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Oryza sativa
cluster # 9802 cluster # 9802       Sequences # 6       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9802#0 length = 2630 sequences # 5  
consensus_9802#1 length = 1747 sequences # 1  

consensusID : consensus_9802#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 2630
fasta sequence
                              [CTCCTTCCCCATCTCAGACTCAGATCGATCTAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCACGGCGGCCGCGTTTGTCGGCCTCGACTCCTTCCTCGCGGCGGCGGCCGCCCGCGACCCCTCCGCCGGCAACGACACCTTCGGCGCCCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCAGCTCTCGACCCCGTCCCCGCTCCTCCCCACCCGCCTCCTCTCCCTCTCCGCGCAGGTCCCCGTCACCGTCCGCCTCGCCGGCGCCTCCTTCCCGCCCGCCACCGGCCGCCTCCTCGAGTCCTTCGTCAACTCCGCCGTCTCCTCCTCGCGCTTCCTCTCCAGCCGCCGCCCGCACCGCCTCGCGCTCTCCCACAAGATCCACCTCGAGGTCGCCGCCTCCTCCTCCCAGCTCGCGCCCCGCGCCGCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGCGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCTTGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAATTCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTTGACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCAATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTTTAAGCTGATTCTTTAAGAACTATGATTGTGGCTTATATTCGCAAAGTTGGTTGTAAGTCAATAGGGTTTTTAGTCCAGTTCCTTTGTAGCACTCTTTGTTTTTTATCTGCTTG]

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[+] EMBL CA999579             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCACGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTACCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CB631148             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAATTCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTTGACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCAATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTTTAAGCTGATTCT                                                                                                     ]
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>consensus_9802#0 CTCCTTCCCCATCTCAGACTCAGATCGATCTAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCG CCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTC CTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCACGGC GGCCGCGTTTGTCGGCCTCGACTCCTTCCTCGCGGCGGCGGCCGCCCGCGACCCCTCCGC CGGCAACGACACCTTCGGCGCCCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCAGCTCTCGACCCCGTC CCCGCTCCTCCCCACCCGCCTCCTCTCCCTCTCCGCGCAGGTCCCCGTCACCGTCCGCCT CGCCGGCGCCTCCTTCCCGCCCGCCACCGGCCGCCTCCTCGAGTCCTTCGTCAACTCCGC CGTCTCCTCCTCGCGCTTCCTCTCCAGCCGCCGCCCGCACCGCCTCGCGCTCTCCCACAA GATCCACCTCGAGGTCGCCGCCTCCTCCTCCCAGCTCGCGCCCCGCGCCGCCGCCGCCGT CCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCC TTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTC CGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTA CACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCC CGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTA TGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGCGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGC GCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCT CAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTC GTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCTTGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTG GGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAA GTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCG GTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGA ATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAA GGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGA TTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGA TATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGG TCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCA GAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGT CGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATC GCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTA CACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTAT ACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAA ACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCT GAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGA GTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCAT GTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAG GAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATC TTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCAC TGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATA CTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAATTCA CTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTTGAC TAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCAATT GATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTTTAA GCTGATTCTTTAAGAACTATGATTGTGGCTTATATTCGCAAAGTTGGTTGTAAGTCAATA GGGTTTTTAGTCCAGTTCCTTTGTAGCACTCTTTGTTTTTTATCTGCTTG



consensusID : consensus_9802#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 1747
fasta sequence
                              [TAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTCCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGG]

[+] EMBL AK106549             [TAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTCCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGG]


>consensus_9802#1 TAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCA CCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGT CTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTT CCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGA CTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCT CGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTC ACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGAT CGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCC CCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATT GGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCT CAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACA CGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAA TCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTG CCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTT TGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCT GTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTCCATGATAATGATGACTATGA CAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAG GTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACA GACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGA CCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTC ATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACC ATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAG GAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTC AATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCAT TCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCT CGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCA CACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCC ACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGT TTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAG TTCACGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9802#0      CTCCTTCCCCATCTCAGACTCAGATCGATCTAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCG 60
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      CCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTC 120
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      CTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCACGGC 180
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      GGCCGCGTTTGTCGGCCTCGACTCCTTCCTCGCGGCGGCGGCCGCCCGCGACCCCTCCGC 240
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      CGGCAACGACACCTTCGGCGCCCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCAGCTCTCGACCCCGTC 300
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      CCCGCTCCTCCCCACCCGCCTCCTCTCCCTCTCCGCGCAGGTCCCCGTCACCGTCCGCCT 360
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      CGCCGGCGCCTCCTTCCCGCCCGCCACCGGCCGCCTCCTCGAGTCCT-TCGTCAACTCCG 419
consensus_9802#1      ---------------------------TAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCG 33
                                                     * * **   **  **   ** *  * ***

consensus_9802#0      CCGTCTCCTCCTCGCGCTTCCTCTCCAGCCGCCGCCCGCACCGCCTCGCGCTC--TCCCA 477
consensus_9802#1      CCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTT 93
                      *** *  ** * * *     *    ** * **  ** **   * **** ** *  ***  

consensus_9802#0      CAAGATCCACCTCGAGGTCGCCGCCTCCTCCTCCCAGCTCGCGCCCCGCGCCGCCGCCGC 537
consensus_9802#1      CCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCC---------GCCGC 144
                      *    *** ** *    **  *  *  *******  **** *****         *****

consensus_9802#0      CGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGT 597
consensus_9802#1      CGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGT 204
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGG 657
consensus_9802#1      CCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGG 264
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGC 717
consensus_9802#1      CTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGC 324
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGC 777
consensus_9802#1      CTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGC 384
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGA 837
consensus_9802#1      CCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGA 444
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGCGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGC 897
consensus_9802#1      CTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGC 504
                      ***************************** ******************************

consensus_9802#0      CGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGT 957
consensus_9802#1      CGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGT 564
                      ************************************************************

consensus_9802#0      GCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAG 1017
consensus_9802#1      GCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAG 624
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCTTGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGA 1077
consensus_9802#1      CTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGA 684
                      ***************************** ******************************

consensus_9802#0      TTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTT 1137
consensus_9802#1      TTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTT 744
                      ************************************************************

consensus_9802#0      GAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGC 1197
consensus_9802#1      GAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGC 804
                      ************************************************************

consensus_9802#0      GCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAG 1257
consensus_9802#1      GCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAG 864
                      ************************************************************

consensus_9802#0      TGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCA 1317
consensus_9802#1      TGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCA 924
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTT 1377
consensus_9802#1      CAAGGTGGCTGGTGTCCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTT 984
                      *************** ********************************************

consensus_9802#0      TGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCG 1437
consensus_9802#1      TGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCG 1044
                      ************************************************************

consensus_9802#0      TGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAA 1497
consensus_9802#1      TGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAA 1104
                      ************************************************************

consensus_9802#0      TGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCT 1557
consensus_9802#1      TGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCT 1164
                      ************************************************************

consensus_9802#0      GCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTAC 1617
consensus_9802#1      GCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTAC 1224
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAA 1677
consensus_9802#1      CGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAA 1284
                      ************************************************************

consensus_9802#0      ATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAA 1737
consensus_9802#1      ATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAA 1344
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAG 1797
consensus_9802#1      CTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAG 1404
                      ************************************************************

consensus_9802#0      TATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTA 1857
consensus_9802#1      TATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTA 1464
                      ************************************************************

consensus_9802#0      TAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTT 1917
consensus_9802#1      TAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTT 1524
                      ************************************************************

consensus_9802#0      TCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCA 1977
consensus_9802#1      TCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCA 1584
                      ************************************************************

consensus_9802#0      GGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTC 2037
consensus_9802#1      GGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTC 1644
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTT 2097
consensus_9802#1      CATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTT 1704
                      ************************************************************

consensus_9802#0      CAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTC 2157
consensus_9802#1      CAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGG----------------- 1747
                      *******************************************                 

consensus_9802#0      ATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGT 2217
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      CACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGAT 2277
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      ATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAAT 2337
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      TCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTT 2397
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      GACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCA 2457
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      ATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTT 2517
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      TAAGCTGATTCTTTAAGAACTATGATTGTGGCTTATATTCGCAAAGTTGGTTGTAAGTCA 2577
consensus_9802#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9802#0      ATAGGGTTTTTAGTCCAGTTCCTTTGTAGCACTCTTTGTTTTTTATCTGCTTG 2630
consensus_9802#1      -----------------------------------------------------
                                                                           




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)