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Oryza sativa
cluster # 9903 cluster # 9903       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9903#0 length = 1925 sequences # 7  

consensusID : consensus_9903#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1925
fasta sequence
                              [ACCGGCGGCGGAGGCGCACCACCAAAGTCCCCACGCGCCTCAAACTCCCCAACAAGAGAATGCCAGATTATCCACTCCTCCGCCTTCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCACCATGATTCGGATTACCACCCACCTCTCTCCCACCCTCAAGCCTCCTCCTCCTCTATCCCTCCACCCCCACCTCCCTCTCCTCCGCCGCCACCGCCACCCCTCCTCCAGGCCCATCTCCGTCTCCGCCGCCGCCCCGTCCGACCTCCTCGCCAGCGTCGAGTCCGTCGCCTCCGCCGCCTCCGTCCTCGCCGCCATCGTCCTCGTCCACGAGTCGGGCCACTTCCTCGCCGCCACCTCCCGCGGCATCCACGTCTCCCAGTTCTCCGTCGGCTTCGGCCCCGCCCTCGCGCGCTTCCGCCTCGGCCCCGTCGAGTACGCGCTCCGCGCCATCCCGCTCGGGGGCTACGTCGGCTTCCCCGACGACGACCCGGACTCCGGCTTCCCGCCCGACGACCCCGACCTCCTCCGCAACCGCCCCGTCCCCGACCGCCTCCTCGTCGTCTCCGCCGGCGTCGCCGCCAACCTCCTCTTCGCCTTCCTCATCGTCTACGCCCAGGCGCTCACCGTCGGCGTCCCCGTCCAGGCGCAGCTCCCCGGCGTCCTCGTCCCCGAGGTCATCCCCGGCTCCGCCGCCGCCCGCGCCGGCCTCCTCCCCGGCGATGTCATCCTCTCCGTCCCCGGCCTCGCACCGGACCCCTCCGTTCCTGTCCTCGTCGACCTCATCAAGGCAAGCCCCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA-TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA-AGCGCCGAGGGC-TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA-ATAAACTTGTTGCCA-TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC-GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA-GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT-GCAATTGGGATTCGTTTGCCCCA-TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAACTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCCCTTGTGAAGCAAAAAAATAGTTGCTTTATACTCGCCTTTTTTGGATTGCCATTTACAACCCTGTTAAAATCAAATCAGATTAAACTAACTAGTCGATTGCTATAAAATGTATCAGTTGCTATGGTATGGTCTCCTATTCTGCACGATTTTTTTACCAACAATCTCAGGTCTGAAATTTAGCTATTAAATGTTCAGTTTTGCTATACACCTGATATATGCAACAAGATAACATAACCGGTGCTCTGTGGCAATGAAACATTTACACATTAAACATTGGACATGGAATACTACGATAAGGAAGAATGTGGATC]

[+] EMBL AK072995             [ACCGGCGGCGGAGGCGCACCACCAAAGTCCCCACGCGCCTCAAACTCCCCAACAAGAGAATGCCAGATTATCCACTCCTCCGCCTTCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCACCATGATTCGGATTACCACCCACCTCTCTCCCACCCTCAAGCCTCCTCCTCCTCTATCCCTCCACCCCCACCTCCCTCTCCTCCGCCGCCACCGCCACCCCTCCTCCAGGCCCATCTCCGTCTCCGCCGCCGCCCCGTCCGACCTCCTCGCCAGCGTCGAGTCCGTCGCCTCCGCCGCCTCCGTCCTCGCCGCCATCGTCCTCGTCCACGAGTCGGGCCACTTCCTCGCCGCCACCTCCCGCGGCATCCACGTCTCCCAGTTCTCCGTCGGCTTCGGCCCCGCCCTCGCGCGCTTCCGCCTCGGCCCCGTCGAGTACGCGCTCCGCGCCATCCCGCTCGGGGGCTACGTCGGCTTCCCCGACGACGACCCGGACTCCGGCTTCCCGCCCGACGACCCCGACCTCCTCCGCAACCGCCCCGTCCCCGACCGCCTCCTCGTCGTCTCCGCCGGCGTCGCCGCCAACCTCCTCTTCGCCTTCCTCATCGTCTACGCCCAGGCGCTCACCGTCGGCGTCCCCGTCCAGGCGCAGCTCCCCGGCGTCCTCGTCCCCGAGGTCATCCCCGGCTCCGCCGCCGCCCGCGCCGGCCTCCTCCCCGGCGATGTCATCCTCTCCGTCCCCGGCCTCGCACCGGACCCCTCCGTTCCTGTCCTCGTCGACCTCATCAAGGCAAGCCCCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTTGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATACTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCAATTGGGATTCATTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAGCTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AK061586             [                                                                              TCCGCCTTCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCACCATGATTCGGATTACCACCCACCTCTCTCCCACCCTCAAGCCTCCTCCTCCTCTATCCCTCCACCCCCACCTCCCTCTCCTCCGCCGCCACCGCCACCCCTCCTCCAGGCCCATCTCCGTCTCCGCCGCCGCCCCGTCCGACCTCCTCGCCAGCGTCGAGTCCGTCGCCTCCGCCGCCTCCGTCCTCGCCGCCATCGTCCTCGTCCACGAGTCGGGCCACTTCCTCGCCGCCACCTCCCGCGGCATCCACGTCTCCCAGTTCTCCGTCGGCTTCGGCCCCGCCCTCGCGCGCTTCCGCCTCGGCCCCGTCGAGTACGCGCTCCGCGCCATCCCGCTCGGGGGCTACGTCGGCTTCCCCGACGACGACCCGGACTCCGGCTTCCCGCCCGACGACCCCGACCTCCTCCGCAACCGCCCCGTCCCCGACCGCCTCCTCGTCGTCTCCGCCGGCGTCGCCGCCAACCTCCTCTTCGCCTTCCTCATCGTCTACGCCCAGGCGCTCACCGTCGGCGTCCCCGTCCAGGCGCAGCTCCCCGGCGTCCTCGTCCCCGAGGTCATCCCCGGCTCCGCCGCCGCCCGCGCCGGCCTCCTCCCCGGCGATGTCATCCTCTCCGTCCCCGGCCTCGCACCGGACCCCTCCGTTCCTGTCCTCGTCGACCTCATCAAGGCAAGCCCCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTTGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATACTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCAATTGGGATTCATTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAGCTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AU174567             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL AU174568             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCANCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BQ907397             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGGTGCTCGACGGCCTCAGCCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCCGTTGCCATCACTTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCACAGCGCCGAGGGCGTTGTTTCAGTTT CGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCACATAAACTTGTTGCCACTTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACACGAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACCTTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCCCAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCCATTGGGATTCGTTTGCCCCACTTTGTTGGGATTGCTCTA CATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAACTCTAATGTTCCATTTAGTC CATTTCTAGATGAATGGGAACCCTGAATTGTTGAaaaaaaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BQ908156             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCCCGGTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGTCGCAATTGGGATTCGTTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCNGAANGAAACTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BF430689             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTCTACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCAATTGGGATTCGTTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAACTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCCCTTGTGAAGCAAAAAAATAGTTGCTTTATACTCGCCTTTTTTGGATTGCCATTTACAACCCTGTTAAAATCAAATCAGATTAAACTAACTAGTCGATTGCTATAAAATGTATCAGTTGCTATGGTATGGTCTCCTATTCTGCACGATTTTTTTACCAACAATCTCAGGTCTGAAATTTAGCTATTAAATGTTCAGTTTTGCTATACACCTGATATATGCAACAAGATAACATAACCGGTGCTCTGTGGCAATGAAACATTTACACATTAAACATTGGACATGGAATACTACGATAAGGAAGAATGTGGATC]


>consensus_9903#0 ACCGGCGGCGGAGGCGCACCACCAAAGTCCCCACGCGCCTCAAACTCCCCAACAAGAGAA TGCCAGATTATCCACTCCTCCGCCTTCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCACCATGATTCG GATTACCACCCACCTCTCTCCCACCCTCAAGCCTCCTCCTCCTCTATCCCTCCACCCCCA CCTCCCTCTCCTCCGCCGCCACCGCCACCCCTCCTCCAGGCCCATCTCCGTCTCCGCCGC CGCCCCGTCCGACCTCCTCGCCAGCGTCGAGTCCGTCGCCTCCGCCGCCTCCGTCCTCGC CGCCATCGTCCTCGTCCACGAGTCGGGCCACTTCCTCGCCGCCACCTCCCGCGGCATCCA CGTCTCCCAGTTCTCCGTCGGCTTCGGCCCCGCCCTCGCGCGCTTCCGCCTCGGCCCCGT CGAGTACGCGCTCCGCGCCATCCCGCTCGGGGGCTACGTCGGCTTCCCCGACGACGACCC GGACTCCGGCTTCCCGCCCGACGACCCCGACCTCCTCCGCAACCGCCCCGTCCCCGACCG CCTCCTCGTCGTCTCCGCCGGCGTCGCCGCCAACCTCCTCTTCGCCTTCCTCATCGTCTA CGCCCAGGCGCTCACCGTCGGCGTCCCCGTCCAGGCGCAGCTCCCCGGCGTCCTCGTCCC CGAGGTCATCCCCGGCTCCGCCGCCGCCCGCGCCGGCCTCCTCCCCGGCGATGTCATCCT CTCCGTCCCCGGCCTCGCACCGGACCCCTCCGTTCCTGTCCTCGTCGACCTCATCAAGGC AAGCCCCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCG GAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGG CGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGC CACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAG GCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCAT TGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCAAGCGCCGAGGGCTTGTTTCAGTTTGCGGCTGT GATAAACCTCAACCTTGCTGCAATAAACTTGTTGCCATTGCCAGCATTAGACGGTGGGAC GTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCCGTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGA ACAGAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGT CCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAA CTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTA GTAGTTGTGCAATTGGGATTCGTTTGCCCCATTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCT TCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAACTCTAATGTTGCATTTA GTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCCCTTGTG AAGCAAAAAAATAGTTGCTTTATACTCGCCTTTTTTGGATTGCCATTTACAACCCTGTTA AAATCAAATCAGATTAAACTAACTAGTCGATTGCTATAAAATGTATCAGTTGCTATGGTA TGGTCTCCTATTCTGCACGATTTTTTTACCAACAATCTCAGGTCTGAAATTTAGCTATTA AATGTTCAGTTTTGCTATACACCTGATATATGCAACAAGATAACATAACCGGTGCTCTGT GGCAATGAAACATTTACACATTAAACATTGGACATGGAATACTACGATAAGGAAGAATGT GGATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)