cluster # 978

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Oryza sativa
cluster # 978 cluster # 978 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_978#0 length = 593 sequences # 2

consensusID : consensus_978#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 593
fasta sequence

                              [GATATGACCCTATGTCTAGCATGTTGTGAGGCTTGATGAGCTCTCGACTACTCATTGGATAATTGTGGAAGGCCAAGATGTCNCTAGGACATAGGAGGGGATGTGCCCCCAAGATCCAAGCTAGCTGTGCTGGATGCTGTGCGCTGGGCAATGCAGCTGGAGGATGGGACGCAACACCTGCGCCAGACTGACAACATGCCAAGAAGGAGTGCCACACCTGCCACCTGGGTGGCTGCCAGCACTGCCGTGGTGGGTCAATAATGCAGCCAGTGTTGGTGGAGCTGCCGATGGTGCCTGGGTGCATGCCACAGAGCCTGCTGGTTGCGTGCAAGGATTTGTGGTGGCTGGATGGTGCTGACTGTGTGTCTGGNTTAATGGACCATCGAGTCCGTATGATATGTTAGTTTTATGGAAACAGTTTCCTGTGGGACAGCAGTATGCTTTATGAATAAGTTGGATTTGATCTTAAATATGTGCTCAATTTGCTCATTTGCAAAAAAAAAAATTTTTTTTTAAAAAGGAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BQ907902             [GATATGACCCTATGTCTAGCATGTTGTGAGGCTTGATGAGCTCTCGACTACTCATTGGATAATTGTGGAAGGCCAAGATGTCNCTAGGACATAGGAGGGGATGTGCCCCCAAGATCCAAGCTAGCTGTGCTGGATGCTGTGCGCTGGGCAATGCAGCTGGAGGATGGGACGCAACACCTGCGCCAGACTGACAACATGCCAAGAAGGAGTGCCACACCTGCCACCTGGGTGGCTGCCAGCACTGCCGTGGTGGGTCAATAATGCAGCCAGTGTTGGTGGAGCTGCCGATGGTGCCTGGGTGCATGCCACAGAGCCTGCTGGTTGCGTGCAAGGATTTGTGGTGGCTGGATGGTGCTGACTGTGTGTCTGGNTTAATGGACCATCGAGTCCGTATGATATGTTAGTTTTATGGAAACAGTTTCCTGTGGGACAGCAGTATGCTTTATGAATAAGTTGGATTTGA                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CF313149             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATGTTAGTTTTAT GAAACAGTTTCCTGTGGGACAGCAGTATGCTTTATGAATAAGTTGGATTTGTTCTTAAATATGTGCTCAATTTGCTCATTTGCAAAAAAAAAAATTTTTTTTTAAAAAGGAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_978#0
GATATGACCCTATGTCTAGCATGTTGTGAGGCTTGATGAGCTCTCGACTACTCATTGGAT
AATTGTGGAAGGCCAAGATGTCNCTAGGACATAGGAGGGGATGTGCCCCCAAGATCCAAG
CTAGCTGTGCTGGATGCTGTGCGCTGGGCAATGCAGCTGGAGGATGGGACGCAACACCTG
CGCCAGACTGACAACATGCCAAGAAGGAGTGCCACACCTGCCACCTGGGTGGCTGCCAGC
ACTGCCGTGGTGGGTCAATAATGCAGCCAGTGTTGGTGGAGCTGCCGATGGTGCCTGGGT
GCATGCCACAGAGCCTGCTGGTTGCGTGCAAGGATTTGTGGTGGCTGGATGGTGCTGACT
GTGTGTCTGGNTTAATGGACCATCGAGTCCGTATGATATGTTAGTTTTATGGAAACAGTT
TCCTGTGGGACAGCAGTATGCTTTATGAATAAGTTGGATTTGATCTTAAATATGTGCTCA
ATTTGCTCATTTGCAAAAAAAAAAATTTTTTTTTAAAAAGGAAAAAAATAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case