These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10054#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 949 fasta sequence [CTCCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAA-CCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA-GGAAACACCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT-GTTTTCAAGATTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTAAACGGATTCAGCTGAAATATTTTTTATTTGTCTTTATCTGACTATTCTTTGCAATGTGCATATATTAACATGTTTAATCTTTGATGATAGTTTAAGCGAAAATTGAAAAATGTATAATTC] [+] EMBL CD080446 [CTCCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCGTTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCATCCATATTCTACTGTAAAATTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAA CCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTNTATATATTAATGGTATCTCTT ] [+] EMBL CD082332 [ aacTTACCGCTTTCTACATCCACTTTCTGTGCAT TATATTCTACTGTAAAACTGTCATTCTAATTAGCTGTTTGGTTATTATATTTCCTTTTCCTTCTCTGTTATAAATGGCTAAAAATACCGGAGATACAAAATTTCGAACGGTGAATGTTGACCAGTTGACTGAACCAACATTTCAAGATGAACTAACGGAAGATATCAAACCGTCTAGGTTGAATGTTTCTGAAATCAATAGTTTAATATCGAGTGGAAAGTCTACAGATGCTATTTTGAACATATTACAAAATGCACCAATTAATTCAAAAGATCAGCAAACTAAGGACACAGTATTCAAATTGATGATGCGTTTGCTATCACAATTTAAATCAAA CCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTNTATATATTAATGTTATCTCTNTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTA ] [-] EMBL CD074358 [ TGCTATCACAATTTAAATCAAACCCAAAATATTGATGAATTTTTGTCAACTATGGATCAAGATAAAATTGATTTACTTATGAAATATATTTACCGTGGATTTGAACAACCACAAGAGATAAGTTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA GGAAACCCCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGATTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTAAACGGATTCAGCTGAAATATTTTTTATTTGTCTTTATCTGACTATTCTTTGCAATGTGCATATATTAACATGTTTAATCTTTGATGATAGTTTAAGCGAAAATTGAAAAATGTATAATTC] [-] EMBL CD075930 [ TTGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTTTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAACCAA GGAAACCCCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGATTTTATTTTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTA ] [+] EMBL AA559660 [ TGTGCAGCACTGTTAACATGGCATGAGAAGGTGTATACTTACGGCAAAGCTGGTTCTATTATGCGTGTCCTTACTGATCGTAAACGTGTTTAATAACTATGCCATATGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAAGGGAAACACCNAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGCTATTTTATATCNTATTTTATTTCAATTGGTTTTCAAGATTTTAT ] [-] EMBL SMAA8341 [ cgGTATATGTTCGTGCTCATGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA GGAAACACCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGTTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGGTTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTA ] [-] EMBL SMAA85778 [ TGATTTTATATATTAATGTTATCTCTTTTACAGTGCAGTTACATTGCAAAATATTATTTGTACTTTCATCAAAATAAAACAA GGAAACACCAAGTGGCAGTGTTGACATCAATTTGTCGGCCTTTTTTTAATGTTATTTTATATCATATTTTATTTCAATT GTTTTCAAGGTTTTATTCTTACTCGATTGGATAATATACAAAGGTTA ] consensusID : consensus_10054#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||