cluster # 1008

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Schistosoma mansoni
cluster # 1008 cluster # 1008 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1008#0 length = 1023 sequences # 2

consensusID : consensus_1008#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1023
fasta sequence

                              [AGAACTAATGTGTTTATCAACTATATATGCTTATAATATTCGTAAAGTACCAAGTCGATTTAATGAAGCTAGAGCATTAGCATTTGTGAATTATATTAATTGTATTTGTTTTATTACAACACCTATACTTATGTATTATGCTAGTAAAACAATGTTAGAATTAGTACCATTAAGTTTTTTATTAATTTCTACGGCAACTAATGAATTCAGTGTTTTGATCTTACCAAAGATATACATTATTCTATTCCGACCATATAAAAATACAAGAGCCAGTATTATGCAACGTCTTAGAGGACTTAGTCAAGTCGAATGTACGGAGTGGATTAATGAGGTTACGTCTAGGAGTTCGTCTGGTATATTTAGTATATCTAGAGGTAAAGTGCTAAACCCTTGGCTAAAAATACGAGAACTGTCTTCAAAATCTCTAGGTGGTCCAGCATCCATAATGAATAATCCAACAACACTGAAAAATCAAAAATTCAAGACAACCGAAAAGTGTTTA-ATTAATGAGTTTTCATGTGGCACATCGCTCATAATACAGTGCTACAATGTAAAATCACCTACTAAACAAGTACAGAAGAATTTAATTACATCTCANATGAGACCAAAAGTTGTTTCCTTTGTGGAAAAACCCAATACCGAAGAAAATGACAATGAATGGATCACTTCACATAGGACAATGAATTTAGTTACGAGCGATAATAGTCGTGTAGATGGAAATAATGTTGATTCTAAAAATGATCACAAAGTTGATACCAATAATCACGTAAACTATAAAAACCGAATACTTTAGAAGTAGTAAATAAAATACTGACGGGGATTTTCAAACGTTCCACTGAAAATAAGAGCGGAGTATATTTCGCGAAGAAATTTCCCTTGTCTATACTTTCTTCAAGTTCTTTCGTTTTGATTGAAAATAATCTTTATTACTTCATAATTTCTACGGCCTTTTCAATTTGTGTGGAATTTCAAAATCATGCAGAGAAATTATTGTTTCTTCATTTAAAAAGTTAATAATCAGTT]

[+] EMBL CD082108             [AGAACTAATGTGTTTATCAACTATATATGCTTATAATATTCGTAAAGTACCAAGTCGATTTAATGAAGCTAGAGCATTAGCATTTGTGAATTATATTAATTGTATTTGTTTTATTACAACACCTATACTTATGTATTATGCTAGTAAAACAATGTTAGAATTAGTACCATTAAGTTTTTTATTAATTTCTACGGCAACTAATGAATTCAGTGTTTTGATCTTACCAAAGATATACATTATTCTATTCCGACCATATAAAAATACAAGAGCCAGTATTATGCAACGTCTTAGAGGACTTAGTCAAGTCGAATGTACGGAGTGGATTAATGAGGTTACGTCTAGGAGTTCGTCTGGTATATTTAGTATATCTAGAGGTAAAGTGCTAAACCCTTGGCTAAAAATACGAGAACTGTCTTCAAAATCTCTAGGTGGTCCAGCATCCATAATGAATAATCCAACAACACTGAAAAATCAAAAATTCAAGACAACCGAAAAGTGTTTA ATTAATGAGTTTTCATGTGGCACATCGCTCATAATACAGTGCTACAATGTAAAATCACCTACTAAACAAGTACAGAAGAATTTAATTACATCTCANATGAGACCAAAAGTTGTTTCCTTTGTGGAAAAACCCAATACCGAAGAAAATGACAATGAATGGATCACTTCACATAGGACAATGAATTTAGTTACGAGCGATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD075724             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAAATCAAAAATTCAAGACAACCGAAAAGTGTTTANATTAATGAGTTTTCATGTGGCACATCGCTCATAATACAGTGCTACAATGTAAAATCACCTACTAAACAAGTACAGAAGAATTTAATTACATCTCAAATGAGACCAAAAGTTGTTTCCTTTGTGGAAAAACCCAATACCGAAGAAAATGACAATGAATGGATCACTTCACATAGGACAATGAATTTAGTTACGAGCGATAATAGTCGTGTAGATGGAAATAATGTTGATTCTAAAAATGATCACAAAGTTGATACCAATAATCACGTAAACTATAAAAACCGAATACTTTAGAAGTAGTAAATAAAATACTGACGGGGATTTTCAAACGTTCCACTGAAAATAAGAGCGGAGTATATTTCGCGAAGAAATTTCCCTTGTCTATACTTTCTTCAAGTTCTTTCGTTTTGATTGAAAATAATCTTTATTACTTCATAATTTCTACGGCCTTTTCAATTTGTGTGGAATTTCAAAATCATGCAGAGAAATTATTGTTTCTTCATTTAAAAAGTTAATAATCAGTT]




>consensus_1008#0
AGAACTAATGTGTTTATCAACTATATATGCTTATAATATTCGTAAAGTACCAAGTCGATT
TAATGAAGCTAGAGCATTAGCATTTGTGAATTATATTAATTGTATTTGTTTTATTACAAC
ACCTATACTTATGTATTATGCTAGTAAAACAATGTTAGAATTAGTACCATTAAGTTTTTT
ATTAATTTCTACGGCAACTAATGAATTCAGTGTTTTGATCTTACCAAAGATATACATTAT
TCTATTCCGACCATATAAAAATACAAGAGCCAGTATTATGCAACGTCTTAGAGGACTTAG
TCAAGTCGAATGTACGGAGTGGATTAATGAGGTTACGTCTAGGAGTTCGTCTGGTATATT
TAGTATATCTAGAGGTAAAGTGCTAAACCCTTGGCTAAAAATACGAGAACTGTCTTCAAA
ATCTCTAGGTGGTCCAGCATCCATAATGAATAATCCAACAACACTGAAAAATCAAAAATT
CAAGACAACCGAAAAGTGTTTAATTAATGAGTTTTCATGTGGCACATCGCTCATAATACA
GTGCTACAATGTAAAATCACCTACTAAACAAGTACAGAAGAATTTAATTACATCTCANAT
GAGACCAAAAGTTGTTTCCTTTGTGGAAAAACCCAATACCGAAGAAAATGACAATGAATG
GATCACTTCACATAGGACAATGAATTTAGTTACGAGCGATAATAGTCGTGTAGATGGAAA
TAATGTTGATTCTAAAAATGATCACAAAGTTGATACCAATAATCACGTAAACTATAAAAA
CCGAATACTTTAGAAGTAGTAAATAAAATACTGACGGGGATTTTCAAACGTTCCACTGAA
AATAAGAGCGGAGTATATTTCGCGAAGAAATTTCCCTTGTCTATACTTTCTTCAAGTTCT
TTCGTTTTGATTGAAAATAATCTTTATTACTTCATAATTTCTACGGCCTTTTCAATTTGT
GTGGAATTTCAAAATCATGCAGAGAAATTATTGTTTCTTCATTTAAAAAGTTAATAATCA
GTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case