTCCGACGCGCTGAGGCACTACGGGAGGTGCTACTTCGAGCTCTCCAAAGCCCGCCTAAGTGCCCTTGTTGTGGCAACATCTGGGGCTGGTTATGTGCTCGGAAGTGGCAACATGGTAGACATAGCTGGACTTTGTTGCACCTGCGCTGGTACCATGATGGTTGCAGCATCTGCAAATACTCTCAACCAGGTGTTTGAGATAAAGAATGACGCTAAAATGAAAAGAACCATGCGACGGCCCCTACCATCAGGGCGCATTAGTCCTGCACATGCTGCCATGTGGGCTACTAGTGTTGGAGTTGCTGGAACAGCTTTGTTGGCTTGGAAGGCTAATGGCTTGGCGGCTGGGCTCGCAGCTTCTAATCTTATTCTGTATGCATTTGTATACACACCATTGAAGCAAATACACCCTGTAAATACATGGGTTGGAGCAGTTGTTGGTGCCATACCACCACTTCTAGGGTGGGCAGCAGCTTCGTCTGAACTGTCACTGAATGCTATGATTCTCCCTGCTGCATTGTACTATTGGCAAATACCACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGC ] [-] EMBL CB658975 [ CACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGCACATACTTTCAGAAATAATCTGCATATTTTCAAACTTTGTTTGCT] [+] EMBL BQ906299 [ ccgGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGAACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCNAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAACCCAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCAaaaaaaaaa ] [+] EMBL BI812281 [ ATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGAACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCAaaaaaaaaa ] [-] EMBL CA998178 [ TACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTGGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||