cluster # 9764

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 9764 cluster # 9764 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9764#0 length = 1636 sequences # 6
consensusID : consensus_9764#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1636
fasta sequence
                              [AGTCCACTCCTCGCCTTCGTTTCTCCTCCCCCATTTCGTCCCTACCTGCTCCTCACCAGATCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCATGTGGAGGGGCGGAGCGACCGCCGCCTCCGCCGCGAGGGCTCTCCGCTCGCGCCTGATCCCCGACACGTCCCACCACCCGGCCACGGCTCTAGCTCCCATCGCATCGCCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTGCCCCCACCATCGCCGCCGCTGTGCCCGCCGTCGCGGAGGCTACGGCGGCCGCGGCCGCTGTTTCGAGGCAAGCTGGATCCGTCTCCGACGCGCTGAGGCACTACGGGAGGTGCTACTTCGAGCTCTCCAAAGCCCGCCTAAGTGCCCTTGTTGTGGCAACATCTGGGGCTGGTTATGTGCTCGGAAGTGGCAACATGGTAGACATAGCTGGACTTTGTTGCACCTGCGCTGGTACCATGATGGTTGCAGCATCTGCAAATACTCTCAACCAGGTGTTTGAGATAAAGAATGACGCTAAAATGAAAAGAACCATGCGACGGCCCCTACCATCAGGGCGCATTAGTCCTGCACATGCTGCCATGTGGGCTACTAGTGTTGGAGTTGCTGGAACAGCTTTGTTGGCTTGGAAGGCTAATGGCTTGGCGGCTGGGCTCGCAGCTTCTAATCTTATTCTGTATGCATTTGTATACACACCATTGAAGCAAATACACCCTGTAAATACATGGGTTGGAGCAGTTGTTGGTGCCATACCACCACTTCTAGGGTGGGCAGCAGCTTCGTCTGAACTGTCACTGAATGCTATGATTCTCCCTGCTGCATTGTACTATTGGCAAATACCACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA-CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGCACATACTTTCAGAAATAATCTGCATATTTTCAAACTTTGTTTGCT]

[+] EMBL AK061861             [AGTCCACTCCTCGCCTTCGTTTCTCCTCCCCCATTTCGTCCCTACCTGCTCCTCACCAGATCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCATGTGGAGGGGCGGAGCGACCGCCGCCTCCGCCGCGAGGGCTCTCCGCTCGCGCCTGATCCCCGACACGTCCCACCACCCGGCCACGGCTCTAGCTCCCATCGCATCGCCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTGCCCCCACCATCGCCGCCGCTGTGCCCGCCGTCGCGGAGGCTACGGCGGCCGCGGCCGCTGTTTCGAGGCAAGCTGGATCCGTCTCCGACGCGCTGAGGCACTACGGGAGGTGCTACTTCGAGCTCTCCAAAGCCCGCCTAAGTGCCCTTGTTGTGGCAACATCTGGGGCTGGTTATGTGCTCGGAAGTGGCAACATGGTAGACATAGCTGGACTTTGTTGCACCTGCGCTGGTACCATGATGGTTGCAGCATCTGCAAATACTCTCAACCAGGTGTTTGAGATAAAGAATGACGCTAAAATGAAAAGAACCATGCGACGGCCCCTACCATCAGGGCGCATTAGTCCTGCACATGCTGCCATGTGGGCTACTAGTGTTGGAGTTGCTGGAACAGCTTTGTTGGCTTGGAAGGCTAATGGCTTGGCGGCTGGGCTCGCAGCTTCTAATCTTATTCTGTATGCATTTGTATACACACCATTGAAGCAAATACACCCTGTAAATACATGGGTTGGAGCAGTTGTTGGTGCCATACCACCACTTCTAGGGTGGGCAGCAGCTTCGTCTGAACTGTCACTGAATGCTATGATTCTCCCTGCTGCATTGTACTATTGGCAAATACCACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGCAC                                           ]
[+] EMBL AK099005             [                                        CCTACCTGCTCCTCACCAGATCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCATGTGGAGGGGCGGCGCGACCGCCGCCTCCGCCGCGAGGGCTCTCCGCTCGCGCCTGATCCCCGACACGTCCCACCACCCGGCCACGGCTCTAGCTCCCATCGCATCGCCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTGCCCCCACCATCGCCGCCGCTGTGCCCGCCGTCGCGGAGGCTACGGCGGCCGCGGCCGCTGTTTCGAGGCAAGCTGGATCCGTCTCCGACGCGCTGAGGCACTACGGGAGGTGCTACTTCGAGCTCTCCAAAGCCCGCCTAAGTGCCCTTGTTGTGGCAACATCTGGGGCTGGTTATGTGCTCGGAAGTGGCAACATGGTAGACATAGCTGGACTTTGTTGCACCTGCGCTGGTACCATGATGGTTGCAGCATCTGCAAATACTCTCAACCAGGTGTTTGAGATAAAGAATGACGCTAAAATGAAAAGAACCATGCGACGGCCCCTACCATCAGGGCGCATTAGTCCTGCACATGCTGCCATGTGGGCTACTAGTGTTGGAGTTGCTGGAACAGCTTTGTTGGCTTGGAAGGCTAATGGCTTGGCGGCTGGGCTCGCAGCTTCTAATCTTATTCTGTATGCATTTGTATACACACCATTGAAGCAAATACACCCTGTAAATACATGGGTTGGAGCAGTTGTTGGTGCCATACCACCACTTCTAGGGTGGGCAGCAGCTTCGTCTGAACTGTCACTGAATGCTATGATTCTCCCTGCTGCATTGTACTATTGGCAAATACCACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGC                                             ]
[-] EMBL CB658975             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCGAATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTGTCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTTCAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCTGGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGCTTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCATTTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGCACATACTTTCAGAAATAATCTGCATATTTTCAAACTTTGTTTGCT]
[+] EMBL BQ906299             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccgGTCACTCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGCTAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTATGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGAACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCNAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAACCCAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCAaaaaaaaaa                                                                                            ]
[+] EMBL BI812281             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATATATGTCTCTACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGAACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCAaaaaaaaaa                                                                                            ]
[-] EMBL CA998178             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TACCCAAGGTCATGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTGGGTCCATATTTTTTTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCGAAAATAATGAA CAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTC                                                                               ]




>consensus_9764#0
AGTCCACTCCTCGCCTTCGTTTCTCCTCCCCCATTTCGTCCCTACCTGCTCCTCACCAGA
TCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCATGTGGAGGGGCGGAGCGACCGCCGCCTCCGCCGCGAG
GGCTCTCCGCTCGCGCCTGATCCCCGACACGTCCCACCACCCGGCCACGGCTCTAGCTCC
CATCGCATCGCCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTGCCCCCACCATCGCCGC
CGCTGTGCCCGCCGTCGCGGAGGCTACGGCGGCCGCGGCCGCTGTTTCGAGGCAAGCTGG
ATCCGTCTCCGACGCGCTGAGGCACTACGGGAGGTGCTACTTCGAGCTCTCCAAAGCCCG
CCTAAGTGCCCTTGTTGTGGCAACATCTGGGGCTGGTTATGTGCTCGGAAGTGGCAACAT
GGTAGACATAGCTGGACTTTGTTGCACCTGCGCTGGTACCATGATGGTTGCAGCATCTGC
AAATACTCTCAACCAGGTGTTTGAGATAAAGAATGACGCTAAAATGAAAAGAACCATGCG
ACGGCCCCTACCATCAGGGCGCATTAGTCCTGCACATGCTGCCATGTGGGCTACTAGTGT
TGGAGTTGCTGGAACAGCTTTGTTGGCTTGGAAGGCTAATGGCTTGGCGGCTGGGCTCGC
AGCTTCTAATCTTATTCTGTATGCATTTGTATACACACCATTGAAGCAAATACACCCTGT
AAATACATGGGTTGGAGCAGTTGTTGGTGCCATACCACCACTTCTAGGGTGGGCAGCAGC
TTCGTCTGAACTGTCACTGAATGCTATGATTCTCCCTGCTGCATTGTACTATTGGCAAAT
ACCACATTTTATGGCCCTTGCATACTTATGTCGGAATGATTACCTTGCTGGAGGGTACCG
AATGTTTTCTTTTGCTGATCCTACTGGTAAAAGAACTGCATGGGTATCACTCAGAAATTG
TCTATACATGCTGCCCTTGGGATTTTTTGCATACAACTGGGGTCTCACATCTGAGTGGTT
CAGTCTTGAAGCATCACTTCTAACTTTGGGCCTTACAATTGGAGCTCTATCATTTGTGCT
GGAGCCAACCCCCAAAACTGCAAGGAGAATGTTCTATGGTAGCCTTTTGTATCTTCCTGC
TTTTATGGCTGGACTTCTGTTGCATCGGCTGCCTAATGAGCAAAAGGAGCATAATGTCAC
TCAGACGAGTGAAATCACCGGAATTCTTTATGGTGCTGAACAGCAGGATGAAGAACGAGC
TAGACAGAAGCGTGAGGACCGAAAACCTTCTCGTATTCACTCGCGCCCTCCGGTTGCCTA
TGCTTCTGTGGCCCCTTTTCCTTTCTTACCAGTACCTATATATGTCTCTACCCAAGGTCA
TGAGCTATGAAAGATATTACATGGACTAGGCTTGTGGACGCAATGTTGGTCCATATTTTT
TTGGCTTCCAAAGGAAATTTTCCTGATCAAGTACTTTGTCCTTGATGTTGATATGATTCG
AAAATAATGAACAAGAAATTTAGCTCTTGGGCTCACCTGACTGTAAAAATTGATGTCCAT
TTACATTTGATGTCTTGAGTAACATGAATGCACATACTTTCAGAAATAATCTGCATATTT
TCAAACTTTGTTTGCT
clustalw multiple alignements is not computed in this case