These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9903#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1925 fasta sequence [ACCGGCGGCGGAGGCGCACCACCAAAGTCCCCACGCGCCTCAAACTCCCCAACAAGAGAATGCCAGATTATCCACTCCTCCGCCTTCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCACCATGATTCGGATTACCACCCACCTCTCTCCCACCCTCAAGCCTCCTCCTCCTCTATCCCTCCACCCCCACCTCCCTCTCCTCCGCCGCCACCGCCACCCCTCCTCCAGGCCCATCTCCGTCTCCGCCGCCGCCCCGTCCGACCTCCTCGCCAGCGTCGAGTCCGTCGCCTCCGCCGCCTCCGTCCTCGCCGCCATCGTCCTCGTCCACGAGTCGGGCCACTTCCTCGCCGCCACCTCCCGCGGCATCCACGTCTCCCAGTTCTCCGTCGGCTTCGGCCCCGCCCTCGCGCGCTTCCGCCTCGGCCCCGTCGAGTACGCGCTCCGCGCCATCCCGCTCGGGGGCTACGTCGGCTTCCCCGACGACGACCCGGACTCCGGCTTCCCGCCCGACGACCCCGACCTCCTCCGCAACCGCCCCGTCCCCGACCGCCTCCTCGTCGTCTCCGCCGGCGTCGCCGCCAACCTCCTCTTCGCCTTCCTCATCGTCTACGCCCAGGCGCTCACCGTCGGCGTCCCCGTCCAGGCGCAGCTCCCCGGCGTCCTCGTCCCCGAGGTCATCCCCGGCTCCGCCGCCGCCCGCGCCGGCCTCCTCCCCGGCGATGTCATCCTCTCCGTCCCCGGCCTCGCACCGGACCCCTCCGTTCCTGTCCTCGTCGACCTCATCAAGGCAAGCCCCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA-TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA-AGCGCCGAGGGC-TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA-ATAAACTTGTTGCCA-TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC-GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA-GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT-GCAATTGGGATTCGTTTGCCCCA-TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAACTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCCCTTGTGAAGCAAAAAAATAGTTGCTTTATACTCGCCTTTTTTGGATTGCCATTTACAACCCTGTTAAAATCAAATCAGATTAAACTAACTAGTCGATTGCTATAAAATGTATCAGTTGCTATGGTATGGTCTCCTATTCTGCACGATTTTTTTACCAACAATCTCAGGTCTGAAATTTAGCTATTAAATGTTCAGTTTTGCTATACACCTGATATATGCAACAAGATAACATAACCGGTGCTCTGTGGCAATGAAACATTTACACATTAAACATTGGACATGGAATACTACGATAAGGAAGAATGTGGATC] [+] EMBL AK072995 [ACCGGCGGCGGAGGCGCACCACCAAAGTCCCCACGCGCCTCAAACTCCCCAACAAGAGAATGCCAGATTATCCACTCCTCCGCCTTCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCACCATGATTCGGATTACCACCCACCTCTCTCCCACCCTCAAGCCTCCTCCTCCTCTATCCCTCCACCCCCACCTCCCTCTCCTCCGCCGCCACCGCCACCCCTCCTCCAGGCCCATCTCCGTCTCCGCCGCCGCCCCGTCCGACCTCCTCGCCAGCGTCGAGTCCGTCGCCTCCGCCGCCTCCGTCCTCGCCGCCATCGTCCTCGTCCACGAGTCGGGCCACTTCCTCGCCGCCACCTCCCGCGGCATCCACGTCTCCCAGTTCTCCGTCGGCTTCGGCCCCGCCCTCGCGCGCTTCCGCCTCGGCCCCGTCGAGTACGCGCTCCGCGCCATCCCGCTCGGGGGCTACGTCGGCTTCCCCGACGACGACCCGGACTCCGGCTTCCCGCCCGACGACCCCGACCTCCTCCGCAACCGCCCCGTCCCCGACCGCCTCCTCGTCGTCTCCGCCGGCGTCGCCGCCAACCTCCTCTTCGCCTTCCTCATCGTCTACGCCCAGGCGCTCACCGTCGGCGTCCCCGTCCAGGCGCAGCTCCCCGGCGTCCTCGTCCCCGAGGTCATCCCCGGCTCCGCCGCCGCCCGCGCCGGCCTCCTCCCCGGCGATGTCATCCTCTCCGTCCCCGGCCTCGCACCGGACCCCTCCGTTCCTGTCCTCGTCGACCTCATCAAGGCAAGCCCCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTTGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATACTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCAATTGGGATTCATTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAGCTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCC ] [+] EMBL AK061586 [ TCCGCCTTCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCACCATGATTCGGATTACCACCCACCTCTCTCCCACCCTCAAGCCTCCTCCTCCTCTATCCCTCCACCCCCACCTCCCTCTCCTCCGCCGCCACCGCCACCCCTCCTCCAGGCCCATCTCCGTCTCCGCCGCCGCCCCGTCCGACCTCCTCGCCAGCGTCGAGTCCGTCGCCTCCGCCGCCTCCGTCCTCGCCGCCATCGTCCTCGTCCACGAGTCGGGCCACTTCCTCGCCGCCACCTCCCGCGGCATCCACGTCTCCCAGTTCTCCGTCGGCTTCGGCCCCGCCCTCGCGCGCTTCCGCCTCGGCCCCGTCGAGTACGCGCTCCGCGCCATCCCGCTCGGGGGCTACGTCGGCTTCCCCGACGACGACCCGGACTCCGGCTTCCCGCCCGACGACCCCGACCTCCTCCGCAACCGCCCCGTCCCCGACCGCCTCCTCGTCGTCTCCGCCGGCGTCGCCGCCAACCTCCTCTTCGCCTTCCTCATCGTCTACGCCCAGGCGCTCACCGTCGGCGTCCCCGTCCAGGCGCAGCTCCCCGGCGTCCTCGTCCCCGAGGTCATCCCCGGCTCCGCCGCCGCCCGCGCCGGCCTCCTCCCCGGCGATGTCATCCTCTCCGTCCCCGGCCTCGCACCGGACCCCTCCGTTCCTGTCCTCGTCGACCTCATCAAGGCAAGCCCCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTTGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATACTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCAATTGGGATTCATTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAGCTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCC ] [-] EMBL AU174567 [ CCAACAAGGATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCACCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCAGCATTAGACGGTGGGACG ] [-] EMBL AU174568 [ GATGTCTCCGTCACCGTCTCAAGAACAGGGCCAGGACCCGGCGACCGGAGGTCCATCGACCTCACCGTCGTGCCGGACACCAGCGTCGACGGGACCGGCCGCATTGGCGTGCAGCTCTCGCCCTACTTCCGTGTCACTCGCGTCCANCCCAACAACCTGGCCGAGGCCACCGTCCTCGCCTTGCGCGAGTTCACCGCATTGAGCGCCACGGTGCTCGACGGCCTCAGGCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCAGTTGCAATCA TTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCA AGCGCCGAGGGC TTGTTTCAGTTTGCGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCA ATAAACTTGTTGCCA TTGCCA ] [+] EMBL BQ907397 [ CGGTGCTCGACGGCCTCAGCCAGACGTTCCTCAACTTCTCGCAGACGGCGGAGAAGGTGTCTGGTCCCGTTGCCATCACTTGCGGTTGGCGCAGAGGTGGCCAGGTCACAGCGCCGAGGGCGTTGTTTCAGTTT CGGCTGTGATAAACCTCAACCTTGCTGCACATAAACTTGTTGCCACTTGCCAGCATTAGACGGTGGGACGTTGGCGTTGATCCTTCTCGAGGCGGCCC GTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACACGAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACCTTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCCCAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCCATTGGGATTCGTTTGCCCCACTTTGTTGGGATTGCTCTA CATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAACTCTAATGTTCCATTTAGTC CATTTCTAGATGAATGGGAACCCTGAATTGTTGAaaaaaaaa ] [+] EMBL BQ908156 [ GCCCGGTGGTGGGCAGAAGATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTATACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGTCGCAATTGGGATTCGTTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCNGAANGAAACTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATAa ] [+] EMBL BF430689 [ ATCCCCCGTGAAATCGAACA GAGGATCATGTCGTCAGGTCTACTGGTGGTACTCATGGTTGGCATGTTTCTGATTGTCCGCGACACGCTCAATCTCGACTTCATCAAGGACATTTTGTGATATTTGGGTGATGAAAACTTGGATCACAGTTAGTGAAGTCAAAAGTTTCAGACATTGGTTGGCCTCTGAAAAGGTTAGTAGTTGT GCAATTGGGATTCGTTTGCCCCA TTTGTTGGGATTGCTCTAGCATTCTAGCTTCTTATACTGATCATAGGTCCTTGTATTGTTATCTGAATGAAACTCTAATGTTGCATTTAGTCGCATTTCTAGATGAATGGGAACACTGAATTGTTGATATGTAAATTGCCCCCCTTGTGAAGCAAAAAAATAGTTGCTTTATACTCGCCTTTTTTGGATTGCCATTTACAACCCTGTTAAAATCAAATCAGATTAAACTAACTAGTCGATTGCTATAAAATGTATCAGTTGCTATGGTATGGTCTCCTATTCTGCACGATTTTTTTACCAACAATCTCAGGTCTGAAATTTAGCTATTAAATGTTCAGTTTTGCTATACACCTGATATATGCAACAAGATAACATAACCGGTGCTCTGTGGCAATGAAACATTTACACATTAAACATTGGACATGGAATACTACGATAAGGAAGAATGTGGATC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||