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Oryza sativa
cluster # 9945 cluster # 9945       Sequences # 7       consensus # 6


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9945#0 length = 980 sequences # 2  
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consensus_9945#4 length = 756 sequences # 1  
consensus_9945#5 length = 642 sequences # 1  

consensusID : consensus_9945#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
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fasta sequence
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>consensus_9945#0 GAACTAGTCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAATGTCATAGGTTAGGTTTTTATTCGG CCTATAAGTGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAAGTTGGCAACATCGGAACTGAA ATCACTAGACCGTTTGTGACACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTCTGCGATCCACGA AAAACCTTACCACAATTTGTATATATTCATATACTAAGAATAATCCTTTTAGATTATTCT TAGATATATATGTAGCTATTAATAATAGACAGGTGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTCATGT AGTGAAATTATGGGTAATTCCATGTAGTTAACGTCAGCCCTTGCTTTATTTGTAAAAGTT GTTTGATAAACTGATTCGCCACTATAGCGGATGATGATAATAAGGACTAAGACAAGCATC ATGGCTTATCATTGTGGGCTTAGACTTGCACATACTCCTATACCAAGAGATGCAATATTG CGAATCTACGCTAACGTCGTACAAAGAACAAAAAAAACTCGAGGGGGGCACAGTTCCCAA TTCCCTTATAGTAGCNTCTTACACCCGCTATCTGCCGCGGTGTAAACTCTAGACTGGGAT ACCAGGGTACCCACTGTATCCCGTGATAATCGCCTTTACGATTGTGTATAGAAGAAGCCG GCCAGTGCCTTCCAAATGTGCACCTATAGGCATAGGCAAGCCCTGTTCGACTAATCACGN TGGTGGTATCCATATGACAGCTATCCGGCTATGCTATATAGTGTATATGTATNACACATG CCTCTCGTATATATTAGCGAGCTTGTAGGTGTGTATATCGCGCAACACACTAACTAAGTT AGTGTGTCNTGCGTGTGGCGATTGACTNTGATTCTGTGATACTACGTAGAGAATAGTCAC GTGTNTGCGAGATCTAGATGACTGNGNCGTGACTAGTAACATTTGTTACGCGTAGTACAT GTGCATGTCTAGTCTGAATC



consensusID : consensus_9945#1
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>consensus_9945#1 AATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAGCGTATTATATGTAATATG ATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGTGAACAGGTGAGTAAAAAA AAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTAATAATAAAAAAAGGCTTT AACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGTAATAGAGTCGGGTTAGGC AGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGA TCGACCACATTGGGGATGAANAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTG GTCAATGGCCTACGGCTGAACTGGCAACTTGAGGAATAGAGTANGGTTACTGATTAATCG ACTTCGAATAAAATCTGTATGATATGGTATATGACATATATAATTTATGTCTTGACAAAT TCGTGCCGCAGTCGCGGTATACAAAGAGACTAGTGTATTCATCTTCATANGGTTAAANGG TACGAGACNGGTATATATACAATTGATTGATTAACAATGGCAATTAAAACTGAAGTTATA TAAAAGACGACTATGGTGAAGAATAATCTGGATCTTCGGACTGTAAGGCAAGCATTTTTG TAAAACGCGTCNGGACAAGTCGGACCAAAGGATAGTCCAAAATTTGCGAAATATAGGCTA GGAGGTTATTGCATAATAAGGACCTCCCCAAAGAATGACCTGACGATACTACGTTCACCA AGAGTTGTTTGGCCAAACACACTCTTCTTTAAATCTTAATTTTTTTATATTAANNNNCCN NNNNNNNNNNNNGTGGNCCNNNNCTTAGATGTATGTTATTTTGAGAGATTGTGCATAAAA AAAAGCTGCTGCTCCCCCTCGC



consensusID : consensus_9945#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
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fasta sequence
                              [AATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAGCGTATTATATGTAATATGATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGTGAACAGGTGAGTAAAAAAAAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTAATAATAAAAAAAGGCTTTAACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGTAATAGAGTCGGGTTAGGCAGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATATAAATCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTCGTGCCAGCAATCGCGGTAATACGAAGGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTAAAAGCTACGTAGACGGGTATAATATACAATTGTTTAGAATAACCAATTGTCTATTAAAACTAGAGTTTATATGGTATGATCGTCTATTGGTGGAAAATGAATCTTGATACCTTTGGACTGTATGCGAAGGCATTTTATGAAACTGCCGTAGGATCAAGTTAGGCCCATGGTTAGCCCAATACTTTGAAAATTAATGCTAGTGGATTTTGCGTCAAAAAGGTATCCCTCCTAAAAGTGATATGGATTAACAACGTCCAACCGTATGTTTTTTCGACTATACTCCGTATTTTAATGGTGCATGAGATTCTTCTATTAAAGGCGCGTAGAATTACCTATCCTTTTATTAC]

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>consensus_9945#2 AATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAGCGTATTATATGTAATATG ATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGTGAACAGGTGAGTAAAAAA AAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTAATAATAAAAAAAGGCTTT AACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGTAATAGAGTCGGGTTAGGC AGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGA TCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTG GTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTA AATCGAACTTCGAATATAAATCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGT CTTGACAAATTTCGTGCCAGCAATCGCGGTAATACGAAGGAGACTAGTGTTATTCATCTT CATTAGGTTAAAAGCTACGTAGACGGGTATAATATACAATTGTTTAGAATAACCAATTGT CTATTAAAACTAGAGTTTATATGGTATGATCGTCTATTGGTGGAAAATGAATCTTGATAC CTTTGGACTGTATGCGAAGGCATTTTATGAAACTGCCGTAGGATCAAGTTAGGCCCATGG TTAGCCCAATACTTTGAAAATTAATGCTAGTGGATTTTGCGTCAAAAAGGTATCCCTCCT AAAAGTGATATGGATTAACAACGTCCAACCGTATGTTTTTTCGACTATACTCCGTATTTT AATGGTGCATGAGATTCTTCTATTAAAGGCGCGTAGAATTACCTATCCTTTTATTAC



consensusID : consensus_9945#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
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fasta sequence
                              [CTGATTGAACGCTGTCCAAATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAGCGTATTATATGTAATATGATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGTGAACAGGTGAGTAAAAAAAAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTAATAATAAAAAAAGGCTTTAACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGTAATAGAGTCGGGTTAGGCAGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAAATTCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAAATTCGTGCCAACAGTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGGTAATCATCTTCATTAGTTTAAAAGGTACCTTTACCGGATAATATTCAATTGGGTTAAAATACACTGTGGGATTTAAACACAAGATTTTTTTGAAACATCGCTCATGGGGAAAATAAAATTGGGAACCCTGGGATTGGTTGGGAAGGCATTTCTTGTAAACTGACTTAGGACAAGGTTAGCCCCAAGGGTTGCGCCAGTATTTTGAAAATCTGA]

[+] EMBL AW155464             [CTGATTGAACGCTGTCCAAATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAGCGTATTATATGTAATATGATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGTGAACAGGTGAGTAAAAAAAAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTAATAATAAAAAAAGGCTTTAACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGTAATAGAGTCGGGTTAGGCAGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAAATTCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAAATTCGTGCCAACAGTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGGTAATCATCTTCATTAGTTTAAAAGGTACCTTTACCGGATAATATTCAATTGGGTTAAAATACACTGTGGGATTTAAACACAAGATTTTTTTGAAACATCGCTCATGGGGAAAATAAAATTGGGAACCCTGGGATTGGTTGGGAAGGCATTTCTTGTAAACTGACTTAGGACAAGGTTAGCCCCAAGGGTTGCGCCAGTATTTTGAAAATCTGA]


>consensus_9945#3 CTGATTGAACGCTGTCCAAATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAG CGTATTATATGTAATATGATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGT GAACAGGTGAGTAAAAAAAAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTA ATAATAAAAAAAGGCTTTAACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGT AATAGAGTCGGGTTAGGCAGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAG TCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTA CAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAG AGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAAATTCTGTATGTATATGGTATAATG ACAATATATATCTTATGTCTTGACAAAATTCGTGCCAACAGTCGCGGTAATACGAAAGAG ACTAGTGGTAATCATCTTCATTAGTTTAAAAGGTACCTTTACCGGATAATATTCAATTGG GTTAAAATACACTGTGGGATTTAAACACAAGATTTTTTTGAAACATCGCTCATGGGGAAA ATAAAATTGGGAACCCTGGGATTGGTTGGGAAGGCATTTCTTGTAAACTGACTTAGGACA AGGTTAGCCCCAAGGGTTGCGCCAGTATTTTGAAAATCTGA



consensusID : consensus_9945#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence
                              [TTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAAATTCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTCGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTTAAAGGGTACGTAGACGGTAATAATATACAATTGTATAGAATTAACAATTGGCAAATTAAAACTAGAGTTTTATATGAGAAGATCGTACTATTGGTGGAGAGATGAAATTCTGTGATACCTCTGGGACTGGTTAAGGCGAAGGCAATTNTCTATGTAAAAACTGACGTTCANGGACGAAGGCTCANGACACCAAAAGGATTAGGTACCCAAGTAATCTTTGCAGAGAATTATGAATTGTCATAGGTAGGTTTTTATTTGGGCTATTAATTAAAGAGTAAGCTTTCACCTCTGAAGAAATTGGGACATCTGAGATGGATACCTTAAACCGTTTTGACCCATTTGGATTTTGGGTAATTTCGGGATCCCAAAACCTTTCACTTGTGGTTATTATTCCTAAAATACCTCTTATTCCTAAGAATTGAGTTTAAATTAAGGGGTCCGGTTTTAATAAGGTGAAATTGGTA]

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>consensus_9945#4 TTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATG AAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCT GAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAA ATTCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTCGTGCC AGCAGTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTTAAAGGGTA CGTAGACGGTAATAATATACAATTGTATAGAATTAACAATTGGCAAATTAAAACTAGAGT TTTATATGAGAAGATCGTACTATTGGTGGAGAGATGAAATTCTGTGATACCTCTGGGACT GGTTAAGGCGAAGGCAATTNTCTATGTAAAAACTGACGTTCANGGACGAAGGCTCANGAC ACCAAAAGGATTAGGTACCCAAGTAATCTTTGCAGAGAATTATGAATTGTCATAGGTAGG TTTTTATTTGGGCTATTAATTAAAGAGTAAGCTTTCACCTCTGAAGAAATTGGGACATCT GAGATGGATACCTTAAACCGTTTTGACCCATTTGGATTTTGGGTAATTTCGGGATCCCAA AACCTTTCACTTGTGGTTATTATTCCTAAAATACCTCTTATTCCTAAGAATTGAGTTTAA ATTAAGGGGTCCGGTTTTAATAAGGTGAAATTGGTA



consensusID : consensus_9945#5
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 642
fasta sequence
                              [TTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAAATTCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTCGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTTAAAGGGTACGTAGACGGTAATAATATACAATTGTATAGAATTAACAATTGGCAAATTAAAACTAGAGTTTTATATGAGAAGATCGTACTATTGGTGGAGAGATGAAATTCTGTGATACCTCTGGGACTGGTTAAGGCGAAGGCAATTTTCTATGTTAAAACTGACGTTTAAGGACCACAGCGCTCGAGACCCCAAAGGGTTAGTGCCCCCTGTAATCTTTGCAGAAAATAATAATGTCATAGGTAAGGTTTTTATTTGGCCTATAAATTAAAGTGTAAGCTTCCACCTCAAGAGTAAGTTGGCAACCATCGAACTGAAATCACTTCCCGTTTCTGACACCAGTAGTGAAG]

[+] EMBL AW155312             [TTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCTGAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAAATTCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTCGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTTAAAGGGTACGTAGACGGTAATAATATACAATTGTATAGAATTAACAATTGGCAAATTAAAACTAGAGTTTTATATGAGAAGATCGTACTATTGGTGGAGAGATGAAATTCTGTGATACCTCTGGGACTGGTTAAGGCGAAGGCAATTTTCTATGTTAAAACTGACGTTTAAGGACCACAGCGCTCGAGACCCCAAAGGGTTAGTGCCCCCTGTAATCTTTGCAGAAAATAATAATGTCATAGGTAAGGTTTTTATTTGGCCTATAAATTAAAGTGTAAGCTTCCACCTCAAGAGTAAGTTGGCAACCATCGAACTGAAATCACTTCCCGTTTCTGACACCAGTAGTGAAG]


>consensus_9945#5 TTAACTAGCTTACAATACACGTAGTCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATG AAAAAATCCCAAGGCAAGTAGGTACAGCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGCCTAACGGCT GAACTGGCAACTTGGAGGAATGAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGAATAAA ATTCTGTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTCGTGCC AGCAGTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTTAAAGGGTA CGTAGACGGTAATAATATACAATTGTATAGAATTAACAATTGGCAAATTAAAACTAGAGT TTTATATGAGAAGATCGTACTATTGGTGGAGAGATGAAATTCTGTGATACCTCTGGGACT GGTTAAGGCGAAGGCAATTTTCTATGTTAAAACTGACGTTTAAGGACCACAGCGCTCGAG ACCCCAAAGGGTTAGTGCCCCCTGTAATCTTTGCAGAAAATAATAATGTCATAGGTAAGG TTTTTATTTGGCCTATAAATTAAAGTGTAAGCTTCCACCTCAAGAGTAAGTTGGCAACCA TCGAACTGAAATCACTTCCCGTTTCTGACACCAGTAGTGAAG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9945#2      ------------------AATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAG 42
consensus_9945#3      CTGATTGAACGCTGTCCAAATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAG 60
consensus_9945#1      ------------------AATGCTTGACACAGGCTAATCGAACGTTTAATTTTAAAAAAG 42
consensus_9945#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#0      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9945#2      CGTATTATATGTAATATGATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGT 102
consensus_9945#3      CGTATTATATGTAATATGATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGT 120
consensus_9945#1      CGTATTATATGTAATATGATAAAAAATATTCACTTAATTAAGCTTATTATTAAAAGTGGT 102
consensus_9945#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#0      -------GAACTAGTCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAATGTCATAGGTTAGGTTTT 53
                                                                                  

consensus_9945#2      GAACAGGTGAGTAAAAAAAAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTA 162
consensus_9945#3      GAACAGGTGAGTAAAAAAAAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTA 180
consensus_9945#1      GAACAGGTGAGTAAAAAAAAAGTAATTACAACCTACCTTAAAGTTAGGACAAAATCCCTA 162
consensus_9945#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#0      TATTCGGCCTATAAGTGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAAGTTGGCAACATCGG 113
                                                                                  

consensus_9945#2      ATAATAAAAAAAGGCTTTAACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGT 222
consensus_9945#3      ATAATAAAAAAAGGCTTTAACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGT 240
consensus_9945#1      ATAATAAAAAAAGGCTTTAACATTTACAATCAGTAATAAGGCTGCTTTAAGATGAATCGT 222
consensus_9945#4      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#0      AACTGAAATCACTAGACCGTTTGTGACACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTCTGCGA 173
                                                                                  

consensus_9945#2      AATAGAGTCGGGTTAGGCAGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAG 282
consensus_9945#3      AATAGAGTCGGGTTAGGCAGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAG 300
consensus_9945#1      AATAGAGTCGGGTTAGGCAGTAGTTAAGGTAATGGCTTAACTAGCTTACAATACACGTAG 282
consensus_9945#4      ------------------------------------TTAACTAGCTTACAATACACGTAG 24
consensus_9945#5      ------------------------------------TTAACTAGCTTACAATACACGTAG 24
consensus_9945#0      TCCACGAAAAACCTTACCACAATTTGTATATATTCATATACTAAGA-ATAATCCTTTTAG 232
                                                          *  ****    * *** *   ***

consensus_9945#2      TCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCC--CAAGGCAAG--TA 338
consensus_9945#3      TCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCC--CAAGGCAAG--TA 356
consensus_9945#1      TCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAANAAATCC--CAAGGCAAG--TA 338
consensus_9945#4      TCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCC--CAAGGCAAG--TA 80
consensus_9945#5      TCGAAGCTGAGAGGTTGATCGACCACATTGGGGATGAAAAAATCC--CAAGGCAAG--TA 80
consensus_9945#0      ATTATTCTTAGATATATATGTAGC-TATTAATAATAGACAGGTGTTGCACGGCTGTCTTC 291
                         *  ** ***  *  **  * *  ***    **  * *  *    ** ***     * 

consensus_9945#2      GGTACA-GCAGTGAGGAATATTGGTCA----ATG-GCCTAACGGCTGAACTGGCA--ACT 390
consensus_9945#3      GGTACA-GCAGTGAGGAATATTGGTCA----ATG-GCCTAACGGCTGAACTGGCA--ACT 408
consensus_9945#1      GGTACA-GCAGTGAGGAATATTGGTCA----ATG-GCCTA-CGGCTGAACTGGCA--ACT 389
consensus_9945#4      GGTACA-GCAGTGAGGAATATTGGTCA----ATG-GCCTAACGGCTGAACTGGCA--ACT 132
consensus_9945#5      GGTACA-GCAGTGAGGAATATTGGTCA----ATG-GCCTAACGGCTGAACTGGCA--ACT 132
consensus_9945#0      AGTTCATGTAGTGAA-ATTATGGGTAATTCCATGTAGTTAACGTCAGCCCTTGCTTTATT 350
                       ** ** * *****  * *** *** *    ***    ** ** * *  ** **   * *

consensus_9945#2      TGGAGGAAT-----GAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGA--ATATAAATCT 443
consensus_9945#3      TGGAGGAAT-----GAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGA--ATAAAATTCT 461
consensus_9945#1      TG-AGGAAT------AGAGTANGGTT-ACTGATTAA-TCGA-CTTCGA--ATA-AAATCT 436
consensus_9945#4      TGGAGGAAT-----GAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGA--ATAAAATTCT 185
consensus_9945#5      TGGAGGAAT-----GAGAGTAAGGTTTACTGATTAAATCGAACTTCGA--ATAAAATTCT 185
consensus_9945#0      TGTAAAAGTTGTTTGATAAACTGATTCGCC-ACTATAGCGGATGATGATAATAAGGACTA 409
                      ** *  * *      * *    * **  *  * **   **      **  ***       

consensus_9945#2      GTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTC-GTGCCAGCA 502
consensus_9945#3      GTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAAATTC-GTGCCAACA 520
consensus_9945#1      GTATG-ATATGGTATA-TGACA-TATATAATTTATGTCTTGACAAA-TTC-GTGCC-GCA 490
consensus_9945#4      GTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTC-GTGCCAGCA 244
consensus_9945#5      GTATGTATATGGTATAATGACAATATATATCTTATGTCTTGACAAATTTC-GTGCCAGCA 244
consensus_9945#0      AGACAAGCATCATGGCTTATCATTGTG-GGCTTAGACTTGCACATACTCCTATACCAAGA 468
                        *     **  *    *  ** * *     ***    *  *** * * *  * **   *

consensus_9945#2      ATCGCGGTAATACGAAGGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTT-AAAAGCTACGTA 561
consensus_9945#3      GTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGGTAATCATCTTCATTAGTTT-AAAAGGTACCTT 579
consensus_9945#1      GTCGCGGTA-TAC-AAAGAGACTAGTG-TATTCATCTTCATANGGTT-AAANGGTACG-A 545
consensus_9945#4      GTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTTAAAGGGTACGTA 304
consensus_9945#5      GTCGCGGTAATACGAAAGAGACTAGTGTTATTCATCTTCATTAGGTTTAAAGGGTACGTA 304
consensus_9945#0      GATGCAATATTGCGAA-----TCTACGCTAACGTCGTACAAAGAACAAAAAAAACTCG-A 522
                         **  ** * * **          * **      * **        ***     *   

consensus_9945#2      GACGGGTATAATATACAATTGT-TTAGAATAACCAATTGTCTATTAAAACTAGAGT-TTA 619
consensus_9945#3      TACCGG-ATAATATTCAATTGGGTTAAAATACACTGTGGG--ATTTAAACACAAGA-TTT 635
consensus_9945#1      GACNGGTATA-TATACAATTGATT---GATTAACAATGGCA-ATTAAAACTGAAG--TTA 598
consensus_9945#4      GACGGTAATAATATACAATTGTATAGAATTAACAATTGGCAAATTAAAACTAGAGTTTTA 364
consensus_9945#5      GACGGTAATAATATACAATTGTATAGAATTAACAATTGGCAAATTAAAACTAGAGTTTTA 364
consensus_9945#0      GGGGGGCACAGTTCCCAATTCCCTTATAGTAGCNTCTTACACCCGCTATCTGCCGCGGTG 582
                          *  * * *   *****   *     *      *          * *    *   * 

consensus_9945#2      TATGG-TATGATCGT-CTATTGGTGGA-AAATGAATCT---TGATA----CCT-TTGGAC 668
consensus_9945#3      TTTTG-AAACATCGC-TCATGGG--GA-AAATAAAATT---GGGAA----CCC-TGGGAT 682
consensus_9945#1      TAT---AAAAGACGA-CTATGGT--GA-AGAATAATCT---GG--A----TCT-TCGGAC 641
consensus_9945#4      TATGA-GAAGATCGTACTATTGGTGGAGAGATGAAATTCTGTGATA----CCTCTGGGAC 419
consensus_9945#5      TATGA-GAAGATCGTACTATTGGTGGAGAGATGAAATTCTGTGATA----CCTCTGGGAC 419
consensus_9945#0      TAAACTCTAGACTGGGATACCAGGGTACCCACTGTATCCCGTGATAATCGCCTTTACGAT 642
                      *            *    *       *   *           *  *     *  *  ** 

consensus_9945#2      TGTAT----GCGAAGGCATTTTA-----TG-AAACTGCCGT---AGGATCAAG---TTAG 712
consensus_9945#3      TGGTT----GGGAAGGCATTTCT-----TGTAAACTGACTT---AGGACAAGG---TTAG 727
consensus_9945#1      TGTAA----G-GCAAGCATTTT------TGTAAAACGCGTC---NGGAC-AAG---TCGG 683
consensus_9945#4      TGGTTA-AGGCGAAGGCAATTNTCTATGTAAAAACTGACGTTCANGGACGAAGGCTCANG 478
consensus_9945#5      TGGTTA-AGGCGAAGGCAATTTTCTATGTTAAAACTGACGTTTAAGGACCACAGCGCTCG 478
consensus_9945#0      TGTGTATAGAAGAAGCCGGCCAGTGCCTTCCAAATGTGCACCTATAGGCATAG-----GC 697
                      **         * *  *           *  ***            *             

consensus_9945#2      GCCCATGGTTAGC-CCAATACTTTGAAA--ATTAATGCTAGTGGATTTTGCGTCAAAAAG 769
consensus_9945#3      CCCCAAGGGTTGCGCCAGTATTTTGAAA--ATCTGA------------------------ 761
consensus_9945#1      ACCAAAGGATAGT-CCAAAATTTGCGAA--ATATAGGCTAGGAGGTTAT-TGCATAATAA 739
consensus_9945#4      ACACCA-AAAGGATTAGGTACCCAAGTA--ATCTTTGCAGAGAATTATGAATTGTCATAG 535
consensus_9945#5      AGACCCCAAAGGGTTAGTGCCCCCTGTA--ATCTTTGCAGAAAATAATAA--TGTCATAG 534
consensus_9945#0      AAGCCCTGTTCGACTAATCACGNTGGTGGTATCCATATGACAGCTATCCGGCTATGCTAT 757
                                 *                  **                            

consensus_9945#2      GTATCCCTCCTAAAAGTGATATGGATTAACAACGTCCAACCGTATGTTTTTT-CGACTAT 828
consensus_9945#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#1      GGACCTCCCCAAAGAATGACCTGACGATACTACGTTCACCAAGAGTTGTTTG-GCCAAAC 798
consensus_9945#4      GTA-GGTTTTTATTTGGGCTATTAAT---TAAAGAGTAAGCTTTCACCTCTG-AAG-AAA 589
consensus_9945#5      GTAAGGTTTTTATTTGGCCTATAAAT---TAAAGTGTAAGCTTCCACCTCAA-GAGTAAG 590
consensus_9945#0      ATAGTGTATATGTATNACACATGCCTCTCGTATATATTAGCGAGCTTGTAGGTGTGTATA 817
                                                                                  

consensus_9945#2      ACTCCGTATTTTAATGGTGCATGAGATTCTTCTATTAAAGGCGCGTAGAATTACCTATCC 888
consensus_9945#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#1      ACACTCTTCTTTAAATCTTAATTTTTTTATATTAANNNNCCNNNNNNNNNNNNNGTGGNC 858
consensus_9945#4      TTGGGACATCTGAGATGGATACCTTAAACCGTTTTGACCCATTTGGATTTTGGGTAATTT 649
consensus_9945#5      TTGGCAACCATCGAACTGAAATCACTTCCCGTTTCTGAC-ACCAGTAGTGAAG------- 642
consensus_9945#0      TCGCGCAACACACTAACTAAGTTAGTGTGTCNTGCGTGTGGCGATTGACTNTGATTCTGT 877
                                                                                  

consensus_9945#2      TTTTATTAC--------------------------------------------------- 897
consensus_9945#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#1      CNNNNCTTAGATGTATGTTATTTTGAGAGATTGTGCATAAAAAAAAGCTGCTGCTCCCCC 918
consensus_9945#4      CGGGATCCCAAAACCTTTCACTTGTGGTTATTATTCCTAAAATACCTCTTATTCCTAAGA 709
consensus_9945#5      ------------------------------------------------------------
consensus_9945#0      GATACTACGTAGAGAATAGTCACGTGTNTGCGAGATCTAGATGACTGNGNCGTGACTAGT 937
                                                                                  

consensus_9945#2      -----------------------------------------------
consensus_9945#3      -----------------------------------------------
consensus_9945#1      TCGC------------------------------------------- 922
consensus_9945#4      ATTGAGTTTAAATTAAGGGGTCCGGTTTTAATAAGGTGAAATTGGTA 756
consensus_9945#5      -----------------------------------------------
consensus_9945#0      AACATTTGTTACGCGTAGTACATGTGCATGTCTAGTCTGAATC---- 980
                                                                     




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)