|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9967#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 2115 fasta sequence
[TGTGGACCTTATTAAGCCTACAGTGAAAGTGAATGGAGTTTGGAAAAATGTAGAATATACAAAGGCTACACTGAAAGCGAATGGAGTTGGGAAAAATGCAGAAAATACAAAGGTTCCAACTATTCCTAGCACCCAAAAGTCTAGGAGAAGTACCAGCCAAGCTCATAAAAAGTACATTCAAGGCACTTTTCCTGTTGACGATGGTGATGATGATACTAGGCCA-TCTATTCGACAATCTGGTTCACCAGTTTCAAGATGGAGCAGTTCTGGTAAAGCAGTTGACACTGCCAATCACAGTTATCAAGACACAAAACAAAATCAGCTACCACTATTGTCTTATTCACACCGTGTGCATGGTGCTCACTCCGCTGGAAGAGAGAATTCAAGTAGTGAGAAAGTTGACAGTAGTGCAATCCCATCAACAAATCTGTACATTGAGGATGACAAAAGGTTCAAGGCAGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAAAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTCAAGTACACTTCATTTTTCCACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTGATGATCTTTTGAAGATTGTGATAATGAATGACCATCTAGCTTGTGATCCAGAAGATGGTGGTTGTGGAAAACCAAACCATATTCATCACATTCTTTCTAGCCCCCCTCATGTTTTTACAGTTGTTTTGGGGTGGCAGAACAACAAAGAAAGTGTGGATGACATATCTGGAACTTTGGCTGGTATTTCAACTGAGATAGACATCAGTACTTTCTACCGTGGTCTAGACCAAGGAAGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCA-CGGTGCTTACATTGAAATGTTACAGAATTTCCATAATCCTGGCAAGGTTAAAATGAATGGTCGCCATGTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK062304 [TGTGGACCTTATTAAGCCTACAGTGAAAGTGAATGGAGTTTGGAAAAATGTAGAATATACAAAGGCTACACTGAAAGCGAATGGAGTTGGGAAAAATGCAGAAAATACAAAGGTTCCAACTATTCCTAGCACCCAAAAGTCTAGGAGAAGTACCAGCCAAGCTCATAAAAAGTACATTCAAGGCACTTTTCCTGTTGACGATGGTGATGATGATACTAGGCCA TCTATTCGACAATCTGGTTCACCAGTTTCAAGATGGAGCAGTTCTGGTAAAGCAGTTGACACTGCCAATCACAGTTATCAAGACACAAAACAAAATCAGCTACCACTATTGTCTTATTCACACCGTGTGCATGGTGCTCACTCCGCTGGAAGAGAGAATTCAAGTAGTGAGAAAGTTGACAGTAGTGCAATCCCATCAACAAATCTGTACATTGAGGATGACAAAAGGTTCAAGGCAGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAGAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTCAAGTACACTTCATTTTTCCACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTGATGATCTTTTGAAGATTGTGATAATGAATGACCATCTAGCTTGTGATCCAGAAGATGGTGGTTGTGGAAAACCAAACCATATTCATCACATTCTTTCTAGCCCCCCTCATGTTTTTACAGTTGTTTTGGGGTGGCAGAACAACAAAGAAAGTGTGGATGACATATCTGGAACTTTGGCTGGTATTTCAACTGAGATAGACATCAGTACTTTCTACCGTGGTCTAGACCAAGGAAGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTCTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCA CGGTGCTTACATTGAAATGTTACA ]
[+] EMBL CB631939 [ GGCCACTCTATTCGACAATCTGGTTCACCAGTTTCAAGATGGAGCAGTTCTGGTAAAGCA GCCAATCACAGTTATCAAGACACAAAACAAAATCAGCTACCACTATTGTCTTATTCACACCGTGTGCATGGTGCTCACTCCGCTGGAAGAGAGAATTCAAGTAGTGAGAAAGTTGACAGTAGTGCAATCCCATCAACAAATCTGTACATTGAGGATGACAAAAGGTTCAAAGCAGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAAAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTNCAGTACACTTCATTTTT CACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTG ]
[+] EMBL CB671816 [ AGACCTTGAGAGAGCTGTGCTTCAAAGCCTTGGCACTTCTAATGAAAAAGAAGTCTATGGGACTGGCCTTAAAAATGCTGCTGGTGAATACAATTGTTTCTTGAATGTGATTATCCAGTCATTATGGCATTTAAAGCGGTTTCGTGATGGATTTCTTAAAACATCATCGCTGCATAAGCATGTTGAAGATCCTTGTGCTGTCTGTGCATTGTATGATATCTTCACTGATCTGAGCAAAGCATCAGAGGAGCAAGGGGAAGCTGTCGCACCTACTTCTTTGAGGATCGCTTTGAGCAAATCCTACCCCAACAGCAAATTCTTTCAGGAGGGGCAAATGAATGATGCATCTGAGGTTTTGGGGGTGATCTTTGAGTGCTTGCATAAGTCATACACTTCTCGTGCTGACTGCCAAGTTAAATCTCATGAGATCAATTATATTGGTTCCTGGGATTGTGCAAGTAGTTCCTGCATAGCACACTGTCTTTTTGGAATGGATATCCTTGAACGAATGAACTGCCAGAGTTGTCGGTTGGAGTCAAGACGACTCAAGTACACTTCATTTTTCCACAATATCAATGCTAGTTCACTTCGAACTGCAAAGGATATGTTTCCAGATCATTCATTTGATGATCTTTTGAAGATTGTGATAATGAATGACCATCTAGCTTGTGATCCAGAAGATGGTGGTTGTGGAAAACCAAACCATATTCATCACATTCTTTCTAGCCCCCCTCATGTTTTTACAGTTGTTTTGGGGTGGCAGAACAACAAAGAAAGTGTGGATGACATATC ]
[-] EMBL CB671817 [ GTGGATGACATATCTGGACCTTTGGCTGGTATTTCAACTGAGATAGACATCAGTACTTTCTACCGTGGTCTAGACCAAGGAAGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGAGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCACCGGTGCTTAACTTAAAAaga ]
[-] EMBL CB631940 [ AGCAAACATTCTCTGGTGTCAGTGGTCTGTTACTACGGGCAACACTATCATTGCTTTGCTTTTGAGGATGGGCAGTGGGTCATGTACGATGACCAGACTGTGAAGGTTGTTGGTAATTGGGATGATGTGCTCGTAATGTGTAAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATAGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCGTTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAAGGATATGTTTTTGGGAGCA CGGTGCTTACATTGAAATGTTACAGAATTTCCATAATCCTGGCAAGGTTAAAATGAATGGTCGCC ]
[+] EMBL AU057332 [ AAGAAAGGTCACTTGCAACCTCAGGTGCTCTTCTTTGAAGCTGCAAAGTAATTGTTCCTTCAGATAGGCTTTTCCTTGTGGTGTTGTGAAGATTAGAAATTGATACCAAATTCGTTTTGAGCTGTGGGGGATAAAGGCGTAAAGTGGTAATTCAGCAGTTGCACTGATCAGTTAGTTTTGTCATGCCCCGTCATAAATAAACGGTCACATGAGAATACTAGAAATAGAAAAGCCAGTAATCCTTTTGTTTAGGTTTTTTGGAGCTTCGGTATAGTTCTGATCCCTGATCCTGTCAATAAGATTTTGGCATAGGAGTGGGAGGGTGGCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCA ]
[+] EMBL AU057333 [ AAGATTTTGNCATAGGAGTGGGAGGGTGNCCATTCGATCGTTTGCCATCTAGAGGATAGAGAAAATTTCAGAGATTCATAAGCATTGCTGAATTTATTTTGAAGCTGATCCGAATGCATCGACGATGTACAGAGTTGTGTTTACCATGGGAAGGCTATAGGGGTGGTGTTCATTAGTTTTTGGAGAAGGGCGAGTTGTGATGCAAAACTGGTTGTATTCGTTGGAAAATGTTGGGGAAGGGATATGTTTTTGGGAGCA CGGTGCTTACATTGAAATGTTACAGAATTTCCATAATCCTGGCAATGTTAAAATGAATGGTCGCCATGTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||