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consensusID : consensus_10054#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 949 fasta sequence
[CTCCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAA-CCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA-GGAAACACCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT-GTTTTCAAGATTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTAAACGGATTCAGCTGAAATATTTTTTATTTGTCTTTATCTGACTATTCTTTGCAATGTGCATATATTAACATGTTTAATCTTTGATGATAGTTTAAGCGAAAATTGAAAAATGTATAATTC]
[+] EMBL CD080446 [CTCCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAA CCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTNTATATATTAATGGTATCTCTT ]
[+] EMBL CD082332 [ aacTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCAT TATATTCTACTGTAAAACTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAA CCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTNTATATATTAATGTTATCTCTNTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTA ]
[-] EMBL CD074358 [ TGCTATCACAATTTAAATCAAACCCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA GGAAACCCCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGATTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTAAACGGATTCAGCTGAAATATTTTTTATTTGTCTTTATCTGACTATTCTTTGCAATGTGCATATATTAACATGTTTAATCTTTGATGATAGTTTAAGCGAAAATTGAAAAATGTATAATTC]
[-] EMBL CD075930 [ TTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTTTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAACCAA GGAAACCCCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGATTTTATTTTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTA ]
[+] EMBL AA559660 [ TGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAAGGGAAACACCNAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCNTATTTTATTTCAATTGGTTTTCAAGATTTTAT ]
[-] EMBL SMAA8341 [ cgGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA GGAAACACCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGTTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGGTTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTA ]
[-] EMBL SMAA85778 [ TGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA GGAAACACCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGTTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGGTTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTA ]
consensusID : consensus_10054#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 590 fasta sequence
[CCTCGTGCCGAGTGTCTAGCCCAGATATCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCANAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTT]
[+] EMBL CD078465 [CCTCGTGCCGAGTGTCTAGCCCATATATCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCANAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTT]
[+] EMBL CD159348 [ agagAGATATCGCTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTC ]
[-] EMBL CD140120 [ tGATATCGTTACCCGCTTTCAACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGAT ]
[+] EMBL CD139643 [ TGCGTTTGCAATCACAATTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTACGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTCGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGT ]
consensusID : consensus_10054#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 504 fasta sequence
[TGATTTTAATGCTAGATTGACCTTTGCTTTGTGTCTTCCTGTAGTGTCTAGCCCATATATCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGCGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAGGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGT]
[-] EMBL CD160956 [TGATTTTAATGCTAGATTGACCTTTGCTTTGTGTCTTCCTGTAGTGTCTAGCCCATATATCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGCGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAGGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGT]
[-] EMBL CD161327 [TGATTTTAATGCTAGATTGACCTTTGCTTTGTGTCTTCCTGTAGTGTCTAGCCCATATATCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_10054#1 --------------------------CCTCGTGCCG------AGTGTCTAGCCCAGATAT 28
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* * * * * * ** *
consensus_10054#0 CGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATT 86
consensus_10054#1 CGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATT 88
consensus_10054#2 CGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATT 120
************************************************************
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consensus_10054#1 CTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAAT 148
consensus_10054#2 CTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAAT 180
************************************************************
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consensus_10054#1 ACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAA 208
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************************************************************
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consensus_10054#1 GATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTA 268
consensus_10054#2 GATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTA 300
************************************************************
consensus_10054#0 ATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAAT 326
consensus_10054#1 ATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAAT 328
consensus_10054#2 ATATCGAGCGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAAT 360
******** ***************************************************
consensus_10054#0 TCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAA 386
consensus_10054#1 TCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAA 388
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***** ******************************************************
consensus_10054#0 TTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGAT 446
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consensus_10054#2 TTTAAATCAAACCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGAT 480
************************************************************
consensus_10054#0 TTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCA 506
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************************
consensus_10054#0 CTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTC 566
consensus_10054#1 CTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCANAGCTGGTTCTATTATGCGTGTC 568
consensus_10054#2 ------------------------------------------------------------
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consensus_10054#2 ------------------------------------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||