cluster # 1001

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Schistosoma mansoni
cluster # 1001 cluster # 1001 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1001#0 length = 674 sequences # 2

consensusID : consensus_1001#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 674
fasta sequence

                              [GTCGGATTCTAACAGTTACCGGTGATTTAATGAATTCTAATCGTTTAACACGTGTATTTACACGTGGTCATAAGACATCAAATGTTAATGAGCAGTCAAATAAATCACTACTAAATACACAAGTATCCAAACAATTATCAGTAATGGGATTGAATAATAATAATAATAATAATGGCATTAATGTTAACAGTTCCAATGATAATTTAGACTGGTCATCTGACATTGAAGATAAGTCAAGTACTTTAGTAAGAAAAACATCTGATAAAAGTTCAGACAATTCTTCTGCATTAAAACAACTAAATTCATTAGATTGTAAAAAAACTACTCCACCTAGACAAGTTGTTCAGCCTCATGAAGCTCCACTTCTTGATCCTTTTGGTTCTGATTGTGGCAAGCCTCGTTTACGGATTCTCCTAGGACAAACAAATCGTTTAAATTCTCTATCTGGAATATCTTCAAATATGAAATTTAATCCCAATACCACATACAAAAATATCTCAGATCATAAAAATAATTTAGCTAGTCACCAGTCTCTAGCAAAATCCTGTATGACATCTACCATTACTGCCACAAGTCTTGTATCAAAAGGAAGTACGAATTCAATCAATAGTATCTCTTCTTCGTATTATAATCCCAATTAGTAAAACAGATTTTTAAAATCTACCCGTAATTAT]

[+] EMBL CD124154             [GTCGGATTCTAACAGTTACCGGTGATTTAATGAATTCTAATCGTTTAACACGTGTATTTACACGTGGTCATAAGACATCAAATGTTAATGAGCAGTCAAATAAATCACTACTAAATACACAAGTATCCAAACAATTATCAGTAATGGGATTGAATAATAATAATAATAATAATGGCATTAATGTTAACAGTTCCAATGATAATTTAGACTGGTCATCTGACATTGAAGATAAGTCAAGTACTTTAGTAAGAAAAACATCTGATAAAAGTTCAGACAATTCTTCTGCATTAAAACAACTAAATTCATTAGATTGTAAAAAAACTACTCCACCTAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI976778             [                                AATTCTAATCGTTTAACACGTGTATTTACACGTGGTCATAAGACATCAAATGTTAATGAGCAGTCAAATAAATCACTACTAAATACACAAGTATCCAAACAATTATCAGTAATGGGATTG   AATAATAATAATAATAATGGCATTAATGTTAACAGTTCCAATGATAATTTAGACTGGTCATCTGACATTGAAGATAAGTCAAGTACTTTAGTAAGAAAAACATCTGATAAAAGTTCAGACAATTCTTCTGCATTAAAACAACTAAATTCATTAGATTGTAAAAAAACTACTCCACCTAGACAAGTTGTTCAGCCTCATGAAGCTCCACTTCTTGATCCTTTTGGTTCTGATTGTGGCAAGCCTCGTTTACGGATTCTCCTAGGACAAACAAATCGTTTAAATTCTCTATCTGGAATATCTTCAAATATGAAATTTAATCCCAATACCACATACAAAAATATCTCAGATCATAAAAATAATTTAGCTAGTCACCAGTCTCTAGCAAAATCCTGTATGACATCTACCATTACTGCCACAAGTCTTGTATCAAAAGGAAGTACGAATTCAATCAATAGTATCTCTTCTTCGTATTATAATCCCAATTAGTAAAACAGATTTTTAAAATCTACCCGTAATTAT]




>consensus_1001#0
GTCGGATTCTAACAGTTACCGGTGATTTAATGAATTCTAATCGTTTAACACGTGTATTTA
CACGTGGTCATAAGACATCAAATGTTAATGAGCAGTCAAATAAATCACTACTAAATACAC
AAGTATCCAAACAATTATCAGTAATGGGATTGAATAATAATAATAATAATAATGGCATTA
ATGTTAACAGTTCCAATGATAATTTAGACTGGTCATCTGACATTGAAGATAAGTCAAGTA
CTTTAGTAAGAAAAACATCTGATAAAAGTTCAGACAATTCTTCTGCATTAAAACAACTAA
ATTCATTAGATTGTAAAAAAACTACTCCACCTAGACAAGTTGTTCAGCCTCATGAAGCTC
CACTTCTTGATCCTTTTGGTTCTGATTGTGGCAAGCCTCGTTTACGGATTCTCCTAGGAC
AAACAAATCGTTTAAATTCTCTATCTGGAATATCTTCAAATATGAAATTTAATCCCAATA
CCACATACAAAAATATCTCAGATCATAAAAATAATTTAGCTAGTCACCAGTCTCTAGCAA
AATCCTGTATGACATCTACCATTACTGCCACAAGTCTTGTATCAAAAGGAAGTACGAATT
CAATCAATAGTATCTCTTCTTCGTATTATAATCCCAATTAGTAAAACAGATTTTTAAAAT
CTACCCGTAATTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case