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consensusID : consensus_10024#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 879 fasta sequence
[TGTGGTCCAAAAATTGCTACCACACATTTATCTACTGATATTGCAGAATTTATTTTATTCGGAATCTTATGTGGTCTACACGTAAATGGTAAAAATGCTGAAAATGCTTTAAACTGTTTACTATATGCTGGAATTAAAACTTATCTATCTGTGGATATTATTGTGGCCAGACAAAATTTACGATCTGTTATAATTCTCAATTTCAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGTCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTTTGATTTACACTTTCAATGGGTATGAAATATCTGAACAATTTAATACTCCTAAGGAACATGATGGAGAGTGCGATGATGATAATGATGATGTAGACATGTCAGAAAGTATATGTGCAAATGGTCAGTCGGGTACAAATAGTTCGCTTGGCCATTTAACAAAATTNTTGGCAAATATGCACACTGTGTCATCGGAACCGGACTATAATGCACAGAATC]
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consensusID : consensus_10024#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 607 fasta sequence
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[+] EMBL CD161010 [ CAAAATATACTCAAATTTGTAGATGTTACGAGTCCTTCGTTACACCGGTTGCGCACTTTCCTCAATGACTGTCATGAGAATTTAATGGGGATAGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTTAAGAATTGCATTGCACGATGGTTGTTGTGCTGCATTTGAACATTTGCCCGACCTCAAGCTAAACAGTCTTCTACGATCTATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCATTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTGCTATTAAGAGAACTGGTGCAAGATGGAATGAATTAGTCGTGGCCGATGGACGTATCTGTGAAGACGAAAAAGCAATCGCAGCTGAACTTGTACTGGACAGATCGACTCGCCTGTTAAGTCGAACATGTTTAGATATATTGCGTAAGCTGTTGATTTTTATCATCAACCAATTAAATGTTTGTTGTTACATTATTAACTATTTATC]
consensusID : consensus_10024#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 469 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_10024#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10024#2 ------------------------------------------------------------
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* * *
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consensus_10024#2 TCCTTTGTTCTTACGTTCACTAACGAAAATTTTAGCTTGGCCTGATACTTCAA------- 121
***** *** ** * * ** * * ** * *** * ** **
consensus_10024#0 AGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTT 355
consensus_10024#1 AGTTGGTCTTTTATTTGTTTCGTTGGGATCGAAATTCTATCGTTTACCAACTGAACAGTT 238
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consensus_10024#0 CTAAACAGTCTTCTACGATCT-ATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCA 472
consensus_10024#1 CTAAACAGTCTTCTACGATCT-ATTCTTCGTCCCTTTATCCGTCAGTGTCCTAGGCAGCA 355
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consensus_10024#0 TTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTG------CTATTAA 526
consensus_10024#1 TTTTGAAACTGCCATCATTCCTTTGGTCCCTCCAATAATTGAAGCTG------CTATTAA 409
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* ***** *** * * *** * * * **** ** ** ** * *
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consensus_10024#2 TATTATTGGGGCCAGACAAAATTTAC-GATCTGGTATAATTCGTGTTTTAATGGATACAT 406
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consensus_10024#1 TTTAGATATATTGCGTAAGCTGTTGATTTTTATCATCAACCAATTAAATGTTTGTTGTTA 589
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* ** * *
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consensus_10024#2 -----------------------------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||