cluster # 0

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Schistosoma mansoni
cluster # 0 cluster # 0 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_0#0 length = 720 sequences # 2

consensusID : consensus_0#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 720
fasta sequence

                              [TAACTACAGTTGATTCATTAATATACCCAACATGTCCTCCTGGTTTCCGATTCCATCGTGACCGTTGTTACCAATTGATTACAGATAAATTTACCTGGAGTGAAGCCAATGACAATTGTCACCAGATTGTGAAACCATACACAAATTTTAATGGATCGTTAGCCCGTATCGACAACGGACTTGATCAGCAGTTTCTAGCTAGTCTCCTAGATAATCTTGAACCTGAAAAATCATCTGCAGTACGGATTGGTTTGTACCGTAATTTATCACATAATTCTCACAGTTACGATTGGGCAGATGGTAAAAAACCTCAATTCATCAAACCAATTATAAGAGATCATCAGCTTTCTTTGTATAGTCATACTTTCGTTTCACGAACAACTATTTCGATTAAGTTGAAATCTATGAGTCTATGTACGTCGATGTTTCGTTCAACTGATCCTAGATTGAATGGAATTTGGCTTCAATGGTCTTGTGATGAACCAATTTATTTAAGTAGTGTATGTCAGGCGTCACCAATTAATC-AAATAGACATGT-AATCAAATGTTGCTTCCTCCGTATCGAACAGAGATATTTTATTGTCCATCAGGTTTCCAGTTGGGTACAACTGGTCTGTTGAAAGTTAAAGGTCAATCAATGGCAAAACTTTCCCAACCTATGTGTTATCGTGTGTTCAATCATGTCGCCAAAATGAATTGGGCTTCAGCAAATATGGCTTGC]

[+] EMBL CD201945             [TAACTACAGTTGATTCATTAATATACCCAACATGTCCTCCTGGTTTCCGATTCCATCGTGACCGTTGTTACCAATTGATTACAGATAAATTTACCTGGAGTGAAGCCAATGACAATTGTCACCAGATTGTGAAACCATACACAAATTTTAATGGATCGTTAGCCCGTATCGACAACGGACTTGATCAGCAGTTTCTAGCTAGTCTCCTAGATAATCTTGAACCTGAAAAATCATCTGCAGTACGGATTGGTTTGTACCGTAATTTATCACATAATTCTCACAGTTACGATTGGGCAGATGGTAAAAAACCTCAATTCATCAAACCAATTATAAGAGATCATCAGCTTTCTTTGTATAGTCATACTTTCGTTTCACGAACAACTATTTCGATTAAGTTGAAATCTATGAGTCTATGTACGTCGATGTTTCGTTCAACTGATCCTAGATTGAATGGAATTTGGCTTCAATGGTCTTGTGATGAACCAATTTATTTAAGTAGTGTATGTCAGGCGTCACCAATTAATC AAATAGACATGT AATCAAA                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD154814             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTATTTCGATTAAGTTGAAATCTATGAGTCTATGTACGTCGATGTTTCGTTCAACTGATCCTAGATTGAATGGGATTTGGCTTCAATGGTCTTGTGATGAACCAATTTATTTAAGTAGTGTATGTCAGGCGTCACCAATTAATCAAAATAGACATGTAAATCAAATGTTGCTTCCTCCGTATCGAACAGAGATATTTTATTGTCCATCAGGTTTCCAGTTGGGTACAACTGGTCTGTTGAAAGTTAAAGGTCAATCAATGGCAAAACTTTCCCAACCTATGTGTTATCGTGTGTTCAATCATGTCGCCAAAATGAATTGGGCTTCAGCAAATATGGCTTGC]




>consensus_0#0
TAACTACAGTTGATTCATTAATATACCCAACATGTCCTCCTGGTTTCCGATTCCATCGTG
ACCGTTGTTACCAATTGATTACAGATAAATTTACCTGGAGTGAAGCCAATGACAATTGTC
ACCAGATTGTGAAACCATACACAAATTTTAATGGATCGTTAGCCCGTATCGACAACGGAC
TTGATCAGCAGTTTCTAGCTAGTCTCCTAGATAATCTTGAACCTGAAAAATCATCTGCAG
TACGGATTGGTTTGTACCGTAATTTATCACATAATTCTCACAGTTACGATTGGGCAGATG
GTAAAAAACCTCAATTCATCAAACCAATTATAAGAGATCATCAGCTTTCTTTGTATAGTC
ATACTTTCGTTTCACGAACAACTATTTCGATTAAGTTGAAATCTATGAGTCTATGTACGT
CGATGTTTCGTTCAACTGATCCTAGATTGAATGGAATTTGGCTTCAATGGTCTTGTGATG
AACCAATTTATTTAAGTAGTGTATGTCAGGCGTCACCAATTAATCAAATAGACATGTAAT
CAAATGTTGCTTCCTCCGTATCGAACAGAGATATTTTATTGTCCATCAGGTTTCCAGTTG
GGTACAACTGGTCTGTTGAAAGTTAAAGGTCAATCAATGGCAAAACTTTCCCAACCTATG
TGTTATCGTGTGTTCAATCATGTCGCCAAAATGAATTGGGCTTCAGCAAATATGGCTTGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case