These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9802#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 2630 fasta sequence [CTCCTTCCCCATCTCAGACTCAGATCGATCTAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCACGGCGGCCGCGTTTGTCGGCCTCGACTCCTTCCTCGCGGCGGCGGCCGCCCGCGACCCCTCCGCCGGCAACGACACCTTCGGCGCCCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCAGCTCTCGACCCCGTCCCCGCTCCTCCCCACCCGCCTCCTCTCCCTCTCCGCGCAGGTCCCCGTCACCGTCCGCCTCGCCGGCGCCTCCTTCCCGCCCGCCACCGGCCGCCTCCTCGAGTCCTTCGTCAACTCCGCCGTCTCCTCCTCGCGCTTCCTCTCCAGCCGCCGCCCGCACCGCCTCGCGCTCTCCCACAAGATCCACCTCGAGGTCGCCGCCTCCTCCTCCCAGCTCGCGCCCCGCGCCGCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGCGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCTTGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAATTCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTTGACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCAATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTTTAAGCTGATTCTTTAAGAACTATGATTGTGGCTTATATTCGCAAAGTTGGTTGTAAGTCAATAGGGTTTTTAGTCCAGTTCCTTTGTAGCACTCTTTGTTTTTTATCTGCTTG] [+] EMBL AK073844 [CTCCTTCCCCATCTCAGACTCAGATCGATCTAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCACGGCGGCCGCGTTTGTCGGCCTCGACTCCTTCCTCGCGGCGGCGGCCGCCCGCGACCCCTCCGCCGGCAACGACACCTTCGGCGCCCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCAGCTCTCGACCCCGTCCCCGCTCCTCCCCACCCGCCTCCTCTCCCTCTCCGCGCAGGTCCCCGTCACCGTCCGCCTCGCCGGCGCCTCCTTCCCGCCCGCCACCGGCCGCCTCCTCGAGTCCTTCGTCAACTCCGCCGTCTCCTCCTCGCGCTTCCTCTCCAGCCGCCGCCCGCACCGCCTCGCGCTCTCCCACAAGATCCACCTCGAGGTCGCCGCCTCCTCCTCCCAGCTCGCGCCCCGCGCCGCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGCGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCTTGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAGGTTGCATGTGCCCAATTCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTTGACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCAATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTTTAAGCTGATTC ] [+] EMBL AK068592 [ CTAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCACGGCGGCCGCGTTTGTCGGCCTCGACTCCTTCCTCGCGGCGGCGGCCGCCCGCGACCCCTCCGCCGGCAACGACACCTTCGGCGCCCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCAGCTCTCGACCCCGTCCCCGCTCCTCCCCACCCGCCTCCTCTCCCTCTCCGCGCAGGTCCCCGTCACCGTCCGCCTCGCCGGCGCCTCCTTCCCGCCCGCCACCGGCCGCCTCCTCGAGTCCTTCGTCAACTCCGCCGTCTCCTCCTCGCGCTTCCTCTCCAGCCGCCGCCCGCACCGCCTCGCGCTCTCCCACAAGATCCACCTCGAGGTCGCCGCCTCCTCCTCCCAGCTCGCGCCCCGCGCCGCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAATTCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTTGACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCAATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTTTAAGCTGATTCTTTAAGAACTATGATTGTGGCTTATATTCGCAAAGTTGGTTGTAAGTCAATAGGGTTTTTAGTCCAGTTCCTTTGTAGCACTCTTTGTTTTTTATCTGCTTG] [+] EMBL CA999579 [ GTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCACGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTACCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTT ] [-] EMBL CB631148 [ TGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAATTCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTTGACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCAATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTTTAAGCTGATTCT ] [+] EMBL BM420556 [ CAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGC AAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTCATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGTCACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGATATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCC ATTCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTNGACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATCCTGTGCTCAATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTC ATTTTTCTAAAC AT CCCTTCCAGGATATTTTAA CTGATTC TTAAGAAaaa ] consensusID : consensus_9802#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 1747 fasta sequence [TAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTCCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGG] [+] EMBL AK106549 [TAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGTCCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGGCTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGCCTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGCCCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGACTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGCCGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGTGCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAGCTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGATTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTTGAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGCGCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAGTGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCACAAGGTGGCTGGTGTCCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTTTGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCGTGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAATGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCTGCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTACCGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAAATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAACTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAGTATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTATAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTTTCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCAGGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTCCATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTTCAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGG] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_9802#0 CTCCTTCCCCATCTCAGACTCAGATCGATCTAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCG 60 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 CCGCCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTC 120 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 CTTCCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCCGCCGCCACGGC 180 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 GGCCGCGTTTGTCGGCCTCGACTCCTTCCTCGCGGCGGCGGCCGCCCGCGACCCCTCCGC 240 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 CGGCAACGACACCTTCGGCGCCCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCAGCTCTCGACCCCGTC 300 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 CCCGCTCCTCCCCACCCGCCTCCTCTCCCTCTCCGCGCAGGTCCCCGTCACCGTCCGCCT 360 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 CGCCGGCGCCTCCTTCCCGCCCGCCACCGGCCGCCTCCTCGAGTCCT-TCGTCAACTCCG 419 consensus_9802#1 ---------------------------TAAACTCTTCACTGAACCCAGCCGCCGCCGCCG 33 * * ** ** ** ** * * *** consensus_9802#0 CCGTCTCCTCCTCGCGCTTCCTCTCCAGCCGCCGCCCGCACCGCCTCGCGCTC--TCCCA 477 consensus_9802#1 CCGCCGGCTGCCCCCCTCCGCCGCTCACCGGCGACCAGCCATGGCTCGAGCCCCTTCCTT 93 *** * ** * * * * ** * ** ** ** * **** ** * *** consensus_9802#0 CAAGATCCACCTCGAGGTCGCCGCCTCCTCCTCCCAGCTCGCGCCCCGCGCCGCCGCCGC 537 consensus_9802#1 CCTCCTCCTCCCCTTACTCCTCCTCGTCTCCTCCTCGCTCACGCCC---------GCCGC 144 * *** ** * ** * * ******* **** ***** ***** consensus_9802#0 CGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGT 597 consensus_9802#1 CGTCCGCGCGCACCTCGACTCCTCCGCGGCGCCGTTCCACGCCGCCGCGCTCTCCTCCGT 204 ************************************************************ consensus_9802#0 CCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGG 657 consensus_9802#1 CCCTTACTCCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCGAGGACTACCGCGCGCTCGTCGACACCGG 264 ************************************************************ consensus_9802#0 CTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGC 717 consensus_9802#1 CTCCGCCCCGTCGGTGTACATCTACCTGCTCAACCTCGGCCCGCAGCCGCGGCCGTACGC 324 ************************************************************ consensus_9802#0 CTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGC 777 consensus_9802#1 CTACACCGCGGCATCGTCGCCGGCCGATGCGCATTCACCTGGCTTCTCCCGCTGCCTCGC 384 ************************************************************ consensus_9802#0 CCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGA 837 consensus_9802#1 CCCCGTCTGGGCTGGCAAGGAGCGGTACATTTGGATCGACCTGGGTGCAGGGCCGGTGGA 444 ************************************************************ consensus_9802#0 CTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGCGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGC 897 consensus_9802#1 CTATGGCCCTGCGCTCTCCGGTGAAGGCGTGCTCCCCCGTGGCGAGTTCCACCCTCTCGC 504 ***************************** ****************************** consensus_9802#0 CGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGT 957 consensus_9802#1 CGCGCTCCACGGCCGGCCGAGGTCGGAGAAGGCATTGGTTGCTGATCTTGCTTCGCTGGT 564 ************************************************************ consensus_9802#0 GCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAG 1017 consensus_9802#1 GCTCAGTGCTTACAAGTCATTGCTAGTGCCTTCGCTCAGAATTCCAGTGCATTACGAGAG 624 ************************************************************ consensus_9802#0 CTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCTTGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGA 1077 consensus_9802#1 CTCGTTGCTGGTTCAGGTCTTTCACATCCATGGACACGAGAGGGATACGTCCGGGCTTGA 684 ***************************** ****************************** consensus_9802#0 TTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTT 1137 consensus_9802#1 TTGGGGTTCGATCGAACAGTCGATTCGTGATGGGAATCTGGCATATGAAGGGCAGAGGTT 744 ************************************************************ consensus_9802#0 GAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGC 1197 consensus_9802#1 GAAGTTTGATTTGAACAGGATCAGGTTCTCTGACTGCCCAATTTGCTCGTTTGCGGTTGC 804 ************************************************************ consensus_9802#0 GCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAG 1257 consensus_9802#1 GCGGTCGACAACCTCGTTTACGTCCAGGTTCTTGTTTGATAATTACACGCTGATTGTGAG 864 ************************************************************ consensus_9802#0 TGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCA 1317 consensus_9802#1 TGAATACTTGGACTCCAAGCGGATGAGGCAGGTGCTGTCTGACTCGTTGGAAGAGTTGCA 924 ************************************************************ consensus_9802#0 CAAGGTGGCTGGTGTTCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTT 1377 consensus_9802#1 CAAGGTGGCTGGTGTCCATGATAATGATGACTATGACAAGGTTGTGCCAGTTTTTGTGTT 984 *************** ******************************************** consensus_9802#0 TGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCG 1437 consensus_9802#1 TGATTTAGATTATGATAAGCTTCTGTTGCTAGATAGGTATCACCAGGCAGTGGCTTTTCG 1044 ************************************************************ consensus_9802#0 TGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAA 1497 consensus_9802#1 TGATATGGTGATTTCTGTGAGGACAAGGAGCTCACAGACGGTCAGCGACTACAGCTGTAA 1104 ************************************************************ consensus_9802#0 TGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCT 1557 consensus_9802#1 TGGTCGACATGTGATTACAATGACTAGGAATCTTGACCGGCCGATCATCGCTTCAGTTCT 1164 ************************************************************ consensus_9802#0 GCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTAC 1617 consensus_9802#1 GCAGAGCATGTGGGGTGTGTCACCGACACACCAGTCATGGAGCCCTGAGCACAATGCTAC 1224 ************************************************************ consensus_9802#0 CGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAA 1677 consensus_9802#1 CGTCGTTGACTACACTTGGAGCACTGGACATACACCATTTGGCCCATTCTCAGAGACCAA 1284 ************************************************************ consensus_9802#0 ATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAA 1737 consensus_9802#1 ATCGCTTTCTTTTGTGCAGAAAGATGCAGCCCGTAGGAATGTTCTTCTAACCACTCTGAA 1344 ************************************************************ consensus_9802#0 CTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAG 1797 consensus_9802#1 CTACACAATCACAAGCGCTATTGATGTTTTGGAGTCAATGGCTGCGCATGGTGGAGAGAG 1404 ************************************************************ consensus_9802#0 TATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTA 1857 consensus_9802#1 TATACTCCTTAGAAGGAAAAGGCGTGTTGAATTCATTCAAAGATGGAATCTGCTCACTTA 1464 ************************************************************ consensus_9802#0 TAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTT 1917 consensus_9802#1 TAAACTGGAGAAGGTGGTCTCAGCCATGTCCCGCCTCGACTACAATAAAGCGATGTACTT 1524 ************************************************************ consensus_9802#0 TCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCA 1977 consensus_9802#1 TCTGAGATCGTCAGATCATGATCTGTTTGCCGTCCACACTTTGGTGTATCAGGCGTCTCA 1584 ************************************************************ consensus_9802#0 GGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTC 2037 consensus_9802#1 GGAGTTGGAGGCTTCTCTGGTTTGCTTCAAAGATCCACCATTTCCCTGGTTGTCAGTTTC 1644 ************************************************************ consensus_9802#0 CATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTT 2097 consensus_9802#1 CATGTCTGGAATTTTCGTTTTTGGTTTCTTTTATGTTTACTCGAAGAGAGATAAATTGTT 1704 ************************************************************ consensus_9802#0 CAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGGATACTGTTTGAATGCTC 2157 consensus_9802#1 CAGGAGCAAAAGGAAACAGTTTTGACTGCACTTCAGTTCACGG----------------- 1747 ******************************************* consensus_9802#0 ATCTTGATACCATAGTCAGGATTCAGAAAAGTTGCATCCTTGCATAATACATGGAGATGT 2217 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 CACTGGATGCATGAAACGGGTGCATCTTGTTTTAAACAGATGAATTCACTTGTACGAGAT 2277 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 ATACTGGATTTCCTTAGGAAGCACTACTTCCACTAGTTTTGTAAGTTGCATGTGCCCAAT 2337 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 TCACTCGGTACATACTGTTGATCTAGATTCTGGAGACATGCATATATGTTTTCTATTCTT 2397 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 GACTAGCTTAATTACTGTCATACTTGCTGGGTGCATAACCTATGTGGGATGCTGTGCTCA 2457 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 ATTGATCATGTGTAATTTCGAGATGTCAATTTTTCTAAACAATGCCTTTGCAGGATATTT 2517 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 TAAGCTGATTCTTTAAGAACTATGATTGTGGCTTATATTCGCAAAGTTGGTTGTAAGTCA 2577 consensus_9802#1 ------------------------------------------------------------ consensus_9802#0 ATAGGGTTTTTAGTCCAGTTCCTTTGTAGCACTCTTTGTTTTTTATCTGCTTG 2630 consensus_9802#1 ----------------------------------------------------- |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||