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Oryza sativa
cluster # 9814 cluster # 9814       Sequences # 6       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9814#0 length = 1527 sequences # 4  
consensus_9814#1 length = 768 sequences # 1  
consensus_9814#2 length = 729 sequences # 1  

consensusID : consensus_9814#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1527
fasta sequence
                              [TAACCTTTCCTAATAACTAGGTATGCTTGATTGTAATTTATTATGGGTAATTCTACAGTATCATTTAAGTCAAGTTCATGTGTCTGCATGTCTACATGTTATTCATTGCAAAATGATCTTCAAGTCATGAATTTAGTGGCGTGCGTGATTGGTTATATTGTTTGAAGCTATGATGTCTGGCAGTCAGGCAAGGTTCTCATTACATGTGTCTTGGAAGTTGAAACTAGATTCCATGGTTACATCTTAACTTTCATACCATGCCACATGAAGCTTGCCATTACCTAATTCAATTATCACATCATTTATATCTCAGGATCAAAACTGCATTTTAACAGAACTTGATTATGATCTTTCAGCATTCTCTAATTTACATTTAGTATACCATGGCAGAATAATATATTTGTTCAAGTTTTAGATAGTTGTATTGCTAGAGAATTGTTGGGAGTTGCTTGGTTGGACTCCTGCAGGTACAATTGTTCAGATTGGATATGCAAATTTGATGGAAGGAAAATTCATCTAAACCTTTTTGAAAACTTCTGGCGTGGGAACTGAATTCTTCTTTAAGGAAGATACAACCTTTCTAAGGGAAGATTCACATCTGAATAAAAAACATGTTACGTGACATGTTATAAATACATGTGTTACTGGAAGGAATTTCTTGTGAATTTATGTGGCTATCTCAAATGATCGGAGGGATGCTGTGTGTCGTCATGTAAATTGGTAGTTTCTTACCTACATTTCAAGTGTTTAGTAGCAGAGCACACTCCATGTGATTCAAATTATACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGTAGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAAAAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGTTGGAATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGCTTTCAGGGGTTTGTAGCTCTTTGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAGGATTTTACAATAGTTGAAGCAGTAAACCAGAACAAACTGACTAGGGGATATTTTTGCAAGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGCTGATCGATAGCCATTTTACTTATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGA-CGGTTCAAACA-AACGCCATCTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGA-CTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCG-CCTTGTGTATTA-CA-AGAATTCACATTTCTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAAACAATTAATAACTAATGACCTAAATTGATTGACCTGCTTTGAAGTAAAAAAAAAATATAAGGA]

[+] EMBL CB622618             [TAACCTTTCCTAATAACTAGGTATGCTTGATTGTAATTTATTATGGGTAATTCTACAGTATCATTTAAGTCAAGTTCATGTGTCTGCATGTCTACATGTTATTCATTGCAAAATGATCTTCAAGTCATGAATTTAGTGGCGTGCGTGATTGGTTATATTGTTTGAAGCTATGATGTCTGGCAGTCAGGCAAGGTTCTCATTACATGTGTCTTGGAAGTTGAAACTAGATTCCATGGTTACATCTTAACTTTCATACCATGCCACATGAAGCTTGCCATTACCTAATTCAATTATCACATCATTTATATCTCAGGATCAAAACTGCATTTTAACAGAACTTGATTATGATCTTTCAGCATTCTCTAATTTACATTTAGTATACCATGGCAGAATAATATATTTGTTCAAGTTTTAGATAGTTGTATTGCTAGAGAATTGTTGGGAGTTGCTTGGTTGGACTCCTGCAGGTACAATTGTTCAGATTGGATATGCAAATTTGATGGAAGGAAAATTCATCTAAACCTTTTTGAAAACTTCTGGCGTGGGAACTGAATTCTTCTTTAAGGAAGATACAACCTTTCTAAGGGAAGATTCACATCTGAATAAAAAACATGTTACGTGACATGTTATAAATACATGTGTTACTGGAAGGAATTTCTTGTGAATTTATGTGGCTATCTCAAATGATCGGAGGGATGCTGTGTGTCGTCATGTAAATTGGTAGTTTCTTACCTACATTTCAAGTGTTTAGTAGCAGAGCACACTCCATGTGATTCAAATTATACACATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CB633721             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTAGTAGCAGAGCACACTCCATGTGATTCAAATTAAACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGTAGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAAAAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGTTGGAATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGCTTTCAGGGGTTTGTAGCTCTTTGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAGGATTTTACAATAGTTGAAGCAGTAAACCAGAACAAACTGACTAGGGGATATTTTTGCAAGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGCTGATCGATAGCCATTTTACTTATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGA CGGTTCAAACA AACGCCATCTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGA CTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCG CCTTGTGTATTA CA AGAATTCACATTTCTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAAACAATTAATAACTAATGACCGAAATTGATTGACCTGCTTTGAAGTAAAAAAAAAATATAAGGA]
[-] EMBL CB631454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGTAGTTTTTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAAAAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTTTTAGTTGGAATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGCTTTCAGGGGTTTGTAGCTCTTTGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAGGATTTTCCAATAGTTGAAGCAGTAAACCAGAACAAACTGACTAGGGGATATTTTTGCAAGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGCTGATCGATAGCCATTTTACTTATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGA CGGTTCAAACA AACGCCATTTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGA CTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATAAGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACAAATTTGGGAATGTTCCTTTTTTCGTCTTTCC CCTTGTGTATTA CA AGAATTCACATTTTTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTCCAAACAATTAATAACTAATGCCCTAAATGGATTGCCCTG                           ]
[+] EMBL BQ906961             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccGGTTGAAAATGGACCGGTTCAAACACAACGCCATCTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGANCTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACCAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCCTTGTGTATTACCACAGAATTCACATTTCTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAAACCATTAATAACTAATGACCTAAATTGATTGACCNGCTTTGAA  AAAAAAAA          ]


>consensus_9814#0 TAACCTTTCCTAATAACTAGGTATGCTTGATTGTAATTTATTATGGGTAATTCTACAGTA TCATTTAAGTCAAGTTCATGTGTCTGCATGTCTACATGTTATTCATTGCAAAATGATCTT CAAGTCATGAATTTAGTGGCGTGCGTGATTGGTTATATTGTTTGAAGCTATGATGTCTGG CAGTCAGGCAAGGTTCTCATTACATGTGTCTTGGAAGTTGAAACTAGATTCCATGGTTAC ATCTTAACTTTCATACCATGCCACATGAAGCTTGCCATTACCTAATTCAATTATCACATC ATTTATATCTCAGGATCAAAACTGCATTTTAACAGAACTTGATTATGATCTTTCAGCATT CTCTAATTTACATTTAGTATACCATGGCAGAATAATATATTTGTTCAAGTTTTAGATAGT TGTATTGCTAGAGAATTGTTGGGAGTTGCTTGGTTGGACTCCTGCAGGTACAATTGTTCA GATTGGATATGCAAATTTGATGGAAGGAAAATTCATCTAAACCTTTTTGAAAACTTCTGG CGTGGGAACTGAATTCTTCTTTAAGGAAGATACAACCTTTCTAAGGGAAGATTCACATCT GAATAAAAAACATGTTACGTGACATGTTATAAATACATGTGTTACTGGAAGGAATTTCTT GTGAATTTATGTGGCTATCTCAAATGATCGGAGGGATGCTGTGTGTCGTCATGTAAATTG GTAGTTTCTTACCTACATTTCAAGTGTTTAGTAGCAGAGCACACTCCATGTGATTCAAAT TATACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGT AGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAA AAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGTTGG AATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGCTTTCAGGGGTTTGTAGCTCTTT GCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAGG ATTTTACAATAGTTGAAGCAGTAAACCAGAACAAACTGACTAGGGGATATTTTTGCAAGC TATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGCTGATCGATAGCCATTTTACTTAT GTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAA TTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATCTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGA CTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACAAATT TGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGAATTCACATTTCTAATT GTTATATGTTATTTAACTGTACAAACAATTAATAACTAATGACCTAAATTGATTGACCTG CTTTGAAGTAAAAAAAAAATATAAGGA



consensusID : consensus_9814#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 768
fasta sequence
                              [GCCTAATTTTTGTGATTGGCAAATACCGCTGCCATAAAACCAATTTGATATACACCATACTGCATACAGGTAAATGTTAAAGGCTTTCTTCACCAATTTAGTTTCCTCTTCTTAACTTTGAGATTTACTAAGGAATAATACATTATCTCCTCCTGACCAGTAATACATTTAGACCCCCTAAGGAATACTAATTTATCTCTTTAGGGGCATTGACGTGTTCTGTTTTTCAAGTTCACTTTCAAAAAAAAAACTTATGCTTTTGTTGGCATTTTTTTTCATTATGCAGATGGTAAAATATGTTTTATAAATATGCTTGCAGTTTTACACGAATTGTCATATTACTGAAAAGCTGGCATTTCGAATTGCAGGTTCTATACAATTGGAAGTTTGGAACAGTGCTTCCAAACAATGTTTATTCCCCAGATCTTTAGTTTTCAGCAGCAAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATTTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTTTTCAATAAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGAATTCACATTTTTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTCCAAACAATTAATAACTAATGCCCTAAAGGGATTGACCTGCTTTGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGA]

[-] EMBL CB624148             [GCCTAATTTTTGTGATTGGCAAATACCGCTGCCATAAAACCAATTTGATATACACCATACTGCATACAGGTAAATGTTAAAGGCTTTCTTCACCAATTTAGTTTCCTCTTCTTAACTTTGAGATTTACTAAGGAATAATACATTATCTCCTCCTGACCAGTAATACATTTAGACCCCCTAAGGAATACTAATTTATCTCTTTAGGGGCATTGACGTGTTCTGTTTTTCAAGTTCACTTTCAAAAAAAAAACTTATGCTTTTGTTGGCATTTTTTTTCATTATGCAGATGGTAAAATATGTTTTATAAATATGCTTGCAGTTTTACACGAATTGTCATATTACTGAAAAGCTGGCATTTCGAATTGCAGGTTCTATACAATTGGAAGTTTGGAACAGTGCTTCCAAACAATGTTTATTCCCCAGATCTTTAGTTTTCAGCAGCAAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATTTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTTTTCAATAAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGAATTCACATTTTTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTCCAAACAATTAATAACTAATGCCCTAAAGGGATTGACCTGCTTTGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGA]


>consensus_9814#1 GCCTAATTTTTGTGATTGGCAAATACCGCTGCCATAAAACCAATTTGATATACACCATAC TGCATACAGGTAAATGTTAAAGGCTTTCTTCACCAATTTAGTTTCCTCTTCTTAACTTTG AGATTTACTAAGGAATAATACATTATCTCCTCCTGACCAGTAATACATTTAGACCCCCTA AGGAATACTAATTTATCTCTTTAGGGGCATTGACGTGTTCTGTTTTTCAAGTTCACTTTC AAAAAAAAAACTTATGCTTTTGTTGGCATTTTTTTTCATTATGCAGATGGTAAAATATGT TTTATAAATATGCTTGCAGTTTTACACGAATTGTCATATTACTGAAAAGCTGGCATTTCG AATTGCAGGTTCTATACAATTGGAAGTTTGGAACAGTGCTTCCAAACAATGTTTATTCCC CAGATCTTTAGTTTTCAGCAGCAAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAA GGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATTTACTTTACAT GGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTTTTCAATA AGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGAA TTCACATTTTTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTCCAAACAATTAATAACTAATGCCCT AAAGGGATTGACCTGCTTTGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGA



consensusID : consensus_9814#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 729
fasta sequence
                              [AATTAAACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGTAGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAAAAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGTTGGAATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGCTTTCAGGGGTTTGTAGCTCTTTGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAGGATTTTACAATAGTTGAAGCAGTAAACCAGAACAAACTGACTAGGGGATATTTTTGCAAGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGCTGATCGATAGCCATTTTACTTATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATCTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGAATTCACATTTCTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAGGCAATTAATAACTAATGACCTAAATTGATGGAATTAAAAGGG]

[-] EMBL CB622619             [AATTAAACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGTAGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAAAAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGTTGGAATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGCTTTCAGGGGTTTGTAGCTCTTTGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAGGATTTTACAATAGTTGAAGCAGTAAACCAGAACAAACTGACTAGGGGATATTTTTGCAAGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGCTGATCGATAGCCATTTTACTTATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATCTACTTTACATGGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGAATTCACATTTCTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAGGCAATTAATAACTAATGACCTAAATTGATGGAATTAAAAGGG]


>consensus_9814#2 AATTAAACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCA TGTAGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATG TAAAAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGT TGGAATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGCTTTCAGGGGTTTGTAGCTC TTTGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAA AGGATTTTACAATAGTTGAAGCAGTAAACCAGAACAAACTGACTAGGGGATATTTTTGCA AGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGCTGATCGATAGCCATTTTACT TATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAAAGGACATCACTAC AAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATCTACTTTACATGGTTTAGCGTCA GGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAATAAGTTTAGCACAA ATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGAATTCACATTTCTA ATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAGGCAATTAATAACTAATGACCTAAATTGATGGAA TTAAAAGGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9814#0      TAACCTTTCCTAATAACTAGGTATGCTTGATTGTAATTTATTATGGGTAATTCTACAGTA 60
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      TCATTTAAGTCAAGTTCATGTGTCTGCATGTCTACATGTTATTCATTGCAAAATGATCTT 120
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      CAAGTCATGAATTTAGTGGCGTGCGTGATTGGTTATATTGTTTGAAGCTATGATGTCTGG 180
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      CAGTCAGGCAAGGTTCTCATTACATGTGTCTTGGAAGTTGAAACTAGATTCCATGGTTAC 240
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      ATCTTAACTTTCATACCATGCCACATGAAGCTTGCCATTACCTAATTCAATTATCACATC 300
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      ATTTATATCTCAGGATCAAAACTGCATTTTAACAGAACTTGATTATGATCTTTCAGCATT 360
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      CTCTAATTTACATTTAGTATACCATGGCAGAATAATATATTTGTTCAAGTTTTAGATAGT 420
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      TGTATTGCTAGAGAATTGTTGGGAGTTGCTTGGTTGGACTCCTGCAGGTACAATTGTTCA 480
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      GATTGGATATGCAAATTTGATGGAAGGAAAATTCATCTAAACCTTTTTGAAAACTTCTGG 540
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      CGTGGGAACTGAATTCTTCTTTAAGGAAGATACAACCTTTCTAAGGGAAGATTCACATCT 600
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      GAATAAAAAACATGTTACGTGACATGTTATAAATACATGTGTTACTGGAAGGAATTTCTT 660
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      GTGAATTTATGTGGCTATCTCAAATGATCGGAGGGATGCTGTGTGTCGTCATGTAAATTG 720
consensus_9814#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9814#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9814#0      GTAGTTTCTTACCTACATTTCAAGTGTTTAGTAGCAGAGCACACTCCATGTGATTCAAAT 780
consensus_9814#2      ---------------------------------------------------------AAT 3
consensus_9814#1      -------------------------------------------GCCTAATTTTTGTGATT 17
                                                                               * *

consensus_9814#0      TATACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGT 840
consensus_9814#2      TAAACACATTGTTGCATGCATGTCCAGTTGTTGACGCAGAGCATTTTAACACAAGCATGT 63
consensus_9814#1      GGCAAATACCGCTGC-CATAAAACCAAT--TTGATATA---CACCATACTGCATACAGGT 71
                         * * *  * ***    *   *** *  ****   *   **   **   **  ** **

consensus_9814#0      AGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAA 900
consensus_9814#2      AGTTTCTAAGGGTGCTCTAGAGAAAAAAAATACATTGCTCTTGTTTCAAGGAGCATGTAA 123
consensus_9814#1      AAATGTTAAAGGCTTTCTTCACCAATTTAGTTTCCTCTTCTTAACTTTGAGATTTACTAA 131
                      *  *  *** **   ***  *  **   * *    *  ****   *    **     ***

consensus_9814#0      AAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGTTGG 960
consensus_9814#2      AAATCTTTTAATCATGGTGAGAGGCTGATGGATAGTCATGCACAAATATTTCTTAGTTGG 183
consensus_9814#1      GGAATAATACATTATCTC------CTCCTGACCAGTAATACATTTAGACCCCCTAA--GG 183
                        *    *  ** **         **  **   *** ** **   * *   * **   **

consensus_9814#0      AATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGC-TTTCAGGGGTTTGTAGCTCTT 1019
consensus_9814#2      AATTGTGTGATATCAGACTTTTCATATTCATGCATGGC-TTTCAGGGGTTTGTAGCTCTT 242
consensus_9814#1      AATACTAATTTATCTCTTTAGGGGCATTGACGTGTTCTGTTTTTCAAGTTCAC----TTT 239
                      ***  *    ****    *      *** * *  *    ***     ***        **

consensus_9814#0      TGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAG 1079
consensus_9814#2      TGCATAGATATATGGGATTCTTCAAGATAGATTTTACAATTGGTCCTTATCTGAAAAAAG 302
consensus_9814#1      CAAAAAAAAAACTTATGCTTTTGTTGGCATTTTTTTTCATTATGCAGATGGTAAAATATG 299
                         * * * *  *     * **   *  *  ****   ***   *      * *** * *

consensus_9814#0      GATTTTACA-ATAGTTGAAGCAGTAAACCAG-----AACAAACTGACTAGGGGATATTT- 1132
consensus_9814#2      GATTTTACA-ATAGTTGAAGCAGTAAACCAG-----AACAAACTGACTAGGGGATATTT- 355
consensus_9814#1      TTTTATAAATATGCTTGCAGTTTTACACGAATTGTCATATTACTGAAAAGCTGGCATTTC 359
                        ** ** * **  *** **   ** ** *      *    *****  **  *  **** 

consensus_9814#0      ---TTGCAAGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGC--TGATCGATAG 1187
consensus_9814#2      ---TTGCAAGCTATTTAAGAAGGAATATGTGGAAATATAATGTTTTGC--TGATCGATAG 410
consensus_9814#1      GAATTGCAGGTTCTATACAATTGGAAGTTTGGAACAGTGCTTCCAAACAATGTTTATTCC 419
                         ***** * * * **  *  * *  * *****   *  *      *  ** *   *  

consensus_9814#0      CCA---TTTTACTTATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAA 1244
consensus_9814#2      CCA---TTTTACTTATGTTTTGTCAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAA 467
consensus_9814#1      CCAGATCTTTAGTTTTCAGCAGCAAGTGACATGGCTGGCCCTGCATGCACGCACCCCTAA 479
                      ***    **** ** *     *  ************************************

consensus_9814#0      AGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATCTACTTTACA 1304
consensus_9814#2      AGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATCTACTTTACA 527
consensus_9814#1      AGGACATCACTACAAATTGGTTGAAAATGGACGGTTCAAACAAACGCCATTTACTTTACA 539
                      ************************************************** *********

consensus_9814#0      TGGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAAT 1364
consensus_9814#2      TGGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTCTTCAAT 587
consensus_9814#1      TGGTTTAGCGTCAGGACTCGTAGTTTGGTTTGGTTTTGTATCTATATGTTTTTTTTCAAT 599
                      ***************************************************** ******

consensus_9814#0      AAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGA 1424
consensus_9814#2      AAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGA 647
consensus_9814#1      AAGTTTAGCACAAATTTGTGAATGTTCCTTTCTTCGTCTCTCGCCTTGTGTATTACAAGA 659
                      ************************************************************

consensus_9814#0      ATTCACATTTCTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAAACAATTAATAACTAATGACC 1484
consensus_9814#2      ATTCACATTTCTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTACAGGCAATTAATAACTAATGACC 707
consensus_9814#1      ATTCACATTTTTAATTGTTATATGTTATTTAACTGTCCAAACAATTAATAACTAATGCCC 719
                      ********** ************************* **  **************** **

consensus_9814#0      TAAATTGATTGACCTGCTTTGAAGTAAAAAAAAAATATAAGGA------ 1527
consensus_9814#2      TAAATTGATGGAATTAAAAGGG--------------------------- 729
consensus_9814#1      TAAAGGGATTGACCTGCTTTGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGA 768
                      ****  *** **  *     *                            




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)