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Schistosoma mansoni
cluster # 10005 cluster # 10005       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10005#0 length = 1048 sequences # 12  

consensusID : consensus_10005#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1048
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCAGAATTGCTCTCAAGCACTTTATTGGTTCTTTTGCATTCCCTGATCATCTGAGGCAATCATTATTTCCTAGATGAACTTTTTTTGATGCTTTTTTTATTGTTTAGGGATTTAGCGCAAGTAGGACAAAACCATCGACCTTTCGGTGCAACGGTTAGGTTCACGCAAGCGTAGTGAAACCATTCGAAGGGGCAGTCTGGGGCGTCGCATGCTATCATGTCACCATAACTCACATCTCGGCATATGCAGTAACGCTTGTAATCTTCATCATCATCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGTTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGGTTTTAGCATCCAGTGACATGTCTGGTAGCAAGC-ATGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG-AGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATTTAGTATTTTCCAAAAACGGCGCCGAATA]

[+] EMBL AI395454             [TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCAGAATTGCTCTCAAGCACTTTATTGGTTCTTTTGCATTCCCTGATCATCTGAGGCAATCATTATTTCCTAGATGAACTTTTTTTGATGCTTTTTTTATTGTTTAGGGATTTAGCGCAAGTAGGACAAAACCATCGACCTTTCGGTGCAACGGTTAGGTTCACGCAAGCGTAGTGAAACCATTCGAAGGGGCAGTCTGGGGCGTCGCATGCTATCATGTCACCATAACTCACATCTCGGCATATGCAGTAACGCTTGTAATCTTCATCATCATCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGGTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAAGATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCCGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD128626             [                                                                                                                                                                                                                                        TATCATGTCACCATAACTCACATCTCGGCATATGCAGTAACGCTTGTAATCTTCATCATCATCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGTTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD189599             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGTTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD189695             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcCTGGTGGGTCAGTAGAATCTTCTGGTTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD132894             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD189978             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctgtcCTGGTCGTCAAATCCATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCATCAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTTCCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTGTCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGGTTTTAGCATCCAGTGACATGTCTGGTAGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD133094             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAGCTTGTCACGATCTGCAAAGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAACACGATCGTGCATTCCAGTATGGGTTTTAGCATCCAGTGACATGTCTGGTAGCAAGC ATGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGACCCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG AGTTATTGAAAGACTTTTGATCACCATTTAATGAGAATT                            ]
[-] EMBL CD187664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCAGTGACATGTCTGGTAGCAAGC ATGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG AGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATTTAGTATTTTCCAAAAACGGCGCCGAATA]
[-] EMBL CD187672             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCAGTGACATGTCTGGTAGCAAGCTATGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGAAATCCAGATCTTGAGTTGTGACGGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG AGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATT                            ]
[-] EMBL CD187667             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCAGTGACATGTCTGGTAGCAAGC ATGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG AGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATT                            ]
[+] EMBL CD132418             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGGGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGA CATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGGNAG TATTTGAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATT                            ]
[-] EMBL CD132383             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGGTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCTCTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATGAACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGACTTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATCCAGAAGTTGAGATTAAACTGG AGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATTTAGTATTTTCCAGACACG          ]


>consensus_10005#0 TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCAGAATTGCTCTCAAGCACTTTATTGGTTCTTTTGCATT CCCTGATCATCTGAGGCAATCATTATTTCCTAGATGAACTTTTTTTGATGCTTTTTTTAT TGTTTAGGGATTTAGCGCAAGTAGGACAAAACCATCGACCTTTCGGTGCAACGGTTAGGT TCACGCAAGCGTAGTGAAACCATTCGAAGGGGCAGTCTGGGGCGTCGCATGCTATCATGT CACCATAACTCACATCTCGGCATATGCAGTAACGCTTGTAATCTTCATCATCATCTGGTG GGTCAGTAGAATCTTCTGGTTTCGGATTTCCACTAAATTCATACGTCTGGTCGTCAAATC CATGCTCCAGCGTTGCATTGACACTAGAATTGGGTGAATCATCGAGCTTTCCGAACTCAT CAACCGTAAGGTCACATGCTAGACCTATCCTATCATATCTTCGCGGGTATCGGCGTTTTT CCCGAGTACTAGAGAAACTTGGCGTTAAACCGTGCCATCCGGGTGAACTGATGTTGTCTG TCACTTGATTATCAATTGAACCTGTCCTTGGTGTTAAATTGAGCTTGTCACGATCTGCAA AGTTAGGTTCTGCTGTGTCGTAAAACAAATGACTACTGGAAGAGTTAGCACTTTTAATAA CACGATCGTGCATTCCAGTATGGGTTTTAGCATCCAGTGACATGTCTGGTAGCAAGCATG GGTTGCTTTTTAAAATTGTGGGGAATCCAGAACTTGCGTTGTGACCGTTTATAGTATCCT CTTCAAACTTTGTAACTCCTCCAGTTTGTGGATTAACCGCGTCAAAGGTTCGGTCGTATG AACTGTCACTGGACTGATGGTCCAAACATATTGAGTTTTCGTCAATTGACTTAAGAGGAC TTAGACCATCCGTATGAACAGGGTTCTTTCTGTAGGAACCTGTATCTTGAACATGACATC CAGAAGTTGAGATTAAACTGGAGTTATTGAAGGACTTTTGATCACCATTTAGTGAGAATT TAGTATTTTCCAAAAACGGCGCCGAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)